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Invertebrati marini Prof. Giorgio Sartor Copyright © 2001-2008 by Giorgio Sartor. All rights reserved. Versione 1.1 – nov 2008 I nutrienti

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Invertebrati marini

Prof. Giorgio Sartor

Copyright © 2001-2008 by Giorgio Sartor.

All rights reserved.

Versione 1.1 – nov 2008

I nutrienti

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V.1.1 © gsartor 2001-2008 Invertebrati marini - I nutrienti - 2 -

Fonti di carbonio ed energia

OrganismoFonte di carbonio

Fonte di energia

Donatore di elettroni

Fotoautotrofi(piante, alghe

verdi, cianobatteri fotosintetici)

CO2 LuceH2O, H2S, S,

altri inorganici

Fotoeterotrofi(rodobatteri non

sulfurei)

Composti organici Luce Composti

organici

Chemioautotrofi (H2, Fe, S, batteri

nitrificanti)CO2

Reazioni redox

H2, H2S, NH4+,

NO2-, Fe++, Mn++

Chemioeterotrofi (Animali,

microrganismi, tessuti di piante non fotosintetici)

Composti organici

Reazioni redox

H2O,

composti organici

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V.1.1 © gsartor 2001-2008 Invertebrati marini - I nutrienti - 3 -

Fonti di carbonio ed energia

OrganismoFonte di carbonio

Fonte di energia

Donatore di elettroni

Fotoautotrofi(piante, alghe

verdi, cianobatteri fotosintetici)

CO2 LuceH2O, H2S, S,

altri inorganici

Fotoeterotrofi(rodobatteri non

sulfurei)

Composti organici Luce Composti

organici

Chemioautotrofi (H2, Fe, S, batteri

nitrificanti)CO2

Reazioni redox

H2, H2S, NH4+,

NO2-, Fe++, Mn++

Chemioeterotrofi (Animali,

microrganismi, tessuti di piante non fotosintetici)

Composti organici

Reazioni redox

H2O,

composti organici

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Metabolismo del carbonio

CellulefotosinteticheCellule

O

H

OH

OH

HH

OH

OH

HH

OHH

H

D-Glucoso

O2+

H2O, CO2

N.O. Carbonio < +4

N.O. Carbonio = +4

N.O. Ossigeno = 0

N.O. Ossigeno = -2

OSSID

AZ

ION

E

Luce

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V.1.1 © gsartor 2001-2008 Invertebrati marini - I nutrienti - 5 -

Fonti di carbonio ed energia

FOTOTROFIETEROTROFI

O

H

OH

OH

HH

OH

OH

HH

OHH

H

D-Glucoso

O2+

H2O, CO2

Luce

Ca++

CaCO3

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Ossigeno

AerobiUsano l’ossigeno come accettore

finale degli elettroni

Aerobi obbligatiUsano SOLO l’ossigeno come accettore finale degli elettroni

Anaerobi facoltativi

Possono usare altri accettori di elettroni

Anaerobi obbligati

NON possono usare l’ossigeno come accettore di elettroni

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Digestione, metabolismo, escrezione• Digestione:

– Processo attraverso il quale un polimero complesso (polisaccaride, lipide o proteina) viene convertito in monomeri (o composti semplici) più solubili in acqua.

• Metabolismo– Catabolismo: processo attraverso il quale una

molecola semplice viene ossidata a CO2, H2O e NH3 e l’energia associata ai legami chimici (potenziale chimico) viene immagazzinata o convertita.

– Anabolismo: processo attraverso il quale molecole semplici o intermedi del catabolismo vengono utilizzati per la sintesi molecole complesse.

• Escrezione– Meccanismo attraverso il quale i prodotti di scarto

vengono eliminati.

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Fase idrolitica

• Proteasi– Scissione del legame peptidico

• Lipasi– Scissione del legame estereo nei

trigliceridi e nei lipidi• Glicosidasi

– Scissione del legame etereo nei polisaccaridi

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Digestione

• Endocellulare– Endocitosi

• Vescicole specializzate

• Extracellulare– In organi specializzati

• Apparato digerente

– Extracorporea • Estroflessione di apparati (stelle marine)• Emissione di enzimi digestivi (veleni)

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PROTEINE POLISACCARIDI LIPIDI

Aminoacidi Esosi; Pentosi Ac. Grassi; Glicerolo

ATP

ADP + PiATP

Piruvato

ATP

O2

ADP + Pi ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

AcetilCoA

ATP

ADP + Pi

-chetoacidiATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

CO2H2ONH3

IIFASE OSSIDATIVA

IFASE IDROLITICA

III

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Fase ossidativa

• Metabolismo ossidativo di– Glucidi– Lipidi– Aminoacidi

AcetilCoA

-chetoacidi + NH4+

Urea

NADH

ATPO2

2H2O

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PROTEINE POLISACCARIDI LIPIDI

Aminoacidi Esosi; Pentosi Ac. Grassi; Glicerolo

ATP

ADP + PiATP

Piruvato

ATP

O2

ADP + Pi ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

AcetilCoA

ATP

ADP + Pi

-chetoacidiATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

CO2H2ONH3

IIFASE OSSIDATIVA

IFASE IDROLITICA

III

Metabolismodei glucidi

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PROTEINE POLISACCARIDI LIPIDI

Aminoacidi Esosi; Pentosi Ac. Grassi; Glicerolo

ATP

ADP + PiATP

Piruvato

ATP

O2

ADP + Pi ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

AcetilCoA

ATP

ADP + Pi

-chetoacidiATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

CO2H2ONH3

IIFASE OSSIDATIVA

IFASE IDROLITICA

III

Metabolismodei grassi

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PROTEINE POLISACCARIDI LIPIDI

Aminoacidi Esosi; Pentosi Ac. Grassi; Glicerolo

ATP

ADP + PiATP

Piruvato

ATP

O2

ADP + Pi ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

AcetilCoA

ATP

ADP + Pi

-chetoacidiATP

ADP + Pi

ATP

ADP + Pi

CO2H2ONH3

IIFASE OSSIDATIVA

IFASE IDROLITICA

III

Metabolismodell’azoto

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Vie metaboliche ed intermedi• Le vie metaboliche producono intermedi,• Il destino dei composti intermedi può essere

vario,• Ogni punto di biforcazione di una via

metabolica permette una regolazione,• Le vie metaboliche più importanti sono comuni

a tutti gli organismi,• Organismi diversi in ambienti diversi sono

caratterizzati da vie metaboliche alternative,• Gli organismi vengono caratterizzati in

funzione del modo con cui utilizzano carbonio, ossigeno ed energia.

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Crediti e autorizzazioni all’utilizzo• Questo materiale è stato assemblato da informazioni raccolte dai seguenti testi di Biochimica:

– CHAMPE Pamela , HARVEY Richard , FERRIER Denise R. LE BASI DELLA BIOCHIMICA [ISBN 978-8808-17030-9] – Zanichelli

– NELSON David L. , COX Michael M. I PRINCIPI DI BIOCHIMICA DI LEHNINGER - Zanichelli – GARRETT Reginald H., GRISHAM Charles M. BIOCHIMICA con aspetti molecolari della Biologia

cellulare - Zanichelli– VOET Donald , VOET Judith G , PRATT Charlotte W  FONDAMENTI DI BIOCHIMICA [ISBN 978-8808-

06879-8] - Zanichelli

• E dalla consultazione di svariate risorse in rete, tra le quali:– Kegg: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes http://www.genome.ad.jp/kegg/– Brenda: http://www.brenda.uni-koeln.de/– Protein Data Bank: http://www.rcsb.org/pdb/ – Rensselaer Polytechnic Institute:

http://www.rpi.edu/dept/bcbp/molbiochem/MBWeb/mb1/MB1index.html

Questo ed altro materiale può essere reperito a partire da:http://www.ambra.unibo.it/giorgio.sartor/ oppure da http://www. gsartor.org/

Il materiale di questa presentazione è di libero uso per didattica e ricerca e può essere usato senza limitazione, purché venga riconosciuto l’autore usando questa frase:

Materiale ottenuto dal Prof. Giorgio SartorUniversità di Bologna a Ravenna

Giorgio Sartor - [email protected]