ex vivo vezava probiotikov na Črevesno … · slika 2: prerez stene tankega ĉrevesa (povzeto po...
TRANSCRIPT
UNIVERZA V LJUBLJANI
BIOTEHNIŠKA FAKULTETA
ODDELEK ZA ZOOTEHNIKO
Ljubljana, 2016
Simona ĈAMPA
EX VIVO VEZAVA PROBIOTIKOV NA ČREVESNO SLUZNICO
TANKEGA ČREVESA PRAŠIČEV IN TEKMOVANJE Z E. coli O8:K88
DIPLOMSKO DELO
Univerzitetni študij
EX VIVO ADHESION OF PROBIOTICS ON THE INTESTINAL
MUCOSA OF THE SMALL INTESTINE OF PIGS AND
COMPETITION WITH E. coli O8:K88
GRADUATION THESIS
University Studies
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
II
Diplomsko delo je zakljuĉek Univerzitetnega študija kmetijstvo - zootehnika. Opravljeno
je bilo na Katedri za mlekarstvo Oddelka za zootehniko Biotehniške fakultete Univerze v
Ljubljani.
Komisija za študij 1. in 2. stopnje Oddelka za zootehniko je za mentorico diplomskega dela
imenovala znan. svet. dr. Bojano Bogoviĉ Matijašić in za somentorico dr. Petro Mohar
Lorbeg.
Recenzentka: prof. dr. Irena Rogelj
Komisija za oceno in zagovor:
Predsednik: prof. dr. Janez SALOBIR
Ĉlanica: znan svet. dr. Bojana BOGOVIĈ MATIJAŠIĆ
Ĉlanica: dr. Petra MOHAR LORBEG
Ĉlanica: prof. dr. Irena ROGELJ
Datum zagovora:
Podpisana izjavljam, da je diplomsko delo rezultat lastnega raziskovalnega dela. Izjavljam,
da je elektronski izvod identiĉen tiskanemu. Na univerzo neodplaĉno, neizkljuĉno,
prostorsko in ĉasovno neomejeno prenašam pravici shranitve avtorskega dela v elektronski
obliki in reproduciranja ter pravico omogoĉanja javnega dostopa do avtorskega dela na
svetovnem spletu preko Digitalne knjiţnice Biotehniške fakultete.
Simona ĈAMPA
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
III
KLJUĈNA DOKUMENTACIJSKA INFORMACIJA
ŠD Dn
DK UDK 636.4.084/.087:579(043.2)=163.6
KG prašiĉi/prehrana ţivali/krmni dodatki/probiotiki/E. coli O8:K88/vezava ex
vivo/zaviranje patogenov
KK AGRIS L51/5300
AV ĈAMPA, Simona
SA BOGOVIĈ MATIJAŠIĆ, Bojana (mentorica)/MOHAR LORBEG, Petra
(somentorica)
KZ SI-1230 Domţale, Groblje 3
ZA Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za zootehniko
LI 2016
IN EX VIVO VEZAVA PROBIOTIKOV NA ĈREVESNO SLUZNICO TANKEGA
ĈREVESA PRAŠIĈEV IN TEKMOVANJE Z E. coli O8:K88
TD Diplomsko delo (univerzitetni študij)
OP XI, 60 str., 5 pregl., 14 sl., 18 pril., 99 vir.
IJ sl
JI sl/en
AI Z uporabo probiotikov kot krmnih dodatkov je mogoĉe do doloĉene mere prepreĉiti
ali omiliti oz. skrajšati trajanje drisk pri prašiĉih, ki jih povzroĉajo bakterije iz vrste
Escherichia coli. Pri tem igra pomembno vlogo uspešna vezava probiotikov na
ĉrevesno sluznico in sposobnost tekmovanja za vezavo s patogenimi bakterijami.
Namen naše naloge je bil ugotoviti, ali sta se probiotiĉna seva Lactobacillus gasseri
K7 in Lactobacillus gasseri LF221 sposobna vezati na sveţe tkivo ĉrevesne sluznice
prašiĉev (ex vivo) ter tekmovati z Escherichia coli O8:K88 za vezavo v testnih
razmerah tekmovanja, izkljuĉevanja ali izpodrivanja. Rezultati so pokazali, da sta
seva L. gasseri K7 in L. gasseri LF221 sposobna vezave na ĉrevesno sluznico
prašiĉev v razmerah ex vivo. Prav tako so se na ĉrevesno sluznico dobro vezale
bakterije seva E. coli O8:K88. Seva L. gasseri K7 ter L. gasseri LF221 nista
izkazala statistiĉno znaĉilnega vpliva na vezavo E. coli na ĉrevesno sluznico
prašiĉev (ex vivo) v testnih razmerah tekmovanja, izkljuĉevanja ali izpodrivanja.
Rezultati tega dela so koristni s stališĉa morebitne uporabe probiotiĉnih sevov L.
gasseri K7 in LF221 za zaviranje infekcij pri tej vrsti ţivali.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
IV
KEY WORDS DOCUMENTATION
DN Dn
DC UDC 636.4.084/.087:579(043.2)=163.6
CX pigs/animal nutrition/feed additives/probiotics/E. coli O8:K88/ex vivo
adhesion/zaviranje patogenov
CC AGRIS L51/5300
AU ĈAMPA, Simona
AA BOGOVIĈ MATIJAŠIĆ, Bojana (supervisor)/MOHAR LORBEG, Petra (co-
supervisor)
PP SI-1230 Domţale, Groblje 3
PB University of Ljubljana, Biotechnical Faculty, Department of Animal Science
PY 2016
TI EX VIVO ADHESION OF PROBIOTICS ON THE INTESTINAL MUCOSA OF
THE SMALL INTESTINE OF PIGS AND COMPETITION WITH E. coli O8:K88
DT Graduation Thesis (University studies)
NO XI, 60 p., 5 tab., 14 fig., 18 ann., 99 ref.
LA sl
AL sl/en
AB Probiotics as feed additives can to a certain extent prevent, mitigate or shorten the
duration of diarrhea in pigs, caused by bacteria of the species Escherichia coli. An
important role in such activity plays successful adhesion of probiotics on the
intestinal mucosa and their ability to compete with pathogenic bacteria for adhesion
sites. The aim of our study was to examine whether the probiotic strains
Lactobacillus gasseri K7 and Lactobacillus gasseri LF221 are capable of adhesion
to the fresh tissue of the intestinal mucosa of pigs (ex vivo) and compete with
Escherichia coli O8: K88 binding in the test conditions of competition, exclusion or
displacement. The results showed that the strain L. gasseri K7 and L. gasseri LF221
exhibit the ability of adhesion to the intestinal mucosa of piglets in the ex vivo
conditions. The successful adhesion of E. coli O8:K88 was also demonstrated.
Strains L. gasseri K7 and L. gasseri LF221, however, were not demonstrated to
exhibit any statistically significant effect on the adhesion of E. coli to porcine
intestinal mucosa (ex vivo) in the test conditions of competition, exclusion or
displacement. The results of this work are beneficial from the standpoint of the
potential use of probiotic strains L. gasseri K7 and LF221 to inhibit infection in this
animal species.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
V
KAZALO VSEBINE
str.
Kljuĉna dokumentacijska informacija (KDI) III Key Words Documentation (KWD) IV Kazalo vsebine V Kazalo preglednic VIII Kazalo slik VIII Kazalo prilog IX Okrajšave in simboli XII
1 UVOD 1
2 PREGLED OBJAV 3
2.1 PREBAVILA 3
2.2 MIKROBIOTA PREBAVNEGA TRAKTA 10
2.2.1 Razvoj mikrobiote pri prašičih 13
2.3 PROBIOTIKI 14
2.3.1 Definicija 14
2.3.2 Zgodovina probiotikov 14
2.3.3 Pogoji, uporaba probiotikov 15
2.3.4 Probiotiki za živali 16
2.3.5 Zakonodaja o krmnih dodatkih 18
2.3.6 Načini delovanja probiotikov in probiotičnih krmnih dodatkov 19
2.3.6.1 Kompetitivno izkljuĉevanje 19
2.3.6.1.1 Vezava na steno prebavnega trakta z namenom prepreĉevanja
kolonizacije s patogenimi mikroorganizmi 20
2.3.6.1.2 Tekmovanje s patogenimi bakterijami za hranila v ĉrevesju 20
2.3.6.2 Bakterijski antagonizem 21
2.3.6.3 Imunska modulacija 21
2.4 LACTOBACILLUS GASEERI LF221 in LACTOBACILLUS GASEERI
K7 22
2.5 ESCHERICHIA COLI 23
2.6 RAZISKOVANJE FUNKCIONALNIH LASTNOSTI
PROBIOTIKOV 24
2.7 PROBIOTIKI KOT NADOMESTILO ZA ANTIBIOTIKE 24
3 MATERIAL IN METODE 26
3.1 IZVEDBA POSKUSA 26
3.1.1 Poskusne živali 26
3.1.2 Potek poskusa 26
3.1.2.1 Potek dela 26
3.2 MATERIAL 27
3.2.1 Črevesna sluznica iz tankega črevesa 27
3.2.2 Bakterijski sevi 27
3.2.3 Gojišča 27
3.2.3.1 Trda gojišĉa 27
3.2.3.2 Tekoĉa gojišĉa in diluenti 27
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
VI
3.3 METODE 28
3.3.1 Obdelava kontrolnih vzorcev črevesne sluznice 28
3.3.2 Optimiziranje protokola vezave bakterij – spiranje nevezanih
bakterij 29
3.3.3 Priprava standardiziranih bakterijskih suspenzij 30
3.3.4 Priprava črevesnega tkiva 31
3.3.5 Vezava ali adhezija 32
3.3.6 Spiranje 33
3.3.7 Homogeniziranje 33
3.3.8 Razredčitve in nacepitve na komercialni selektivni gojišči 33
3.3.9 Barvanje po Gramu 33
3.4 STATISTIĈNA OBDELAVA PODATKOV 34
3.4.1 Statistični model 34
4 REZULTATI 35
4.1 REZULTATI MIKROSKOPIRANJA ĈREVESNE SLUZNICE S
PRIPETIMI TESTNIMI LAKTOBACILI 35
4.2 REZULTATI KONTROLE SPIRANJA VZORCEV (VZOREC »0«) 36
4.3 NAĈIN SPIRANJA (PO ADHEZIJI) 37
4.4 PRIMERJAVA MED KONCENTRACIJO SUSPENZIJE IN
VEZANIMI CELICAMI 38
4.5 VEZAVA 39
5 RAZPRAVA IN SKLEPI 44
6 POVZETEK 50
7 VIRI 52
ZAHVALA
PRILOGE
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
VII
KAZALO PREGLEDNIC
str.
Preglednica 1: pH vrednosti razliĉnih predelov prašiĉjega prebavnega trakta
(Ewing, 2008) 5
Preglednica 2: Probiotiki, obiĉajni v ţivalski prehrani (Yirga, 2015) 17
Preglednica 3: Razlike v kemiĉni zgradbi celiĉne stene po Gramu pozitivnih in
negativnih bakterij 34
Preglednica 4: Kontrola izpiranja prvotne mikrobiote iz košĉkov jejunuma
(vzorec niĉ »0«) 36
Preglednica 5: Povpreĉne koncentracije suspenzij E. coli, ter sevov K7 in LF221
(log KE/ml) v posameznih poskusih celotne naloge, izraţene v
logaritemskih vrednostih 39
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
VIII
KAZALO SLIK
str.
Slika 1: Prebavni sistem prašiĉa (povzeto po Oregon state University, 2004) Ошибка!
Закладка не определена.
Slika 2: Prerez stene tankega ĉrevesa (povzeto po Histologija tankega ĉrevesa,
2016) 6
Slika 3: Ĉrevesna resica in mikroresice (povzeto po Resica-zgradba, 2016) 8
Slika 4: MO prebavnega trakta (povzeto po Mikroorganizmi prebavil, 2016) 11
Slika 5: Mikrobiološke interakcije v ĉrevesju (povzeto po Yirga, 2015) 19
Slika 6: Kopiĉenje nepatogenih bakterij na patogene (povzeto po Ewing in Cole,
1994) 20
Slika 7: Nepatogene in patogene bakterije pogosto tekmujejo za hranila (povzeto
po Ewing in Cole, 1994) 21
Slika 8: Mikroskopski preparati (a-f) ĉrevesne sluznice s pripetimi laktobacili
(L. gasseri K7), pripravljeni z barvanjem po Gramu. Celice laktobacilov
so obarvane vijoliĉno, celice enterocitov pa sivo - rumeno 36
Slika 9: Vpliv postopka spiranja 37
Slika 10: Primerjava koncentracije laktobacilov v suspenziji s številom vezanih
laktobacilov 38
Slika 11: Vezava L. gasseri K7 na tanko ĉrevo prašiĉev pri razliĉni zaĉetni
koncentraciji 39
Slika 12: Vezava L. gasseri LF221na tanko ĉrevo prašiĉev pri razliĉni zaĉetni
koncentraciji 41
Slika 13: Zaviranje vezave E. coli, na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev,
z L.gasseri K7, pri razliĉnih koncentracijah dodane suspenzije E. coli,
pod pogoji izkljuĉevanja (K7/Ec), izpodrivanja (Ec/K7) in tekmovanja
(K7+Ec) 42
Slika 14: Zaviranje vezave E. coli na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev
z L. gasseri LF221, pri razliĉnih koncentracijah dodane suspenzije E.
coli, pod pogoji izkljuĉevanja (LF/Ec), izpodrivanja (Ec/LF) in
tekmovanja (LF+Ec) 43
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
IX
KAZALO PRILOG
Priloga A: Vpliv poskusa in vpliv skupine v modelu (Laktobacili) - preglednica
ANOVA, metoda najmanjših kvadratov.
Priloga B: P - vrednosti za posamezne vplive modela (log Lb.).
Priloga C: Vpliv poskusa in skupine v modelu (E. coli) - preglednica ANOVA,
metoda najmanjših kvadratov.
Priloga D: P - vrednosti za posamezne vplive modela (log E. coli).
Priloga E: Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezane E. coli in
p-vrednosti za vpliv skupin, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga F: Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezanih
laktobacilov K7 oz. LF221 in p-vrednosti za vpliv skupin, pridobljeni z
metodo najmanjših kvadratov.
Priloga G: Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezane E. coli in
p-vrednosti za vpliv skupin, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga H: Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezanih
laktobacilov K7 oz. LF221 in p-vrednosti za vpliv skupin, pridobljeni z
metodo najmanjših kvadratov.
Priloga I: Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v prvem
poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga J: Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezanih
laktobacilov K7 oz. LF221 in p-vrednosti za vpliv interakcije med
poskusom in skupino v prvem poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših
kvadratov.
Priloga K: Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7
oz. LF221 in njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in
skupino v drugem poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga L: Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v tretjem
poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga
M:
Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7
oz. LF221 in njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in
skupino v tretjem poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga N: Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v
ĉetrtem poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
X
Priloga O: Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7
oz. LF221 in njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in
skupino v ĉetrtem poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga P: Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v petem
poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga R: Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7
oz. LF221 in njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in
skupino v petem poskusu, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov.
Priloga S: Kontrola izpiranja prvotne mikrobiote iz košĉkov jejunuma (vzorec niĉ
»0«).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
XI
OKRAJŠAVE IN SIMBOLI
MKB mleĉnokislinske bakterije
SCAN Scientific Comittee of Animal Nutrition
GRAS Generally regarded as safe
MO mikroorganizmi
IML-PRO Inštitut za mlekarstvo in probiotike
EMB gojišĉe, ki vsebuje eozin, metilensko modro, laktozo in saharozo
MRS gojišĉe po de Man, Rogosa in Sharpe
PBS fosfatni pufer s soljo
NaCl natrijev klorid
Na2HPO4 di-natrijev-hidrogen-fosfat-anhidrid
KH2PO4 kalijev dihidrogen fosfat
H2O voda
L. rod Lactobacillus
LF Lactobacillus gasseri LF221
K7 Lactobacillus gasseri K7
Ec Escherichia coli O8:K88
SD standardna deviacija
KE/ml število kolonijskih enot v 1 mililitru
KE/g število kolonijskih enot v 1 g vsebine
FAO Organizacija zdruţenih narodov za prehrano in kmetijstvo
(Food and Agricultural Organization of the United Nations)
WHO Svetovna zdravstvena organizacija (World Health Organization)
Pos.1 poskus 1
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
1
1 UVOD
Probiotiki so ţivi mikroorganizmi (MO), ki ob zauţitju v zadostni koliĉini pozitivno
delujejo na zdravje gostitelja (FAO/WHO, 2001). Tako delujejo bodisi neposredno, ali pa
posredno z okrepitvijo fizioloških oz. obrambnih mehanizmov.
Probiotiki se vedno bolj uporabljajo v ţivinorejski dejavnosti. Pospešena proizvodnja
namreĉ povzroĉa rušenje bakterijskega ravnovesja v prebavilih proizvodnih ţivali in
poslediĉno ĉrevesna obolenja pri teh. Sledi neuĉinkovita prebava in absorpcija hranil, nato
pa slabši proizvodni rezultati. Do nedavnega so se kot krmni dodatki, ki so zmanjšali pojav
drisk in izboljšali konverzijo krme, ter s tem poveĉali prirast ţivali, mnoţiĉno in
nekontrolirano uporabljali antibiotiki. Njihovi ostanki v ţivalskih proizvodih prispevajo k
širjenju proti antibiotikom odpornih mikroorganizmov, kar predstavlja tveganje za zdravje
potrošnikov. V Evropski uniji so leta 2006 uvedli popolno prepoved uporabe antibiotikov
kot krmnih dodatkov (Cho in sod., 2011). Probiotiki predstavljajo moţno alternativo
antibiotikom. Potrebno pa je še veliko pojasniti glede uĉinkovitosti in osnovnih
mehanizmov njihovega delovanja. Uspešen probiotiĉni sev mora ustrezati številnim
zahtevam. Med najpomembnejšimi sta sposobnost preţivetja v prebavnem traktu in
tekmovanja s preostalo ĉrevesno mikrobioto, seveda pa tudi varnost. V ĉrevesju se
bakterijam uspe zadrţati in delovati le, ĉe se razrašĉajo hitreje, kot pa poteka sama
peristaltika ĉrevesja, ali pa ĉe se veţejo na epitelne celice ĉrevesja (Fuller in Cole, 1988).
Sposobnost vezave probiotikov na ĉrevesno sluznico, ter uspešno tekmovanje za vezna
mesta na ĉrevesni sluznici oz. prepreĉevanje vezave predstavnikov Escherichia coli (E.
coli, ki so najpogostejši povzroĉitelji drisk pri prašiĉih, so torej pomembni kriteriji za
izbiro probiotiĉnih sevov.
Osnovni namen diplomske naloge je bil prouĉiti sposobnost vezave humanih izolatov
Lactobacillus gasseri K7 in Lactobacillus gasseri LF221 na ĉrevesno sluznico prašiĉev ter
sposobnost vezave oz. inhibicije vezave E. coli O8:K88 na ĉrevesno sluznico prašiĉev (ex
vivo). Z obema obravnavanima probiotikoma so bili predhodno uspešno opravljeni ţe
številni testi in vitro ter in vivo.
Testiranje probiotiĉnih sevov oziroma izolatov je nujen in dolgotrajen proces, pri katerem
lahko uporabimo razliĉne pristope in vitro, ex vivo in in vivo. Rezultati pomagajo pri
odkrivanju dejanskega dogajanja v prebavilih.
Cilji naloge:
Ugotoviti, ali sta se seva L. gasseri LF221 in L. gasseri K7 sposobna vezati na
ĉrevesno sluznico prašiĉev.
Ugotoviti sposobnost vezave seva E. coli O8:K88 na ĉrevesno sluznico prašiĉev.
Ugotoviti, ali pride do tekmovanja, izkljuĉevanja ali izpodrivanja E. coli O8:K88 s
strani laktobacilov.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
2
Hipoteze:
1. Seva L. gasseri K7 in L. gasseri LF221 sta sposobna vezave na ĉrevesno sluznico
(ex vivo).
2. Bakterije seva E. coli O8:K88 so se sposobne vezati na ĉrevesno sluznico prašiĉev
(ex vivo).
3. Seva L. gasseri K7 ter L. gasseri LF221 bosta uspešno tekmovala z Escherichia
coli za vezavo na ĉrevesno sluznico v razliĉnih testnih razmerah (tekmovanje,
izkljuĉevanje, izpodrivanje).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
3
2 PREGLED OBJAV
2.1 PREBAVILA
Prebavila oziroma prebavni sistem predstavlja dolga prebavna cev (tractus alimentarius),
ki sega od ustne odprtine do zadnjika (anus). Prebavna cev sestoji iz treh plasti: sluznice
(tunica mucosa), ţlezno mišiĉne plasti (tunica muscularis) in vezivnotkivne ali serozne
opne (tunica serosa). Dele prebavne cevi izven seroznih open obdaja rahlo vezivno tkivo
(tunica adventitija) (Rebesko, 1983).
Notranjost prebavne cevi obdaja sluznica, ki v bliţini telesnih odprtin prehaja v zunanjo
koţo. V ustni votlini, poţiralniku in predţelodcih preţvekovalcev, kjer je sluznica
izpostavljena moĉnejšim mehaniĉnim vplivom, ta prevzame nekatere lastnosti koţe, zaradi
ĉesar se tudi imenuje koţna ali kutana sluznica. Ta je zaradi slinske in sluzne ţleze vlaţna
in spolzka, je brez ţlez in zgrajena iz veĉplastnega epitela, ki leţi na papilarni osnovi. Na
moĉno izpostavljenih mestih vrhnji epitel oroţeni (Rebesko, 1983).
Ĉrevesna sluznica prebavnega trakta je v stalnem stiku z vsebino ĉrevesja. Predstavlja
povezavo med metabolizmom ţivali in okoljem, zato ima funkcijo ĉrevesne bariere.
Prepreĉuje vdor patogenih bakterij in antigenov v telo in prepreĉuje translokacijo bakterij
iz ĉrevesa v krvni obtok in druga tkiva (Ewing in Cole, 1994; Kocijanĉiĉ in sod., 2005;
Petroviĉ in Zorc, 2005; Zorc in sod., 2006).
Plasti ĉrevesne stene so enakomerno pretkane s kolagenskimi vlakni, ki se med seboj
škarjasto kriţajo (škarjasta mreţa). Ta mreţa se premika s pomoĉjo mišiĉnih trakcev
mišiĉne opne (tunika muskularis), ki so v njo vrinjeni, kar je za motoriĉno delovanje
ĉrevesja (peristaltika) velikega pomena (Rebesko, 1983).
Prebavila se zaĉenjajo z ustno votlino (cavum oris) in ţrelom (pharynx), ki se nadaljuje v
poţiralnik (oesophagus). Slednji sega do ţelodca (ventriculus seu gaster), v katerega se
izliva. Za ţelodcem se nahaja tanko ĉrevo, ki ga sestavljajo dvanajstnik (duodenum), tešĉe
ĉrevo (jejunum) in kratko vito ĉrevo (ileum). Tanko ĉrevo se izliva v debelo ĉrevo
(intestinum crassum), ki ga sestavljajo slepo ĉrevo (caecum), debelo ĉrevo (colon) in danka
(rectum) (Rebesko, 1983).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
4
Slika 1: Prebavni sistem prašiĉa (povzeto po Oregon state University, 2004)
V ustih se hrana preţveĉi. Ţleze slinavke izloĉajo slino, v kateri so voda, mucin, pri
nekaterih rastlinojedih ţivalih in ĉloveku pa še amilaze, ki pomagajo pri razgradnji škroba
v maltozo.
Dobro preţveĉena in napojena hrana potuje po poţiralniku v ţelodec. Prašiĉi, perutnina in
ljudje so nepreţvekovalci in imajo enodelen ţelodec. Zaradi tega se ne zanašajo na
simbiotski odnos z mikrobioto v prebavnem traktu, kot preţvekovalci, pri katerih je to za
preţivetje zelo pomembno. Pri nepreţvekovalcih pa bakterijska populacija prebavnega
trakta hrane ni sposobna razkrojiti in fermentirati v tolikšni meri, da bi razcepila
neprebavljive materiale do snovi, ki jih telo lahko absorbira. Manj raznolika mikrobiota v
primerjavi s preţvekovalci torej pomeni, da imajo nepreţvekovalci manjšo sposobnost
prebavljanja, zato so zanje potrebe po hrani z višjo hranilno vrednostjo nujne. Slabo
kakovostno, revno krmo, ki vsebuje velike koliĉine celuloze, lignina in strukturnih
ogljikovih hidratov, ne izkorišĉajo dobro, zato potrebujejo kakovostnejšo prehrano, sploh
kar se tiĉe vsebnosti aminokislin in vitaminov (Ewing in Cole, 1994).
Ţelodec je organ prebave in skladišĉenja. Pri odraslem prašiĉu je njegova kapaciteta okrog
8 litrov. Ĉeprav je to enodelen ţelodec, ga delimo na štiri poglavitnejše cone (srĉna,
ţelodĉna, pilorusna in poţiralniška). Hormon pilorin v pilorusni regiji stimulira
proizvodnjo ĉrevesnega soka. pH prašiĉjega ţelodca je okrog 2. V konĉni fazi proteazni
encimi v ĉrevesnem soku razcepijo polipeptide v krajše aminokislinske verige. Protein je
konĉno razdeljen na enostavne peptide ali aminokisline. Poţiralniški del ţelodca ne
proizvaja nobenih ţleznih izloĉkov. V poţiralniku so v vseh obdobjih ţivljenja ţivali
prisotni laktobacili (Tannock in Smith, 1970). Tip in število bakterij, še posebej
laktobacilov in streptokokov, je odvisno od njihove sposobnosti vezave in koloniziranja
površine sluznice.
Normalna vrednost pH v ţelodcu prašiĉev je pod 3,5. Takšna vrednost pH ima dvojno
funkcijo: omogoĉa nemoteno delovanje ţelodĉnih encimov in prepreĉuje vdor nezaţelenih
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
5
mikroorganizmov v tanko ĉrevo. Pri slabo razvitih prebavilih novorojenih prašiĉev za
zadostno zakisanje poskrbijo mleĉnokislinske bakterije, ki mleĉni sladkor (laktozo)
spremenijo v mleĉno kislino in tako ustvarijo ustrezno vrednost pH. Problem nastane
vselej ob spremembi krme. Zadrţevanje te v prebavilih, dokler se encimski sistem tankega
ĉrevesa ne pripravi nanjo, in pa višji pH v ţelodcu omogoĉa razvoj nevarnih patogenih
mikroorganizmov (Bolduan in sod., 1988).
pH ĉrevesja se od ust, preko ţelodca, pa vse do danke moĉno spreminja (Preglednica 1).
Vsebina ţelodca je moĉno kisla zaradi klorovodikovih kislin, proteaz in ţolĉnih soli, ter
lahko doseţe tudi pH 1,5. Vendar pa je pH odraslih ţivali ponavadi okrog 2,5-4,5 (še
posebej pri prašiĉih) in 4,5-7 pri mladih sesnih pujskih. pH ţelodca je v obratnem
sorazmerju z zastopanostjo bakterij. Kadar je koncentracija mikrobov visoka, se poveĉa
fermentacija v lumnu, ĉrevesna prebava (razgradnja krme do oblike, primerne za
absorpcijo) pa se zato odvija kasneje. Visoka zakisanost ţelodca limitira rast
mikroorganizmov (Ewing in Cole, 1994).
pH slepega in debelega ĉrevesa je bolj nevtralen (pH 6-8), zato tu poteka mnogo
mikrobioloških aktivnosti. Višje pH vrednosti bi ĉrevesnim patogenom, npr. E. coli, nudile
ugodne pogoje za prehitro rast (Ewing in Cole, 1994).
Preglednica 1: pH vrednosti razliĉnih predelov prašiĉjega prebavnega trakta (Ewing, 2008)
Podroĉje pH
Ţelodec
Dvanajstnik
Slepo ĉrevo
Ostali predeli debelega ĉrevesa
1,5-6,0
6,0-8,5
6,0-9,0
8,0-9,0
Ĉrevesni kanal (intestinum) sestoji torej iz prednjega, tanjšega dela, to je tanko ĉrevo
(intestinum tenue) in zadnjega, širšega dela, imenovanega debelo ĉrevo (intestinum
crassum). Kanal sega od ţelodĉnega vratarja (pilorusa) do kratkega konĉnega dela,
zadnjika (anus) (Rebesko, 1983).
Tanko ĉrevo je dolg, cevast, zavit organ, ki se priĉne pri ţelodĉnem vratarju (pilorusu) in
konĉa pri ileo-cekalnem delu (vito ĉrevo se tu odpira v debelo ĉrevo). Njegova dolţina pri
odraslem prašiĉu lahko meri tudi nad 20 metrov in zavzema eno tretjino volumna
prebavnega trakta (Ewing, 2008).
Tanko ĉrevo je sestavljeno iz treh delov (slika 1):
dvanajstnika (duodenum), predstavlja zaĉetni, proksimalni del tankega ĉrevesa,
vanj se izlivajo izloĉki trebušne slinavke in ţolĉ jeter,
tešĉega ĉrevesa (jejunum), ki zavzema kar 85% celotne dolţine tankega ĉrevesa,
vitega ĉrevesa (ileum), ki predstavlja konĉni, distalni del tankega ĉrevesa (Ewing,
2008).
Stena tankega ĉrevesa (slika 2) je sestavljena iz štirih plasti (tunik): sluznice (mukoza) in
podsluznice (submukoza), gladko-mišiĉnega sloja (muscularis externa) in seroze (Ewing in
Cole, 1994; Pocajt in Širca, 1997).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
6
Slika 2: Prerez stene tankega ĉrevesa (povzeto po Histologija tankega ĉrevesa, 2016)
Mukoza (sluznica) tankega ĉrevesa (slika 2) je sestavljena iz treh slojev: epitelni sloj, rahlo
vezivno tkivo (lamina proprija) in mišiĉna plast sluznice (muscularis mucosae) (Pocajt in
Širca, 1997; Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ in Zorc, 2005; Tanko ĉrevo, 2015).
Epitelni sloj ali epitelij (epithelium) je sluznica, ki jo tvorijo enoskladne visokoprizmatske
vpojne celice, imenovane enterociti in gobletove celice. Izloĉajo sluz (mukus), ki šĉiti
epitelij. Mukus med drugimi sestavljajo glikoproteini in imunoglobulini. Vse epitelijske
celice sluznice tankega ĉrevesa nastanejo iz istih izvornih celic, ki so na dnu vdolbinic oz.
Liberkühnovih kript. Ĉrevesni epitelij se nenehno obnavlja, saj se vsak dan odlušĉi in na
novo razvije veĉ kot milijarda epitelijskih celic (Pocajt in Širca, 1997; Kocijanĉiĉ in sod.,
2005; Petroviĉ in Zorc, 2005; Tanko ĉrevo, 2015).
Ĉrevesni epitelij je sluznica z najveĉjo površino, v kateri se usklajeno odvijajo prebava,
absorpcija, endokrine in imunske funkcije. Epitelne celice izloĉajo sluz (mukus), ki šĉiti
prebavni trakt in tudi omogoĉa razliĉnim bakterijam, da se pripenjajo in se tako v ĉrevesju
zadrţijo dalj ĉasa. Te bakterije lahko pomagajo pri razgrajevanju hrane ter sodelujejo pri
vzpostavljanju, delovanju in obnovi imunskega sistema (Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ
in Zorc, 2005; Pocajt in Širca, 1997; Tanko ĉrevo, 2015).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
7
Lamino proprio je pomembna bariera proti vdoru patogenih bakterij. Tvorijo jo limfociti,
makrofagi in mnoge druge celice, ki so del ĉrevesnega imunskega sistema in sodelujejo pri
imunskem odzivu. V Lamino proprio se skoraj do mišiĉne plasti sluznice med resicami
vdirajo jamice epitelija, imenovane Liberkühnove kripte. Izloĉajo baziĉen ĉrevesni sok, z
veliko koliĉino sluzi in encimov, potrebnih za razgradnjo hrane. Ĉrevesni sok tu izloĉajo
tudi številne ţleze (Pocajt in Širca, 1997; Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ in Zorc, 2005).
Sluznica (tunica mucosa) ima zaradi velike površine veliko absorptivno (vsrkovalno in
izloĉevalno) sposobnost. (Kocijanĉiĉ in sod., 2005 in Petroviĉ in Zorc, 2005). To
poveĉanje ji omogoĉajo tri vrste gub, iz katerih je sestavljena:
1) Kerckringove gube (plicae circulares) (Slika 2) so gube, ki potekajo preĉno glede na
luminalno površino tankega ĉrevesa, ter so spiralaste, kroţne oblike. Nahajajo se v
dvanajstniku, najbolj izrazite so v tešĉem in v prednjem delu vitega ĉrevesa, nato se
zniţujejo in proti koncu tega izginejo. S pomoĉjo peristaltike mešajo zauţito hrano,
absorptivno površino pa poveĉajo za 3-krat (Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ in Zorc,
2005).
2) Ĉrevesne resice ali vili (villi intestinales) (Slika 3) so izrastki sluznice, visoki okrog 1
mm, ki podobni prstkom segajo daleĉ v lumen ĉrevesa. Absorptivno površino sluznice
poveĉajo za 10-krat. Prekrivajo jih epitelne celice (epitelij), veĉinoma sestavljen iz
absorptivnih enterocitov. Sredino resic zapolnjujejo prepletena ţivĉna vlakna, krvne ţilice,
limfne kapilare, gladke mišiĉne celice in rahlo vezivo z limfociti. Najpogostejše in najvišje
so v zaĉetku dvanajstnika, do konca vitega ĉrevesa se postopoma skrajšajo, razredĉijo in
tako zmanjšajo tudi površino resic (Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ in Zorc, 2005). Na
velikost resic vplivajo prehrana, starost in vrsta ţivali, ter izloĉki ţelodca, trebušne
slinavke in jeter. Dokazano je, da se prašiĉem po odstavitvi zaradi stresa resice skrajšajo
(Ewing in Cole, 1994), prav tako so zapisi o popolni deformaciji resic in kript pri ĉloveku z
boleznijo imenovano celiakija (Dolinšek in sod., 2006).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
8
Slika 3: Ĉrevesna resica in mikroresice (povzeto po Resica-zgradba, 2016)
Pri pujskih so v fetalnem obdobju resice ozke, nepravilnih višin in sorazmerno redke. Prvih
deset dni po rojstvu pa se moĉno poveĉata masa tankega ĉrevesa in masa sluznice. Moĉno
se poveĉujeta tudi premer in dolţina tankega ĉrevesa (Cranwell, 1995). Po pribliţno 14.
dnevu ţivljenja je morfologija tankega ĉrevesa pri pujskih podvrţena velikemu zmanjšanju
mase resic in hkrati poveĉanju širine resic in kanalov kript. Med odstavitvijo pa so
spremembe še veĉje (Cranwell, 1995).
Med resicami so vdolbinice, imenovane Lieberkühnove kripte (glandulae intestinales)
(slika 2). To so cevaste ĉrevesne ţleze, ki izloĉajo baziĉni ĉrevesni sok z veliko sluzi in
encimi, potrebnimi za razgradnjo hrane. Tudi kripte poveĉajo absorpcijsko površino
ĉrevesa. Vsebujejo pri regeneraciji tkiva pomembne ĉrevesne izvorne oz. matiĉne celice, ki
so osnova za nastanek razliĉnih vrst epitelijskih celic (enterocitov, ĉašastih celic,
enteroendokrinih celic) (Pocajt in Širca, 1997; Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ in Zorc,
2005; Tanko ĉrevo, 2015; The Histology Guide, 2016).
3) Mikroresice ali mikrovili (Slika 3) se nahajajo na epitelijskih celicah oz. enterocitih
resic. Vsaka celica ima od 3000 do 7000 mikroresic. Absorptivno površino tankega ĉrevesa
poveĉajo za 20-krat. Dolge so pribliţno 1 µm, njihov premer pa je 0,1 µm. Prekriva jih
posebna plazemska membrana, kjer so prisotni tudi glavni sluzniĉni prebavni encimi (npr.
aminopeptidaze, lipaze, disaharidaze) (Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ in Zorc, 2005,
The Histology Guide, 2016).
Submukozo (Slika 2) sestavljajo vezivno tkivo, krvne in limfne ţile, ţivci, ţivĉni vozli,
lahko tudi mašĉobne celice. Tu so Brunnerjeve ţleze, ki izloĉajo viskozno tekoĉino, ki šĉiti
proksimalni del tankega ĉrevesa in nevtralizira kislo vsebino, ki pride iz ţelodca
(Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Petroviĉ in Zorc, 2005).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
9
Mišiĉni sloj (Slika 2) je iz vzdolţne in kroţne mišiĉnine. Te mišice omogoĉajo
peristaltiĉno gibanje ob procesu prebave, saj se ritmiĉno krĉijo. Medtem ko vzdolţna
mišiĉnina s krĉenjem prestavlja vsebino ĉrevesa naprej proti debelemu ĉrevesu, kroţna
mišiĉnina omogoĉa stik s sluznico ter meša ĉrevesno vsebino s prebavnimi sokovi
(Petroviĉ in Zorc, 2005; Pocajt in Širca, 1997).
Seroza (Slika 2) sestoji iz plošĉatega epitelija na zunanji strani tankega ĉrevesa. Razen
proti koncu dvanajsternika, je sicer prisotna po vsej dolţini tankega ĉrevesa (Petroviĉ in
Zorc, 2005).
Ko delno prebavljena hrana prispe v tanko ĉrevo, se tu izvrši pomemben, dokonĉen del
prebave. Razgradnja krme poteka s pomoĉjo ţolĉa, izloĉkov trebušne slinavke in
dvanajstnika. Ogljikovi hidrati in mašĉobe se cepijo na osnovne sestavne dele, ki jih stena
tankega ĉrevesa absorbira, nato potujejo do jeter in kasneje v krvni obtok. Pomembna je
mikrobna fermentacija (tako pri monogastriĉnih ţivalih, še bolj pa pri preţvekovalcih) in
proizvodnja encimov ter hormonov. Številĉnost mikrobiote proti debelemu ĉrevesu
narašĉa. Tu poteka glavni del absorpcije konĉnih produktov prebavnih procesov.
Absorpcija pa poteka laţje zaradi resic (Ewing in Cole, 1994).
Glavne fiziološke naloge tankega ĉrevesa so torej prebava hrane in absorpcija hranil,
elektrolitov in vode, pomembne pa so tudi metabolna, endokrina (tvorba hormonov),
imunska (obramba pred bakterijami, endotoksini in antigeni), ţivĉna (tvorba
nevrotransmiterjev) in sekretorna dejavnost (Kocijanĉiĉ in sod., 2005; Ross in sod., 2004;
Ovejero in Negri, 1993).
Debelo ĉrevo
Debelo ĉrevo je sestavljeno iz slepega ĉrevesa (caecum), debelega ĉrevesa (kolon), danke
(rektum) in anusa.
Debelo ĉrevo nima resic, ima pa tankemu ĉrevesu podobno histološko zgradbo, vendar
debelejšo sluznico z globljimi kriptami. Epitelij ne vsebuje Panethovih celic, katerih
funkcija v tankem ĉrevesu je tudi zašĉita izvornih celic, protimikrobno delovanje in
vzdrţevanje ĉrevesne intestinalne pregrade. Je pa epitelij debelega ĉrevesa zgrajen iz
kolumnarnih absorptivnih (vpojnih) celic s progastimi mejami, veliko gobletovih (ĉašastih)
in endokrinih celic, in pa matiĉnih celic, toda ne Panethovih. Površinske epitelne celice so
obrnjene v lumen in se tedensko obnavljajo. Lamina proprija in submukoza sta podobni kot
v tankem ĉrevesu. Zunanji mišiĉni sloj debelega ĉrevesa je iz treh vzdolţnih plasti gladkih
mišic, pri anusu pa kroţne mišice tvorijo analni sfingter (The Histology Guide, 2016;
Ewing, 2008).
Dokonĉen razkroj hrane v debelem ĉrevesu omogoĉa veĉ milijard tu ţiveĉih bakterij. Pri
tem nastajajo plini ogljikov dioksid, vodik, vodikov sulfid in metan. Sluznica v debelem
ĉrevesu izloĉa sluz, ki maţe iztrebke in jim lajša pot, protitelesca v njej pa organizem
šĉitijo pred bakterijskimi okuţbami. Ne izloĉa pa prebavnih sokov in encimov, saj je
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
10
prebava hrane tukaj ţe konĉana, dokonĉna razgradnja neprebavljenih sestavin pa je
odvisna od bakterij (Rebesko, 1983; Ĉerne, 1996; Petroviĉ in Zorc, 2005; McDonald in
sod., 2010).
Funkcije debelega ĉrevesa so resorpcija vode, natrija in nekaterih vitaminov, iz kaše,
katera prihaja iz tankega ĉrevesa, pa mora tvoriti iztrebke, ter vse do izpraznitve zadrţevati
blato (McDonald in sod., 2010).
2.2 MIKROBIOTA PREBAVNEGA TRAKTA
Ĉrevesna mikrobiota vsebuje raznolike mikroorganizme, ki naseljujejo prebavila. Sem
spadajo poleg bakterij tudi virusi, glive in arheje, ki so prav tako obiĉajni prebivalci
ĉrevesja (Quigley, 2013).
Mikrobiota predstavlja enega izmed najbolj izpopolnjenih mikrobnih ekosistemov. Pri
vsakem posamezniku je mikrobiota stabilna in zanj specifiĉna. Število mikroorganizmov
narašĉa vzdolţ prebavne poti. Pri zdravem osebku prevladujejo zdravju koristni
mikroorganizmi, prisotnih pa je tudi nekaj patogenov (Rajilić Stojanović in de Vos, 2014;
Qin in sod., 2010; Ley in sod., 2006).
Študij ĉrevesne ekologije je postal eden najbolj atraktivnih. Sodobne, molekularno
genetske metode odkrivajo tudi tiste vrste, ki jih s klasiĉnimi mikrobiološkimi metodami ni
bilo moţno videti (Scheinbach, 1998; Dunne in sod., 2001). Pri ĉloveku je znanih ĉez 1000
razliĉnih filotipov ĉrevesnih bakterij, od katerih je veĉji del striktnih anaerobov (Qin in
sod., 2010; Rajilić Stojanović in de Vos, 2014). Mikrobna populacija prebavnega trakta je
zelo dobro prilagojena na okolje gostitelja, med posamezniki in razliĉnimi starostnimi
skupinami pa se zelo razlikuje. Vsaka sprememba v mikrobnem ravnoteţju lahko povzroĉi
preobrat iz koristnega v škodljivo delovanje (saj mikrobiota prispeva tako k homeostazi
zdravja, kot patogenezi bolezni (Quigley, 2013).
Bakterije vstopajo v telo skozi ustno votlino in nadaljujejo pot po prebavnem traktu. V
ţelodcu jih veĉinoma uniĉi ţelodĉni sok, zato jih ostane le malo, najpogosteje po Gramu
pozitivne fakultativno anaerobne bakterije, npr. Streptococcus, Staphylococcus in
Lactobacillus. Podobna, vendar številĉnejša je nato populacija bakterij v tankem ĉrevesu
(dvanajstnik in tešĉe ĉrevo). Najveĉ je po Gramu pozitivnih aerobov, nekaj pa je tudi
koliformnih in anaerobnih bakterij (Goldin in sod., 1988).
Bakterije so prokariotski organizmi. Se hitro namnoţujejo (npr. generacijski ĉas bakterije
E. coli je v ugodnih pogojih 15-20 minut), zaradi svoje majhnosti pa so izredno
prilagodljive. Lahko so sferiĉne, paliĉaste ali zavite oblike, glede na delitev nastanejo tudi
pari (diplokoki), grozdasti skupki (stafilokoki), veriţice (streptokoki, streptobacili) ali
paketi po 4 do 8 celic (sarcine) (Smole-Moţina in Marić, 1992). Bakterije se glede na
razlike v zgradbi celiĉne stene, ki jih ugotovimo z diferencialnim barvanjem po Gramu,
delijo v dve veliki skupini: po Gramu pozitivne (G+) in po Gramu negativne (G-
).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
11
Naseljenost z mikrobioto v prebavnem traktu ĉloveka, ki je zelo podoben prašiĉjemu,
narašĉa od zelo redko naseljenega ţelodca, prek dvanajstnika in tankega ĉrevesa do obilno
naseljenega debelega ĉrevesa. Tekom ţivljenja sta število in sestava bakterijske zdruţbe
vzdolţ prebavil spremenljiva. Skupno število bakterij v ţelodcu je obiĉajno pod 104
kolonijskih enot /g vsebine (CFU/g; colony forming units), od tega je število bifidobakterij
(BF) do 102
CFU/g, laktobacilov (LB) do 103
CFU/g. Vzrok nizkemu številu je kisla
vsebina (Goldin in sod., 1988; Teskaĉ in sod., 2008; Medigan in Martinko, 2005).
V tankem ĉrevesu najdemo razliĉno veliko bakterij glede na predel. Do 104 KE/ml vsebine
jih je v zaĉetnem delu, do 105 KE/g v jejunumu, sledi ileum z 10
4-10
9 CFU/g bakterij.
Glavni omejitveni dejavnik za poselitev bakterij v tankem ĉrevesu je hiter prehod hrane, ter
izloĉki ţolĉa in pankreasnih encimov (Goldin in sod., 1988; Teskaĉ in sod., 2008; Medigan
in Martinko, 2005).
Debelo ĉrevo je precej gosteje poseljen mikrobni ekosistem. Gram vsebine vsebuje od 109
do 1012
KE bakterij. Prevladujejo anaerobne bakterije, ki jih je veliko veĉ kot aerobnih.
Koliĉinsko sta tako pri ţivalih kot pri ĉloveku najpomembnejši skupini Bacteroides (do
30%) in bifidobakterije (do 25%). Številĉno prevladujejo po Gramu negativne vrste
Bacteroides (npr. Bacteroides ovatus, Bacteroides fragilis in Bacteroides
thetaiotaomicron). V tem rodu so tako proteolitiĉne kot saharolitiĉne vrste. Najštevilĉnejše
anaerobne bakterije so predstavnice Bacteroides, Bifidobacterium, Fusobacterium,
Clostridium, Eubacterium, Peptococcus in Peptostreptococcus. V manjšem obsegu so
prisotne še številne druge vrste (Goldin in sod., 1988; Teskaĉ in sod., 2008).
Slika 4: MO prebavnega trakta (povzeto po Mikroorganizmi prebavil, 2016)
Nekateri mikroorganizmi rastejo na površini resic (epitelija), drugi ţivijo prosto v lumnu
ĉrevesja, tretji pa se razrašĉajo po kanalih kript in po epiteliju. V vsakem posamezniku se
vzpostavi znaĉilna zdruţba bakterij, ki so med seboj v ravnovesju. Za to ravnovesje skrbi
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
12
stalna selekcija s snovmi okolja prebavil, kot npr. vodikov sulfid, hlapljive mašĉobne in
ţolĉne kisline, lizolecitin, lizocin in imunoglobini. Razen tega se morajo bakterije
spopadati še s konstantnim peristaltiĉnim gibanjem hrane iz prednjih delov ĉrevesja proti
zadnjim. V ĉrevesju jim uspe ostati, ĉe se razrašĉajo hitreje, kot poteka sama peristaltika
ĉrevesja, ali ĉe se veţejo na epitelne celice ĉrevesja (Fuller in Cole, 1988).
Pri mleĉnokislinskih bakterijah, vkljuĉno z bifidobakterijami, je bilo dokazano, da lahko
ovirajo vezavo in/ali invazijo patogenov na ĉrevesnih epitelnih celicah. Vezava je prvi
pogoj za kolonizacijo gastrointestinalne ĉrevesne sluznice, zaviranje vezave pa je lastnost,
ki lahko pomaga prepreĉiti ali zmanjšati infekcijo (Bogoviĉ Matijašić in sod., 2006).
Mikroorganizmi, ki naseljujejo sluznico, predstavljajo uĉinkovito oviro za patogene
bakterije, saj zasedajo mesta pripenjanja in s tem prepreĉujejo njihovo vezavo na sluz ali
ĉrevesne epitelne celice, proizvajajo protimikrobne snovi in tekmujejo s patogenimi
bakterijami za hranilne snovi (Vaughan in sod., 1999). Raziskave kaţejo, da tudi
uravnavajo homeostazo gostiteljevih obrambnih mehanizmov, ter da obstaja komunikacija
med mikroorganizmi, ĉrevesnimi epitelnimi celicami in imunskimi celicami.
Bakterije, ki prebivajo na površini ali v notranjosti sluznice, sodelujejo v interakcijah z
imunskim sistemom gostiteljice, medtem ko so tiste, ki prosto zapolnjujejo lumen,
dejavnejše pri presnovi hrane in interakcijah s presnovki. Ţivijo v soţitju z gostiteljem in
korist je obojestranska. Ni dvomov o tem, da imajo velik pomen pri ohranjanju zdravja in
razvoju bolezni. Problem pri raziskovanju predstavlja nedostopnost populacij v tankem in
debelem ĉrevesu, zato je bila veĉina raziskav ĉrevesne mikrobiote narejena na podlagi
fekalnih vzorcev, kar pa predstavlja veliko omejitev, saj ne pokaţe popolne slike dogajanja
v ĉrevesju (Carroll in sod., Chang, Y. H., Packey, C. D., Sartor, E. B., Ringel Y. 2011;
Swidsinski in sod., 2005; Quigley, 2013).
Mikrobioti v prebavilih pripisujemo vrsto uĉinkov na gostitelja, med katerimi so
najpomembnejši naslednji:
uĉinkovanje na bakterije v prebavilih s kislinami (mleĉna, ocetna, maslena,
propionska kislina) in vodikovim peroksidom protimikrobnimi snovmi
(bakteriocini in drugimi), ki jih izloĉajo,
tekmovanje s patogenimi mikrobi za vezna mesta na sluznicah (npr. E. coli s K88
antigenom),
tekmovanje za hranila,
spodbujanje imunskega sistema,
vpliv na imunski sistem.
Vsaka sprememba v mikrobnem ravnoteţju lahko povzroĉi preobrat iz koristnega v
škodljivo delovanje. Do škodljivega delovanja pa privede tudi prehajanje bakterij skozi
sluznico ĉrevesja ob nepravilnem delovanju sluzniĉne ovire. Dokazi na ţivalih kaţejo, da
so vzroki za prehajanje poveĉana prepustnost ĉrevesne sluznice, prehitra rast bakterij v
tankem ĉrevesu in nepravilnosti v imunski zašĉiti gostitelja. Ţivi MO, ki z limfo pridejo v
notranje organe, npr. jetra, se lahko razširijo po vsem telesu in povzroĉijo sepso, odpoved
organov, šok ali smrt. Ciroza jeter, pankreatitis, ĉrevesna vnetja in ĉrevesno zaprtje so
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
13
bolezni, pri katerih prihaja do poveĉanega prehajanja bakterij (Guarner in Malagelada,
2003).
Na sestavo in delovanje mikroorganizmov torej vplivajo gostitelj, bakterijski dejavniki in
okolje. Vlogo mikrobiote, ki jo lahko smatramo kar za organ, pri vzdrţevanju zdravja
oziroma razvoju bolezni, so v preteklosti podcenjevali. Številna nova dognanja pa kaţejo
na povezave med bolezenskimi stanji in mikrobioto ter odpirajo moţnosti za terapevtsko
uporabo mikroorganizmov, preko spreminjanja mikrobiote (Quigley, 2013; Marchesi in
sod., 2016).
2.2.1 Razvoj mikrobiote pri prašičih
Ob rojstvu je ĉrevesje pujskov sterilno in predstavlja idealen medij za hitro razrast bakterij,
ki jih ţival dobi iz okolja (Maxwell in Stewart, 1995; McDonald in sod., 2010). Ţe po treh
urah je prisotna manjša populacija mikroorganizmov. Pri veĉini ţivali najprej kolonizirajo
ĉrevo nepatogeni sevi vrste Escherichia coli, ter predstavniki rodov Streptococcus in
Lactobacillus. Kasneje, ko aerobne bakterije porabijo kisik, postanejo dominantne
anaerobne bakterije, npr. Clostridium. 10-12 ur po rojstvu vsebuje 1 g blata ţe 108 - 10
9
bakterij. Laktobacili postanejo glavni prebivalci ţelodca in tankega ĉrevesa po prvem
dnevu. Prisotnost Bacteroides sp. je opaţena šele 32 ur po rojstvu, po tem ĉasu pa
predstavljajo najštevilĉnejši deleţ uravnovešene mikrobiote debelega ĉrevesa (Maxwell in
Stewart, 1995).
Novorojeni prašiĉek pridobi mikrobioto v porodnem kanalu, iz bliţnje okolice, glavni vir
pa predstavlja materino blato. Doloĉene bakterije imajo lastnosti, ki jim omogoĉijo dobro
tekmovalnost, zaradi ĉesar njihovo število zelo poraste, tako da predstavljajo glavni del
mikrobiote. Problemi se lahko pojavijo s prisotnostjo patogenih mikroorganizmov, ki pa
motijo razvoj normalne mikrobiote (Maxwell in Stewart, 1995). Škodljive, strupene ali
patogene bakterije, ki kolonizirajo v prebavnem traktu, proizvajajo strupene odpadne
produkte, ti pa vodijo k plinjenju, napenjanju, driski, zaprtju, razjedam ali zastrupitvi s
hrano (FEFANA). S probiotiki lahko na naraven naĉin zajezimo to invazijo patogenov.
Koristni mikroorganizmi proizvajajo encime, ki dopolnjujejo prebavne sposobnosti
gostitelja, njihova prisotnost pa predstavlja oviro pred preplavitvijo patogenov (Yirga,
2015).
Pri prašiĉih poteka glavni del mikrobne prebave v debelem ĉrevesu, kjer sodelujejo
mikroorganizmi. Pred tem prebavni encimi mikrobiota tankega ĉrevesa ţe opravijo svojo
nalogo. Lastno amilazo vsebujejo samo nekatere vrste, npr. Bifidobacterium bifidum,
Streptococus equinus, S. bovis, Clostridium butyricum in Cl. perfingens, medtem ko veĉina
vrst ĉrevesnih bakterij pri prašiĉih razgrajuje monosaharide (fruktozo, glukozo in
galaktozo). Bakterije vrste Cl. butyricum pri prašiĉu predstavljajo glavni izvor alfa-amilaze
v debelem ĉrevesu, v slepem ĉrevesu pa se z njihovo pomoĉjo prebavi surovi škrob. Kuhan
škrob se prebavi ţe v tankem ĉrevesu. Laktobacili in streptokoki fermentirajo maltozo in
maltotriozo do mleĉne kisline iz katere kasneje nastanejo hlapne mašĉobne kisline. Prašiĉ
nima lastnih celulolitiĉnih encimov, zato mikrobiota pomembno prispeva k prebavi hrane
(Ĉerne, 1996).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
14
2.3 PROBIOTIKI
2.3.1 Definicija
Izraz probiotik, z današnjim pomenom, je prvi uporabil Parker leta 1974 (cit. po Fuller,
1992). Probiotike je oznaĉil kot organizme in snovi, ki prispevajo k ĉrevesnemu
mikrobnemu ravnoteţju. Izraz je uporabil za opis dodatkov ţivalski krmi, ki pospešujejo
rast. Parkerjevo definicijo je preoblikoval Fuller (2006), ki je opisal probiotike kot ţive
mikrobne dodatke krmi, ki ugodno vplivajo na ţival gostiteljico, z izboljšanjem njenega
ĉrevesnega mikrobnega ravnoteţja. Dolgo je bila definicija omejena samo na uporabo v
ţivalski prehrani.
Razširitev definicije na uporabo v ĉloveški prehrani je prispevala k razvoju in dodajanju
probiotikov na razliĉnih podroĉjih (respiratorni trakt, urogenitalni trakt, koţa). Po Huis in't
Veldu in Havenaarju (1991) se glasi opis probiotikov kot »mono- ali mešanih kultur ţivih
mikroorganizmov, ki uĉinkujejo koristno na ĉloveka in ţival z izboljšanjem lastnosti
obstojeĉe (lastne) mikrobiote«.
Leta 1988 sta Guarner in Schaafsma zapisala, da so to ţivi mikroorganizmi, ki ob zauţitju
ob zadostni koliĉini pozitivno delujejo na zdravje neposredno, ali posredno z okrepitvijo
fizioloških oziroma obrambnih mehanizmov. Kasneje je bil uveden tudi pojem probiotiĉno
aktivna snov, saj so ugotovili, da stimulacija imunskega sistema ni omejena zgolj na ţive
celice, kot je bilo najprej mišljeno, ampak gre za celiĉne komplekse (mrtve celice ali dele
celic) mleĉnokislinskih bakterij ali drugih probiotiĉnih mikroorganizmov, ki tudi vplivajo
na imunski odgovor in na funkcijo ĉrevesne sluznice (Naidu in sod., 1999).
Danes uveljavljena definicija probiotikov, ki sta jo sprejeli tudi organizaciji FAO in WHO,
pravi, da so to ţivi MO, ki ob zauţitju v zadostni koliĉini pozitivno delujejo na zdravje
gostitelja (FAO/WHO, 2001; Hill in sod., 2014).
2.3.2 Zgodovina probiotikov
Uţivanje hrane z mikrobiološko aktivnostjo se je zaĉelo ţe v zaĉetku ĉloveške civilizacije.
Fermentirano mleko je najverjetneje bilo prvo ţivilo, ki je vsebovalo aktivne
mikroorganizme. Znanstvene raziskave o pozitivnih uĉinkih uţivanja fermentiranih
mleĉnih izdelkov pa so se priĉele v zaĉetku 20. stoletja (Jimenez, 2010; Yirga, 2015).
Konec 19. stoletja so bili narejeni zapisi o prvi uporabi mikroorganizma Bacterium terumo.
Te bakterije je Arnold Canani pri zdravljenju pljuĉne tuberkuloze s sprejem neposredno
vnesel v pljuĉa in ugotovil pozitivne uĉinke (Fuller, 1999).
V zaĉetku prejšnjega stoletja so ugotovili, da Bolgari povpreĉno ţivijo dalj ĉasa, kar naj bi
bilo posledica uţivanja jogurta. Nobelov nagrajenec Ilija Metchnikov, ki je takrat deloval
na Pasteurjevem inštitutu v Parizu, je pojasnjeval, da Lactobacillus bulgaricus in
Streptococcus thermophilus iz jogurta izpodrineta ĉrevesne mikrobe, ki proizvajajo toksine
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
15
(avtointoksikacija). Deloma je bila kasneje trditev ovrţena, saj organizmi iz jogurta v
ĉrevesu ne preţivijo najbolje, okrepilo pa se je prepriĉanje, da je uţivanje teh in drugih
mleĉnokislinskih mikroorganizmov zelo koristno (Fuller, 1999; Jimenez, 2010). Delo
Metchnika je vodilo do sodobnih jogurtov, pridobljenih iz mleka, fermentiranega z
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus in Streptococcus thermophilus (Fuller, 1999).
Danes vemo, da ti dve vrsti ponavadi uporabljajo in sta tipiĉni za jogurte, vendar pa slabo
preţivita.
Japonci so leta 1930 s sevom Lactobacillus casei priĉeli pripravljati limonin mleĉni
napitek Yakult. Ta je petinšestdeset let kasneje prišel tudi na evropsko trţišĉe in je prvi
izmed t.i. funkcionalnih ţivil (Reid, 2015).
Do intenzivnejšega trgovanja s probiotiki je prišlo šele po letu 1960, ko so jih zaĉeli
uporabljati pri farmskih ţivalih. Leta 1968 je King dosegel pomembno poveĉanje rasti pri
prašiĉih z dodajanjem Lactobacillus acidophilus krmi ţivali (Fuller, 1999).
Objave Swann Committee v zvezi z zlorabljanjem antibiotikov v veterinarski praksi in
prireji ţivali leta 1969 so spodbudile nadaljnjo uporabo probiotikov za farmske ţivali.
Predlagano zmanjšanje uporabe antibiotikov v ţivalski prehrani, kjer ti niso uporabljeni v
terapevtske namene, je spodbudilo razvoj probiotikov za ţivali (Fuller, 1999).
Nasprotovanje uporabi antibiotikov je povzroĉala tudi skrb po zmanjšanju njihovih
stranskih uĉinkov, npr. diareji, ki pogosto spremlja tako zdravljenje. Vedeli so tudi, da
antibiotiki sicer lahko zmanjšajo kolonizacijo ĉrevesja pišĉancev s salmonelo, a se ustvari
problem ogroţenosti zdravja ljudi zaradi širjenja rezistence proti antibiotikom med
bakterijami. Pravkar izvaljeni pišĉanĉki so lahko zavarovani pred kolonizacijo salmonele v
ĉrevesju, ĉe jim predhodno dajemo suspenzijo preparata ĉrevesne vsebine zdravih odraslih
pišĉancev. To spoznanje Nurme in Rantala iz leta 1973 je predstavlja naslednji mejnik v
razvoju probiotikov za ţivali (Fuller, 1999).
Podpora probiotikom je prihajala tudi s strani lobijev, usmerjenih proti prekomerni uporabi
aditivov v prehrani, ki so antibiotike videli kot tuje substance, katere ne bi smele biti
prisotne v krmi ţivali, medtem ko so probiotiki predstavniki mikroorganizmov, ki so
naravnoprisotni v favni in v ĉrevesju zdravih ţivali brez kakršnegakoli škodljivega uĉinka
(Fuller, 1999).
V ZDA so Rettger in njegovi sodelavci v prepriĉanju, da je kolonizacija in rast v ĉrevesju
prvi pogoj probiotiĉne aktivnosti, uporabili ĉrevesne izolate vrste L. acidophilus. Vse veĉje
poznavanje ĉrevesne mikrobiote pokazalo, da je mleĉnokislinska mikrobiota ĉrevesja
veliko bolj obseţna in zapletena, kot so vedeli v preteklosti, in zato tudi dopušĉa uporabo
velikega števila razliĉnih rodov mikroorganizmov (Fuller, 1999).
2.3.3 Pogoji, uporaba probiotikov
Probiotiki so mikroorganizmi, ki pomagajo vzpostaviti ĉrevesno mikrobioto ţivali in ljudi
v uravnovešeno stanje (Fuller, 1999). Poznamo bakterijske probiotike, kulture kvasovk in
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
16
plesni ter kombinirane pripravke. Najpomembnejšo skupino probiotiĉnih bakterij
predstavljajo mleĉnokislinske bakterije (MKB), katere veljajo za varne bakterije (Rogelj in
Bogoviĉ Matijašić, 2004). MKB so prisotne tudi v prebavilih ţivali in ljudi. Sevi, ki so
najpogosteje v probiotiĉnih izdelkih, so predstavniki vrst Lactobacillus acidophilus (na
primer sev La5), L. casei (predvsem sev Shirota), L. rhamnosus (naprimer sev GG),
Bifidobacterium bifidum in Bifidobacterium animalis ssp. lactis (naprimer sev BB12). Za
probiotiĉne lahko razglasimo le tiste seve MKB, pri katerih so bili uĉinki dokazani.
Bakterijski sev, ki ga uporabljamo kot probiotiĉni, mora tekmovati z obstojeĉo mikrobioto
za hranljive snovi, atmosferske potrebe in mesta pripenjanja na ĉrevesni epitelij.
Izbira probiotika vedno temelji na kriterijih, ki vkljuĉujejo varnost in kliniĉne uĉinke.
Potrebno je:
poznati vrsto in lastnosti, ki so povezane z varnostjo (izvor, identifikacija,
karakterizacija, virulenca, invazivnost, rezistenca proti antibiotikom),
prouĉiti farmakokinetiĉne lastnosti seva (preţivetje in aktivnost v ĉrevesu, vezava
in s tem kolonizacija, moţna invazivnost, odnos med odmerkom in uĉinkom),
raziskati interakcije med sevom in gostiteljem (vezava na ĉrevesno tkivo,
selektivna stimulacija koristnih bakterij in zaviranje škodljivih,
stimulacija/supresija imunskega odgovora, kliniĉni stranski uĉinki). Vedno veĉ
pozornosti je namenjeno varnosti probiotikov (FAO/WHO, 2002).
Posebno pozornost pri prouĉevanju varnosti je treba posvetiti enterokokom, ki jih
uporabljajo kot probiotike. Posamezniki tega rodu so namreĉ lahko patogeni, nekateri pa so
tudi sposobni prenesti gene za odpornost proti antibiotikom (vankomicin) na druge
mikroorganizme (Franz in Holzapfel, 2004).
2.3.4 Probiotiki za živali
Probiotike za ţivalih uporabljajo za ponovno vzpostavitev uravnoteţene mikrobiote, ki je
bila prizadeta zaradi razliĉnih negativnih dejavnikov okolja. Bolezni z njimi ni moţno
pozdraviti in prav tako probiotiki niso specifiĉni za posamezno bolezen, kot je to pri
zdravilih, ki jih uporabljajo v veterinarski medicini. Zato probiotikov ne predpisujejo
veterinarji. Delovanje probiotikov na gostitelja vkljuĉuje neposredne uĉinke na mikrobioto,
ali posredne uĉinke, vkljuĉno z nekaterimi, ki se lahko pojavijo znotraj tkiv gostitelja, kot
npr. imunski odgovor (SCAN, 2000; Matsuzaki, 1998; Dunne in sod., 1999). Pri ţivalih je
zanimiva predvsem kontrola moţnih patogenov (Tortuero in sod., 1995), z namenom
prepreĉevanja bolezni in smrti, še posebej pri mladih prašiĉih. Ugodno delovanje mikrobov
se kaţe tudi preko kakovosti ţivalskih proizvodov(Vanbelle, 2001).
Mikroorganizmi, prisotni v probiotikih za ţivali, so izbrani na podlagi raziskav.
Najpogosteje so to predstavniki rodov Lactobacillus, Bifidobacterium, Streptococcus,
Pediococcus in Enterococcus. Te skupine, skupaj z Bacillus sp., kvasovkami in nitastimi
glivami, so glavne komponente probiotikov, danes splošno uporabljenih pri farmskih
ţivalih. Razliĉni probiotiĉni preparati lahko vsebujejo samo en sev, ali pa vsebujejo mnogo
sevov in imajo tako širši spekter delovanja (Fuller, 1999; Yirga, 2015).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
17
Probiotiki, ki se obiĉajno uporabljajo v prehrani ţivali, so prikazani v preglednici 2.
Preglednica 2: Probiotiki, obiĉajni v ţivalski prehrani (Yirga, 2015)
Rod Vrsta
Bifidobacterium B. lactis
B. longum
B. pseudolongum
B. thermophilum
B. bifidum
Enterococcus E. faecalis
Lactobacillus L. acidophilus
L. amylovorus
L. brevis
L. casei
L. farciminis
L. fermentum
L. plantarum
L. reuteri
L. rhamnosus
Lactococcus L. lactis
Leuconostoc L. citreum
L. lactis
L. mesenteroides
Pediococcus P. acidilactici
P. pentosaceus subsp. pentosaceus
Streptococcus S. infantarius
S. salivarius
Bacillus B. cereus
B. licheniformis
B. subtilis
Saccharomyces S. cerevisiae (S. boulardii)
S. pastorianus (S. carlsbergensis)
Aspergillus A. oriza
A. niger
Rod Bifidobacterium taksonomsko sicer ne pripada mleĉnokislinskim bakterijam, vendar
pa ima nekaj sorodnih lastnosti (npr. so po Gramu pozitivne, fermentativne, tvorijo laktat)
in si delijo z MKB iste ekološke niše zato jih pogosto povezujejo. Probiotikom podobne
uĉinke imajo tudi kvasovke (npr. S. boulardii) (Saarela in sod., 2002).
Fuller (2006) je navajal številne potencialne dobrodejne uĉinke probiotikov pri farmskih
ţivalih:
boljša odpornost ţivali proti infekcijskim boleznim,
poveĉan prirast,
izboljšana konverzija krme,
izboljšana prebava,
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
18
veĉja sposobnost absorpcije hranilnih snovi,
boljša oskrba z esencialnimi hranilnimi snovmi,
poveĉanje mleĉnosti,
izboljšana kakovost mleka,
poveĉana produkcija jajc,
izboljšana kakovost jajc,
izboljšana kakovost klavnih trupov,
manjše onesnaţevanje.
Dejansko so se probiotiki najbolj izkazali pri prepreĉevanju in kot podporna terapija pri
infekcijah s patogenimi mikroorganizmi, kot so E. coli, Salmonella, Campylobacter,
Clostridium in rotavirusi. Tako prispevajo k zmanjšanju uporabe antibiotikov (De
Magalhaes in sod., 2015).
2.3.5 Zakonodaja o krmnih dodatkih
Uredba Evropskega parlamenta in Sveta (ES) št. 1831/2003 o dodatkih za uporabo v
prehrani ţivali 2003 definira krmne dodatke kot snovi, mikroorganizme ali pripravke, ki
niso niti posamiĉna krmila niti premiksi in se namenoma dodajajo krmi ali vodi za ţivali.
V skladu z zgoraj navedeno Uredbo, krmne dodatke razvršĉamo v eno ali veĉ kategorij,
odvisno od njihovih funkcij in lastnosti:
tehnološki dodatki (se dodajajo krmi iz tehnoloških razlogov),
senzoriĉni dodatki (izboljšujejo organoleptiĉne lastnosti krme ali vizualne lastnosti
proizvodov ţivalskega izvora),
nutritivni dodatki (za prehranske namene, na primer vitamini, elementi v sledovih,
aminokisline…),
zootehniški dodatki (ugodno vplivajo na prirejo zdravih ţivali ali na okolje),
kokcidiostatiki in sredstva proti histomonijazi.
To so snovi, ki za nemoteno delovanje ţivalskega organizma sicer niso nujno potrebne,
njihov vpliv pa se kaţe v boljši proizvodnji ţivali. Obiĉajno se uporabljajo v zelo majhnih
koliĉinah. Pri tem morajo biti izpolnjene temeljne zahteve, da ne delujejo škodljivo niti na
ţivalsko telo, niti pozneje na porabnika ţivalskih proizvodov.
V evropskem registru krmnih dodatkov (European Union Register of Feed Additives)
najdemo tudi razliĉne probiotiĉne seve, ki so uvršĉeni v kategorijo zootehniških dodatkov,
funkcionalno skupino stabilizatorjev mikrobiote, ki so opisani kot » mikroorganizmi ali
druge kemijsko definirane snovi, ki imajo, ĉe z njimi krmimo ţivali, ugoden vpliv na
mikrofloro prebavil«.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
19
2.3.6 Načini delovanja probiotikov in probiotičnih krmnih dodatkov
Slika 5: Mikrobiološke interakcije v ĉrevesju (povzeto po Yirga, 2015)
Probiotiki v prebavnem traktu s svojim delovanjem zmanjšujejo okuţbe ĉrevesja in
nastanek diareje, zaradi razliĉnih probiotikov z razliĉnimi mehanizmi oz. naĉini delovanja,
pa imajo tudi bolj splošen vpliv (Fuller, 1992; Cho in sod., 2011). Dobro zdravje osebka je
pogojeno z ugodnim mikrobnim ravnovesjem v ĉrevesju. Probiotiki, kot podpora naravni
ĉrevesni mikrobioti, pripomorejo k temu, zato se ţivalim dodajajo v obliki krmnih
dodatkov. Delovanje probiotiĉnih krmnih dodatkov temelji predvsem nakompetitivnem
izkljuĉevanju, bakterijskem antagonizmu in imunski modulaciji (Hughes in Heritage,
2002; Steiner, 2009).
2.3.6.1 Kompetitivno izkljuĉevanje
Kompetitivno izkljuĉevanje temelji na zašĉitni sposobnosti normalne mikrobiote pred
škodljivimi patogeni. Kulture izbranih, koristnih mikroorganizmov, dodanih krmi,
tekmujejo s potencialno škodljivimi bakterijami, pri ĉemer tekmujejo za vezavo na
ĉrevesno sluznico ter porabljajo iste organske substrate (predvsem ogljik in energijo) kot
druge bakterije (Steiner, 2009). Vezava na steno prebavnega trakta lahko sluţi ali
prepreĉitvi naselitve patogenih mikroorganizmov, ali tekmovanju za hranila (Yirga, 2015).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
20
2.3.6.1.1 Vezava na steno prebavnega trakta z namenom prepreĉevanja
kolonizacije s patogenimi mikroorganizmi
Škodljive bakterije se morajo najprej pritrditi na ĉrevesno steno, da lahko tam delujejo
(McDonald in sod., 2010). Zato je priĉakovan uĉinek dodajanja probiotikov poveĉanje
kolonizacije koristne mikrobiote v ĉrevesju in poslediĉno zaviranje vezave škodljivih
patogenov na ĉrevesni epitelij, s ĉimer se blokirajo receptorska mesta in je prepreĉena
pritrditev drugih bakterij, vkljuĉno s škodljivimi vrstami (Cho in sod., 2011). S takšnim
ravnanjem probiotiĉne bakterije izkljuĉujejo patogene in jim tako prepreĉijo povzroĉitev
okuţb (Hughes in Heritage, 2002).
Slika 6: Kopiĉenje nepatogenih bakterij na patogene (povzeto po Ewing in Cole, 1994)
Kompetitivno izkljuĉevanje je lahko tudi rezultat vezave nepatogenih bakterij na patogene
v predelih prebavnega pretoka (Slika 6), kar povzroĉi odstranitev patogenov iz ĉrevesja
(Ewing in Cole, 1994).
Kompetitivno izkljuĉevanje je lahko tudi rezultat vezave nepatogenih bakterij na patogene,
posledica zdruţevanja pa prepreĉuje vezavo patogenov na pritrdilna mesta in vodi k
njihovi odstranitvi iz ĉrevesa (slika 6) (The living gut).
Razliĉne študije so pokazale, da je potencial probiotikov zmanjšanje nevarnosti okuţb in
ĉrevesnih obolenj. Prav tako so pokazale, da je bila rast E.coli uspešno zavrta z razliĉnimi
sevi Lactobacillus. Poroĉali so tudi, da je kombinacija razliĉnih mleĉnokislinskih bakterij
bistveno zniţala raven Salmonelle v vsebini slepiĉa pišĉancev, ki so jim oralno dozirali
patogene. Pri prašiĉih je prehransko dopolnilo z Enterococcus faecium zavrlo vezavo E.
coli na epitelij tankega ĉrevesa (Yirga, 2015).
2.3.6.1.2 Tekmovanje s patogenimi bakterijami za hranila v ĉrevesju
Probiotiki lahko tekmujejo za hranila in absorpcijska mesta s patogenimi bakterijami (sliki
5 in 7). Tekmovanje za energijo in hranilne snovi med probiotiki in drugimi bakterijami
povzroĉi zatiranje patogenih vrst. Probiotiki imajo dobro fermentativno sposobnost in
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
21
spodbujajo prebavo. Znano je, da laktobacili proizvajajo mleĉno kislino in proteolitiĉne
encime, ki lahko izboljšajo prebavo hranil v prebavnem traktu (Yu in sod., 2008). Razliĉne
študije kaţejo, da probiotiki izboljšajo presnovo surovih beljakovin in pridobivanje
energije iz njih, v primerjavi s tistimi, ki niso tretirani s probiotiki (Yu in sod., 2008).
Slika 7: Nepatogene in patogene bakterije pogosto tekmujejo za hranila (povzeto po Ewing in Cole,
1994)
Nepatogene in patogene bakterije pogosto tekmujejo za hranila, npr. ogljik, dušik in
minerale. Nepatogene bakterije lahko uspešno konkurirajo patogenim in tako v veĉjem
obsegu kolonizirajo ĉrevesje.
2.3.6.2 Bakterijski antagonizem
Ko so probiotiĉni mikroorganizmi naseljeni v ĉrevesju, lahko proizvajajo snovi z
bakteriocidnim (ubijanje bakterij) ali bakteriostatiĉnim delovanjem (zaviranje rasti in
razmnoţevanja bakterij) (Hughes in Heritage, 2002; Steiner, 2009).
Mleĉnokislinske bakterije fermentirajo laktozo v mleĉno kislino, s ĉimer se zmanjša pH v
ĉrevesju na raven, ki je škodljive bakterije ne prenašajo. Proizvaja se tudi vodikov
peroksid, ki zavira rast po Gram-u negativnih bakterij (McDonald in sod., 2010).
2.3.6.3 Imunska modulacija
Imunska modulacija je za gostitelja ugodno uravnavanje imunskega sistema. Probiotiki
lahko delujejo kot spodbuda imunskemu sistemu. Mikrobne zdruţbe lahko podprejo
obrambo ţivali proti invaziji patogenov s stimulacijo ĉrevesnega imunskega odziva, s
stimulacijo proizvodnje protiteles in poveĉanjem aktivnosti fagocitov (McDonald in sod.,
2010). Nekateri probiotiĉni sevi, kot so predstavniki rodu Lactobacillus, so se izkazali, da
so sposobni stimulirati imunski sistem. Tako lahko delujejo ţive celice, ki se veţejo na
specifiĉne receptorje ali migrirajo skozi ĉrevesno steno, ali pa deli bakterijskih celic, ki se
sprostijo po razpadu mrtvih celic (Klaenhammer in sod., 2012).
Kar 70-80% imunskega sistema, ki je glavni obrambni mehanizem organizma, je v predelu
ĉrevesja. Skozi ĉrevo prihaja s hrano glavnina toksinov, mikroorganizmov in drugih
tujkov, ki jih morajo celice imunskega sistema (levkociti) nevtralizirati. Pri opravljanju te
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
22
vloge pa imajo pomoĉ. Reĉemo lahko, da so v ĉrevesju tri "obrambne linije" celic. Prvo
obrambno ĉrto predstavljajo bakterije (vkljuĉno s probiotiĉnimi), ki so na notranji strani
ĉrevesja (v ĉrevesni svetlini in v sluzi). Druga obrambna ĉrta so celice ĉrevesne stene, ki
prepušĉajo v notranjost organizma molekule in druge delce, predvsem tiste, ki so dovolj
majhne. Šele v tretji liniji so celice imunskega sistema, ki "ĉakajo" v limfi in krvnih ţilah
za ĉrevesno steno, "prepoznajo" morebitne tujke (strupene molekule, viruse,…), ki jih je
prepustila ĉrevesna stena, ter jih napadejo. Vloga probiotikov v tem obrambnem sistemu je
zelo pomembna. Nekatere študije kaţejo, da veţejo probiotiki nase karcinogene snovi iz
hrane, ki se skupaj s fekalijami izloĉijo iz organizma, ali pa jih razkrajajo (Rotovnik-
Kozjek, 2003).
2.4 LACTOBACILLUS GASEERI LF221 in LACTOBACILLUS GASEERI K7
V zbirki Inštituta za mlekarstvo in probiotike (IML-PRO) sta med drugim shranjena dva
humana bakterijska izolata, ki sta bakteriocinogena in imata širok spekter protimikrobne
aktivnosti. To sta Lactobacillus gasseri LF221 in Lactobacillus gasseri K7. Spadata v
skupino bakterij Lactobacillus acidophilus, ki so splošno priznane kot varne za uporabo pri
ljudeh. Oba seva sta bila izolirana iz blata dojenĉkov (Bogoviĉ Matijašić in sod., 2004).
Rod Lactobacillus je taksonomska skupina, ki spada v skupino mleĉnokislinskih bakterij,
vsebuje pa veĉ kot dvesto razliĉnih vrst. Znaĉilnost rodu so po Gramu pozitivne,
nesporogene bakterije, ki energijo dobivajo izkljuĉno s fermentacijo sladkorjev, prisotne pa
so v surovinah rastlinskega in ţivalskega izvora (Hammes in Hertel, 2006).
Sev Lactobacillus gasseri LF221 ima številne lastnosti probiotika. Raste v prisotnosti 1,5
% ţolĉa, preţivi pri vrednosti pH 2 in ima širok spekter protimikrobne aktivnosti. Iz
supernatanta so uspeli oĉistiti dva razliĉna bakteriocina, za katera se je na osnovi
ugotovljenega zaporedja nukleotidov genov za bakteriocina izkazalo, da se razlikujeta od
ţe opisanih bakteriocinov v literaturi. Poimenovali so ju acidiocin LF221 A in acidocin
LF221 B (Bogoviĉ Matijašić in sod., 1998).
Bakteriocini so poleg organskih kislin, vodikovega peroksida in diacetila, eni izmed
mnogih antimikrobnih substanc, ki jih proizvajajo mleĉno kislinske bakterije. Sestava
bakteriocinov je proteinska, vendar z bakterijskim naĉinom delovanja, proizvedenim z
vrsto mikroorganizmov (Tagg in sod., 1976). Zaviralni spekter acidocina B vsebuje tudi
nekatere ne-mleĉno kislinske bakterije, kot so Clostridium sporogenes, Listeria
monocytogenes in Brochothrix thermosphacta (Ten-Brink in sod., 1994; Van der Vossen in
sod., 1994). Acidiocin A je drugi bakteriocin L. acidophilus, katerega spekter delovanja
vkljuĉuje tudi zmoţnost zaviranja nekaterih patogenov, ki povzroĉajo kvarjenje hrane, med
katere spada tudi Listeria monocytogenes (Kanatani in sod., 1995). Delovanje
bakteriocinov seva LF221 je še obširnejše, saj zavirajo nekatere seve iz rodov, ki niso
laktobacili: Lactococcus, Staphylococcus, Pediococcus, Streptococcus, Enterococcus,
Clostridium, Listeria in Bacillus. Opaţeno je tudi delovanje proti oportunistiĉni bakteriji
Cl. difficile, katera povzroĉa z antibiotiki povezano diarejo ali celo ţivljenjsko nevarnemu
psevdomembranskemu kolitisu, ter proti drugim klostridijem. Sev LF221 je sposoben
zavirati tudi nekatere seve B. cereus (Bogoviĉ Matijašić in sod., 1998).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
23
Sev Lactobacillus gasseri K7 je dobro raziskan probiotik z znanim celotnim genomom
(Treven in sod., 2014).
Je prav tako odporen proti ţolĉnim solem in nizkim vrednostim pH, ima širok spekter
protimikrobne aktivnosti, njegove produkcijske sposobnosti (tvorba bakteriocinov) pa so
veĉje kot pri sevu LF221 (Bogoviĉ Matijašić in Rogelj, 2000).
Sposoben je rasti v prisotnosti 0,3% ţolĉnih soli in dobro preţiveti v kislem okolju (pH=3).
Bakteriocini nastajajo med eksponentno fazo rasti. Maksimalna aktivnost teh v
supernatantu MRS kulture je bila zaznana po 8-urni inkubaciji. Med drugim zavira tudi
klostridije. Vegetativne celice Clostridium tyrobutyricum so pokazale veĉjo obĉutljivost za
bakteriocine K7 kot pa spore (Bogoviĉ Matijašić in Rogelj, 2000).
Vsaj zaĉasno je tudi sposoben preţiveti prehod skozi prebavni trakt in kolonizirati
ĉrevesno sluznico gnotobiotiĉnih in konvencionalnih prašiĉkov (Bogoviĉ Matijašić in sod.,
2003; Stojković, 2003).
V dosedanjih raziskavah so pri sevih LF221 in K7 ugotovili vrsto lastnosti, ki so predpogoj
za uporabo izbranih bakterij kot probiotikov. Oba humana izolata poleg organskih kislin,
kot pomembnih protimikrobnih dejavnikov, tvorita tudi bakteriocine s širokim spektrom
delovanja (Bogoviĉ Matijašić in Rogelj, 2000; Bogoviĉ Matijašić in Rogelj, 1999; Bogoviĉ
Matijašić in sod., 1998). Njuna sposobnost zaviranja vrst Clostridium, med katerimi sta
tudi patogeni oziroma oportunistiĉni vrsti C. difficile in C. perfringens (prve kot
povzroĉiteljice psevdomembranskega kolitisa, druge kot patogene bakterije, nevarne za
ljudi in ţivali), je zanimiva s stališĉa prepreĉevanja ali hitrejšega zdravljenja tovrstnih
infekcij tako pri ljudeh kot pri ţivalih (Bogoviĉ Matijašić in Rogelj, 2000; Bogoviĉ
Matijašić in Rogelj, 1999; Bogoviĉ Matijašić in sod., 1998; Rogelj in sod., 1999). Med
zanimivejšimi mikroorganizmi, ki jih je sposoben inhibirati LF221, so še posamezni sevi
Bacillus cereus, Listeria monocytogenes in Staphylococcus aureus (Bogoviĉ Matijašić in
sod., 1998). Dobro se veţeta na enterocite v celiĉni kulturi (Caco-2) (Bogoviĉ Matijašić in
sod., 2003).
2.5 ESCHERICHIA COLI
Vrsto E. coli je leta 1885 prvi opisal nemški zdravnik Escherich. Vrste iz rodu Escherichia
so tipiĉne predstavnice enterobakterij. So po Gramu negativni, fakultativno anaerobni
bacili. Veĉina sevov je gibljiva. Medtem ko virulentni sevi povzroĉajo okuţbe v prebavilih
in zunaj ĉrevesne okuţbe pri ĉloveku in ţivalih, so nevirulentni sevi E. coli del normalne
ĉrevesne mikrobiote (Andlovic, 2002).
Vrsta E. coli, je ena izmed najobiĉajnejših predstavnic ĉrevesne in fekalne mikrobiote,
spada med koliformne bakterije, ter je prisotna v ĉrevesju ţe takoj po rojstvu. Hkrati je to
tudi prva bakterijska vrsta, ki zaĉne po smrti razkrajati truplo (Batis in Brglez, 1984).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
24
Medtem ko so nekateri sevi E. coli neškodljivi, drugi lahko povzroĉijo razliĉne okuţbe,
predvsem okuţbe seĉil, tudi mastitis, ĉrevesna obelenja in drugo V preteklih letih so
poroĉali o poveĉanju števila okuţb z E. coli, odpornimi proti veĉ antibiotikov hkrati, kar
predstavlja dodatno groţnjo za zdravje ljudi (Povzetek dejstev za splošno javnost, 2016).
2.6 RAZISKOVANJE FUNKCIONALNIH LASTNOSTI PROBIOTIKOV
Pri testiranju posameznih mikroorganizmov se lahko posluţujemo in vivo, in vitro ali ex
vivo pristopa.
Definicije, ki jih navaja Slovenski medicinski slovar (Kališnik, 2002) se glasijo:
in vivo = v ţivem organizmu,
in vitro = v umetnem okolju (npr. v epruveti ali v posodi za kulturo tkiva),
ex vivo = v poskusnih razmerah zunaj ţivega organizma.
Raziskave in vivo se izvajajo na ţivem organizmu, torej ţivali ali ĉloveku. So zelo drage in
zamudne, za izvedbo potrebujemo veĉje število ţivali oz. ljudi. Kljub temu so potrebne,
tudi pri prouĉevanju uĉinkov probiotikov (Lavrenĉiĉ, 2003).
Zaradi vse ostrejše zakonodaje, ki prepreĉuje ali omejuje najrazliĉnejše posege na ţivalih,
so raziskave in vivo še teţavnejše. Z metodami in vitro simuliramo pogoje, ki so podobni
tistim, ki so v gostitelju (npr. v prebavilih) (Lavrenĉiĉ, 2003). Obiĉajno prva selekcija
zanimivih sevov poteka in vitro, zanimivejše seve pa nadalje testirajo še in vivo, da
pridobijo podatke o njihovi uĉinkovitosti.
2.7 PROBIOTIKI KOT NADOMESTILO ZA ANTIBIOTIKE
Odkritje antibiotikov pomeni enega najpomembnejših mejnikov v razvoju medicine.
Njihova uporaba je moĉno zmanjšala smrtnosti zaradi infekcijskih bolezni, hkrati pa
omogoĉila razvoj vse veĉ bakterijskih sevov, ki so odporni (rezistentni) proti posameznim
ali celo veĉ razliĉnim antibiotikom. Pojav bakterijske odpornosti proti antibiotikom je znan
ţe od samega zaĉetka njihove uporabe v zdravljenju bakterijskih okuţb. Širitev odpornih
bakterijskih sevov omogoĉa preobseţna in velikokrat nekritiĉna uporaba antibiotikov,
(predvsem dodajanje antibiotikov za spodbujanje rasti farmskih ţivali). Tako je zaradi
široke uporabe penicilina ţe konec 40-ih let prejšnjega stoletja prišlo do selekcije in
razširjanja proti penicilinu odpornih bakterijskih sevov. Odpornost proti penicilinu so
najprej zasledili pri vrsti Staphylococcus aureus. Ţe leta 1950 je bilo veĉ kot 50% sevov te
vrste odpornih proti penicilinu (Seme, 2002).
V posebno skupino antibiotikov štejemo heterogeno skupino antibiotikov – promotorjev
rasti, ki se uporabljajo kot dodatek ţivalski hrani (angleški naziv feed grade). V preteklosti
so tudi v Evropi te spojine dodajali krmi zaradi boljših prirastov ţivali. Za ta namen se
uporabljajo le antibiotiki, ki se sicer ne uporabljajo v humani ali veterinarski medicini.
(Pokorny in sod., 1992). Medtem ko so v Evropi tovrstno uporabo antibiotikov dokonĉno
prepovedali leta 2006, so nekateri antibiotiki še vedno dovoljeni v Aziji, Avstraliji in ZDA.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
25
S 1. januarjem 2006 v EU ni veĉ dovoljeno uporabljati nutritivnih antibiotikov
(flavofosfolipol, natrijev monenzin, natrijev salinomicin, avilamicin) v prehrani ţivali. To
pa ne velja za posebno skupino antibiotikov imenovanih kokcidiostatiki in sredstev proti
histomonijazi. Njihova uporaba je še vedno dovoljena, vendar v toĉno doloĉenih koliĉinah
(Uredba Komisije (ES) št. 574/2011 z dne 16. junija 2011 o spremembi Priloge I k
Direktivi 2002/32/ES Evropskega parlamenta in Sveta glede mejnih vrednosti za nitrit,
melamin, Ambrosio spp. ter prenosa nekaterih kokcidiostatikov ali sredstev proti
histomonijazi in o konsolidaciji prilog I in II k Direktivi).
Razvojni oddelki farmacevtskih druţb so do zaĉetka 80. let uĉinkovito razvijali in
sintetizirali nove antibiotike, s katerimi se je moĉno razširil spekter protibakterijskega
delovanja. Po tem obdobju pa so, prepriĉani, da je cilj dokonĉno doseţen, postopoma
upoĉasnili oz. celo ukinjali razvoj na tem podroĉju. Bakterije so doslej odgovorile na prav
vsak novi antibiotik s pojavom odpornih sevov, vĉasih hitreje, drugiĉ poĉasneje. Danes, po
veĉ kot 70 letih uporabe antibiotikov in razvoju stotin razliĉnih protimikrobnih zdravil,
ugotavljajo, da se pri zdravljenju okuţb s sevi nekaterih bakterijskih vrst nevarno
pribliţujemo stanju pred odkritjem penicilina (Seme, 2002; EFSA/ECDC, 2015).
Med moţnimi alternativami antibiotikom kot rastnim promotorjem so encimi, anorganske
in organske kisline, probiotiki in pa ukrepi obvladovanja okuţb, predvsem respiratornih, na
naĉin preventivne naselitve dobre mikrobiote (Yirga, 2015). Kombinacija razliĉnih
pristopov pa omogoĉa še bolj ugodno ravnovesje v ĉrevesju in s tem dobro poĉutje in
zmogljivost ţivali. Upoštevani so namreĉ razliĉni vidiki prebavnega trakta: mikrobiologija,
presnova hranilnih snovi in oskrba tkiv (Yirga, 2015).
Nekatere skupine naravno prisotnih bakterij se po uţivanju antibiotikov še dolgo potem, ko
zdravljenja ni veĉ, ne opomorejo (Robinson in Young, 2010; Quigley, 2013).
Odkar je uporaba antibiotikov kot pospeševalcev rasti prepovedana, se trudijo najti druga
sredstva, ki bi prav tako pospeševala rast, izkorišĉanje krme in ugodno vplivala na zdravje
ţivali, bi pa bila bolj prijazna okolju in ĉlovekovemu zdravju.
Probiotiki delujejo po principu kompetitivnega izkljuĉevanja. Tako lahko prepreĉijo
nastanek bolezni, npr. dihal pri prašiĉih, ki bi sicer zahtevale antibiotiĉno zdravljenje
(Yirga, 2015).
Obstaja veliko dokazov o uĉinkovitosti probiotikov v preventivi in celo terapiji nekaterih
bolezni farmskih ţivali. Eden od primerov uĉinkovite rabe MKB probiotikov predstavlja
preventiva oz. zdravljenje diareje, ki je pri mladih ţivalih, vkljuĉno z mladimi pujski,
glavni vzrok obolevnosti in smrtnosti (Vanbelle, 2001).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
26
3 MATERIAL IN METODE
3.1 IZVEDBA POSKUSA
3.1.1 Poskusne živali
V poskus so bili vkljuĉeni devet mesecev stari prašiĉi pitanci. Uporabili smo osrednji del
tankega t.i. tešĉega ĉrevesa – jejunuma. Ĉrevesje je bilo takoj po zakolu odvzeto, ohlajeno
in na ledu preneseno v laboratorij. Tu je potekalo nadaljnje izpiranje ter obdelava.
Pomembno je bilo, da so bile analize konĉane v ĉasu dveh ur po zakolu. Kasneje namreĉ
aktivnosti in ţivljenjske funkcije ĉrevesnih enterocitov upadajo.
3.1.2 Potek poskusa
3.1.2.1 Potek dela
Takoj po izkrvavitvi testnih prašiĉev smo odvzeli njihovo tanko ĉrevo. Obstojeĉo
mikrobioto smo sprali s pufrom, nato pa pripravili vzorce velikosti 10 cm2. Seva L. gasseri
K7 in L. gasseri LF221 smo predhodno namnoţili s kultivacijo v komercialnem gojišĉu
MRS. S centrifugiranjem smo odstranili preostalo gojišĉe, celice pa resuspendirali v pufru
z ustrezno pH vrednostjo, tako da smo dobili suspenzije s pribliţno 108 KE/ml.
Pripravljene vzorce tkiva smo vsakiĉ potopili v suspenzijo celic enega od preskušanih
sevov in inkubirali pri 37 °C 30 minut, s ĉimer smo omogoĉili vezavo preskušanih bakterij
na še vedno ţive ĉrevesne epitelne celice. Nevezne celice smo sprali z vzorcev tkiva. Na
koncu smo število vezanih celic ugotovili tako, da smo vzorce prenesli v steklenice s
fiziološko raztopino, vsakega posebej homogenizirali, pripravili razredĉitve, jih nacepili na
komercialno selektivno gojišĉe, inkubirali in prešteli zrasle kolonije.
V drugem delu poskusa smo vzorce tkiva po enaki zaĉetni obdelavi, torej vezavi v
suspenzijah bakterijskih celic in inkubaciji, fiksirali v 10 %-nem formalinu, dehidrirali z
narašĉajoĉimi koncentracijami alkohola in vkljuĉili v parafin.
Pripravljeno tkivo smo z mikrotomom narezali na rezine, debele 5 µm.
Tkivne rezine smo nato pobarvali z metodo po Gramu. Pri tem se po Gram-u pozitivne
bakterije obarvajo modro, po Gram-u negativne rdeĉe ali roţnato, jedra so rdeĉa, ostali
tkivni elementi pa rumeni (Mäyrä-Mäkinen in sod., 1983; Kos, 2001).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
27
3.2 MATERIAL
3.2.1 Črevesna sluznica iz tankega črevesa
Pri poskusu smo uporabljali košĉke tešĉega ĉrevesa takoj po zakolu prašiĉev. Velikost
vzorcev je bila 10 cm2. Razrez ĉrevesa smo izvajali pravokotno na njegovo dolţino,
posamezen košĉek je bil dolg 2,5 cm, širok pa 4 cm.
3.2.2 Bakterijski sevi
Pred poskusom smo testne seve precepili v sveţe gojišĉe MRS in inkubirali 18 ur.
Uporabljeni so bili naslednji bakterijski sevi:
Lactobacillus gasseri LF221 (Zbirka IML-PRO, Oddelek za zootehniko,
Biotehniška fakulteta, Univerza v Ljubljani),
Lactobacillus gasseri K7 (Zbirka IML-PRO, Oddelek za zootehniko, Biotehniška
fakulteta, Univerza v Ljubljani),
Escherichia coli O8:K88 (Research Institute of Experimental Veterinary Medicine,
Košice, Slovaška).
3.2.3 Gojišča
3.2.3.1 Trda gojišĉa
Hranljivi agar MRS smo pripravili po navodilih proizvajalca (Merck, Darmstadt, Nemĉija).
Popolnoma raztopljenega smo nalili v 200 ml steklenice in dali v avtoklav, kjer je potekala
sterilizacija. Ohlajenega na 45 °C smo uporabljali za razlitje v petrijeve plošĉe in sicer kot
trdo gojišĉe, ustrezno za rast laktobacilov.
Po navodilih proizvajalca smo agar EMB (Merck, Darmstadt, Nemĉija) raztopili v
demineralizirani vodi. Suspenzijo smo nalili v 200 ml steklenice, zaprli in dali sterilizirati.
EMB je komercialno selektivno gojišĉe vijoliĉno rdeĉe barve. Njegova sestava ustreza
potrebam enterobakterij, katerim pripada tudi vrsta E. coli.
Sterilna hranljiva gojišĉa smo pred razlivanjem segreli v mikrovalovni peĉici in jih ohladili
na primerno temperaturo (45 °C) v vodni kopeli.
3.2.3.2 Tekoĉa gojišĉa in diluenti
Bujon MRS je tekoĉe gojišĉe za gojenje laktobacilov. Pripravili smo ga po navodilih
proizvajalca (Merck, Darmstadt, Nemĉija), odpipetirali v epruvete, ter avtoklavirali pri 121
°C. Potrebovali smo ga za pripravo 18-urne kulture sevov Lactobacillus gasseri K7 in
Lactobacillus gasseri LF221.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
28
Fiziološko (¼ Ringerjevo) raztopino smo pripravili po navodilih proizvajalca (Merck,
Darmstadt, Nemĉija). Ena tableta zadostuje za 500 ml vode. Raztopino smo z avtomatskim
dispenzerjem porazdelili v epruvete po 9,4 ml, preostalo pa v steklenico (500 ml).
Sterilizacija je potekala v avtoklavu pri 121 °C 15 minut.
Pripravili smo 20-kratno zaloţno raztopino fosfatnega pufra (PBS)z naslednjo sestavo:
- 170 g NaCl (Merck, Darmstadt, Nemĉija),
- 42,9 g Na2HPO4 x 12 H2O (Merck, Darmstadt, Nemĉija),
- 10,8 g KH2PO4 (Merck, Darmstadt, Nemĉija).
Natehtane sestavine smo stresli v erlenmajerico z 800 ml destilirane vode, ter vsebino
premešali s pomoĉjo magnetnega mešala. Nato smo uravnali vrednost pH na 7,4, dopolnili
z vodo do 1000 ml in sterilizirali v avtoklavu. Zaloţno raztopino sterilnega pufra smo
hranili pri 4°C. Kadar smo potrebovali PBS v konĉni koncentraciji, smo 50 ml zaloţne
raztopine dodali 950 ml demineralizirane in sterilizirane vode.
3.3 METODE
3.3.1 Obdelava kontrolnih vzorcev črevesne sluznice
Na zaĉetku poskusa smo preverili, ali postopek obdelave vzorcev tankega ĉrevesa, ki smo
ga povzeli po literaturi, zadostuje za odstranitev obstojeĉe mikrobiote, vezane na ĉrevesno
sluznico tankega ĉrevesa ţivali.
Notranjost ĉrevesa smo trikrat sprali z ohlajenim pufrom PBS (glej shemo 1), ter s tem
odstranili vsebino. Nato smo, prav tako kot kasneje vsakiĉ v nadaljevanju poskusa,
jejunum razrezali na košĉke, velike 10 cm2. Potopili smo jih v PBS in inkubirali v
hladilniku pri 4°C, 30 minut, da se je sluz (mukus) odlušĉila. S pinceto smo nato prijeli
vsak posamezen košĉek ter ga narahlo še 3-krat sprali v ĉaši s cca. 150 ml vsakiĉ sveţega
pufra PBS. Dva od košĉkov smo dali v steklenici s po 100 ml ¼ Ringerjeve raztopine,
homogenizirali, dopolnili do 100 ml, razredĉili, nacepili na hranljivi gojišĉi MRS in EMB,
ter po inkubaciji pri 37 °C prešteli zrasle kolonije. Gojišĉa z agarjem MRS smo inkubirali
48 ur v anaerobnih razmerah (GenBOX anaer, Bio-Merieux, Marcy l'Etoile, Francija),
gojišĉa z EMB pa 24 ur v aerobnih. Ta vzorec smo oznaĉili z oznako »0«. Postopek smo
ponovili pri vsakem nadaljnjem poskusu.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
29
SHEMA 1: Kontrola spiranja ĉrevesa s PBS
(VZOREC »0«)
ĈREVO (jejunum)
3x SPEREMO s PBS odstranitev ĉrevesne vsebine
RAZREZ jejunuma na košĉke (10 cm
2)
INKUBACIJA v PBS (4°C, 30 min) odlepljanje mukusa
ponovno 3x spiranje v PBS (150 ml)
potopitev košĉka v Ringerjevo raztopino
HOMOGENIZACIJA
RAZREDĈEVANJE
NACEPLJANJE na hranljivo podlogo (MRS, EMB)
INKUBACIJA (37 °C, 48 oz. 24 ur)
ŠTETJE KOLONIJ
3.3.2 Optimiziranje protokola vezave bakterij – spiranje nevezanih bakterij
V nadaljevanju smo ugotavljali, ali je enkratno spiranje po vezavi testnih laktobacilov
zadostno za odstranitev nevezanih bakterij. V poskusu pripenjanja na ĉrevesno sluznico
smo uporabljali dva testna seva, Lactobacillus gasseri LF221 in Lactobacillus gasseri K7.
Pet košĉkov jejunuma, pripravljenih kot je opisano v zaĉetku poglavja 3.3.1, smo potopili
v vsako od dveh steklenic, s po 200 ml pripravljene suspenzije ustrezne koncentracije (cca.
107
KE/ml) dveh sevov laktobacilov. Obe steklenici smo postavili v stresalnik, kjer smo
vzorce ob rahlem stresanju inkubirali 30 minut, pri 37 °C in 150 obratih/minuto (glej
shemo 2). Po konĉani inkubaciji v stresalniku smo iz obeh steklenic s pinceto pobrali vsak
posamezen košĉek ter ga sprali v pufru PBS. Uporabili smo štiri razliĉne naĉine spiranja:
1) prvi košĉek iz vsake od steklenic samo roĉno spiranje (narahlo, prijem s sterilno
pinceto),
2) naslednji košĉek najprej roĉno spiranje, nato še 5 minut v stresalniku pri 37 °C
in 150 obratih/minuto v 200 ml pufra PBS,
3) roĉno, nato dvakrat po 5 minut spiranja v stresalniku z vmesno menjavo pufra ali
4) roĉno in 3-krat po 5 minut spiranja v stresalniku z vmesno menjavo pufra.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
30
SHEMA 2: Izvedba postopka spiranja košĉkov ĉrevesa po vezavi laktobacilov
ĈREVO (jejunum)
3x SPEREMO s PBS (500 ml) odstranitev vsebine ĉrevesa
RAZREZ jejunuma na košĉke (10 cm2)
INKUBACIJA v PBS (4°C, 30 min) odlepljanje mukusa
ponovno 3x spiranje v PBS (150 ml)
prenos tkiva v SUSPENZIJO SEVOV LF221 oz. K7 (cca 10
7 KE/ml)
INKUBACIJA v stresalniku (30 min, 37 °C, 150 obratov /min)
razliĉni naĉini SPIRANJA
3.3.3 Priprava standardiziranih bakterijskih suspenzij
Priprava 18-urnih kultur bakterijskih celic je potekala tako, da smo v epruvete s sterilnim
bujonom MRS (10 ml) odpipetirali 100 ml kulture L. gasseri K7, L. gasseri LF221 oz. E.
coli, prejšnji dan nacepljene iz zamrznjenih celic. Inkubirali smo 18 ur pri temperaturi 37
°C. Do uporabe smo epruvete potopili v mrzlo vodo z ledom in tako prepreĉili nadaljnje
razmnoţevanje.
Epruvete vseh treh 18-urnih kultur smo v nadaljevanju centrifugirali (3700 g, 5 minut).
Celice so se ob tem loĉile od bujona in ostale na dnu epruvet. Bujon smo previdno odlili,
vzeli sterilne steklenice z ustrezno koliĉino vode in PBS, ter s pipeto popolnoma izprali
sediment celic iz epruvet, in sicer v prvo steklenico celice seva LF221, v drugo seva K7,
ter v tretjo steklenico celice E. coli. Vsebino steklenic smo dobro premešali.
Ţeleli smo pripraviti suspenzije treh sevov s ĉimbolj enakimi koncentracijami. Na podlagi
podatkov, pridobljenih v predhodnih poskusih, smo suspenzije pripravili tako:
LF221: 142,5 ml vode (avtoklavirane)
7,5 ml pufra PBS (20-kratna koncentracija)
celice LF, pridobljene iz 6 ml 18-urne kulture
Skupaj: 150 ml.
K7: 142,5 ml vode (avtoklavirane)
7,5 ml pufra PBS (20-kratna koncentracija)
celice K7, pridobljene iz 4 ml 18-urne kulture
Skupaj: 150 ml.
E.coli: 237,5 ml vode (avtoklavirane)
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
31
12,5 pufra PBS (20-kratna koncentracija)
celice E. coli, pridobljene iz 1,2 ml 18-urne kulture
Skupaj: 250 ml.
Pripravljene suspenzije celic smo vsakiĉ razdelili v devet 200 ml sterilnih steklenic ter
dodali ustrezno koliĉino pufra PBS enkratne koncentracije, ohlajenega na 4 ˚C,v naslednjih
kombinacijah:
1) LF: 50 ml suspenzije LF + 50 ml pufra PBS (2 steklenici)
2) K7 : 50 ml suspenzije K7 + 50 ml pufra PBS (2 steklenici)
3) Ec : 50 ml suspenzije Ec + 50 ml pufra PBS (3 steklenice)
4) Ec + LF : 50 ml suspenzije LF + 50 ml susp. Ec (1 steklenica)
5) Ec + K7 : 50 ml suspenzije K7 + 50 ml susp. Ec (1 steklenica).
Koncentracije celic so bile pribliţno enake v prvih treh poskusih, v ĉetrtem in petem pa
smo uporabili 10x veĉje koncentracije laktobacilov, medtem ko je koncentracija E. coli
ostala enaka. Pri vsakem poskusu smo suspenzije bakterij tudi nacepili na ustrezna gojišĉa,
da smo ugotovili dejansko koncentracijo bakterijskih sevov (KE/ml). Laktobacile smo
nacepili na gojišĉe MRS ter inkubirali 48 h pri 37 °C v anaerobnih razmerah (GenBOX
anaer, Bio-Merieux, Marcy l'Etoile, Francija). E. coli smo nacepili na gojišĉe EMB,
kolonije pa prešteli po 24 h inkubacije pri 37 °C.
Kolonije smo prešteli, s pomoĉjo elektronskega števca kolonij (EŠKO, Ljubljana,
Slovenija), na tistih petrijevih plošĉah, kjer je zraslo od 30 do 300 kolonij. V primeru da je
bilo število kolonij na plošĉah niţje od 30, smo rezultat izrazili kot »manj kot 30 KE/ml oz.
na 10 cm2 vzorca«.
Število kolonijskih enot v 1 ml smo izraĉunali po formuli:
dnn
CN
)1,0( 21
… (1)
N - število kolonijskih enot (KE/cm2 oz. KE/ml)
ΣC - število preštetih kolonij na vseh plošĉah
n1 - število števnih plošĉ (30 do 300 kolonij) prve razredĉitve
n2 - število števnih plošĉ (30 do 300 kolonij) druge razredĉitve
d - razredĉitveni faktor, ki ustreza prvi razredĉitvi
3.3.4 Priprava črevesnega tkiva
Notranjost ĉrevesa smo s pomoĉjo lijaka vsakiĉ trikrat sprali z dobro ohlajenim pufrom
PBS in s tem odstranili vsebino. Nato smo z ostrim rezilom odvzeli deset košĉkov
jejunuma, velikih 10 cm2. Potopili smo jih v posodo s PBS, ter dali za 30 minut v hladilnik.
Ta inkubacija pri 4C je povzroĉila, da se je sluz (mukus) odlušĉila. En košĉek smo
homogenizirali in analizirali takoj, da smo se prepriĉali, ali je spiranje zadostovalo za
odstranitev prisotne mikrobiote. Preostalih devet košĉkov smo uporabili za poskus vezave.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
32
3.3.5 Vezava ali adhezija
Z adhezijo smo ţeleli ugotoviti sposobnost vezave samostojnih ĉistih sevov LF221, K7 ter
E. coli ex vivo. Hkrati je bil namen ugotoviti, do kolikšnega tekmovanja (competition),
izkljuĉevanja (exclusion) oziroma izpodrivanja (displacement) E. coli pride s strani
laktobacilov oz. ĉe do ĉesarkoli omenjenega v primeru simulacije ex vivo vezave
probiotikov sploh pride.
Tekmovanje med E. coli in L. gasseri LF221 smo opazovali tako, da smo v testu uporabili
suspenzijo, ki je vsebovala oba seva hkrati (Ec+LF), tekmovanje med E. coli in sevom K7
pa z mešanico kultur E. coli in L. gasseri K7 (Ec+K7).
Morebitno izpodrivanje E. coli s strani laktobacilov smo opazovali tako, da smo
posamezne košĉke pomoĉili najprej v suspenzijo Ec, potem pa v suspenzijo enega od
testnih laktobacilov. Oznaka teh vzorcev je bila Ec/LF oziroma Ec/K7.
Izkljuĉevanje E. coli s strani laktobacilov je bilo simulirano na naĉin, da smo posamezne
košĉke ĉrevesa inkubirali najprej v suspenziji enega od testnih sevov laktobacilov, nato pa,
po vmesnem spiranju, v suspenziji Ec. Oznaki vzorcev sta bili LF/Ec in K7/Ec.
Košĉke ĉrevesne sluznice za teste adhezije smo pripravili tako, kakor je opisano zgoraj
(3.3.2). S sterilno pinceto (alkohol + ogenj) smo iz posode s PBS vzeli košĉek ĉrevesne
sluznice, ga narahlo 3x sprali v ĉaši z 250 ml pufra PBS, ki smo ga vmes vsakiĉ zamenjali,
ter s tem izprali še zadnje ostanke mukusa in vsebine ĉrevesja. Endogeno mikrobioto smo
torej preteţno odstranili, košĉke ĉrevesa pa smo nato prenesli v prej pripravljene steklenice
s suspenzijami:
v steklenico z oznako »LF« dva košĉka,
v steklenico z oznako »K7« prav tako dva košĉka,
v steklenico z oznako »Ec« tri košĉke,
v steklenico z oznako »LF+Ec« en košĉek,
v steklenico z oznako »K7+Ec« prav tako en košĉek ĉrevesa.
Vseh pet steklenic smo postavili za 30 minut v stresalnik, kjer je potekala vezava
preskušanih bakterij na še vedno ţive ĉrevesne epitelne celice, in sicer pri 37 ºC in hitrosti
stresanja 75 obratov na minuto.
Po en košĉek iz mešanic LF+Ec, K7+Ec, ter ĉistih suspenzij LF, K7 in Ec smo po konĉani
vezavi takoj sprali in prenesli v fiziološko raztopino (100 ml), kasneje pa homogenizirali in
razredĉitve nacepili na ustrezno gojišĉe. Drugega od obeh košĉkov iz steklenic LF in K7
smo prenesli v novi steklenici s suspenzijo seva E. coli, v katerih je nato potekala
inkubacija s sevom E. coli. Oznaĉili smo ju kot LF/Ec, oz. K7/Ec. Prav tako drugega od
treh košĉkov iz steklenice Ec smo dali v steklenico s sevom LF, ter oznaĉili Ec/LF, tretjega
pa v suspenzijo K7 in oznaĉili Ec/K7. Tudi te štiri steklenice smo inkubirali v stresalniku
pri enakih pogojih (30 min, 37 ºC, 75 obr/min).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
33
3.3.6 Spiranje
Vsakega od košĉkov smo po konĉani vezavi najprej narahlo roĉno sprali v PBSu, prenesli
v steklenice s po 150 ml ohlajenega pufra in te postavili v stresalnik. Vzorce smo stresali 5
minut pri 150-ih obratih/minuto in 37 ºC. S tem so bile odstranjene bakterije, ki se niso
vezale na ĉrevesni epitel.
3.3.7 Homogeniziranje
Po spiranju v stresalniku smo košĉke še roĉno sprali v PBSu in prenesli v oznaĉene
steklenice s po 100 ml sterilne, dobro ohlajene fiziološke raztopine. Vsebine vseh devetih,
poleg teh pa tudi vsebino steklenice z oznako »0«, ki je vsebovala vzorec za preverjanje
uspešnosti odstranjevanja prvotne mikrobiote, so bile pripravljene za homogeniziranje, ki
smo ga opravili z aparatom Ultra Turrax T25 basic (Ika, Staufen, Nemĉija).
Hitrost homogeniziranja je bila 11000 obratov/minuto, ĉas pa 2-3 minute. Pred obdelavo
vsakega naslednjega vzorca je bilo potrebno homogenizator dobro oĉistiti ter sprati v 70%
alkoholu, nato pa še v pufru PBS. Sledilo je nadaljnje razredĉevanje ter nacepljanje na
selektivna gojišĉa.
3.3.8 Razredčitve in nacepitve na komercialni selektivni gojišči
Po pripravi suspenzij smo iz dobro premešanih vsebin steklenic z oznakami LF, K7, Ec,
LF+Ec in K7+Ec, ter prav tako iz homogeniziranega vzorca z oznako »0«, aseptiĉno
odpipetirali po 1 ml vsebine v sterilne epruvete z 9 ml fiziološke raztopine. Tako smo
dobili desetkrat razredĉene vzorce (razredĉitev 10-1
). Epruvete smo postavili v posodo z
ledom. V nadaljevanju smo pripravljali zaporedne 10-kratne razredĉitve posameznih
vzorcev do 10-5
. Razredĉitve smo nacepili v selektivna trda gojišĉa in inkubirali pri
ustreznih pogojih, opisanih zgoraj (3.3.3).
3.3.9 Barvanje po Gramu
Bakterije lahko loĉujemo na po Gramu pozitivne in po Gramu negativne, na podlagi
barvanja po Gramu. Za razliĉno barvanje je odgovorna celiĉna stena, ki obdaja citoplazmo
in citoplazemsko opno, bakterijski celici pa daje obliko in trdnost. Stena je po zgradbi
podobna mreţici, njena glavna sestavina pa je peptidoglikan ali murein, ki je kompleks N-
acetil glukozamina in N-acetil-muraminske kisline, vsebuje pa tudi alanin, glutaminsko
kislino, lizin in diaminopimeliĉno kislino. Murein je mreţasto grajen in je razliĉno
sestavljen pri po Gramu pozitivnih in negativnih bakterijah. Tako se kristali
metilvijoliĉnega barvila, ki nastanejo po dodatku raztopine joda, pri po Gramu pozitivnih
bakterijah ujamejo v debelo plast peptidoglikana, pri po Gramu negativnih pa ne. Po
spiranju z zmesjo acetona in etanola se tako le po Gramu negativne bakterije razbarvajo,
po Gramu pozitivne pa ostanejo vijoliĉne. V zadnjem koraku barvanja se po Gramu
negativne bakterije obarvajo z barvilom safranin rdeĉe.(Bratis in Brglez, 1984).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
34
Preglednica 3: Razlike v kemiĉni zgradbi celiĉne stene po Gramu pozitivnih in negativnih bakterij
Gram + Gram -
Aminokisline glutaminska kislina in alanin
-
veĉina aminokislin
diaminopimeliĉna kislina
Lipidi do 2% lipidov 10-20% lipidov
Polisaharidi 36-60% polisaharidov 15-20% polisaharidov
Teihoiĉna kislina do 50% -
Murein veĉplasten enoplasten
3.4 STATISTIĈNA OBDELAVA PODATKOV
Za statistiĉno obdelavo smo uporabili statistiĉni paket SAS/STAT (1994) iz programskega
paketa SAS.
Vse vrednosti, ki smo jih dobili po štetju mikroorganizmov na petrijevih plošĉah, smo pred
testiranjem pretvorili v logaritemske vrednosti.
3.4.1 Statistični model
Lastnosti v poskusu smo obdelali s statistiĉnim modelom. Kot sistematska vpliva smo v
model vkljuĉili poskus (Pi) in skupino (Sj), znaĉilnosti njunih vplivov pa testirali po metodi
najmanjših kvadratov. Za analizo razlik med skupinami smo uporabili test sredin in
Tukeyev test.
yijk = µ + Pi + Sj + PSij + eijk … (2)
yij – število vezanih kolonijskih enot seva K7 oz. LF221 oz. E. coli
- srednja vrednost
Pi - vpliv poskusa, (i = 1, 2, 3, 4, 5)
Sj - vpliv skupine, (j = 1, 2, ….., 7 oz. 8)
PSij – vpliv interakcije med poskusom in skupino
eij - ostanek
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
35
4 REZULTATI
4.1 REZULTATI MIKROSKOPIRANJA ĈREVESNE SLUZNICE S PRIPETIMI
TESTNIMI LAKTOBACILI
Rezultati mikroskopiranja ĉrevesne sluznice, ki je bila najprej obdelana tako, da smo
odstranili ĉrevesno vsebino, mukus in naravno mikrobioto, zatem pa jo izpostavili celicam
L. gasseri K7 ali L. gasseri LF221, so pokazali, da se oba seva veţeta na enterocite
ĉrevesne sluznice. Vezali so se dovolj ĉvrsto, da jih s spiranjem nismo odstranili s površine
vzorcev. Nevezane bakterije smo s spiranjem s fosfatnim pufrom pred barvanjem
odstranili. Celice laktobacilov so obarvane vijoliĉno, celice enterocitov pa sivo- rumeno.
Vezavo smo ovrednotili s štetjem na plošĉah, kar je opisano v nadaljevanju.
a b
c d
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
36
Slika 8: Mikroskopski preparati (a-f) ĉrevesne sluznice s pripetimi laktobacili (L. gasseri K7),
pripravljeni z barvanjem po Gramu. Celice laktobacilov so obarvane vijoliĉno, celice enterocitov
pa sivo - rumeno
4.2 REZULTATI KONTROLE SPIRANJA VZORCEV (VZOREC »0«)
Tekom poskusa smo dodatno izvajali kontrolo izpiranja prvotne mikrobiote iz vzorcev
ĉrevesne sluznice. Prvotno mikrobioto smo s spiranjem ţeleli odstraniti, da ne bi motila
preskusa.
Za preskus, ali je bilo odstranjevanje prvotne mikrobiote uspešno, smo homogenizirane
vzorce ĉrevesne sluznice nacepili na plošĉe z gojišĉema EMB (za E. coli) in MRS (za
laktobacile).
Preglednica 4: Kontrola izpiranja prvotne mikrobiote iz košĉkov jejunuma (vzorec niĉ »0«)
MRS: A B SD POVP. LOG A LOG B SD LOG POVP. Log
Pos. 1«0« 4000 4000 0 4000 3,60 3,60 0 3,60
Pos. 3«0« 48000 43000 3535,53 45500 4,68 4,63 0,03 4,66
Pos. 4«0« 1 0 0,71 0,5 0 0 0 0
Pos. 5«0« 3 2 0,71 2,5 0,48 0,30 0,12 0,39
EMB A B SD POVP. LOG A LOG B SD LOG POVP. Log
Pos. 1«0« 387000 384000 2121,32 385500 5,59 5,58 0,00 5,59
Pos. 3«0« 29000 22000 4949,75 25500 4,46 4,34 0,09 4,40
Pos. 4«0« 0 14 9,90 7 0 1,15 0,81 0,57
Pos. 5«0« 3 10 4,95 6,5 0,48 1 0,37 0,74
Legenda:
»0« košĉek jejunuma brez kakršnihkoli dodatkov, samo spran
A,B paralelki; košĉka jejunuma, velika 10 cm
SD standardna deviacija
POVP. povpreĉna vrednost števila mikroorganizmov, preštetih na plošĉah, dobljenih od paralelk A in B
LOG A logaritmirana vrednost rezultatov vzorca A
LOG B logaritmirana vrednost rezultatov vzorca B
Pos. poskus
e f
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
37
Preštete kolonije (KE) smo pretvorili v logaritemsko vrednost. Iz preglednice 4 je
razvidno, da so ostanki mikroorganizmov v prvih dveh poskusih veliko veĉji kot v
naslednjih, ĉeprav je bil naĉin izvajanja poskusa enak. Mleĉnokislinskih bakterij, ki smo
jih šteli na gojišĉu MRS, je bilo v vseh vzorcih manj kot 105
na 10 cm2, kar je bilo za
potrebe testiranja zadovoljivo. Z izjemo enega vzorca je bilo v vseh drugih vzorcih tudi
preostalih enterobakterij, ki smo jih nacepljali na gojišĉe EMB, manj kot 105
na 10 cm2,
kar pomeni za 2 log enoti manjše število od povpreĉnega števila vezanih E. coli v
preskusih.
4.3 NAĈIN SPIRANJA (PO ADHEZIJI)
Med procesom vezave se laktobacili veţejo na resice ĉrevesa. Nevezane laktobacile pa je
pred nadaljnjim postopkom obdelave potrebno sprati. V tem delu poskusa smo ugotavljali
najprimernejši naĉin spiranja vzorcev, potrebnega za odstranitev nevezanih bakterij.
6,6
6,7
6,8
6,9
7
7,1
7,2
7,3
7,4
7,5
1 2 3 4
Naĉin spiranja
Lo
g š
t. v
ezan
ih c
eli
c s
ev
ov
K7
in
LF
22
1 (
KE
/10
cm2
)
K7
LF221
Slika 9: Vpliv postopka spiranja
Legenda:
Spiranje 1 košĉek ĉrevesa smo spirali samo roĉno (narahlo s pomakanjem v pufru PBS)
Spiranje 2 najprej roĉno spiranje, nato še 5 minut v stresalniku (37 °C, 150 obratov/min. v 200 ml pufra
PBS)
Spiranje 3 roĉno, nato dvakrat po 5 minut v stresalniku
Spiranje 4 roĉno in še 3 x 5 minut v stresalniku z vmesno menjavo pufra
Glede na rezultate (slika 9) je razvidno, da je po prvem naĉinu spiranja, ki je vkljuĉevalo le
roĉno spiranje s pomakanjem v pufer, ostalo pripetih na vzorce sluznice znaĉilno veĉ
testnih laktobacilov kot pri ostalih treh postopkih, ki so vkljuĉevali še dodatne korake
inkubacije v stresalniku. Pri sevu K7 je število vezanih celic pri postopku 1 znaĉilno veĉje
(p<0,05) od števila, dobljenega pri ostalih treh postopkih. Rezultati postopkov 2, 3 in 4 se
med seboj ne razlikujejo. Podobno lahko zakljuĉimo za sev LF221.
Ţe en ciklus stresanja je odstranil slabše vezane laktobacile, saj se po enem ali dveh
dodatnih ciklih stresanja število vezanih laktobacilov ni veĉ znaĉilno zmanjšalo. Na
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
38
podlagi rezultatov tega preskusa smo v nadaljnjih testih uporabljali protokol, ki je
vkljuĉeval najprej roĉno in nato še enkratno pet minutno spiranje vzorcev v stresalniku, v
pufru PBS.
4.4 PRIMERJAVA MED KONCENTRACIJO SUSPENZIJE IN VEZANIMI
CELICAMI
y = 0,6286x + 2,5465
R2 = 0,8331
y = 0,4635x + 3,4926
R2 = 0,774
4
4,5
5
5,5
6
6,5
7
7,5
8
8,5
5 5,5 6 6,5 7 7,5 8 8,5 9
Koncentracija celic v suspenziji (log KE/cm2 )
Ad
hezi
ran
e c
elice (
log
KE
/cm
2 )
LF
K7
Linearno (LF)
Linearno (K7)
Slika 10: Primerjava koncentracije laktobacilov v suspenziji s številom vezanih laktobacilov
Slika 10 prikazuje primerjavo med koncentracijo suspenzij sevov LF221 oz. K7 in
logaritemskim številom vezanih kolonijskih enot obeh laktobacilov. Pri tem je razvidno,
tako pri sevu LF221 kot K7, da je višji koncentraciji suspenzije sledilo tudi veĉje število
vezanih kolonijskih enot. Koeficient determinacije v primeru seva LF221 je znašal R2 =
0,8331 in je pomenil, da smo pojasnili 83,31% variabilnosti. V primeru seva K7 je bil R2 =
0,774 in je bilo pojasnjene 77,4% variabilnosti. V obeh primerih je dodana tudi regresijska
enaĉba. Linearna funkcija slabše opiše povezavo med izhodišĉnim številom laktobacilov v
suspenziji in številom laktobacilov, ki so se vezali na ĉrevesno sluznico (nizke vrednosti
R2).
Primerjava med koncentracijo suspenzije ter številom vezanih L. gasseri K7 in LF221
kaţe, da se nekoliko bolje veţe LF221, kar lahko izraĉunamo tudi z regresijsko enaĉbo. Pri
obeh sevih je razvidno, da je višji koncentraciji suspenzije sledilo tudi veĉje število
vezanih kolonijskih enot.
Koncentracija laktobacilov v suspenziji
(log KE/ml)
Šte
vil
o v
ezan
ih L
. ga
sser
i K
7 i
n L
F2
21
(KE
/10
cm
2)
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
39
4.5 VEZAVA
Preglednica 5: Povpreĉne koncentracije suspenzij E. coli, ter sevov K7 in LF221 (log KE/ml) v
posameznih poskusih celotne naloge, izraţene v logaritemskih vrednostih
Poskus 1 Poskus 2 Poskus 3 Poskus 4 Poskus 5
Ec 7,83 6,54 7,88 7,85 7,85
K7 7,13 6,07 7,77 7,76 7,76
LF 7,01 6,48 7,95 8,42 8,42
Koncentracije suspenzij sevov E. coli O8:K88, K7 ter LF221 v posameznem poskusu
celotne naloge (preglednica 5). Pri tem smo ţeleli, da bi bile koncentracije suspenzij E. coli
pri vseh petih poskusih ĉimbolj enake, pri obeh laktobacilih pa razliĉne. Najniţje
koncentracije suspenzij smo imeli v drugem poskusu.
4,0
4,5
5,0
5,5
6,0
6,5
7,0
7,5
8,0
Poskus 2
6,07
Poskus 1
7,13
Poskus 4
7,76
Poskus 5
7,76
Poskus 3
7,77
Šte
vil
o v
ezan
ih L
. g
ass
eri
K7
(KE
/10
cm
2)
Število dodanih L. gasseri K7 v poskusu (log KE/ml)
K7 K7/Ec Ec/K7 K7+Ec
Slika 11: Vezava L. gasseri K7 na tanko ĉrevo prašiĉev pri razliĉni zaĉetni koncentraciji
Legenda: Susp. K7 – koncentracija suspenzij seva L. gasseri K7 (KE/ml)
K7 - inkubacija tkiva v suspenziji samostojnih sevov L. gasseri K7
K7/Ec – inkubaciji tkiva v suspenziji L. gasseri K7 je sledila inkubacija v suspenziji E. coli (izkljuĉevanje)
Ec/ K7 - inkubaciji tkiva v suspenziji E. coli je sledila inkubacija v suspenziji L. gasseri K7 (izpodrivanje)
K7+Ec – inkubacija tkiva v mešanici obeh sevov (tekmovanje) Prikazane so srednje vrednosti ± SD dveh ponovitev. Zvezdica (*) ponazarja srednjo vrednost, ki se je
statistiĉno znaĉilno (p<0,05) razlikovala od kontrolnega vzorca, to je ĉiste kulture L. gasseri K7 (K7).
Slika 11 prikazuje uspešnost vezave L. gasseri K7 (KE/10 cm2) glede na koncentracijo
dodanih L. gasseri K7 (log KE/ml) v vseh petih poskusih. Pri tem smo v sliki po velikosti
razvrstili dodano koliĉino suspenzije (log KE/ml) in temu primerno razvrstili zaporedno
številko opravljenega poskusa. Prikazana je vezava L. gasseri K7 samostojnega seva, ter v
*
*
*
*
*
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
40
poskusih izkljuĉevanja (K7/Ec), izpodrivanja (Ec/K7) in tekmovanja (K7+Ec). Podatki
prikazujejo logaritmirane srednje vrednosti ± SD dveh ponovitev. Na sliki je opaziti, da se
je L. gasseri K7 sposoben vezati in da z narašĉanjem koncentracije suspenzije narašĉa tudi
koliĉina vezanega seva K7. Prav tako je opaziti, da je število vezanih K7 v primeru
izkljuĉevanja (K7/Ec) pri vseh poskusih nekoliko niţje od ostalih naĉinov (samostojno
vezanje seva, tekmovanje, izpodrivanje).
Primerjava statistiĉno znaĉilnega odstopanja od samostojno vezanega seva K7 kaţe, da je
to le pri poskusu 1, kjer je koncentracija dodane K7 (7,13 log KE/ml) in sicer statistiĉno
znaĉilno odstopa izkljuĉevanje (K7/Ec), (P<0,0001). Pri ostalih poskusih ni bilo statistiĉno
znaĉilnega odstopanja od samostojno vezanega seva K7.
Ĉe pa med sabo primerjamo vse naĉine vezave znotraj poskusa vidimo, v poskusu 2, kjer
je koncentracija dodane K7 (6,07 log KE/ml), statistiĉno znaĉilno odstopanje v primeru
izkljuĉevanja (K7/Ec) in tekmovanja (K7+Ec). Na grafu je statistiĉno znaĉilno odstopanje
ponazorjeno z zvezdico (*).V poskusu 1 se v tem primeru statistiĉno znaĉilno razlikujejo
vsi naĉini vezave. Pri ostalih poskusih ni bilo statistiĉno znaĉilnega odstopanja.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
41
4,0
4,5
5,0
5,5
6,0
6,5
7,0
7,5
8,0
8,5
Poskus 2
6,48
Poskus 1
7,01
Poskus 3
7,95
Poskus 4
8,42
Poskus 5
8,42
Šte
vil
o v
ezan
ih L
. g
ass
eri
LF
22
1
(KE
/10
cm2)
Število dodanih L. gasseri LF221 v poskusu (log KE/ml)
LF LF/Ec Ec/LF LF+Ec
Slika 12: Vezava L. gasseri LF221na tanko ĉrevo prašiĉev pri razliĉni zaĉetni koncentraciji
Legenda:
Susp. LF – koncentracija suspenzij seva Lactobacillus gasseri LF221 (KE/ml)
Susp. Ec – koncentracija suspenzij E. coli (KE/ml)
Ec - inkubacija tkiva v suspenziji samostojne E. coli
LF/Ec – inkubaciji tkiva v suspenziji seva LF221 je sledila inkubacija v suspenziji E. coli (izkljuĉevanje)
Ec/LF - inkubaciji tkiva v suspenziji E. coli je sledila inkubacija v suspenziji seva LF221 (izpodrivanje)
LF+Ec – inkubacija tkiva v mešanici obeh sevov (tekmovanje) Prikazane so srednje vrednosti ± SD dveh ponovitev. Zvezdica (*) ponazarja srednjo vrednost, ki se je
statistiĉno znaĉilno (p<0,05) razlikovala od kontrolnega vzorca, to je ĉiste kulture L. gasseri LF221 (LF).
Slika 12 prikazuje uspešnost vezave seva L. gasseri LF221 (log KE/10 cm2) na ĉrevesno
sluznico prašiĉev. Podatki prikazujejo logaritmirane srednje vrednosti ± SD dveh
ponovitev. V sliki smo po velikosti razvrstili dodano koliĉino suspenzije (log KE/ml) in
temu primerno razvrstili zaporedno številko opravljenega poskusa. Vidimo, da se je L.
gasseri LF221 sposoben vezati na celice ĉrevesne sluznice. Z veĉjo koncentracijo dodane
suspenzije LF221 se poveĉa tudi število vezanih sevov. Tudi tu smo ţeleli, da bi bile
koncentracije suspenzij E. coli pri vseh petih poskusih ĉimbolj enake, pri laktobacilu pa
razliĉne (preglednica 5). Do najvišjega števila vezanih L. gasseri LF221 je prišlo v
poskusu 3, kjer smo dodali 7,95 KE/ml LF221, pri višji koncentraciji suspenzije pa se je
koliĉina vezanih laktobacilov nekoliko zmanjšala. Razlike so sicer majhne, lahko pa
pomislimo, da je prišlo do zasiĉenosti vezave laktobacila. Statistiĉna obdelava kaţe, da se
nobena od skupin izkljuĉevanja, izpodrivanja ali tekmovanja statistiĉno znaĉilno ne
razlikuje.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
42
4,0
4,5
5,0
5,5
6,0
6,5
7,0
7,5
8,0
Poskus 2
6,54
Poskus 1
7,83
Poskus 4
7,85
Poskus 5
7,85
Poskus 3
7,88
Šte
vil
o v
ezan
ih
E. co
li
(KE
/10
cm2)
Število dodanih E. coli v poskusu (log KE/ml)
Ec K7/Ec Ec/K7 K7+Ec
Slika 13: Zaviranje vezave E. coli, na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev, z L.gasseri K7, pri
razliĉnih koncentracijah dodane suspenzije E. coli, pod pogoji izkljuĉevanja (K7/Ec),
izpodrivanja (Ec/K7) in tekmovanja (K7+Ec)
Legenda:
Susp. Ec – koncentracija suspenzij seva E. coli (KE/ml)
K7 - inkubacija tkiva v suspenziji samostojnih sevov L. gasseri K7
K7/Ec – inkubaciji tkiva v suspenziji L. gasseri K7 je sledila inkubacija v suspenziji E. coli
Ec/ K7 - inkubaciji tkiva v suspenziji E. coli je sledila inkubacija v suspenziji L. gasseri K7
K7+Ec – inkubacija tkiva v mešanici obeh sevov Prikazane so srednje vrednosti ± SD dveh ponovitev. Zvezdica (*) ponazarja srednjo vrednost, ki se je
statistiĉno znaĉilno (p<0,05) razlikovala od kontrolnega vzorca, to je ĉiste kulture E. coli (Ec).
Slika 13 nam prikazuje vezavo oz. zaviranje vezave E. coli na ĉrevesno sluznico tankega
ĉrevesa prašiĉev z L. gasseri K7. Vseh pet poskusov smo na sliki razvrstili glede na
koliĉino dodane suspenzije E. coli in sicer od najmanjše (6,54 KE/ml), pa do najveĉje (7,88
KE/ml). Razliĉne so tudi dodane suspenzije K7 in sicer (6,07), (7,13), (7,76), (7,76) in
(7,77 KE/ml). Razvidno je, da se je E. coli sposobna vezati na epitelne celice ĉrevesa, tako
samostojno, kot ob uĉinkovanju seva L. gasseri K7. V poskusu dva, pri naĉinu, kjer je
inkubacija tkiva potekala samo v ĉisti suspenziji E. coli, je najverjetneje prišlo do napake
pri delu, zaradi tega na gojišĉu niso zrasle kolonije E. coli. Kljub temu primeri
izkljuĉevanja, izpodrivanja in tekmovanja kaţejo sposobnost vezave E. coli tudi v
celotnem drugem poskusu. Statistiĉno analizo smo opravili z GLM proceduro,
Studentovim t testom. Primerjali smo rezultate znotraj vsakega od petih poskusov.
Kontrolne vzorce so ponazarjale srednje vrednosti vezane samostojne oz. ĉiste E. coli (Ec).
V poskusu 2 tega rezultata nismo dobili, zato v tem primeru statistiĉna obdelava ni bila
mogoĉa. V dveh (poskusa 4 in 5) od petih preskusov smo opazili nekaj znaĉilnih razlik
* *
* * *
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
43
(p<0,05) v vezavi E. coli (Ec) v ĉisti kulturi od vezave v primerih tekmovanja,
izpodrivanja in izkljuĉevanja. Izkljuĉevanje (K7/Ec) in izpodrivanje (Ec/K7) E. coli s
strani laktobacila K7 v veĉini primerov ni bilo statistiĉno znaĉilno.
4,0
4,5
5,0
5,5
6,0
6,5
7,0
7,5
8,0
Poskus 2
6,54
Poskus 1
7,83
Poskus 4
7,85
Poskus 5
7,85
Poskus 3
7,88
Šte
vil
o v
ezan
ih E
. co
li
(KE
/10
cm2)
Število dodanih E. coli v poskusu (KE/ml)
Ec LF/Ec Ec/LF LF+Ec
Slika 14: Zaviranje vezave E. coli na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev z L. gasseri LF221, pri
razliĉnih koncentracijah dodane suspenzije E. coli, pod pogoji izkljuĉevanja (LF/Ec),
izpodrivanja (Ec/LF) in tekmovanja (LF+Ec)
Legenda:
Susp. Ec – koncentracija suspenzij E. coli (KE/ml)
Ec - inkubacija tkiva v suspenziji samostojne E. coli
LF/Ec – inkubaciji tkiva v suspenziji seva LF221 je sledila inkubacija v suspenziji E. coli
Ec/LF - inkubaciji tkiva v suspenziji E. coli je sledila inkubacija v suspenziji seva LF221
LF+Ec – inkubacija tkiva v mešanici obeh sevov Prikazane so srednje vrednosti ± SD dveh ponovitev. Zvezdica (*) ponazarja srednjo vrednost, ki se je
statistiĉno znaĉilno (p<0,05) razlikovala od kontrolnega vzorca, to je ĉiste kulture E. coli (Ec).
Slika 14 nam prikazuje vezavo oz. zaviranje vezave E. coli na ĉrevesno sluznico tankega
ĉrevesa prašiĉev z L. gasseri LF221. Koliĉine dodane suspenzije LF221 v posameznem
poskusu so razliĉne in sicer pri 6,54 KE/ml E. coli je dodano (6,48 KE/ml) LF221, nadalje
(7,01), (8,42), (8,42), in pri 7,88 KE/ml dodane suspenzije E. coli je bilo suspenzije LF221
(7,95 KE/ml). Podatki prikazujejo srednje vrednosti ± SD dveh ponovitev. Razvidno je, da
se je E. coli sposobna vezati na epitelne celice ĉrevesa, tako v primeru, kjer smo tkivo
inkubirali samo v suspenziji E. coli, kot tam, kjer je uĉinkoval dodan sev LF221.
V poskusu 2, za tkivo samo v ĉisti suspenziji Ec., kjer je dodane E. coli 6,54 KE/ml, zaradi
najverjetnejše napake pri delu in poslediĉno manjkajoĉega rezultata, statistiĉna obdelava ni
bila mogoĉa. Sicer pa ta kaţe, da se, z eno izjemo (poskus 3, LF/Ec) nobena od skupin
*
*
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
44
izkljuĉevanja, izpodrivanja ali tekmovanja statistiĉno znaĉilno ne razlikuje od primerjalne
skupine, kjer smo tkivo inkubirali v suspenziji samostojne E. coli. Na sliki pa je razvidno,
da je v vseh poskusih najuspešnejša vezava E. coli v primeru tekmovanja, najmanj pa pri
izpodrivanju E. coli s strani LF221.
5 RAZPRAVA IN SKLEPI
5.1 RAZPRAVA
Vezava na ĉrevesno sluznico je pomemben kriterij za izbiro probiotiĉnih sevov. Narejen je
bil poskus vezave dveh probiotikov, L. gasseri LF221 in L. gasseri K7, na ĉrevesno
sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev. Prej imenovani L. gasseri LF221 so kasneje
prerazporedili v vrsto L. gasseri. Ĉloveška probiotiĉna seva L. gasseri K7 in LF221 sta
izolirana iz razliĉnih otrok ter ob razliĉnem ĉasu, izkazalo pa se je, da producirata enake
bakteriocine. Ugotovili so, da so genski nukleotidni zapisi za bakteriocina seva K7,
poimenovana gassericin K7 A (GenBank EF392861) in gassericina K7 B (GenBank
AY307382), podobni zapisom za bakteriocine seva LF221 (acidocin LF221 A in acidocin
LF221 B) (Bogoviĉ Matijašić in Rogelj, 1998; Zoriĉ-Peternel in sod., 2010). V poskus v tem delu so bili vkljuĉeni devet mesecev stari prašiĉi pitanci. Uporabili smo
osrednji del tešĉega ĉrevesa (jejunuma). Prebavni sistem prašiĉev je primerljiv s
ĉloveškim, zato so prašiĉi veĉkrat uporabljeni kot testne ţivali znanstvenih poskusov, med
njimi tudi poskusov glede uporabe probiotikov (Goldin in sod., 1988; Singer in sod., 2003;
Jensen in sod., 2011).
Ohlajene vzorce ĉrevesne sluznice, ki smo jih takoj po ţrtvovanju ţivali na ledu prenesli v
laboratorij, smo sprali s pufrom, da smo odstranili obstojeĉo mikrobioto ĉrevesa, nato smo
narezali vzorce velikosti 10 cm2. Po ponovnem spiranju s pufrom smo nekaj vzorcev
sluznice pregledali s štetjem na plošĉah, da smo videli, kako uspešno smo odstranili
endogeno mikrobioto, rezultate pa imenovali »vzorec 0«. To kontrolo smo izvajali tekom
vseh petih neodvisnih poskusov. Ugotovili smo, da smo endogeno mikrobioto v veĉji meri
odstranili, saj je je ostalo za najmanj 2 log enoti manj kot se je na sluznico vezalo testnih
laktobacilov oz. E. coli.
Seva L. gasseri K7 in L. gasseri LF221, ki sta znana kot varna probiotika, ter sta
bakteriocinogena in imata širok spekter protimikrobne aktivnosti (Bogoviĉ Matijašić in
sod., 2004), smo predhodno namnoţili s kultivacijo v komercialnem gojišĉu MRS. S
centrifugiranjem smo odstranili preostalo gojišĉe, celice pa resuspendirali v pufru z
ustrezno pH vrednostjo, tako da smo dobili ustrezne koncentracije suspenzij, v katere smo
pomakali košĉke. Koncentracije suspenzij obeh laktobacilov in E. coli v petih neodvisnih
poskusih, nacepljene in preštete na petrijevih plošĉah so variirale:
- K7 od 1,2x106 KE/ml do 5,95x10
7 KE/ml,
- LF221 od 3x106 KE/ml do 2,65x10
8 KE/ml,
- E.c. od 3,5x106 KE/ml do 7,55x10
7 KE/ml.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
45
Pripravljene vzorce tkiva smo vsakiĉ potopili v suspenzijo celic enega od preskušanih
sevov in inkubirali pri 37 °C 30 minut, s ĉimer smo omogoĉili vezavo preskušanih bakterij
na še vedno ţive ĉrevesne epitelne celice. Nevezane celice smo sprali z vzorcev tkiva. Na
koncu smo število vezanih celic ugotovili tako, da smo vzorce prenesli v steklenice s
fiziološko raztopino, vsakega posebej homogenizirali, pripravili razredĉitve, jih nacepili na
komercialno selektivno gojišĉe, inkubirali in prešteli zrasle kolonije.
Rezultate povpreĉnih koncentracij suspenzij sevov LF221, K7 ter E. coli v posameznem
poskusu smo pretvorili v logaritemske vrednosti (preglednica 5). Pri tem smo ţeleli, da bi
bile koncentracije suspenzij E. coli pri vseh petih poskusih ĉimbolj enake, kar je uspelo v
zadnjih štirih poskusih, pri obeh laktobacilih pa razliĉne (dokaj enake so v zadnjih treh
poskusih).
Znano je, da nekateri mikroorganizmi rastejo na površini resic (epitelija), drugi ţivijo
prosto v lumnu ĉrevesja, tretji pa se razrašĉajo po kanalih kript in po epiteliju. (Fuller,
1984). Ţeleli smo prešteti samo vezane mikroorganizme. Roĉno spiranje, s tresenjem
košĉka s pinceto v PBS, in nato še 5 minutno spiranje v stresalniku pri 37 °C, 150
obratih/min., v 200 ml pufra PBS, se je pokazalo kot najprimernejši naĉin spiranja
nevezanih laktobacilov. Postopek spiranja je bil uspešen in smo ga izvajali tekom vseh
poskusov.
Ugotavljali smo sposobnost ex vivo vezave L. gasseri K7 na ĉrevesno sluznico tankega
ĉrevesa prašiĉev. Po Kališniku (2002) metoda ex vivo pomeni delovanje v poskusnih
razmerah zunaj ţivega organizma. Delali smo s tkivom, katero je bilo dnevno sproti
odvzeto prašiĉem, v manj kot dveh urah po odvzemu pa smo priĉeli izvajati poskus.
Ţivljenjske funkcije ĉrevesa so torej bile še aktivne in tako je bilo ustvarjeno ĉimbolj
kompleksno in fiziološko ţivemu podobno ĉrevesno okolje.
Dokazana je ţe bila sposobnost vezave laktobacilov na plošĉate epitelijske celice v grlu in
poţiralniku prašiĉev in drugih ţivali Fuller in sod., 1978. Mäyrä-Mäkinen in sod. (1983) so
prouĉevali vezavo razliĉnih laktobacilov na stebriĉaste epitelne celice z in vitro metodo. Po
Kališniku, 2002 in vitro raziskave potekajo v umetnem okolju (v epruveti ali v posodi za
kulturo tkiva). Pri tem simuliramo pogoje, ki so podobni tistim v gostitelju (npr. v
prebavilih) (Lavrenĉiĉ, 2003).
Naš adhezijski test je bil izveden in prirejen po metodi Mäyrä-Mäkinen (1983). Sposobnost
vezave L. gasseri K7 na epitelne celice ĉrevesne sluznice smo dokazali (slika 11). Veĉji
koncentraciji dodanih laktobacilov je vedno sledilo veĉje število vezanih laktobacilov K7.
Opazimo, da je kljub veĉji razliki v koliĉini dodane suspenzije med drugim in prvim
poskusom napram prvim in ĉetrtim poskusom, vezava pri slednjem veĉja. Ta preskok
lahko pove, da je za dovoljšno vezavo in uspešno delovanje dobre mikrobiote v ĉrevesju
potrebna doloĉena koliĉina posameznega laktobacila. Zato moramo biti pozorni pri
navedbi vsebovane koliĉine ali roku uporabe izdelka z laktobacili, saj koliĉina laktobacilov
s starostjo izdelka pada, poslediĉno pa tudi število vezanih laktobacilov.
Ugotavljali smo tudi sposobnost ex vivo vezave L. gasseri LF221 na ĉrevesno sluznico
tankega ĉrevesa prašiĉev. Spencer in Chesson (1994) sta izolate, prvotno zrasle na MRS
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
46
agarju in preštete pod mikroskopom, razdelila na moĉno vezane in nevezane oz. slabo
vezane na enterocite jejunuma. V poskusu je bilo vkljuĉenih 43 laktobacilov izoliranih iz
razliĉnih delov prebavnega trakta, med njimi je bilo 11 primerkov sevov L. acidophilus,
nato L. fermentum, L. salivarius, L. delbruckii, L. plantarum in drugi. V nadaljevanju
poskusa na sveţe pripravljenih prašiĉjih enterocitih se je kot najmoĉneje vezan izkazal L.
fermentum, nasprotno od priĉakovanega, pa so se vsi sevi L. salivarius in veĉina sevov L.
acidophilus izkazali kot slabo vezani na enterocite jejunuma. V našem primeru je vezava
potekala dobro (slika 12), opaziti pa je, da je najboljša vezava potekala v poskusu 3 s 7,95
log ke/ml dodanih LF221, pri višji vrednosti dodanih laktobacilov pa je bila vezava
nekoliko slabša, kar kaţe tudi na vpliv dodane koliĉine suspenzije in morebitno zasiĉenost.
Spencer in Chesson (1994) tudi navajata veliko boljšo sposobnost vezave tistih trdno
vezanih Lactobacillus spp., ki so rasli na MRS trdem gojišĉu, kot pa v tekoĉem gojišĉu
MRS. V našem poskusu smo uporabili tekoĉe gojišĉe MRS, vezava pa je bila kljub temu
uspešna.
Mäyrä-Mäkinen in sod. (1983) navajajo, da so bili pri prašiĉih iz ĉrevesnega tkiva in blata
najpogosteje izolirani sevi vrst L. delbrueckii, L. acidophilus in L. fermentum. Pri tem se je
na epitelne celice prašiĉev dobro vezalo 13 od 22 sevov laktobacilov, kar dokazuje
uspešnost vezave. Splošno pa je vezava bila variabilna celo med sevi iste vrste. Sicer pa so
tudi dokazali, da adhezivni sevi pri prašiĉih tolerirajo nizek pH in ţolĉne kisline, kar je
pomembno za njihovo preţivetje pod pogoji, ki so v ţelodcu in ĉrevesju.
Primerjali smo tudi vezavo obeh sevov testnih laktobacilov L. gasseri. Relacija med
številom dodanih in vezanih celic v poskusu je bila doloĉena z regresijsko analizo pa
metodi najmanjših kvadratov (slika 15). Vidimo, da se sev LF221 veţe bolje kot sev K7.
Linearna funkcija slabše opiše povezavo med izhodišĉnim številom laktobacilov v
suspenziji in številom laktobacilov, ki so se vezali na ĉrevesno sluznico (nizke vrednosti
R2). Razvidno pa je, da z narašĉajoĉo koliĉino dodane suspenzije narašĉa tudi koliĉina
vezanih laktobacilov, tako pri K7 kot LF221. Koeficient determinacije v primeru seva
LF221 znaša (R2 = 0,833), s tem smo pojasnili 83,31% variabilnosti. Bogoviĉ Matijašić in
sod. (2003) prav tako navajajo, da višji koncentraciji suspenzije sledi veĉje število vezanih
kolonijskih enot, vse dokler ne pride do zasiĉenosti.
V nadaljevanju nas je zanimala reakcija laktobacilov v primerih, ko v realni situaciji
delovanja ĉrevesa prostora epitelnih celic ne zasedajo sami, ampak se morajo boriti s
posameznimi patogeni. Vkljuĉena so bile tudi bakterije E. coli, kot tipiĉni tipiĉne
predstavnice enterobakterij.
Preizkušali smo vezavo obeh sevov laktobacilov ter E. coli v razmerah tekmovanja
(laktobacili in E. coli dodani istoĉasno), izkljuĉevanja (laktobacili dodani pred E. coli)
oziroma izpodrivanja (E. coli dodana pred laktobacili).
Pri statistiĉni obdelavi podatkov smo za testiranje vezave laktobacilov na sluznico ĉrevesa,
simulirano kot izpodrivanje, izkljuĉevanje in tekmovanje, uporabili Studentov t test
(p<0,05) in sicer na podlagi primerjav s kontrolnimi primeri, katere so predstavljali ĉisti
sevi. Znaĉilnost posameznih vplivov nam povedo p – vrednosti.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
47
Vpliv poskusa in vpliv skupine v modelu laktobacilov (model 1) smo obdelali z metodo
najmanjših kvadratov, ANOVA. V analizo je vkljuĉenih 5 poskusov, 8 skupin, vseh
opazovanj je bilo 80. Koeficient determinacije modela 1 znaša R2
= 0,920963. S tem
modelom smo torej pojasnili 92,1% variabilnosti. Vpliv poskusa je visoko statistiĉno
znaĉilen (p<0,0001), prav tako je visoko statistiĉno znaĉilen vpliv skupine (p<0,0001)
(priloga A).
Rezultati nadaljnje razdelitve na posamezne nivoje vplivov v modelu laktobacilov (model
1) kaţejo, da je vpliv poskusa 1 in 2 visoko statistiĉno znaĉilen (p<0,0001), poskusa 3
statistiĉno znaĉilen (p = 0,0421), poskusa 4 pa statistiĉno neznaĉilen (p = 0,6216). Vpliv
skupine je bil visoko statistiĉno znaĉilen v primeru tekmovanja (K7+Ec) in izkljuĉevanja
(K7/Ec), vpliv ostalih posameznih skupin je bil statistiĉno znaĉilen, medtem ko je vpliv t.i.
tekmovanja med sevom LF in E. coli (LF+Ec), statistiĉno neznaĉilen (p = 0,6491). (priloga
B).
Vpliv poskusa in vpliv skupine v modelu E. coli (model 2), smo obdelali z metodo
najmanjših kvadratov, ANOVA V analizo je vkljuĉenih 5 poskusov, 7 skupin. Vseh
opazovanj je bilo 70, zaradi manjkajoĉih podatkov jih je bilo v analizo vkljuĉenih 67.
Koeficient determinacije modela 2 znaša R2
= 0,8613 in pove, da smo z modelom pojasnili
86,13% variabilnosti. Vpliv poskusa je visoko statistiĉno znaĉilen (p<0,0001), prav tako je
na vezavo seva E. coli na sluznico ĉrevesa visoko statistiĉno znaĉilno vplivala skupina
(p<0,0001) (priloga C).
Rezultati nadaljnje razdelitve na posamezne nivoje vplivov modela 2 kaţejo, da sta
poskusa 1 in 2 visoko statistiĉno znaĉilno vplivala na število (log ke) vezanih sevov E. coli
(p<0,0001). Poskus 3 je statistiĉno znaĉilno vplival (p = 0,0078), poskus 4 pa je bil
statistiĉno neznaĉilen. Visoko statistiĉno znaĉilni sta bili skupini tekmovanja (K7+Ec) in
(LF+Ec), skupina izpodrivanja (Ec/LF) je vplivala statistiĉno znaĉilno (p = 0,0275), vpliv
ostalih skupin pa je bil statistiĉno neznaĉilen (priloga D).
Z metodo najmanjših kvadratov je bilo ugotovljeno, da je p – vrednost vsakega od nivojev
skupin, tako pri modelu 1, kot modelu 2, enaka p<0,0001, vpliv skupin je torej statistiĉno
znaĉilen. Pri tem je bil za model 1 uporabljen Tukey-ev test, za model 2 pa Tukey-
Kramarjev test.
Z metodo najmanjših kvadratov, vpliv interakcije med poskusom in skupino, pri vezavi L.
gasseri K7 (slika 11, priloga J) so v poskusu 2, kjer je bilo število dodanih laktobacilov K7
7,13 log KE/ml, statistiĉno znaĉilne razlike med izkljuĉevanjem (K7/Ec) in tekmovanjem
(K7+Ec). V poskusu 1 so statistiĉno znaĉilne razlike med izkljuĉevanjem (K7/Ec) in
izpodrivanjem (Ec/K7), med izkljuĉevanjem (K7/Ec) in vezavo ĉiste kulture K7 (K7), ter
med izkljuĉevanjem (K7/Ec) in tekmovanjem (K7+Ec). V tretjem, ĉetrtem in petem
poskusu ni bilo statistiĉno znaĉilnih razlik. Opaziti je, da je število vezanih L. gasseri K7 v
primeru izkljuĉevanja (K7/Ec) pri vseh poskusih nekoliko niţje od ostalih naĉinov
(samostojno vezanje seva, tekmovanje, izpodrivanje).
Dokazali smo tudi uspešnost vezave L. gasseri LF221 v primerih izkljuĉevanja,
izpodrivanja in tekmovanja, vendar statistiĉno znaĉilnih razlik ni bilo (slika 12). Do
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
48
najvišjega števila vezanih L. gasseri LF221 je prišlo v poskusu 3, kjer smo dodali 7,95 log
KE/ml LF221, pri višji koncentraciji dodane suspenzije pa se je koliĉina vezanih
laktobacilov nekoliko zmanjšala. Razlike so sicer majhne, lahko pa pomislimo, da je prišlo
do zasiĉenosti vezave laktobacila. Nekoliko veĉ LF221 je vezanih v primeru izpodrivanja
(Ec/LF). To bi morda lahko pomenilo, da je v primeru okuţbe ĉrevesja s sevi E. coli
smiselno uţivati L. gasseri LF221, saj se ta v primeru izpodrivanja (Ec/LF), kljub invaziji
patogena, še nekoliko uspešnejše veţe.
Vezavo oz. zaviranje vezave E. coli na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev z L.
gasseri K7 smo dokazali (slika 13). Statistiĉno analizo smo opravili z metodo najmanjših
kvadratov, GLM proceduro, Tukey-Kramerjev test, odvisna spremenljivka je log E. coli;
Studentovim t testom. Primerjali smo rezultate znotraj vsakega od petih poskusov, vpliv
interakcije med poskusom in skupino. Kontrolne vzorce so ponazarjale srednje vrednosti
vezane samostojne oz. ĉiste E. coli (Ec). V poskusu 2 tega rezultata nismo dobili, zato v
tem primeru statistiĉna obdelava ni bila mogoĉa. Rezultati analiz preostalih poskusov nam
kaţejo, da se od vezave E. coli v ĉisti kulture (Ec) statistiĉno znaĉilno razlikuje (p<0,05)
samo t.i. tekmovanje (K7+Ec) med E. coli in K7 (p=0,0234), in sicer znotraj poskusa 4.
Izkljuĉevanje (K7/Ec) in izpodrivanje (Ec/K7) E. coli s strani laktobacila K7 ni statistiĉno
znaĉilno.
Vezavo oz. zaviranje vezave E. coli na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev z L.
gasseri LF221 prikazuje slika 14. Nobena od skupin izkljuĉevanja, izpodrivanja ali
tekmovanja se statistiĉno znaĉilno ne razlikuje od primerjalne skupine, kjer smo tkivo
inkubirali v suspenziji ĉiste kulture E. coli. Na sliki pa je razvidno, da je v vseh poskusih
najuspešnejša vezava E. coli v primeru tekmovanja, najmanj pa pri izpodrivanju E. coli s
strani LF221. V poskusu 3, kjer je bilo najveĉ dodane E. coli, pa se vezava te statistiĉno
znaĉilno razlikuje med izkljuĉevanjem (LF/Ec) in tekmovanjem (LF+Ec).
Literature s podobno temo raziskovanja skorajda ni, zato je neposredna primerjava
nemogoĉa. Podobno kot v našem delu, so Spencer in Chesson (1994) opazili, da testiranje
v razmerah izkljuĉevanja (laktobacili dodani pred E. coli), tekmovanja (laktobacili in E.
coli dodani hkrati) in izpodrivanja (E. coli dodane pred laktobacili) vplivalo na vezavo
enterotoksigene E. coli na prašiĉje enterocite.
Raţman (2009) navaja, da so seva K7 in LF221 odkrili v ĉrevesni sluznici nekaterih
ţrtvovanih ţivali peti dan po zaĉetku dajanja (oralno), v blatu pa še šest dni po konĉanem
krmljenju s sevoma. To dokazuje, da sta seva sposobna pripenjanja na ĉrevesno sluznico in
imata dobre preţivitvene sposobnosti v prebavnem traktu (Raţman, 2009).
Stojković in sod. (2003) navajajo rezultate raziskave in vivo (v ţivem organizmu) o
inhibiciji E. coli z L. gasseri K7 na gnotobiotiĉnih pujskih. Laktobacili K7 so preţiveli in
zaĉasno kolonizirali prebavni trakt pujskov. Pri zaviranju E. coli s strani seva K7 so bili
prisotni razliĉni mehanizmi, kot stimulacija imunskega sistema in produkcija organskih
kislin ter tudi tekmovalno izkljuĉevanje. Opazovanje ţivali je pokazalo pozitivni uĉinek L.
gasseri K7 na kondicijo in zdravje prašiĉev. Vnetij ali razdraţenosti na ĉrevesju ţivali,
tretiranih s sevom K7 ni bilo opaziti, kar potrjuje varnost uporabe seva.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
49
Bogoviĉ Matijašić in sod. (2004) so oba seva, LF221 in K7, odstavljenim pujskom
aplicirali v obliki suspenzije celic (in vivo poskusi) in, podobno kot pri miših, dokazali
prisotnost obeh sevov v blatu. Pri tem so opazili pozitivne uĉinke predvsem seva K7 na
prirast in do doloĉene mere tudi na konverzijo krme, kot pomembnih dejavnikov
ekonomske prireje prašiĉev. Vsi pujski so ostali zdravi in tudi ni bilo diareje. Kolonije
identiĉne sevom LF221 in K7 so bile izolirane le iz blata ţivali, ki so bile krmljene s sevi
LF221 oziroma sevi K7.
Ĉeprav je Fuller (2006) dvomil, da je vezava na ĉrevesni epitel pomemben kolonizacijski
faktor, se je zavedal, da je kolonizacija bistven predpogoj probiotiĉne aktivnosti, saj tako
probiotiĉnim mikroorganizmom med drugim omogoĉi ĉas za izvrševanje njihovih uĉinkov.
Vezava na ĉrevesni steni tudi upoĉasni premikanje organizmov s peristaltiko. In z našo
nalogo je bilo dokazano, da so tako L. gasseri K7, L. gasseri LF221, kot E. coli sposobni
vezave na ĉrevesno sluznico prašiĉev tudi ex vivo.
5.2 SKLEPI
Glede na rezultate, ki smo jih dobili z raziskavo, smo prišli do nekaterih pomembnih
sklepov:
Seva L. gasseri K7 in L. gasseri LF221 sta sposobna vezave na ĉrevesno sluznico (ex
vivo).
Bakterije seva E. coli O8:K88 so se sposobne vezati na ĉrevesno sluznico prašiĉev (ex
vivo).
Seva L. gasseri K7 ter L. gasseri LF221 nista izkazala statistiĉno znaĉilnega vpliva na
vezavo E. coli na ĉrevesno sluznico prašiĉev (ex vivo) v testnih razmerah tekmovanja,
izkljuĉevanja ali izpodrivanja.
Prvi dve hipotezi, ki smo si ju zastavili pred izvajanjem poskusa, smo tako potrdili, zadnje
pa ne.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
50
6 POVZETEK
Namen našega dela je bil prouĉiti vezavo dveh sevov laktobacilov s probiotiĉnimi
lastnostmi, ki so jih dokazali v številnih predhodnih raziskavah in vitro in in vivo.
Zanimalo nas je, ali sta seva Lactobacillus gasseri K7 in Lactobacillus gasseri LF221
sposobna ex vivo vezave na ĉrevesno sluznico prašiĉev. Prav tako smo ugotavljali
sposobnost vezave Escherichia coli O8:K88 same na ĉrevesno sluznico ex vivo, kakor tudi
vezave v razmerah tekmovanja, izkljuĉevanja oziroma izpodrivanja.
Uporabili smo osrednji del prašiĉjega tankega ĉrevesa, to je tešĉega ĉrevesa ali jejunuma,
ki smo ga takoj po odvzemu na ledu prinesli v laboratorij in obdelali.
Ĉrevo smo vsakiĉ trikrat sprali s PBS in tako odstranili ĉrevesno vsebino, nato pa ga
razrezali na košĉke, velike 10 cm2. Sledila je inkubacija v hladilniku (4°C, 30 min), da se
je mukus-sluz odlušĉila, ter ponovno trikratno spiranje vsakega košĉka v PBS. Najprej smo
s štetjem na plošĉah preverili, ali smo iz vzorcev ĉrevesne sluznice uspeli odstraniti
endogeno mikrobioto. V ta namen smo vzorce homogenizirali, ustrezno razredĉili, nacepili
na hranljivi podlogi MRS za mleĉnokislinske bakterije ter EMB za enterobakterije,
inkubirali (37 °C, 48 oz. 24 ur) in nato prešteli kolonije. Ugotovili smo, da je prvotna
mikrobiota zadovoljivo izprana.
Pred poskusom smo testne seve L. gasseri K7, L. gasseri LF221 in E. coli O8:K88 nacepili
v sveţe gojišĉe in inkubirali 18 ur.
Z adhezijo smo najprej ţeleli ugotoviti sposobnost vezave ĉistih sevov L. gasseri LF221, L.
gasseri K7 ter E. coli ex vivo.
Tekmovanje med E. coli in L. gasseri LF221 smo izvedli tako, da smo v testu uporabili
suspenzijo, ki je vsebovala oba seva hkrati (Ec+LF), tekmovanje med E. coli in sevom K7
z mešanico kultur E. coli in L. gasseri K7 (Ec+K7).
Morebitno izpodrivanje E. coli s strani laktobacilov smo opazovali tako, da smo
posamezne košĉke pomoĉili najprej v suspenzijo E. coli, potem pa v enega od testnih
laktobacilov osnovnega vzorca. Oznaka teh je bila Ec/LF oziroma Ec/K7.
Izkljuĉevanje E. coli s strani laktobacilov je bilo simulirano na naĉin, da smo posamezne
košĉke ĉrevesa inkubirali najprej v suspenziji enega od testnih sevov laktobacilov, nato pa,
po vmesnem spiranju, v suspenziji E. coli. Oznaki vzorcev sta bili LF/Ec in K7/Ec.
Pri izvajanju poskusa vezave sevov na košĉke ĉrevesa smo po ţe zgoraj omenjeni zaĉetni
obdelavi ĉrevesa in po trikratnem spiranju vsakega košĉka v PBS, le te potapljali v
suspenzije celic preskušanih sevov in inkubirali pri 37 °C 30 minut, s ĉimer smo omogoĉili
vezavo preskušanih bakterij na enterocite ĉrevesne sluznice.
Nevezane celice smo, po prej dokazanem najprimernejšem naĉinu, sprali z vzorcev tkiva
najprej roĉno, nato še 5 minut v stresalniku (37 °C, 150 obratov/min. v 200 ml pufra PBS).
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
51
Vzorce smo prenesli v steklenice s fiziološko raztopino, homogenizirali, pripravili
razredĉitve, jih nacepili na komercialno selektivno gojišĉe, inkubirali in po metodi štetja na
plošĉah prešteli zrasle kolonije.
Za statistiĉno obdelavo smo uporabili statistiĉni paket SAS/STAT (1994) iz programskega
paketa SAS. Vse vrednosti, ki smo jih dobili po štetju mikroorganizmov na petrijevih
plošĉah, smo pred testiranjem pretvorili v logaritemske vrednosti. Lastnosti v poskusu smo
obdelali s statistiĉnim modelom. Kot sistematska vpliva smo v model vkljuĉili poskus (Pi)
in skupino (Sj), znaĉilnosti njunih vplivov pa testirali po metodi najmanjših kvadratov. Za
analizo razlik med skupinami smo uporabili test sredin in Tukeyev test.
Rezultati mikroskopiranja ĉrevesne sluznice so pokazali, da se oba seva, L. gasseri K7 in
L. gasseri LF221, veţeta na enterocite ĉrevesne sluznice.
Primerjava med koncentracijo suspenzije ter številom vezanih L. gasseri K7 in LF221 je
pokazala, da se nekoliko bolje veţe LF221, kar smo izrazili tudi z regresijsko enaĉbo. Pri
obeh sevih je razvidno, da je višji koncentraciji suspenzije sledilo tudi veĉje število
vezanih kolonijskih enot.
Tudi sev L. gasseri K7 se je uspešno vezal na ĉrevesno sluznico (ex vivo). V veĉini
preskusov nismo opazili, da bi bila vezava seva K7 v prisotnosti E. coli drugaĉna kot v
primeru, ko so bili vzorci izpostavljeni le laktobacilom seva K7. Podobno se je pokazalo
tudi pri preskušanju seva L. gasseri LF221 samega oziroma v kombinacijah z E. coli.
Sev E. coli O8:K88 je izkazal sposobnost vezave na ĉrevesno sluznico (ex vivo), tako v
primeru dodajanja ĉiste kulture kot tudi v razmerah izkljuĉevanja, izpodrivanja in
tekmovanja. Pri tem prisotnost sevov L. gasseri K7 ali L. gasseri LF221 ni znaĉilno
vplivala na vezavo E. coli na ĉrevesno sluznico prašiĉev.
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
52
7 VIRI
Andlovic A. 2002. Escherichia coli. V: Medicinska bakteriologija z imunologijo in
mikologijo. Gubina M., Ihan A. (ur.). Ljubljana, Medicinski Razgledi: 185-188
Batis J., Brglez I. 1984. Mikrobiologija za veterinarje: skripta. Splošni del. Ljubljana,
Biotehniška fakulteta, VTOZD za veterinarstvo: 112 str.
Bogoviĉ Matijašić B., Rogelj I. 1998. Bacteriocin complex of Lactobacillus gasseri LF221
— production studies in MRS media at different pH values and effect against
Lactobacillus helveticus ATCC 15009. Process Biochemistry, 33, 3: 345-352
Bogoviĉ Matijašić B., Rogelj I., Nes I. F., Holo H. 1998. Isolation and characterization of
two bacteriocins of Lactobacillus gasseri LF221. Applied Microbiology and
Biotechnology, 49: 606-612
Bogoviĉ Matijašić B., Rogelj I. 1999. Bacteriocinogenic activity of lactobacilli isolated
from cheese and baby faeces. Food Technology and Biotechnology, 37, 2: 93-100
Bogoviĉ Matijašić B., Rogelj I. 2000. Lactobacillus K7 – a new candidate for a probiotic
strain. Food Technology and Biotechnology, 38, 2: 113-119
Bogoviĉ Matijašić B., Narat M., Zoriĉ M. 2003. Adhesion of two Lactobacillus gasseri
probiotic strains on Caco-2 cells. Food Technology and Biotehnology, 41, 1: 83-88
Bogoviĉ Matijašić B., Narat M., Zoriĉ M., Rogelj I. 2006. Ability of Lactobacillus gasseri
K7 to inhibit E. coli adhesion in vitro on Caco-2 cells and ex vivo on pigs' jejunal tissue.
International Jurnal of Food Microbiology, 107, 92-96
Bogoviĉ Matijašić, B., Stojković, S., Salobir, J., Malovrh, Š., Rogelj, I. 2004. Evaluation of
the Lactobacillus gasseri K7 and LF221 strains in weaned piglets for their possible
probiotic use and their detection in the faeces. Animal Research, 53: 35-44
Bolduan G., Jung H., Schneider R. 1988. Recent advances in the nutrition of weaner
piglets. Pigs News and Information, 9, 4: 381-385
Carroll I. M., Ringel-Kulka T., Keku T. O., Chang, Y. H., Packey, C. D., Sartor, E. B.,
Ringel Y. 2011. Molecular analysis of the luminal-and mucosal-associated intestinal
microbiota in diarrhea-predominant irritable bowel syndrome. Americal Journal of
Physiology, Gastrointestinal and Liver Physiology, 301, 5: G799–G807
Cho J. H., Zhao P. Y., Kim I. H. 2011. Probiotics as a Dietary Additive for Pigs. Journal of
Animal and Veterinary Advances, 10: 2127-2134
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
53
Cranwell P. D. 1995. Development of the National Gut and Enzymes System. V: The
national Pig development and Survival. Varley M. A. (ur.). Leeds, Department of
Animal Physiology and Nutrition: 99-153
Ĉerne M. 1996. Morfološke, morfometrijske in histokemiĉne raziskave tankega ĉrevesa pri
malabsorpcijskem sindromu prašiĉev odstavljencev. Doktorska disertacija. Ljubljana,
Veterinarska fakulteta: 168 str.
De Magalhaes J. T., Bitencourt L. L., Teixeira leite M. C., do Carmo A. P., de Morase, C.
A. 2015. The use of probiotics to enhance animal performance. V: Probiotics and
Prebiotics: Current research and future trends. Venema K., do Carmo A. P. (ur.). UK,
Norfolk, Caister Academic Press: 459-468
Dolinšek J, Urlep-Ţuţej D, Miĉetić-Turk D. 2006. Sodobni principi diagnostike celiakije.
Zdravstveni Vestnik, 75: II-89-97
Dunne C., Murphy L., Flynn S., O'Mahony L., O'Halloran S., Feeney M., Morrissey D.,
Thornton G., Fitzgerald G., Daly C., Kiely B., Quigley E. M., O'Sullivan G. C.,
Shanahan F., Collins J. K. 1999. Probiotics: from myth to reality. Demonstration of
functionality in animal models of disease and in human clinical trials. Antonie Van
Leeuwenhoek, 76: 279-292
Dunne C., O’Mahony L., Murphy L., Thornton G., Morrissey D., O’Halloran S., Feeney
M., Flynn S., Fitzgerald G., Daly C., Kiely B., O’Sullivan G., Shanahan F., Collins J. K.
2001. In vitro selection criteria for probiotic bacteria of human origin: correlation with
in vivo findings. American Journal of Clinical Nutrition, 73 (suppl.): 386S–392S
EFSA/ECDC. (European Food Safety Authority and European Centre for Disease
Prevention and Control). 2015. EU Summary Report on antimicrobial resistance in
zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2013. EFSA Journal,
13, 2: 4036
Ewing W. N., Cole D. J. A. 1994. The living gut. An introduction to micro-organisms in
nutrition. 1st
ed. Trowbridge, Redwood Books: 220 str.
Ewing W. N. 2008. The living Gut, 2nd ed. Nottingham, Nottingham University Press: 192
str.
FAO/WHO. 2001. Health and Nutritional Properties of Probiotics in Food including
Powder Milk with Live Lactic Acid Bacteria.Report of a Joint FAO/WHO Expert
Consultation on Evaluation, Argentina, 1-4 October 2001: 34 str.
http://www.mesanders.com/probio_report.pdf (5. jul. 2016)
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
54
FAO/WHO. 2002. Guidelines for the Evaluation of Probiotics in Food: report of a Joint
FAO/WHO Working Group on Drafting Guidelines for the Evaluation of Probiotics in
Food, London, Ontario, Canada, April 30 and May 1, 2002.
http://www.who.int/foodsafety/fs_management/en/probiotic_guidelines.pdf (5. jul.
2016)
Franz C. M. A. P., Holzapfel W. H. 2004. The genus Enterococcus: Biotechnological and
safety issues. V: Lactic acid bacteria: Microbiology and Functional Aspects. Third
Edition. Salminen S., von Wright A., Ouwehand A. (ur.). CRC Press: 199-247
Fuller R., Barrow P. A., Brooker B. E. 1978. Bacteria associated with the gastric
epithelium of neonatal pigs. Applied and Environmental Microbiology, 35, 3: 582-591
Fuller R., Cole C. B. 1988. The scientific basis on the probiotic concept. V: Probiotics –
Theory and Applications. Stark, B. A., Wilkinson, J. M. (ur.). Chalcombe Publications,
Marlow: 1-14
Fuller R. 1989. Probiotics in Man and Animals. Journal of Applied Bacteriology, 66, 5:
365-378
Fuller R. 1992. History and Development of Probiotics. V: Probiotics. The Scientific
Basis. Fuller R. (eds.). London, Chapman & Hall: 1-8
Fuller R. 1999. Probiotics for farm animals. V: Probiotics: a critical rewiev. Tannock G.
(ur.). England, Horizon Scientific Press: 15-22
Goldin B. R., Lichtenstein A. H., Gorbach S. L. 1988. The roles of Intestinal Flora. V:
Modern nutrition in health and disease. 7th ed., Philadelphia, Lea & Febiger: 500-515
Guarner F., Malagelada J. R. 2003. Gut flora in health and disease. Lancet, 361, 9356:
512–519
Hammes W. P., Hertel C. 2006. The genera Lactobacillus and Carnobacterium. V: The
Prokaryotes, Vol. 4: Bacteria: Firmicutes, Cyanobacteria. Dworkin M., Falkow S. (ur.).
Springer Science & Business Media: 320-403.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi/ (25. maj 2016)
Hill C., Guarner F., Reid G., Gibson G. R., Merenstein D. J., Pot B., Morelli L., Canani R.
B., Flint H. J., Salminen S., Calder P. C. and Sanders M. E. 2014. The International
Scientific Association for Probiotics and Prebiotics consensus statement on the scope
and appropriate use of the term probiotic. Nature Reviews Gastroenterology &
Hepatology, 11: 506-514
Histologija tankega ĉrevesa. 2016. SlidePlayer. The digestive system 2 (lekcija 16,
poglavje 24, sliĉica 18).
http://slideplayer.com/slide/8398599/ (5 jul. 2016)
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
55
Hughes P., Heritage J. 2002. Food and Agriculture Organization. Antibiotic growth-
promoters in food animals.
http://www.fao.org/docrep/007/y5159e/y5159e08.htm (5. jul. 2016)
Huis in't Veld J., Havenaar R. 1991. Probiotics and health in man and animal. Journal of
Chemical Technology and Biotechnology, 51, 4: 562-567
Jensen S. R., Fink L. N., Struve C., Sternberg C., Andersen J. B., Brynskov J., Nielsen O.
H., Brix S. 2011. Quantification of specific E. coli in gut mucosa from Crohn's disease
patients. Journal of Microbiological Methods, 86, 1: 111-114
Jimenez G. 2010. Probiotics in Animal Nutrition – a Century of Research.Webinar. Piglets.
Pig Progress. http://www.allaboutfeed.net/Nutrition/Feed-Additives/2010/7/Probiotics-
in-animal-nutrition---a-century-of-research-AAF011607W/ (5. jul. 2016)
Kališnik M. 2002. Slovenski medicinski slovar. Univerza v Ljubljani, Medicinska
fakulteta: 1007 str.
Kanatani K., Oshimura M., Sano K. 1995. Isolation and characterization of acidocin A and
cloning of the bacteriocin gene from Lactobacillus acidophilus. Applied and
Environmental Microbiology, 61, 3: 1061-1067
Klaenhammer T. R., Kleerebezem M., Kopp M. V., Rescigno M. 2012. The impact of
probiotics and prebiotics on the immune system. Nature reviews - Immunology, 12:
728-734
Kocijanĉiĉ A., Mrevlje F., Štajer D. 2005. Interna medicina. 3. izdaja, Ljubljana, Littera
picta: 493-496
Kos B. 2001. Probiotiĉki koncept: in vitro istraţivanja s odabranim bakterijama mlijeĉne
kiseline. Disertacija. Zagreb, Prehrambeno – Biotehnološki fakultet Sveuĉelišta u
Zagrebu: 144 str.
Lavrenĉiĉ A. 2003. Vaje pri predmetu Prehrana domaĉih ţivali. Ljubljana, Veterinarska
fakulteta: 116 str.
Ley R. E., Peterson D. A., Gordon J. I. 2006. Ecological and evolutionary forces shaping
microbial diversity in the human intestine. Cell, 124: 837-848
Marchesi J. R., Adams D. H., Fava F., Hermes G. D. A., et al. 2016. The gut microbiota
and host health: a new clinical frontier. Gut, 65: 330-339
Matsuzaki T. 1998. Immunomodulation by treatment with Lactobacillus casei strain
Shirota. International Journal of Food Microbiology, 41, 2: 133-140
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
56
Maxwell F. J., Stewart C. S. 1995. Microbiology of the gut and the role of probiotics. V:
The national Pig, Development and Survival. Varley M. A. (ur.). Leeds, CAB
International: 155-186
Mäyrä-Mäkinen A., Manninen M., Gyllenberg H. 1983. The adherence of lactic acid
bacteria of the columnar epithelial cells of pigs and calves. The Journal of Applied
Bacteriology, 55, 2: 241-245
McDonald P., Edwards R. A., Greenhalgh J. F. D., Morgan C. A., Sinclair L. A.,
Wilkinson, G. 2010. Animal Nutrition. 7th
ed. Toronto, Pearson Books: 714 str.
Medigan M. T., Martinko J. M. 2005. Microbial Interactions with Humans. V: Brock
Biology of Microorganisms. London, Pearson Prentice Hall: 700-725
Mikroorganizmi prebavil. 2016. SlidePlayer. Aspectos bioquímicos da interação dos
probióticos com a mucosa intestinal (sliĉica 10).
http://slideplayer.com.br/slide/2633364/ (5. jul. 2016)
Naidu A. S., Bidlack W. R., Clemens R. A. 1999. Probiotic spectra of Lactic Acid Bacteria
(LAB). Critical Reviews in Food Science and Nutrition, 38, 1: 13-126
Ovejero A. F., Negri M. 1993. Fiziologija ĉloveka. Ljubljana, Mladinska knjiga: 34-37
Petroviĉ D., Zorc M. 2005. Histologija – uĉbenik. Ljubljana, Inštitut za histologijo in
embriologijo Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani: 173-178
Oregon state University, Department of Animal Sciences, OSU Extended Campus (2004),
Applied Animal Nutrition, Introduction to feeding swine.
https://courses.ecampus.oregonstate.edu/ans312/ten/swine_1.htm (15. feb. 2015)
Pocajt M., Širca A. 1997. Anatomija in fiziologija za medicinske šole. Ljubljana, DZS: 97-
98, 107-117
Pokorny M., Filipović B., Ĉadeţ J., Japelj M. 1992. Proizvodnja antibiotikov in drugih
sekundarnih metabolitov. V: Biotehnologija. Raspor P. (ur.). Ljubljana, Bia: 385-403
Povzetek dejstev za splošno javnost. 2016. ECDC (European Centre for Disease
Prevention and Control).
http://ecdc.europa.eu/sl/eaad/antibiotics-get-informed/factsheets/Pages/general-
public.aspx (20. jun. 2016)
Qin J., Li R., Raes J., Arumugam M., in sod. 2010. A human gut microbial gene catalogue
established by metagenomic sequencing. Nature, 464: 59-65
Quigley E. M. 2013. Gut Bacteria in Health and Disease. Gastroenterology & Hepatology,
9: 560–569
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
57
Rajilić Stojanović M., de Vos W. M. 2014. The first 1000 cultured species of the human
gastrointestinal microbiota. FEMS Microbiology Reviews, 38: 996-1047
Raţman, S. 2009. Vpliv sevov Lactobacillus gasseri LF221 in K7 na morfometriĉne
parametre resic in sestavo mikrobne zdruţbe tankega ĉrevesja pri odstavljenih pujskih:
Diplomsko delo. Ljubljana, Biotehniška fakulteta, Oddelek zootehniko: 55 str.
Rebesko B. 1983. Fiziologija z anatomijo domaĉih ţivali, Ljubljana, Drţavna zaloţba
Slovenije: 364 str.
Reid G. 2015. Regulatory and clinical aspects of dairy probiotics. FAO/WHO Expert
consultation on evaluation of health and nutritional properties of powder milk with live
lactic acid bacteria.
ftp://ftp.fao.org/es/esn/food/reid.pdf (15. feb. 2015)
Resica-zgradba. 2016. SlidePlayer. The digestive tract (sliĉica 45).
http://slideplayer.com/slide/1703117/ (5. jul. 2016)
Robinson C. J., Young V. B. 2010. Antibiotic administration alters the community
structure of the gastrointestinal micobiota. Gut Microbes, 1, 4: 279–284
Rogelj I., Narat M., Hoĉevar I. 1999. The immune response in mice immunized with
Lactobacillus gasseri LF221 – a potential probiotic strain. Food Technology and
Biotechnology, 37, 3: 153-158
Rogelj I., Bogoviĉ Matijašić B. 2004. Probiotiki in varnost. V: Varnost ţivil. 22. Bitenĉevi
ţivilski dnevi 2004, Radenci, 18-19 marec 2004. Gašperlin L., Ţlender B. (ur.).
Ljubljana, Biotehniška fakulteta, Oddelek za ţivilstvo: 181-189
Ross M. H., Kaye G. I., Wojciech P. 2004. Histology. A text and atlas with cell and
molecular biology. 4th ed. Baltimore, Philadelphia, Williams&Wilkins: 475-478, 491-
501
Rotovnik-Kozjek N. 2003. Probiotiki in prebiotiki v onkologiji. Onkologija/ problemi in
perspektive: 35-37.
http://www.onko-i.si/fileadmin/onko/datoteke/dokumenti/1-2001-kozjek.pdf (24. avg.
2016)
Saarela M., Lähteenmäki L., Crittenden R., Salminen S., Mattila-Sandholm T. 2002. Gut
bacteria and health foods – The European perspective. International Journal of Food
Microbiology, 78, 1-2: 99–117
SCAN (Scientific Committee for Animal Nutrition). 2000. Report of the Scientific
Committee on Animal Nutrition on the assessment under directive 87/153/EEC of the
efficacy of micro-organisms used as feed additives.
http://ec.europa.eu/food/fs/sc/scan/out40_en.pdf (18. feb. 2000)
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
58
Scheinbach S. 1998. Probiotics: Functionality and commercial status. Biotechnology
Advances, 16, 3: 581-608
Seme K. 2002. Mehanizmi bakterijske odpornosti proti antibiotikom. V: Medicinska
bakteriologija z imunologijo in mikologijo. Gubina M, Ihan A. (ur.). Ljubljana,
Medicinski razgledi: 439-446
Singer R.S., Finch R., Wegener H.C., Bywater R., Walters J., Lipsitch M. 2003. Antibiotic
resistance – the interplay between antibiotic use in animals and human beings. The
Lancet Infectious Diseases, 3, 1: 47-51
Smole-Moţina S., Marić V. 1992. Bakterije. V: Biotehnologija. Raspor P. (ur.), Ljubljana,
Bia: 29-42
Spencer R. J., Chesson A. 1994. The effect of Lactobacillus spp. on the attachment of
enterotoxigenic Escherichia coli to isolated porcine enterocytes. The Journal of Applied
Bacteriology, 77, 2: 215-220
Steiner T. 2009. Probiotics in Poultry and Pig Nutrition. Basics and Benefits, The Poultry
site.
http://www.thepoultrysite.com/articles/1564/probiotics-in-poultry-and-pig-nutrition-
basics-and-benefits/ (24. avg. 2016)
Stojković S. 2003. Prez ̌ivetje in uc ̌inkovitost sevov Lactobacillus K7 in LF221 v razlic ̌nih
okoljskih razmerah. Doktorska disertacija. Ljubljana, Biotehniška fakulteta, Oddelek za
ţivilstvo: 133 str.
Stojković S., Rogelj I., Bogoviĉ Matijašić B., Bomba A., Nemcova R., Gancarĉikova S.,
Jonecova Z., Scirankova L., Košĉova J., Cigankova V., Pistl J., Buleca J. 2003.
Inhibition of Escherichia coli 08K88H9 ent- by Lactobacillus gasseri K7 – in vivo study
on gnotobiotic piglets. V: Milk & dairy products, European Dairy Congress 03,
Portoroţ, Slovenia, 15.-18. nov. 2003. Domţale, Biotehniška fakulteta, Oddelek za
zootehniko: 53 str.
Swidsinski A., Weber J., Loening-Baucke V., Hale L.P., Lochs H. 2005. Spatial
organization and composition of the mucosal flora in patients with inflammatory bowel
disease. Journal of Clinical Microbiology, 43, 7: 3380–3389
Tagg J. R., Dajani A. S., Wannamaker L. W. 1976. Bacteriocins of gram-positive bacteria.
Bacteriological Reviews, 40, 3: 722-756
Tanko ĉrevo. 2015. Wikipedia (7. sept. 2015).
https://sl.wikipedia.org/wiki/Tanko_%C4%8Drevo (23. apr. 2016)
Tannock G. W., Smith J. D. B. 1970. The micro-flora of the pig stomach and its possible
relationship to ulceration on the pars oesophagia. Journal of Comparative Pathology, 80:
359-367
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
59
Ten-Brink B., Minekus M., Van der Vossen J. M., Leer R. J., Huis in't Veld J. H. 1994.
Antimicrobial activity of Lactobacilli: preliminary characterization and optimization of
production of acidocin B, a novel bacteriocin produced by Lactobacillus acidophilus
M46. Journal of Applied Bacteriology, 77, 2: 140-148
Teskaĉ k., Hudournik N., Marinšek-Logar R., Kristl J. 2008. Pomen probiotikov kot
prehranskih dopolnil in zdravil. Farmacevtski Vestnik, 59: 287-292
The Histology Guide. Small intestine.
http://www.histology.leeds.ac.uk/digestive/small_intestine.php (2. maj 2016)
Tortuero F., Rioperez J., Fernandez E., Rodriguez M. L. 1995. Response of piglets to oral
administration of lactic acid bacteria. Journal of Food Protection, 58, 12: 1369-1374
Treven P., Trmĉić A., Bogoviĉ Matijašić B., Rogelj I. 2014. Improved draft genome
sequence of probiotic strain Lactobacillus gasseri K7. Genome Announcements, 2, 4: 1-
2
Uredba Evropskega parlamenta in Sveta (ES) št. 1831/2003 o dodatkih za uporabo v
prehrani ţivali. 2003. Uradni list Evropske unije L 268: 29
Uredba Komisije (ES) št. 574/2011 o spremembi Priloge I k Direktivi 2002/32/ES
Evropskega parlamenta in Sveta glede mejnih vrednosti za nitrit, melamin, Ambrosio
spp. ter prenosa nekaterih kokcidiostatikov ali sredstev proti histomonijazi in o
konsolidaciji prilog I in II k Direktivi. 2011. Uradni list Evropske unije L 159: 7
Vanbelle M. 2001. Current status and future perspectives in E.U. for antibiotics, probiotics,
enzymes and organic acids in animal nutrition. V: Gut environment of pigs. Piva A.,
Bach Knudsen K. E., Lindberg J. E. (ur.). Nottingham, Nottingham University Press:
231-256
Van der Vossen J. M. B. M., Van-Herwijnen M. H. M., Leer R. J., Ten-Brink B., Pouwels
P. H., Huis in't Veld J. H. J. 1994. Production of acidocin B, a bacteriocin of
Lactobacillus acidophilus M46 is a plazmid encoded trait: plasmid curing, genetic
marking by in vivo plasmid integration and gene transfer. FEMS Microbiology Letters,
166, 3: 333-340
Vaughan E. E., Mollet B., de Vos W. M. 1999. Functionality of probiotics and intestinal
lactobacilli: Light in the intestinal tract tunnel. Current Opinion in Biotechnology, 10, 5:
505-510
Yirga H. 2015. The Use of Probiotics in Animal Nutrition. Journal of Probiotics & Health,
3: 132
Yu H., Braun P., Yildrum M. A., Lemmens I., Venkatesan K., in sod. 2008. High-Quality
Binary Protein Interaction Map of the Yeast Interactome Network. Science, 322: 104-11
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
60
Zorc Pleskoviĉ R., Gošnak Dahmane R., Milutinović Ţivin A. 2006. Histologija. 1. izdaja.
Ljubljana, Univerza v Ljubljani, Visoka šola za zdravstvo: 45-47
Zoriĉ-Peternel M., Ĉanţek Majheniĉ A., Holo H., Nes I. F., Salehian Z., Berlec A., Rogelj
I. 2010. Wide-Inhibitory Spectra Bacteriocins Produced by Lactobacillus gasseri K7.
Probiotics and Antimicrobial Proteins, 2, 4: 233-240
Ĉampa S. Ex vivo vezava probiotikov na ĉrevesno sluznico tankega ĉrevesa prašiĉev… E. coli O8:K88.
Dipl. delo. Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Odd. za zootehniko, 2016
ZAHVALA
Neskonĉno se zahvaljujem mentorici, znan. svet. dr.Bojani Bogoviĉ Matijašić, ki je vloţila
veliko ĉasa in potrpljenja in do konca verjela vame, ter mi pomagala, da smo nalogo
pripeljali do konca.
Zahvaljujem se somentorici dr. Petri Mohar Lorbeg, da mi je omogoĉila dokonĉati in
zagovarjati nalogo.
Posebna zahvala gre tudi recenzentki prof. dr. Ireni Rogelj za literaturo in strokovno
pomoĉ pri nastajanju dela. Ţe kot predavateljica ste mi bili vzgled in vedno z veseljem
preberem vaša dela.
Zahvaljujem se predsedniku komisije prof. dr. Janezu Salobirju.
Prav tako se zahvaljujem vsem ĉlanom kolektiva Inštituta za mlekarstvo in probiotike, ki
so mi pomagali pri izvedbi praktiĉnega dela diplomske naloge in mi svetovali.
Hvala dr. Nataši Siard in doc. dr. Špeli Malovrh.
Najlepša hvala vsem v knjiţnici in gospe Sabini Knehtl.
Iskreno se zahvaljujem vsem neimenovanim, ki so mi kakorkoli pomagali pri nastajanju
diplomskega dela.
Romĉ, klic v petek me je spodbudil. Hvala ti.
Hvala mojemu moţu Marku, sinovoma in mami! Brez vas mi ne bi uspelo.
Nekje – ĉisto na koncu, ko sem imela opravljene ţe vse izpite, veĉji del naloge, …, sem se
ustavila.
Sam Bog ve, zakaj!?
Ţelela sem si, da bi prej našla moĉ za dokonĉanje tega dela…
Pa vendar – bolje sedaj, kot nikoli!
Hvala vsem.
Tudi tebi, ki bereš te vrstice…
PRILOGE
Statistiĉna obdelava podatkov
Za testiranje vezave laktobacilov na sluznico ĉrevesa, simulirano kot izpodrivanje,
izkljuĉevanje in tekmovanje, smo uporabili Studentov t test (p<0,05) in sicer na podlagi
primerjav s kontrolnimi primeri, katere so predstavljali ĉisti sevi. Znaĉilnost posameznih
vplivov nam povedo p – vrednosti. Rezultati za posamezne vplive so navedeni v spodnjih
preglednicah.
Priloga A:
Vpliv poskusa in vpliv skupine v modelu (Laktobacili) - preglednica ANOVA, metoda
najmanjših kvadratov Vpliv Stopinje
prostosti
Vsota kvadratov Srednji kvadrat F-vrednost P>F
Poskus 4 23,4233 5,8552 138,84 <0,0001
Skupina 7 9,9956 1,4279 33,86 <0,0001
Priloga B:
P - vrednosti za posamezne vplive modela (log Lb.) Vpliv p - vrednost Vpliv p - vrednost
---------- Poskus: ---------- ---------- Skupina: ----------
1 <0,0001 Ec/K7 0,0016
2 <0,0001 Ec/LF 0,0228
3 0,0421 K7 0,0013
4 0,6216 K7+Ec <0,0001
5 - K7/Ec <0,0001
LF 0,0262
LF+Ec 0,6491
LF/Ec -
Priloga C:
Vpliv poskusa in skupine v modelu (E. coli) - preglednica ANOVA, metoda najmanjših
kvadratov Vpliv Stopinje
prostosti
Vsota kvadratov Srednji kvadrat F-vrednost P>F
Poskus 4 8,160 2,040 61,23 <0,0001
Skupina 6 3,4261 0,5710 17,14 <0,0001
Priloga D:
P - vrednosti za posamezne vplive modela (log E. coli) Vpliv p - vrednost Vpliv p - vrednost
----------Poskus: ---------- ----------Skupina: ----------
1 <0,0001 Ec 0,6059
2 <0,0001 Ec/K7 0,1504
3 0,0078 Ec/LF 0,0275
4 0,9108 K7+Ec <0,0001
5 - K7/Ec 0,3988
LF+Ec 0,0002
LF/Ec -
Metoda najmanjših kvadratov:
Z metodo najmanjših kvadratov je bilo ugotovljeno, da je p – vrednost vsakega od nivojev
skupin, tako pri modelu 1, kot modelu 2, enaka p<0,0001. Vpliv vseh skupin je torej bil
statistiĉno znaĉilen. Pri tem je bil za model 1 uporabljen Tukey-ev test, za model 2 pa
Tukey-Kramarjev test.
Metoda najmanjših kvadratov za vpliv SKUPINA, Tukey-Kramer, GLM, odvisna
spremenljivka je log E. coli
Priloga E:
Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezane E. coli in p-vrednosti za
vpliv skupin, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec Ec/K7 Ec/LF K7+Ec K7/Ec LF+Ec LF/Ec
Ec 0,167834 0,230129 -0,421497 0,114746 -0,274189 0,045335
Ec/K7 0,5089 0,062295 -0,589331 -0,053087 -0,442023 -0,122499
Ec/LF 0,1356 0,9893 -0,651626 -0,115383 -0,504318 -0,184794
K7+Ec 0,0002 <0,0001 <0,0001 0,536243 0,147308 0,466832
K7/Ec 0,8430 0,9954 0,7923 <0,0001 -0,388935 -0,069411
LF+Ec 0,0407 <0,0001 <,0001 0,5507 0,0003 0,319524
LF/Ec 0,9985 0,7678 0,2797 <0,0001 0,9782 0,0044
Metoda najmanjših kvadratov za vpliv SKUPINA, Tukey, GLM procedura, odvisna
spremenljivka je log Lb:
Priloga F:
Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezanih laktobacilov K7 oz.
LF221 in p-vrednosti za vpliv skupin, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec/K7 Ec/LF K7 K7+Ec K7/Ec LF LF+Ec LF/Ec
Ec/K7 -0,515351 0,007147 0,106082 0,605665 -0,510162 -0,343334 -0,301361
Ec/LF <,0001 0,522498 0,621434 1,121017 0,005189 0,172018 0,213990
K7 1,0000 <0,0001 0,098935 0,598519 -0,517309 -0,350481 -0,308508
K7+Ec 0,9416 <0,0001 0,9594 0,499583 -0,616244 -0,449416 -0,407443
K7/Ec <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001 -1,115827 -0,948999 -0,907026
LF <0,0001 1,0000 <0,0001 <0,0001 <0,0001 0,166828 0,208801
LF+Ec 0,0087 0,5738 0,0068 0,0002 <0,0001 0,6114 0,041973
LF/Ec 0,0331 0,2931 0,0266 0,0009 <0,0001 0,3232 0,9998
Skupina*poskus: Metoda najmanjših kvadratov za vpliv skupina, odvisna sp.=Ec. V
zgornjem delu razpredelnice so navedene razlike povpreĉnih srednjih vrednosti med
skupinami, v spodnjem delu pa njihove p-vrednosti.
Priloga G:
Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezane E. coli in p-vrednosti za
vpliv skupin, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec Ec/K7 Ec/LF K7+Ec K7/Ec LF+Ec LF/Ec
Ec 0,169780 0,216969 -0,377425 0,059706 -0,269175 0,064211
Ec/K7 0,2968 0,047189 -0,547205 -0,110074 -0,438955 -0,105569
Ec/LF 0,0639 0,9952 -0,594393 -0,157262 -0,486143 -0,152757
K7+Ec 0,0002 <,0001 <,0001 0,437131 0,108250 0,441636
K7/Ec 0,9776 0,7604 0,3160 <,0001 -0,328881 0,004505
LF+Ec 0,0115 <,0001 <,0001 0,7243 0,0013 0,333386
LF/Ec 0,9680 0,7929 0,3483 <,0001 1,0000 0,0011
Priloga H:
Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezanih laktobacilov K7 oz.
LF221 in p-vrednosti za vpliv skupin, pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec/K7 Ec/LF K7 K7+Ec K7/Ec LF LF+Ec LF/Ec
Ec/K7 -0,515351 0,007147 0,106082 0,605665 -0,510162 -0,343334 -0,301361
Ec/LF <,0001 0,522498 0,621434 1,121017 0,005189 0,172018 0,213990
K7 1,0000 <,0001 0,098935 0,598519 -0,517309 -0,350481 -0,308508
K7+Ec 0,7413 <,0001 0,8018 0,499583 -0,616244 -0,449416 -0,407443
K7/Ec <,0001 <,0001 <,0001 <,0001 -1,115827 -0,948999 -0,907026
LF <,0001 10,000 <,0001 <,0001 <,0001 0,166828 0,208801
LF+Ec 0,0002 0,1818 0,0001 <,0001 <,0001 0,2115 0,041973
LF/Ec 0,0011 0,0440 0,0008 <,0001 <,0001 0,0533 0,9981
Priloga I:
Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in njihove p-vrednosti za
vpliv interakcije med poskusom in skupino v prvem poskusu, pridobljeni z metodo
najmanjših kvadratov. Skupina Ec Ec/K7 Ec/LF K7+Ec K7/Ec LF+Ec LF/Ec
Ec 0,145543 0,376191 -0,307534 -0,323187 -0,112369 -0,161133
Ec/K7 1,0000 0,230648 -0,453077 -0,468730 -0,257912 -0,306676
Ec/LF 0,6261 0,9997 -0,683725 -0,699379 -0,488560 -0,537324
K7+Ec 0,8913 0,6545 0,0095 -0,015653 0,195165 0,146401
K7/Ec 0,8435 0,5963 0,0073 1,0000 0,210818 0,162055
LF+Ec 1,0000 0,9983 0,1958 0,9994 0,9982 -0,048764
LF/Ec 1,0000 0,9845 0,0999 1,0000 1,0000 1,0000
Priloga J:
Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi skupin vezanih laktobacilov K7 oz.
LF221 in p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v prvem poskusu,
pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec/K7 Ec/LF K7 K7+Ec K7/Ec LF LF+Ec LF/Ec
Ec/K7 -0,222744 0,051478 0,489622 1,406756 -0,245623 0,004234 0,288839
Ec/LF 0,9999 0,274223 0,712367 1,629500 -0,022879 0,226978 0,511584
K7 1,0000 0,9955 0,438144 1,355278 -0,297101 -0,047244 0,237361
K7+Ec 0,3296 0,0089 0,5555 0,917134 -0,735245 -0,485388 -0,200783
K7/Ec <,0001 <,0001 <,0001 0,0001 -1,652379 -1,402522 -1,117917
LF 0,9993 1,0000 0,9857 0,0057 <,0001 0,249857 0,534462
LF+Ec 1,0000 0,9998 1,0000 0,3462 <,0001 0,9990 0,284605
LF/Ec 0,9903 0,2517 0,9996 1,0000 <,0001 0,1851 0,9921
Priloga K:
Razlike med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7 oz. LF221 in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v drugem poskusu,
pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec/K7 Ec/LF K7 K7+Ec K7/Ec LF LF+Ec LF/Ec
Ec/K7 -0,885163 -0,266446 -0,436299 0,189912 -0,694618 -0,657301 -0,684611
Ec/LF 0,0003 0,618717 0,448864 1,075075 0,190545 0,227862 0,200552
K7 0,9971 0,0494 -0,169853 0,456358 -0,428172 -0,390855 -0,418164
K7+Ec 0,5642 0,5051 1,0000 0,626211 -0,258319 -0,221002 -0,248311
K7/Ec 1,0000 <,0001 0,4706 0,0434 -0,884530 -0,847213 -0,874523
LF 0,0125 1,0000 0,6027 0,9983 0,0003 0,037317 0,010008
LF+Ec 0,0250 0,9998 0,7703 0,9999 0,0006 1,0000 -0,027309
LF/Ec 0,0151 1,0000 0,6497 0,9991 0,0003 1,0000 1,0000
Priloga L:
Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in njihove p-vrednosti za
vpliv interakcije med poskusom in skupino v tretjem poskusu, pridobljeni z metodo
najmanjših kvadratov. Skupina Ec Ec/K7 Ec/LF K7+Ec K7/Ec LF+Ec LF/Ec
Ec 0,391174 0,293554 -0,006530 0,183853 -0,282412 0,372455
Ec/K7 0,5576 -0,097620 -0,397704 -0,207321 -0,673585 -0,018719
Ec/LF 0,9256 1,0000 -0,300084 -0,109701 -0,575965 0,078902
K7+Ec 1,0000 0,5279 0,9106 0,190383 -0,275881 0,378985
K7/Ec 0,9998 0,9986 1,0000 0,9996 -0,466264 0,188603
LF+Ec 0,9472 0,0113 0,0558 0,9576 0,2588 0,654867
LF/Ec 0,6431 1,0000 1,0000 0,6133 0,9997 0,0155
Priloga M:
Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7 oz. LF221 in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v tretjem poskusu,
pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec/K7 Ec/LF K7 K7+Ec K7/Ec LF LF+Ec LF/Ec
Ec/K7 -0,555458 0,327286 0,508748 0,499742 -0,432504 -0,118544 -0,249073
Ec/LF 0,1367 0,882744 1,064206 1,055200 0,122955 0,436914 0,306385
K7 0,9532 0,0003 0,181462 0,172456 -0,759790 -0,445830 -0,576359
K7+Ec 0,2610 <,0001 1,0000 -0,009006 -0,941252 -0,627292 -0,757821
K7/Ec 0,2920 <,0001 1,0000 1,0000 -0,932245 -0,618286 -0,748815
LF 0,5822 1,0000 0,0035 <,0001 <,0001 0,313959 0,183431
LF+Ec 1,0000 0,5613 0,5193 0,0426 0,0498 0,9711 -0,130529
LF/Ec 0,9991 0,9786 0,0992 0,0036 0,0044 1,0000 1,0000
Priloga N:
Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in njihove p-vrednosti za
vpliv interakcije med poskusom in skupino v ĉetrtem poskusu, pridobljeni z metodo
najmanjših kvadratov. Skupina Ec Ec/K7 Ec/LF K7+Ec K7/Ec LF+Ec LF/Ec
Ec -0,048455 0,107628 -0,630273 0,157320 -0,392061 -0,044012
Ec/K7 1,0000 0,156083 -0,581818 0,205775 -0,343606 0,004443
Ec/LF 1,0000 1,0000 -0,737902 0,049692 -0,499690 -0,151640
K7+Ec 0,0234 0,0510 0,0037 0,787594 0,238212 0,586261
K7/Ec 1,0000 0,9988 1,0000 0,0016 -0,549382 -0,201332
LF+Ec 0,5535 0,7678 0,1691 0,9913 0,0837 0,348049
LF/Ec 1,0000 1,0000 1,0000 0,0475 0,9991 0,7497
Priloga O:
Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7 oz. LF221 in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v ĉetrtem poskusu,
pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec/K7 Ec/LF K7 K7+Ec K7/Ec LF LF+Ec LF/Ec
Ec/K7 -0,497260 -0,025933 -0,065631 0,462412 -0,540835 -0,408104 -0,458995
Ec/LF 0,3010 0,471327 0,431629 0,959672 -0,043575 0,089156 0,038265
K7 1,0000 0,4042 -0,039698 0,488345 -0,514902 -0,382171 -0,433062
K7+Ec 1,0000 0,5863 1,0000 0,528043 -0,475204 -0,342473 -0,393364
K7/Ec 0,4433 <,0001 0,3346 0,2023 -1,003247 -0,870516 -0,921407
LF 0,1692 1,0000 0,2411 0,3878 <,0001 0,132731 0,081840
LF+Ec 0,6958 1,0000 0,8046 0,9247 0,0004 1,0000 -0,050891
LF/Ec 0,4586 1,0000 0,5795 0,7599 0,0001 1,0000 1,0000
Priloga P:
Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezane E. coli in njihove p-vrednosti za
vpliv interakcije med poskusom in skupino v petem poskusu, pridobljeni z metodo
najmanjših kvadratov. Skupina Ec Ec/K7 Ec/LF K7+Ec K7/Ec LF+Ec LF/Ec
Ec 0,190858 0,090501 -0,565362 0,220839 -0,289857 0,089535
Ec/K7 0,9996 -0,100357 -0,756220 0,029981 -0,480715 -0,101324
Ec/LF 1,0000 1,0000 -0,655863 0,130337 -0,380359 -0,000967
K7+Ec 0,0657 0,0027 0,0153 0,786200 0,275504 0,654896
K7/Ec 0,9967 1,0000 1,0000 0,0016 -0,510696 -0,131304
LF+Ec 0,9333 0,2165 0,6071 0,9581 0,1457 0,379392
LF/Ec 1,0000 1,0000 1,0000 0,0155 1,0000 0,6115
Priloga R:
Razlika med logaritmiranimi srednjimi vrednostmi vezanih laktobacilov K7 oz. LF221 in
njihove p-vrednosti za vpliv interakcije med poskusom in skupino v petem poskusu,
pridobljeni z metodo najmanjših kvadratov. Skupina Ec/K7 Ec/LF K7 K7+Ec K7/Ec LF LF+Ec LF/Ec
Ec/K7 -0,416130 -0,050651 0,033972 0,469506 -0,637230 -0,536953 -0,402966
Ec/LF 0,6591 0,365479 0,450102 0,885636 -0,221099 -0,120823 0,013164
K7 1,0000 0,8630 0,084623 0,520157 -0,586578 -0,486302 -0,352315
K7+Ec 1,0000 0,4994 1,0000 0,435534 -0,671201 -0,570925 -0,436938
K7/Ec 0,4121 0,0003 0,2250 0,5678 -1,106735 -1,006459 -0,872471
LF 0,0358 0,9999 0,0843 0,0194 <,0001 0,100277 0,234264
LF+Ec 0,1788 1,0000 0,3426 0,1080 <,0001 1,0000 0,133987
LF/Ec 0,7187 1,0000 0,9011 0,5612 0,0003 0,9997 1,0000
REZULTATI KONTROLE SPIRANJA VZORCEV (vzorec »0«)
Priloga S:
Kontrola izpiranja prvotne mikrobiote iz košĉkov jejunuma (vzorec niĉ »0«)
MRS: A B SD POVP. LOG A LOG B SD LOG POVP. Log
Pos. 1«0« 4000 4000 0 4000 3,60206 3,60206 0 3,60206
Pos. 3«0« 48000 43000 3535,534 45500 4,681241 4,633468 0,03378 4,657355
Pos. 4«0« 1 0 0,707107 0,5 0 0 0 0
Pos. 5«0« 3 2 0,707107 2,5 0,477121 0,30103 0,124515 0,389076
EMB A B SD POVP. LOG A LOG B SD LOG POVP. Log
Pos. 1«0« 387000 384000 2121,32 385500 5,587711 5,584331 0,00239 5,586021
Pos. 3«0« 29000 22000 4949,747 25500 4,462398 4,342423 0,084835 4,40241
Pos. 4«0« 0 14 9,899495 7 0 1,146128 0,810435 0,573064
Pos. 5«0« 3 10 4,949747 6,5 0,477121 1 0,369731 0,738561
UNIVERZA V LJUBLJANI
BIOTEHNIŠKA FAKULTETA
ODDELEK ZA ZOOTEHNIKO
Simona ĈAMPA
EX VIVO VEZAVA PROBIOTIKOV NA ČREVESNO
SLUZNICO TANKEGA ČREVESA PRAŠIČEV IN
TEKMOVANJE Z E. coli O8:K88
DIPLOMSKO DELO
Univerzitetni študij
Ljubljana, 2016