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Profil génétique et médecine
personnalisée. Quand et pour qui?
Dr Sara Colombo, Pharmacienne, Responsable du développement scientifique et marketing de Gene Predictis®
Dr Alain E. Mottaz, FMH Urologie, DIU médecine prédictive
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1953: Watson et CrickStructure de l’ADN
1865: MendelExpériences sur l'hybridation des plantes, notions d'hérédité
2001: efforts publics et privésSéquençage du génome humain
2007
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H. Ledford. Nature, 449 (7158): 6, 2007
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Environnement
Génétique
Génétique et santé
Maladies et réponse aux médicaments
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cellule
Graphics courtesy of the National Human Genome Research Institute
protéine
expression du gène
noyau
chromosome
ADN(A, T, C, G)
gène
Quelques notions de génétique
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C C
TT CC
TT TT
Deux gènes normaux activité normale de la protéine
Un gène normal et un avec la variation activité intermédiaire de la protéine
Deux gènes variés activité lente de la protéine
de la mère du père
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La médecine personnalisée
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Qu’est-ce que c’est?
Toute intervention et approche médicale ciblée sur l’individu
Analyse des risques considérant le patrimoine génétique, l’histoire clinique et familiale
Interventions préventives, diagnostiques, ainsi que thérapeutiques
But: fournir un outil cohérent et adéquat pour la gestion de la santé
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Les champs d’activité
Nous analysons des variants génétiques spécifiques et validés afin de mieux
comprendre
le profil pharmacogénétiquela susceptibilité aux maladies
évaluation des facteurs de risques conseils pour sauvegarder la qualité de vie
choix personnalisé du médicament et de sa dose
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La pharmacogénétique étudie la manière dont la
génétique influence l’efficacité et la toxicité
médicamenteuse
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Quelles sont les attentes d’un patient
quand il prend un médicament?
Efficacité
Tolérabilité
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Variabilité dans l'efficacité des médicaments
Spear et al. Trends in Molecular Medicine, 7:201 (2001).
–Inhibiteurs de l’ECA 10-30%
–Bêta bloquants 15-35%
–ISRSs 10-25%
–Anti-dépresseurs tricycl. 20-50%
–Statines 10-60%
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Effets secondaires médicamenteux
> 100’000 morts/année, 4ème cause de décès aux Etats-Unis
2.2 millions de réactions sévères/année Une augmentation de 1.75 milliards
dollars/année des coûts de la santé7%1 (données suisses, CHUV), 18%
(données nord-américaines) des admissions aux urgences sont dues aux effets indésirables médicamenteux
1Wasserfallen JB et al., Eu J Inter Med 2001, 12:442-447
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Les patients sont tous différents et uniques
Les médicaments ne sont pas différenciés
Environ 30% des patients ne bénéficient pas du traitement médicamenteux adéquat
Un médicament ne peut pas convenir à tout le monde.
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But de la PGxPrescrire
la bonne dose du bon médicament
dansla bonne indication pour
le bon patientau bon moment
efficacité effets indésirables coûts
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Les cytochromes
Les polymorphismes génétiques des enzymes responsables du métabolisme sont la cause majeure de la variabilité qui amène à la survenue d’effets indésirables ou au manque d'efficacité thérapeutique1
1Ingelman-Sundberg M et al.Trends Pharmacol Sci 1999;20:342-349http://www.imm.ki.se/cypalleles/
CYP 3 A 4 *15
famille>40%
séquence homologue
sous-famille>55%
séquence homologue
isoenzyme
allèle
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métabolisme
transport
métabolisme et détoxification
CYP 1A2 CYP 2D6 CYP 2C9 CYP 2C19 CYP2B6ABCB1 (MDR1, P-gp)GSTT1GSTM1NAT2
GP-CYPASS®
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Effets indésirables Manque d’efficacitéFenêtre thérapeutique
Per
cen
tag
e o
f st
d d
ose
Allèles CYP2D6
PM UMIM EM
J. Kirchheiner et al. Nat Rev Drug Discov, 4 (2005) 639-647
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J. Kirchheiner et al. Nat Rev Drug Discov, 4 (2005) 639-647
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Quelques cas pratiques
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Antidépresseurs et CYP2D6: impact sur le succès thérapeutique et sur les
coûts associés aux maladies mentales sévères
Patient No (%) Hospitalisation Total cost Group of patients days per years per years
UM 3 26 12’000 U$
EM 72 17 8’300 U$
IM 13 11 6’000 U$
PM 12 24 12’000 U$
Chou et al., J Clin Psychopharmacol, 20 (2000) 246-251
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AntidépresseursFemme 59 ans, dépression, Tofranil®
(imipramine)posologie : 75 mg/j puis augmentation 150 mg/j
après 7 semaines Résultat clinique non satisfaisant, suspicion de
toxicitéDosages plasmatiques:imipramine (CYP 2C19) : 125 ng/ml, normal
désipramine (CYP2D6, métab. actif): 1730 ng/ml, seuil de toxicité 1000 ng/ml, risque létal
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AntidépresseursGénotype CYP2D6: PM 3 mois de traitement inadéquat exposition à un risque toxique grave
STOP ttt 4 semaines, reprise 25 mg/j amélioration thérapeutique sans signe de toxicité
dosage imipr. 25 ng/ml, désipr. 135 ng/mlimipr.+désipr. = 160 ng/ml
(intervalle thér. =180-350 ng/ml)
Posologie adaptée: 3 à 6 x posologie std
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CYP2C9CYP2C9 *2/*2, *2/*3, *3/*3 (= métaboliseur
lents)Sulfamides hypoglycémiants: odd ratio de 5.2
pour des hypoglycémies sévère, fatale dans 1.4-10% des cas1
AINS: prédisposition génétique à des saignements gastriques aigus2
Anticoagulants oraux: fréquence augmentée des complications chez les individus variés pour le CYP2C9 et le VKORC1(sous-unité 1 du complexe vitamine K époxyde réductase). Plus de 40% de la variabilité de la dose est expliquée réaction de la FDA (août 2007)
1Holstein et al., Br J Clin Pharmacol 2005, 60 (1):103-1062Martinez et al., Br J Pharmacol 2004, 141:205-208
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Time after Omeprazole (hour)
CYP2C19 PMs EMs
Sohn, JPET 262: 1195-1202; 1992
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Taux de guérison au H. pylori selon le génotype CYP2C19
T. Furuta et al., Ann. Int. Med., 129: 1027-1030, 1998
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
wt/wt wt/m1wt/m2
m1/m2m1/m1
(n=28)
(n=25)
(n=9)
Perc
en
t cu
re r
ate
Oméprazole 20 mg/j pour 6-8 semainesAmoxicillin 2000 mg/j pour 2 semainesTaux de guérison tatal = 52% (n=62)
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CYPASS®
Métabolisme du Calcium, ostéoporose, traitement hormonal COLLAGENE TYPE 11
VITAMIN D3 RECEPTOR (VDR) RECEPTEUR AUX OESTROGENES (ER)
CYP17A1 CYP19A1 (AROMATASE)
COMTRisque thrombotique
FACTEUR V / FACTEUR II (prothrombine) PAI-1
Métabolisme Vitamine B et acide folique MTHFR
Détoxification et réponse au stress oxydatif GSTM1 / GSTT1
NAT2Métabolisme des lipides
APOE /APOC3
GP-BETTER AGEING
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Tous les profils génétiques GP
GP-DIGEST
GP-CARDIO
GP-CYPASS®
GP-ANAEST GP-MENO or ANDRO
GP-BETTER AGEING
GP-THROMBO
GP-HEMOC / HEMOCplus
GP-STANDARD
GP-VIP
GP-CYPASS®-ONCO
GP-GOLD
GP-PATER
GP-INFERT
GP-OSTEO
GP-ONE PILL ONE SNIP
GP-EYES en développement
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Le test génétique nécessite :
l’historique familial du patient ainsi que son consentement écrit pour l’investigation génétique
un simple frottis buccal, prélèvement facile et indolore
Bâtonnets stériles pour frottis
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Le patient reçoit :
le passeport génétique CYPASS® personnalisé résumant les résultats utiles pour l’optimisation thérapeutique.
![Page 31: Profil génétique et médecine personnalisée. Quand et pour qui? Dr Sara Colombo, Pharmacienne, Responsable du développement scientifique et marketing de](https://reader035.vdocuments.us/reader035/viewer/2022062512/551d9dd5497959293b8e619e/html5/thumbnails/31.jpg)
Le patient reçoit :
le rapport final personnalisé qui comprend :Un descriptif des variants génétiques analysésLes résultats obtenus Un résuméUne interprétation approfondie + tables CYPsDes explications scientifiques exhaustives
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![Page 33: Profil génétique et médecine personnalisée. Quand et pour qui? Dr Sara Colombo, Pharmacienne, Responsable du développement scientifique et marketing de](https://reader035.vdocuments.us/reader035/viewer/2022062512/551d9dd5497959293b8e619e/html5/thumbnails/33.jpg)
![Page 34: Profil génétique et médecine personnalisée. Quand et pour qui? Dr Sara Colombo, Pharmacienne, Responsable du développement scientifique et marketing de](https://reader035.vdocuments.us/reader035/viewer/2022062512/551d9dd5497959293b8e619e/html5/thumbnails/34.jpg)
![Page 35: Profil génétique et médecine personnalisée. Quand et pour qui? Dr Sara Colombo, Pharmacienne, Responsable du développement scientifique et marketing de](https://reader035.vdocuments.us/reader035/viewer/2022062512/551d9dd5497959293b8e619e/html5/thumbnails/35.jpg)
La méthode analytique
![Page 36: Profil génétique et médecine personnalisée. Quand et pour qui? Dr Sara Colombo, Pharmacienne, Responsable du développement scientifique et marketing de](https://reader035.vdocuments.us/reader035/viewer/2022062512/551d9dd5497959293b8e619e/html5/thumbnails/36.jpg)
Les billes Veracode
Billes cylindriques en verre
240 x 28 micronsCode digital
holographiqueRedondance pour
chaque SNPExcitée avec un laser, la
bille émet une image de code unique
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96 à 384 analyses génétiques par puit
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