next generation bio research infra

Next Generation bio Research Infrastructure

Center for Genome Science, NIH, KCDCHong Chang Bum

hongiiv@gmail.com

성공적인 팀성공적인 프로젝트성공적인 논문??말로만 하는 협업

인간과 동물의 차이

없어도 되지만,NO

없어서는 안될 필수적인

구성

• Developer Blog

• Project Management

• Document Project

• Developer PDS

• FTP

Developer Blog

• TextCube 1.7.3

• 관리자 http://192.168.100.226/owner

• 팀블로그 형태로 자신의 ID(e-mail) 등록 후 글쓰기 가능

Project Management

• SVN(Subversion) & trac

• Version Control System

• Issue Tracking System

SVN

• 프로젝트의 산물(코드 & 문서)를 효과적으로 관리

• 버전을 통한 형상 관리(Ver 1.0.23.3)

• CheckOut, Commit, Update, Revision, Import, Export

등록된 소스코드의 목록

trac

• Ticket을 통한 프로젝트 관리

• Ticket

• Roadmap

• Timeline

클러스터관리라는 커다란 목표중 그래픽환경 부문의R관련 Ticket 제출

발행된 티켓의 목록

로드맵에 기재된 마일스톤 목록

모든 내용을 한눈에

SVN with Tortoisesvntrac with Ticket

Example

Document Project

• moniWiKi

• 손쉽게 새로운 페이지를 만들고,

• 수정하고,

• 변경관리를 한다.

문서 만들기• 새로운 계정을 생성

• WiKi 문법에 맞도록 문서 생성

• 목차 만들기

• 링크 만들기

• 파일 업로드 및 링크 생성

• 테이블 만들기

기존의 문서 편집하기

새로운 페이지 생성하기

누가 무엇을 변경했는지,,,

Developer PDS

• 제로보드• 자료실 게시판

FTP 서비스

• SFtp를 통한 파일 업로드

• 웹 환경에서의 편리한 네비게이션 및 다운로드

SFtp 192.168.100.226ftpuser/ftpuserport 22번

pub 디렉토리에 업로드

FileZilla 사용

결론

• 수많은 오픈소스 소프트웨어를 짜집기 한 흉한 모습

• 서로 중복되는 기능도 있지만, 각자의 용도에 맞도록 결합해서 사용한다면 상당한 시너지 발휘

• 좋은 도루란? 바로 사용하는 사람의 몫