kel.1_dna damage response and trancription

7/31/2019 Kel.1_DNA Damage Response and Trancription

1/25

Presented By:Syayyida Muslimah (1509 100 012)

Dinda Zahidah (1509 100 037)

Wahyu Dewi Iftita (1509 100 707)

Afina Dhuhaini (1510 100 004)

DNA Repair


2/25

DNA is a highly stable molecule that replicates with

amazing accuracy, but changes in DNA structure and

errors of replication do occur.A mutation is defined as an inherited change in genetic

information; the descendants may be cells produced by

cell division or individual organisms produced by

reproduction.

Mutation is the source of all genetic variation, the raw

material of evolution


3/25

Phenotypic Effects of Mutation

Others:

- UV radiation

- Ionizing radiation- Cosmic rays

- X-rays

- Deamination

- Etc.


4/25


5/25

Mismatch Repair

Type of damagerepaired :

Replication errors,including mispaired

bases


6/25

Direct Repair

Direct-repair mechanisms do not replace altered

nucleotides but instead change them back into

their original (correct) structures.


7/25


8/25

Nucleotide-Excision

RepairRemoves bulky DNAlesions that distort the

double helix, such aspyrimidine dimers orlarge hydrocarbons

attached to the DNA.


9/25

Presented By:

Kelompok 1 : 1. Syayyida Muslimah (1509 100 012)

2. Dinda Zahidah (1509 100 037)

3. Wahyu Dewi Iftita (1509 100 707)

4. Afina Dhuhaini (1510 100 004)


10/25

DNA Damage & Genome Integrity

The mammalian genome is protected against genotoxicinsults by a network of DNA damage response (DDR)

Mechanisms triggered by the detection of DNA lesions

through specific sensors.

The multiprotein nucleotide excision repair (NER)system removes a wide variety of helix-destabilizingDNA lesions including those induced by UV-

irradiation. This broad substrate recognition is achieved by two

distinct subpathways of NER


11/25


12/25

Global Genome

NER (GG-NER)


13/25

Processing of

UV-lesions

by TC-NER


14/25

DNA Damage Signaling


15/25

The Replication Stress Response

ATR is the main sensor.

Purposed function : Kinase

activated by blockage of

replication and perhaps

transcription. Roles in normal

replication activation of cell

cycle checkpoints, DNA repair

and apoptosis

The ATR kinase orchestratesDNA repair, apoptosis, S-phase

and G2 arrest via the Chk1, p53

and the Fanconi pathways


16/25

The Transcription Stress Response

SMG1, BRCA1 and ATR

have potensial role in this

stress

The activated SMG1 kinase

could then activate p53 byphosphorylating p53 on the

ser15 site


17/25

The Chromatin Alteration Stress

Response

The ATM kinase may monitor

chromatin alterations


18/25


19/25

TC-NER deficiency : human disease

and genome integity

Xeroderma Pigmentosum (XP)

Gejala

- luka terbakar

- banyak bintik-bintik di kulit

- kulit tipis

- mata sensitif pada sinar

matahari

Pengobatan

Belum ditemukan obat untuk

pigmentosum xeroderma.

Tujuan utama dari pengobatanadalah untuk melindungi pasien

dari paparan UV dan dengan

demikian mencegah dampak

buruk itu dapat memiliki pada

kulit.


20/25

Penderita XP sangat sensitif terhadap radiasi ultraviolet (UV), termasuk UVA,UVB, dan UVC. Paparan matahari saja dapat menyebabkan kulit terbakar,kering dan sangat rentan terserang kanker kulit dan melanoma. Selain itu,mata penderita juga sangat sensitif pada cahaya yang juga rentan terserangkanker mata.

Penyebab

cacat dalam mekanisme perbaikan eksisi nukleotida Keterbelakangan mental, sindrom piramidal, neuropathia perifer; lebih parah

sistem saraf pusat (SSP) gangguan diamati ketika mutasi terjadi pada situs DNAXPA

Setelah penyinaran UV pada kultur sel, tidak ada peningkatan kelainankromosom spontan dalam limfosit dari fibroblas, namun setelah paparan UV

naik, trjd peningkatan jumlah pertukaran kromatid saudara (SCE) danpenyimpangan kromosom yang diamati (terutama kromatid-jenis kelainan);fibroblas mengekspresikan kepekaan meningkat menjadi mutagen kimia; tidakada fitur sitogenetika berguna untuk diagnosis XP


21/25

Triochothiodystrophy

Adalah genodermatosis ygditurunkan scr resesif autosomal,ditandai oleh adanya iktiosis,rambut rapuh, penurunan

intelektualitas, postur pendek,mikrosefali, penurunan kesuburan,dan mikrognatia.

Pada TTD dijumpai keadaanfotosensitifitas terhadap sinarmatahari. Adanya defisiensi sulfur

menyebabkan rendahnya kadarsistein dan sistin protein sehinggatrjd iktiosis, rambut dan kuku rapuh.Kelainan kulit tdk berhubungan dgmalignasi seperti XP.


22/25


23/25

Any question????

Lets discuss !!!!!


24/25

Question

Sidratu 10-10: Daminasi sitosin

urasil, gambarin donkmbak dinda strukturnya..

Hefdiyah 10-09 : sejauh manakah kerusakan yang tidak

bisa diatasi hingga kemudian muncul berbagai

penyakit??*tergantung dari paparan UV (polutan penyebab

damage) serta protein yg terlibat dalam repaaring

DNA. Jk protein tidak dapat mengatasi maka

terjadilah penyakit tersebut.

Dadang 09-41 : mungkin g sih perubahan spesies

karena perubahan struktur DNA??

*kalo dalam waktu dekat = g mungkin.


25/25

kel.1_dna damage response and trancription

Documents