Searching the Literature for Evidence-Based Medicine

Medical Research Training 10-12/3/2014

Learning Objectives

Identify how the search terms you enter into a search

Formulate a search in the database and run the search

in recourses

Find the highest levels of evidence

Find the evidence-based in resources

How to Literature Search

1. Evidence based practice – THE LEARNING CYCLE

Identify clinical questions (ask) -> Answer these questions -> Make clinical

decisions -> Evaluate the outcome of clinical decisions

2. Reflect on clinical knowledge and learning needs

3. Identify the question : PICO

4. Find evidence : Journals

5. Searching journals using the internet

6. Obtaining the full-text article

7. Critical appraisal: judging the quality of research articles

Search Strategy

Broaden

Narrow

Evidence Broaden & Narrow

MeSH

Limit

Broaden Search

การใชค าคนหาใหไดผลลพธทครอบคลมบทความมากขน

ค าเหมอน (Synonym) : ใชในการคนหาจะชวยใหครอบคลมบทความมากขน เชน dementia->aberration, alienation, dementedness

ค าพอง (Thesaurus) : ค าทอยในเรองราวทเกยวของกนมกถกใชในบรบทของเรองราวเดยวกน เชน dementia->mental deterioration, loss of

one's faculties,

เงอนไขทางตรรก (Logical/Boolean Operator) : การใชค าเงอนไข OR

ชวยใหภายในการสบคนครงเดยวแตครอบคลม search term ไดมากกวาหนงค า เชน dementia OR aberration

Narrow Search

การเพมค าคนหาใหไดผลลพธทครอบคลมและความจ าเพาะขน

เพมค าในการสบคนใหมากและจ าเพาะขน เชน dementia Australia

เงอนไขทางตรรก (Logical/Boolean Operator) : การใชค าเงอนไข AND หรอ NOT ชวย เชน dementia AND genetic, dementia NOT

stroke

ค าหวขอ (Heading) : ค าทใหความหมาย (Concept) หรอหมวด (Category) ทจ าเพาะมากขน เชน function of brain impairment

Australia

Broaden and Narrow Search

การใช narrow down และ broaden ผสมกนเพอใหมความจ าเพาะขน เชน

เพมค าในการสบคนใหมากและจ าเพาะขน เชน

เลอกใชค าเหมอน (Synonym) หรอ ค าพอง (Thesaurus) : การใชค าใดค าหนงทมความจ าเพาะมากกวาค าอนๆ

ค าหวขอ (Heading) : ค าทใหความหมาย (Concept) หรอหมวด (Category) ทครอบคลมเฉพาะประเดนสงทตองการ

เงอนไขทางตรรก (Logical/Boolean Operator) : การใชค าเงอนไข AND, OR หรอ NOT และเครองหมายการแบงเงอนไข

Broaden Search

การใชค าคนหาใหไดผลลพธทครอบคลมบทความมากขน

ค าหวขอ (Heading) : ค าทใหความหมาย (Concept) หรอหมวด (Category) ใหญทครอบคลมสงตางๆทเกยวของกน อาจนกถงเรองค าจ ากดความได เชน function of brain impairment

Database Search Tips & Tricks

Subject headings and keywords Subject headings describe the content of each item in a database.

Use these headings to find relevant items on the same topic.

Searching by subject headings (a.k.a. descriptors) is the most

precise way to search article databases.

Keyword searching is how you typically search web search engines.

Think of important words or phrases and type them in to get results.

Boolean operators Boolean operators form the basis of mathematical sets and database

logic.

They connect your search words together to either narrow or

broaden your set of results.

The three basic boolean operators are: AND, OR, and NOT.

Example:

second creation (title) AND wilmut and campbell (author) AND

2000 (year)

Truncations Truncation, also called stemming, is a technique that broadens your

search to include various word endings and spellings.

Enter the root of a word and put the truncation symbol at the end.

The database will return results that include any ending of that root

word.

Examples:

child* = child, childs, children, childrens, childhood

genetic* = genetic, genetics, genetically

Truncation symbols may vary by database; common symbols include:

*, !, ?, or #

Wildcards Similar to truncation, wildcards substitute a symbol for one letter of

a word.

This is useful if a word is spelled in different ways, but still has the

same meaning.

Examples:

wom!n = woman, women

colo?r = color, colour

Company Logo

General Search Strategy Search Strategy by Cochrane Review

Developing a Search Strategy 1. Define text words

2. Determine synonyms for the text words

3. Control for different spellings or using appropriate truncations

4. Consider brand names

5. Perform test searches - I

6. Identify keywords (“controlled vocabulary” provided by databases)

7. Decide on whether to perform an “exploded” or a “focused” search

8. Spell check ALL search terms

9. Combine logically all search terms

10. Perform test searches – II

11. Customize the syntax of your search strategy to the specific databases

Developing a Search Strategy 1. Define text words

Focus on the disease and the two interventions/procedures you

want to compare; do not search for outcomes, age groups of

patients etc.

Make a list of words representing the study population (disease)

and the intervention(s)

Developing a Search Strategy 1. Define text words

Create a search statement using keywords

Search Statement: Exp.

Identify potential stem cell methodology that could be used for

changing valine to glutamic acid in hemoglobin of people with

sickle cell disease

Do not type in “stem cell methodology for changing valine to

glutamic acid in hemoglobin”

Concept 1 Concept 2 Concept 3

sickle cell anemia hemoglobin stem cell methodology

Developing a Search Strategy 1. Define text words : Identify Related Keywords

Concept 1 Concept 2 Concept 3

sickle cell anemia hemoglobin stem cell methodology

Sickle cell disease Beta chain Stem cells

Hemoglobin S disease Beta-globin gene Gene silencing

globulinopathies codon nucleotide 6 Gene splicing

(middle) AT Gene transfer techniques

Valine Targeted gene repair

Glutamic acid Genetic engineering

RNA antisense

Developing a Search Strategy 2. Determine synonyms for the text words

Think of, or search for, synonyms of your search terms

Use MeSH database for identification of synonyms: check the

“entry terms” in the description of a specific MeSH-term

Medical Subject Headings (MeSH) is a controlled vocabulary thesaurus of terms

created by the National Library of Medicine and used for PubMed (MEDLINE)

article records. The MeSH Database is freely available for searching in PubMed

(MEDLINE). See The Basics of Medical Subject Headings (MeSH) for more

information.

Developing a Search Strategy 2. Determine synonyms for the text words

Developing a Search Strategy 3. Control for different spellings or using appropriate

truncations

For the same disease

In English

In different languages

Think of meaningful truncations for e.g. singular/plural;

noun/adjective form of search term

Use “wildcards” to replace differences (specific syntax for

different databases!)

Developing a Search Strategy 3. Control for different spellings or using appropriate

truncations

Developing a Search Strategy 4. Consider brand names

If you search for specific drugs, it is advisable to include very

common brand names.

Think of the possibility of combination drugs (and their brand

names) and whether you would like to include them.

Be careful about using abbreviations! Check the results of a test

search if there are too many irrelevant hits.

Developing a Search Strategy 5. Perform test searches - I

Type in text words and / or index terms

Monitor the number of hits after truncations, substitution of

wildcards etc. Use correct syntax for each database!

Developing a Search Strategy 6. Identify keywords (“controlled vocabulary” provided by

databases)

Map (your list of) text words to the database of controlled

vocabulary (e.g. MeSH, EMTREE)

Study the neighboring hierarchic levels of your keyword for their

usefulness as search terms

Developing a Search Strategy 7. Decide on whether to perform an “exploded” or a “focused”

search

Are there other terms in the stems or branches that should be

included (e.g. as text words?)

Instead of searching all parallel branches of one category, add

“exp” to the upper term (closer to the stem)

Are there terms in the lower branches that will definitely increase

the noise in your search?

Are there terms in the tree that may be used interchangeably by

indexers?

Developing a Search Strategy 7. Decide on whether to perform an “exploded” or a “focused”

search

Developing a Search Strategy 8. Spell check ALL search terms

9. Combine logically all search terms

Structure your search terms: group both text words and

keywords for the disease, the intervention(s) and the control,

respectively.

Combine all relevant text words and keywords; disease of

interest, intervention(s), control(s) by “OR”

Combine “disease” AND “intervention” (AND “control”)

Add Cochrane RCT filter: “disease” AND “intervention” (AND

“control”) AND RCT

Developing a Search Strategy 10. Perform test searches – II

Type in your logically combined search terms first individually

Monitor the number of hits after logical combination of the

search terms

Developing a Search Strategy 11. Customize the syntax of your search strategy to the

specific databases

A Medline-search will not find all relevant references in EMBASE

and vice versa.

A search developed for MEDLINE via OVID does not work in

PubMed without “rephrasing and reformatting”

Set Theory of Searching

Freely available

Freely available

TRIP (Turning Evidence into Practice) www.tripdatabase.com

NHS Evidence www.evidence.nhs.uk

Bandolier www.medicine.ox.ac.uk/bandolier/knowledge.html

Intute www.intute.ac.uk

Best Practice www.bestpractice.bmj.com.

Clinical Evidence www.clinicalevidence.bmj.com

HINARI (Access to Research Initiative) www.who.int/hinari/about/en

Identify the question : PICO

Exercise to Searching

ไมม PICO

การวจยเพอหาปจจยทเกยวของททาใหผปวยจตเวชโรครวมจตเวชสารเสพตดท D/C จากรพ.กลบมารกษาในโรงพยาบาลชา (นครพนมฯ)

รปแบบการพยากรณจากขอมลโรคทางจตเวชทแตกตางกนมผลตอความแมนย าในการพยากรณจ านวนการเจบปวยโรคทางจตเวชในอนาคต (สยส)

PICO

ผปวยโรคหรอภาวะทางจตเวชในผสงอาย (P) เครองมอประเมน/คดกรอง โรคหรอภาวะทางจตเวช (I) เครองมอคดกรองทมประสทธภาพ (O) (สวนสราญรมย)

บคลากรทใหบรการผปวยโรคหรอภาวะทางจตเวชในผสงอาย (P) ความรและทกษะในการดแลผปวยโรคหรอภาวะทางจตเวช (I) ความรและทกษะในการดแลผปวยโรคหรอภาวะทางจตเวชม ความรและทกษะในการดแลผปวยโรคหรอภาวะทางจตเวช (I) (สวนสราญรมย)

ผปวยโรคหรอภาวะทางจตเวชในผสงอาย (P) เครองมอประเมน/คดกรอง โรคหรอภาวะทางจตเวช (I) เครองมอคดกรองทมประสทธภาพ (O) (สวนสราญรมย)

PICO

ผปวยออทสตกในระดบปฐมภมและทตยภม (P) แบบประเมน PDDSQ สามารถคดกรอง (I) แบบประเมนความสามารถของผปวยออทสตกทมมาตรฐาน (O) (ยวฯ)

ภาวะแทรกซอนทเกดขนไดบอยในผปวยออทสตก (P) แนวทางการปองกนภาวะแทรกซอนในผปวยออทสตก (I) แนวทางการปองกนภาวะแทรกซอนทเหมาะสมในผปวยออทสตก (O) (ยวฯ)

ผปวยออทสตกในระดบปฐมภมและทตยภม (P) แบบประเมน PDDSQ สามารถคดกรอง (I) การเปรยบเทยบหนวยบรการทใชแบบแบบประเมน PDDSQ กบไมไดใช (C)ความแตกตางของการเขาถงบรการ (O) (ยวฯ)

PICO and Question

ประสทธผลของโปรแกรมระบบรายงาน Psychosocial Clinic คณภาพ (O) (เขตนครชยบรนทร) (P) ปงบประมาณ 2557 (T) เปนอยางไร (ศนยสขภาพจตท 5)

ผทเสยงตอการเปนโรคจตเภท (P) ไดรบการคดกรอง (I) ดวยเครองมอ SPIS ฉบบภาษาไทย (O) ทมประสทธภาพหรอไม (นครสวรรคฯ)

ลกษณะโครงสรางและการท างานของสมอง (P) ของผปวย Dementia และผปวย Dementia with BPSD มความแตกตางกนหรอไม (O) (ส.สมเดจฯ)

ผปวยโรค Dementia (P) มโครงสรางสมอง (O) แตกตางจากคนปกตหรอไม (C) (ส.สมเดจฯ)

ปจจยอะไรบาง (O) ทเกยวของกบการเกดโรค Dementia (P) กอนวยอนควร (ส.สมเดจฯ)

List or

1. Define text words

2. Determine synonyms for the text words

3. Control for different spellings or using appropriate truncations

4. Consider brand names

5. Perform test searches – I

6. Identify keywords (“controlled vocabulary” provided by databases)

7. Decide on whether to perform an “exploded” or a “focused” search

8. Spell check ALL search terms

9. Combine logically all search terms

10. Perform test searches – II

11. Customize the syntax of your search strategy to the specific databases

Checklist for Developing a Search Strategy

Company Logo

Tripdatabase

www.tripdatabase.com

Tripdatabase Step 1. Use PICO to formulate the search strategy; start with the

Patient problem(s) and Intervention

Company Logo

Tripdatabase Step 1. Use PICO to formulate the search strategy; start with the

Patient problem(s) and Intervention

Company Logo

Tripdatabase Step 2. Review the results

Company Logo

Tripdatabase Step 3. Choose the results

Company Logo

Tripdatabase Step 4. Make history your searching

Company Logo

PubMed

www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/

http://guides.mclibrary.duke.edu/content.php?pid=431451&sid=3530477

PubMed Step 1. Use PICO to formulate the search strategy; start with the

Patient problem(s) and Intervention

Company Logo

PubMed Step 2. Look at Search Details to verify Medical Subject Heading

(MeSH) terms

Company Logo

PubMed Step 3. Limit to appropriate study design

Company Logo

PubMed Step 3. Limit to appropriate study design

Company Logo

PubMed Step 4. Review the results

Company Logo

PubMed Step 4. Review the results

Company Logo

Hierarchy of levels of evidence www.ebmpyramid.org

How adjust to Purchase article

Abstract:

Introduction: explains the background, why it is needed and what it

aims to find out

Methods: details of how the work was done, data was analyzed

Results: shows all the findings, graphs and tables, but with no

commentary on them

Discussion: interprets the results

Conclusion: describes whether, in the author’s opinion, the aims of the

study have or have not been met

General Searching Engines; on iPad