Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот
DESCRIPTION
Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот. Ревертаза. РНК-зависимая ДНК-полимераза (ревертаза) способна катализировать синтез ДНК-копии (кДНК) на РНК-матрице. Не LTR-содержащие. LINE ( l ong in terspersed e lements). Структура мРНК кодирующие - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/1.jpg)
Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот.
![Page 2: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/2.jpg)
Ревертаза.
РНК-зависимая ДНК-полимераза (ревертаза) способна катализировать синтез ДНК-копии (кДНК) на РНК-матрице.
![Page 3: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/3.jpg)
Мобильные Ретроэлементы эукариот
LTR-содержащие не LTR-содержащие
Ретротранспозоны
Ретровирусы
LINE(long interspersed elements)
SINE(short interspersed elements)
экзогенные
эндогенные
![Page 4: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/4.jpg)
Не LTR-содержащие
![Page 5: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/5.jpg)
LINE (long interspersed elements)
Структура мРНК
кодирующие характерна усечённость копий с 5’-конца нумерация нуклеотидов в
последовательности LINE принято вести с 3’-конца и выражать в отрицательных числах
![Page 6: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/6.jpg)
Схема жизненного цикла L1.
![Page 7: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/7.jpg)
TPRT – реакция.(target-primed reverse
transcription) в ДНК-мишень вносится одноцепочечный
разрыв 3’-конец одной из цепей используется в
качестве затравки для синтеза кДНК разрезание второй цепи ДНК-мишени [там
же] далее in vivo происходит:• лигирование цепей ДНК• разрушение РНК в составе гетеродуплекса • репаративный синтез второй цепи ДНК
![Page 8: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/9.jpg)
SINE(short interspersed elements)
не содержат кодирующих последовательностей при транспозициях используют обратную
транскриптазу из других источников в качестве таких «доноров» выступают LINE заканчивается олиго(А)-трактом гомогенны по длине внутри одного семейства не содержат 5’-концевых делеций нумерацию нуклеотидов ведут с 5’-конца
![Page 10: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/10.jpg)
Происхождение. Из 7SL РНК с внутренней делецией - B1 грызунов, Alu
приматов. “tRNA-derived SINE” - в 5’-части есть высокая гомология
с последовательностями определённых тРНК - В2 грызунов, TS табака, MIR всех млекопитающих. В то же время их 3’-концевой домен является АТ-богатым и происходит, по-видимому, из 3’-конца LINE-элементов.
Известны случаи происхождения SINE из генов малых ядерных РНК - Bm1 B. mori – из U1.
SINE-R из генома человека обязан своим происхождением длинному концевому повтору эндогенного ретровируса семейства HERV-K
![Page 11: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/11.jpg)
LTR-содержащие
![Page 12: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/12.jpg)
Структура LTR-содержащих элементов на примере
ретровирусов.
![Page 13: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/13.jpg)
Механизм обратной транскрипции.
![Page 14: Мобильные ретроэлементы в геноме эукариот](https://reader036.vdocuments.us/reader036/viewer/2022062500/5681507a550346895dbe795f/html5/thumbnails/14.jpg)
Возможная эволюция
LTR-ретротранспозоны Ретровирусы Эндогенные ретровирусы