plano de ensino e cronograma

UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA CATARINA PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOLOGIA DE FUNGOS, ALGAS E PLANTAS PLANO DE ENSINO / TEACHING PLAN

SEMESTRE 2016/II

1. IDENTIFICAÇÃO DA DISCIPLINA / COURSE IDENTIFICATION: CÓDIGO / CODE

NOME DO CURSO / COURSE NAME

NO DE HORAS-AULA SEMANAIS / TOTAL HOURS PER WEEK

TOTAL DE HORAS-AULA SEMESTRAIS / TOTAL OF HOURS

FAP 410022

Fotossíntese e biorremediação em ambientes extremos / Photosynthesis and bioremediation in extreme environments

30 120

NÚMERO DE ALUNOS / STUDENTS NUMBER Min: 5 Max. 20 Nº DE

CRÉDITOS/CREDITS: 8 O curso será ministrado em inglês / The course language of this course will be English

2. PERÍODO / PERIOD CONCENTRADA / CONCENTRATED 17 de outubro a 16 de novembro de 2016 / October 17th, 2016 to November 16th, 2016

3. PROFESSOR(ES) MINISTRANTE(S) / INSTRUCTORS Professor convidado / Invited Professor: Dr. Ondřej Prášil [OP] (Institute of Microbiology,

Academy of Sciences, Czech Republic) Professor coordenador / Coordinator professor: Dr. José Bonomi Barufi [JBB] Professores participantes /Participant professors: Dr. Leonardo Rörig [LR] (Universidade Federal de Santa Catarina); Dr. Melina Guimarães [MG] (Universidade Católica de Brasília)

4. DESCRIÇÃO DO CURSO / COURSE DESCRIPTION 1. Revisão da fotossíntese em ambientes aquáticos / Overview of photosynthesis in the aquatic system Evolução da fotossíntese / Evolution of the photosynthesis Reações de fotofosforilação: os fotossistemas e a cadeia de transporte de elétrons / Photophosphorylation reactions: the photosystems and electron transport chain Fixação de carbon: o ciclo de Calvin e os mecanismos de concentração de carbono / Carbon fixation: the Calvin Cycle and the carbon concentration mechanisms 2. Fatores extremos afetando as respostas fisiológicas de organismos aquáticos fotossintetizantes / Extreme factors affecting the physiological responses in aquatic photosynthetic organisms. 3. Algas extremofílicas / Extremophilic algae Fotossíntese sob alta irradiância / Photosynthesis at high light Efeitos da radiação UV / Effects of UV light Fototróficos em ambientes quentes e alcalinos / Phototrophs in alkaline hot environments A vida em ambientes hiper-oligotróficos / Living in hyperoligotrophic condition 4. Respostas algais à contaminação de metais pesados e sua biorremediação / Algal response to heavy metal poisoning and remediation. 5. Metabolismo de metais pesados, toxicidade e detoxificação / Metabolism of heavy metals, toxicity and

detoxification. 6. Uso da fluorescência da clorofila a em ambientes aquáticos / Use of chlorophyll fluorescence in the aquatic sciences 7. Métodos biofísicos em fotossíntese / Biophysical methods in photosynthesis Princípios dos métodos / Method principles Oxigênio, PAM, C14, IRGA / Oxygen, PAM, C14, IRGA Análise de dados / Data analysis Estatística / Statistics 8. Análise do conteúdo de metais pesados em massa seca de cultivos de algas / Analysis of heavy metal content in dry weight of algal cultures 9. Delineamento experimental / Experimental designs 10. Análise estatística de dados / Statistics data analysis

5. OBJETIVOS / OBJECTIVES - Explicar/ definir verbalmente e de modo escrito os princípios da fotossíntese e adaptações aos ambientes extremos / Explain/define verbally and in writing the principles of photosynthesis and adaptations to extreme environments - Elaborar hipóteses centíficas e testá-las com métodos e materiais biológicos disponibilizados para avaliar adaptações de organismos extremófilos / Design testable scientific hypothesis with the methods and biological materials available to assess the extremophile organism adaptations Interpretar e avaliar os resultados de experimentos com procedimentos incluindo perspectiva e acurácia científicas / Interpret and evaluate the results of experiments from procedural and scientific accuracy points of view

6. METODOLOGIA DE AVALIAÇÃO A avaliação do curso será feita por um total de pontos que sejam atingidos divididos pelo total de pontos possíveis para calcular uma porcentagem da nota final / Course grading will consist of the total points you have earned divided by the total points possible to calculate a percentage for your final grade. Tarefas / Assignments 15 pontos /points Relatórios / Reports 60 pontos /points Apresentação / Presentation 25 pontos /points Total de pontos possíveis / Total points possible 100 pontos /points 7. CRONOGRAMA / SCHEDULE

DATA /DATE HORA /HOURS TEMA / SUBJECT SALA/ ROOM

PRIMEIRA PARTE / FIRST QUARTER 17/10/2016 Professores: todos Instructors: all

8:00 - 9:30 10:00-11:30

Apresentação do curso e dos professores / Introducing the course and instructors Aula teórica: Introdução à fotossíntese / Lecture: Introduction to photosynthesis

BOT III

17/10/2016 Professor: OP Instructor: OP

14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula teórica: Evolução da fotossíntese / Lecture: Evolution of the photosynthesis Tarefa: atividades de leitura e escrita, baseada em leitura de artigos / Assignment: activities of reading and writing, based on the lectures or excerpts of select papers


8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: reações de fotofosforilação: os fotossistemas e a cadeia de transporte de elétrons / Lecture: Photophosphorylation reactions: the photosystems and electron transport chain

BOT III

18/10/2016 Professor: JBB Instructor: JBB

14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula teórica: Mecanismos de dissipação – NPQ / Lecture: Quenching mechanisms – NPQ Tarefa: discussão de artigos selecionados / Assignment: paper discussion


8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: Métodos biofísicos em fotossíntese / Lecture: Biophysical methods in photosynthesis Tarefa: discussão de artigos selecionados / Assignment: paper discussion

BOT III

19/10/2016 Professores: todos Instructors: all

14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula teórica/prática: demonstração de equipamentos / eletrodos de oxigênio, IRGA, PAM / Lecture/practice: equipments demonstration – Oxygen electrodes, IRGA, PAM

LAFIC

20/10/2016 Professor: MG Instructors: MG

8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: Metabolismo do carbono / Lecture: Carbon metabolism

BOT III


14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula prática: Métodos de avaliação da fotossíntese em organismos aquáticos: IRGAS / Practice: Methods to assess the photosynthesis in aquatic organisms: IRGAs

LAFIC


8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: Genética molecular e bioquímica da fotossíntese, fotossíntese artificial / Lecture: Molecular genetics and biochemistry of photosynthesis, artificial photosynthesis

BOT III


14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula prática: Métodos de avaliação da fotossíntese em organismos aquáticos: PAM e oxímetros / Practice: Methods to assess the photosynthesis in aquatic organisms: PAM and Oxymeters

LAFIC

SEGUNDA PARTE / SECOND QUARTER 24/10/2016 Professor: OP Instructor: OP

8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: Fatores extremos afetando as respostas fisiológicas de organismos aquáticos fotossintetizantes / Lecture: Extreme factors affecting the physiological responses in aquatic photosynthetic organisms

BOT III


14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula teórica: algas extremófilas – fotossíntese com excesso de luz / Lecture: Extremophilic algae – photosynthesis at high light


8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: algas extremófilas – efeitos da radiação UV / Lecture: Extremophilic algae – Effect of UV radiation

BOT III


14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula prática: Métodos de avaliação da fotossíntese em organismos aquáticos: PAM / Practice: methods to assess photosynthesis in the aquatic system: PAM

26/10/2016 Professor: MG Instructor: MG

8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: Fototróficos em ambientes quentes e alcalinos / Lecture: Phototrophs in alkaline hot environments

BOT III

26/10/2016 Professor: MG Instructor: MG

14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula teórica: vivendo em ambientes hiperoligotróficos e condições ácidas / Lecture: Living in hyperoligotrophic and acidic condition

27/10/2016 Professor: LR Instructors: LR

8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: respostas de algas frente à contaminação por metais pesados e a biorremediação / Lecture: Algal response to heavy metal poisoning and remediation.

BOT III

27/10/2016 Professor: LR Instructors: LR

14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula prática: análise de conteúdo de metais pesados em peso seco de cultivos algais / Practice: Analysis of heavy metal content in dry weight of algal cultures

28/10/2016 Professor: LR Instructor: LR

8:00 - 9:30 10:00-11:30

Aula teórica: metabolismo de metais pesados, toxicidade e detoxificação / Lecture: Metabolism of heavy metals, toxicity and detoxification.

BOT III


14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Discussão: delineamento experimental / Discussion: Experiment designs

THIRD QUARTER 31/11/2016 Professores: todos Instructors: all

8:00 - 9:30 10:00-11:30

Discussão: planejamento estatístico e manuseio de softwares / Discussion: Statistical design and software handling

Casa de vegetação e LAFIC / Green house and laboratory


14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Aula prática: preparação dos experimentos / Practice: preparation of the experiments


8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Saída de Campo para Siderópolis / Field trip to Siderópolis

Siderópolis

02/11/2016 FERIADO / HOLIDAY (Dia de Finados / Hallowmas day) 03/11/2016 Professores: OP, JBB, LR Instructors: OP, JBB, LR

8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Desenvolvimento do projeto / Project development


04/11/2016 Professores: OP, JBB, LR Instructors: OP, JBB, LR

8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Desenvolvimento do projeto / Project development


QUARTA PARTE / FORTH QUARTER 07/11/2016: Professores: LR, JBB Instructors: JBB, LR

8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Desenvolvimento do projeto / Project development Análise estatística dos dados / Statistical data analysis


08/11/2016: Professores: LR, JBB Instructors: JBB, LR

8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Preparação dos relatórios- análise de dados / Preparation of the reports – data analysis

BOT III

09/11/2016 Professores: LR, JBB Instructors: JBB, LR

8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Preparação dos relatórios / Preparation of the reports BOT III

10/11/2016 Professores: todos Instructors: JBB, LR, MG, OP

8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Dia todo: Apresentação dos resultados e discussão – web-conferência / All day: Presentation of the results and discussion– web conference

BOT III

11/11/2016 Professores: todos Instructors: JBB, LR, MG, OP

8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Correção dos relatórios / Correction and preparation of the reports

BOT III

14/11 and 15/11/2016

FERIADO / HOLIDAY (Dia da Proclamação da República / Brazilian Republic Proclamation Day )


8:00 - 9:30 10:00-11:30 14:00 – 15:30 16:00 – 17:30

Data final para entrega de relatórios / Final date to deliver the reports

BOT III

9. BIBLIOGRAFIA BÁSICA / BIBLIOGRAPHY

BEER, S., BJORK, M., BEARDALL, J. Photosynthesis in the Marine Environment. Wiley-Blackwell Ed. 224 p., 2014.

BLANKENSHIP, R. E. Molecular Mechanisms of Photosynthesis, 2ª Ed., Wiley-Blackwell Ed., 312 p., 2014.

DUBINSKY, Z. Photosynthesis. Editora InTech. 380 p., 2013 (Open Access book).

SECKBACH, J. (Ed.) Algae and Cyanobacteria in Extreme Environments. Springer Ed., 2007

SECKBACH, J.; OREN, A.; STAN-LOTTER, H (Eds.) Polyextremophyles: life uder multiple forms of stress. Springer Ed., 2013 SUGGETT, D. J., PRÁŠIL, O., BOROWITZKA, M. A. Chlorophyll a Fluorescence in Aquatic Sciences: Methods and Applications. Developments in Applied Phycology, Volume 4, 2010..

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