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Centre deDiagnòsticBiomèdic Utilidad del estudio genético en el
diagnóstico e intervención familiar en la enfermedad de Wilson
Cèlia BadenasSecció de GenèticaMolecular
Servei de Bioquímica i Genètica Molecular
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ENFERMEDAD DE WILSON• Herencia autosómica recesiva• Afecta al metabolismo del cobre, que se acumula en hígado,
cerebro, córnea, hígado y otros órganos• Manifestaciones hepáticas, neurológicas,hematológicas,
psiquiátricas o combinaciones de ellas• Desde que el estudio genético está disponible el espectro
fenotípico se ha aumentado• Causada por mutaciones en un único gen: ATP7B
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PROTEÍNA ATP7B• Proteína es una ATPasa tipo-P transportadora de cobre• Expresada en casi todos los tejidos, pero predominantemente en el hígado• ATP7B es necesaria para el transporte eficiente del cobre de los hepatocitos al sistema biliar• En ausencia de la proteína hay una acumulación tóxica de cobre en diferentes tejidos, lo que da
lugar a los síntomas
Int J Mol Sci. 2015 Mar; 16(3): 6419–6431.6 dominios de unión a cobre8 dominios transmembrana1 dominio de transducción dela energía de la hidrólisis del ATP 1 dominio de fosforilación
CONSEJO GENÉTICO : AR
4
Riesgo de portador2/3
Riesgo de portador2/3x1/2=1/3
• Frecuencia 1/30.000-50.000 individuos• Portadores en población general 1/90• Probablemente infradiagnósticada
ATP7B
Riesgo de portador1/90
Riesgo de afectado1/180
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GEN ATP7B• Cromosoma 13 (13q14.3)• 16 tránscritos• Mensajero de referencia NM_000053
• 21 exones• 6655 bp de mRNA• 1465 aa
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GEN ATP7B
800 mutaciones descritasPocos individuos homozigotos
Variabilidad fenotípica
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Estudio molecular de EWDiferente incidencia según las poblaciones
Diferente espectro mutacional
Diferentes mutaciones recurrentes
Frecuencia de portadores 1/11
No se detectan las mutaciones europeas ni del este asiático
86
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DIAGNÓSTICO GENÉTICO DE ENFERMEDAD DE WILSON
Secuenciación de Sanger: no cuantitativo
Estudio de duplicaciones/deleciones (MLPA)
mut/wt
mut/mut
wt/wt
Secuenciación masiva (NGS)
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DIAGNÓSTICO GENÉTICO DE ENFERMEDAD DE WILSON
Secuenciación de Sanger
Estudio de duplicaciones/deleciones (MLPA): cuantitativoCONTROL
CONTROL
PACIENTE
Secuenciación masiva (NGS)
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DIAGNÓSTICO GENÉTICO DE ENFERMEDAD DE WILSON
Secuenciación de Sanger
Estudio de duplicaciones/deleciones (MLPA)
Secuenciación masiva (NGS)
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RESULTADOS SOSPECHA DE EW
AFECTADO: detección de dos mutaciones en el gen ATP7BEstudio padres para demostrar que ambos son portadores
PORTADOR: baja probabilidad de afectadoEstudio padres para identificar al portador
Los portadores pueden tener niveles de ceruloplasmina plasmática bajos, cobre en orina en los límites de la normalidad, cobre en orina elevado tras estimulación con D-‐penicilamina y/o una elevación moderada del cobre hepático (100-‐250 mg/g peso seco)
NO MUTACIONES: baja probabilidad de afectadoNo estudio familiar
TécnicasSanger + MLPA: detecta >98% de las mutacionesNGS
PROBLEMA!! Variantes de Significado Clínico Incierto (VOUS)
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RESULTADOS DIAGNÓSTICO GENÉTICO DE ENFERMEDAD DE WILSON
207 CASOS ÍNDICE:59 afectados (2 mutaciones)38 portadores (1 mutación)110 no afectados (0 mutaciones)
100 familiares:10 afectados61 portadores29 no portadores
11 parejas de portadores/afectados:8 no portadores3 portadores (1 cambio no descrito)
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RESULTADOS DIAGNÓSTICO GENÉTICO DE ENFERMEDAD DE WILSON
59 casos índice con dos mutaciones en el gen ATP7B46 mutaciones diferentes3 de ellas representan el 39% de los
cromosomas mutadosc.1708-1G>A (10)p.Met645Arg (26)p.His1069Gln (10)
1 mutación recurrente es una deleción
Más de 30 polimorfismos (algunos no descritos)
MUTACIONES MISSENSE78/118 (66%) alelos51 (86%) casos índice son portadores de al
menos una mutación missense
MUTACIÓN PROTEÍNA NUM PACIENTESEXÓ TIPO DESCRITA?
DEL EXÓ 1 6 01 no proteína NO
c.51+4A>T 2 I01 splicing SI
c.523-525delAA+c.777-778insCp.Val176Serfs*28,p.Gln260Profs*10 1 02 frameshift NO*
c.845delT p.Leu282Profs*2 1 02 frameshift SI
c.347T>C p.Ile116Thr 1 02 missense SI
c.331C>T p.Gln111* 4 02 nonsense SI
c.562C>T p.Gln188* 2 02 nonsense SI
c.721C>T p.Gln241* 1 02 nonsense NO
c.1285+5G>T+c.3451C>T IVS2+5G>T+p.Arg1151Cys 1 I02,16 missense/splicing SI
c.1708-1G>A 10 I04 splicing SI
c.1555G>A p.Val519Met 1 04 missense SI
c.1739delA p.His580Profs*3 1 05 frameshift SI
c.3182G>A p.Gly1061Glu 2 06 missense SI
c.1934T>G p.Met645Arg 26 06 missense SI
c.2218G>C p.Ala740Pro 4 08 missense NO
c.2128_2133delGGTGGG p.Gly710_Gly711del 1 08 in-frame deletion NO
c.2123T>C p.Leu708Pro 2 08 missense SI
c.2332C>G p.Arg778Gly 1 08 missense SI
c.2297C>T p.Thr766Met 1 08 missense SI
c.2383C>T p.Leu795Phe 1 09 missense SI
c.2532delA p.Val845Serfs*28 2 10 frameshift SI
c.2605G>A p.Gly869Arg 1 11 missense SI
c.2763T>A p.Ser921Arg 2 12 missense SI
c.2795C>A p.Ser932* 1 12 nonsense SI
c.3060+5G>T IVS13+5G>T 1 I13 splicing SI
c.3061-12T>A 1 I13 splicing SI
c.3053C>T p.Ala1018Val 1 13 missense SI
c.2906G>A p.Arg969Gln 1 13 missense SI
c.2930C>T p.Thr977Met 1 13 missense SI
c.2972C>T p.Thr991Met 1 13 missense SI
c.3221C>T p.Ala1074Val 3 14 missense SI?
c.3083_3085delinsG p.Lys1028Serfs*40 1 14 frameshift SI
c.3190G>A p.Glu1064Lys 1 14 missense SI
c.3207C>A p.His1069Gln 10 14 missense SI
c.3311G>A p.Cys1104Tyr 2 15 missense SI
c.3295G>A p.Gly1099Ser 1 15 missense SI
c.3359T>A p.Leu1120* 4 15 nonsense SI
c.3556G>A p.Gly1186Ser 3 16 missense/splicing? SI
c.3659C>T p.Thr1220M 1 17 missense SI
c.3694A>C p.Thr1232Pro 1 17 missense SI
c.3699+1G>C 1 I17 splicing SI
c.3809A>G p.Asn1270Ser 5 18 missense SI
c.3818C>T p.Pro1273Leu 1 18 missense SI
c.3938T>G p.Leu1313Arg 1 19 missense N0
c.4022G>A p.Gly1341Asp 1 20 missense/splicing? SI
c.4103T>C p.Leu1368Pro 1 20 missense SI
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UK
0
5
10
15
20
25
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21
España
Coffey et al 2013Brain 136:1476-1487
LOCALIZACIÓN DE MUTACIONES
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CASO ÍNDICE: M645R/deleción exón 1
Heterozigoto M645R
Deleción heterozigota exón 1
MADRE: deleción exón 1/normal
Normal
Deleción heterozigota exón 1
PADRE: M645R/normal
Heterozigoto M645R
Normal
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CASOS ESPECIALES:EW CON TRES MUTACIONES
Tres pacientes con tres mutaciones
IVS2+5G>T+R1151C/L1368P
L1368P/WTIVS2+5G>T+R1151C/WT
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CASOS ESPECIALES:EW CON TRES MUTACIONES
Varón de 6 años sin información clínica
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CASOS ESPECIALES:EW EN DOS GENERACIONES
A740P/WT
A740P/WT
523_525ins;778dup/WT
523_525ins;778dup/A470P
523_525ins;778dup/A470P
523_525ins;778dup/A470P
M645R/WT
523_525ins;778dup/M645R
523_525ins;778dup/WT
Una familia con tres mutaciones y 4 afectados en dos generaciones
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TIPOS DE TEST
Test predictivo: familiar de afectado con riesgo de estar afectadoSe tienen que conocer las mutaciones del caso índiceSecuenciación y/o MLPA
Test diagnóstico (confimación/exclusión): sospecha de EWSecuenciación sanger + MLPA
Test prenatal: se tienen que conocer las mutaciones en los padresSecuenciación y/o MLPA
Indispensable información clínica!!!
Test de portador (1): familiar de afectado a riesgo de ser portadorSe tienen que conocer las mutaciones del caso índice
Test pre-‐implantacional/pre-‐concepcional: se tienen que conocer las mutaciones en los padresSecuenciación y/o MLPAConfirmación en muestra de LA o BC
Cribado neonatal bioquímico??Confirmación de positivos mediante estudio genético
Test de portador (2): pareja de afectado/portador a riesgo de tener descendencia afectadaSecuenciación sanger + MLPA
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CONCLUSIONES
El tratamiento temprano y preciso de los enfermos de EW es simple y efectivo y puede prevenir el desarrollo de síntomas neurológicos y hepáticos , pero debido al amplio espectro de la enfermedad a veces es difícil llegar a un diagnóstico
Probablemente infradiagnosticada
A todo paciente con sospecha de Enfermedad de Wilson debe realizarse un estudio genético
No correlación genotipo-‐fenotipo, peroDiferencia portadores de afectadosDetecta individuos presintomáticos
La detección de mutaciones en el gen ATP7B implica la ampliación del estudio a familiares a riesgo (asesoramiento genético)
Familiares a riesgoParejas de portadoresOpciones reproductivas
Cribado neonatal