Virologie

Dr. Florence ABRAVANEL, MCU-PHLaboratoire de Virologie, CHU de Toulouse

06/09/2006

���� Aspect fonctionnel :���� entité qui se caractérise par :

– un seul type d’acide nucléique (ADN ou ARN)– un parasitisme intracellulaire strict

���� Aspect structural (virion) :���� entité constituée :

– d’un génome (ADN ou ARN)– d’une capside de nature protéique– parfois d ’une enveloppe

Qu’est-ce qu’un virus ?

Virus de la rougeole

Virus en microscopie électronique

Adenovirus (virus nus)

Virus HIV

EnveloppeCapside

Virus en microscopie électronique

Nature des virus

• Particules inertes en solution aqueuse

• Pas de multiplication virale dans l’environnement

• Passe à travers les filtres de 0,3 microns

Attachement

Pénétration

Décapsidation

Synthèsedes protéines

Réplication

Assemblage

Libération par bourgeonnement

Libération par lyse cellulaire

Une multiplication intra-cellulaire

Résistance dans l’environnement• Classiquement les virus enveloppés sont

peu résistants dans le milieu extérieur: �inactivation rapide dans le milieu extérieur

(ex: HIV, Grippe…)

• Virus nus plus résistants �transmission indirecte par aliments souillées

(ex: HAV, Poliovirus…)

• Conséquence pour le transport des prélèvements à visée diagnostic: faible T°

Interaction virus - population

���� Réservoirs de virus

���� Transmission

���� Modalités épidé miologiques des infections virales

���� Prévalence et incidence des infections virales

Modalités épidémiologiques

���� Epidémies : cas groupés dans le temps

���� Pandémies : épidémies à l ’échelle mondiale

���� Endémies : circulation permanente du virus dans la population

���� Cas sporadiques : infections isolées

Réservoirs

���� Homme���� individu malade ou asymptomatique

excrétant du virus par différentes voies (aérienne, fécale-orale, sexuelle)

���� Animalex : rage - fièvre jaune – Hépatite E

Transmission

���� Directe inter-humaine

���� Indirecte•••• eau souillée - coquillages•••• vecteur (moustique, tique)•••• matériel ou produit biologique contaminé

VZV, V. rougeole,V. InfluenzaVRS…

HSV, CMV, EBV,AdenovirusHBVEnterovirus, HAV, rotavirus…

HSV, HBV, HCVHPV, Rage

HSV, HBVHPVHIV

HBV, HCV, HIV

HSV, Enterovirus 70V. rougeoleV. rage

Infection aiguë

Infection latenteEx: Herpes virusCMV, HSV, VZV

Infection chroniqueEx: HIV, HCV..

Ex: HAV, grippe

Physiopathologie des infections

Utilisation des antiviraux

• Tous virostatiques• réduisent la contagiosité en diminuant

l’excrétion virale• Traitement prophylactique post-exposition• Traitement des infections aiguës ou

chroniques

Attachement

Pénétration

Décapsidation

Synthèsedes protéines

Réplication

Assemblage

Libération par bourgeonnement

Libération par lyse cellulaire

Cibles des antiviraux

Gestion du risque viral

• Dépistage• Vaccination • Traitement• Information des sujets et du personnel

• Règles universelles d’hygiène

• Circuit à risque viral – Isolement dans l’espace > temps– Locaux et matériels adaptés

Prévention #1:méthodes générales

• Isolement • Arrêt du personnel malade• Mesures universelles d ’hygiène

– Lavage des mains– Gants– Matériels et utilisation (procédures et modes

opératoires)– Traçabilité

Prévention #2:méthodes spécifiques

• Diagnostics rapides

• Vaccinations patients / personnel– Contrôles de l’immunité

• Traitement – Sérothérapie

– Antiviraux

Principaux désinfectants

• Virus enveloppés– Détergents– Alcool 70°, Chlorhexidine, ammoniums

quaternaires, …

• Ensemble des virus (dont virus nus)– Formol / formaldéhyde (P3)– Eau de javel (++)– Aldéhydes (glutaraldéhyde) (Sanytex°)

Transmission sanguine

• Transfusion sanguine et produits sanguin– HBV, HCV, HIV, CMV, ….– Sélection des donneurs + dépistage Ac et

génomique– Déleucocytation, chauffage, …

• Accident d ’exposition au sang– Mode opératoire, formation, conditions de travail, …– Hémodialyse

Principaux antiseptiques

• Ensemble des virus (dont virus nus)– Dérivés chlorés (Dakin®, …)

– Dérivés Iodés (Bétadine, …)– Alcool à 70°+/-

Vaccins anti-viraux

• Inactivés– Complets inactivés: HAV, rage, encéphalite

japonaise, encéphalite à tiques– Recombinants: HBV – Sous-Unitaires : Influenza

• Vivants atténués– Rougeole-Oreillons-Rubéole– VZV– Fièvre Jaune

• Séroprophylaxie : HBV, rage, …

Diagnostic virologique

� Recherche des anticorps dirigés contre un virus (sérologie)

- Technique de dépistage de l’infection

� Recherche directe du virus:

- Technique de confirmation

- Prélèvement adéquat au niveau du site de multiplication du virus

- Culture virale ou amplification du génome virale (PCR)

ATNC ou Prions

Caractères :

- maladies transmissibles - reproduites par inoculation cérébrale

- incubation silencieuse et très longue

- dégénérescence SNC - fatale (spongiose)

- absence de réactions inflammatoires et immunitaires

- absence de structure évocatrice d’un microorganisme

dans le SNC

- résistance inhabituelle aux nucléases et radiations ionisantes

- résistance partielle aux protéases

Définition

- identification de la PrP par S. Prusiner (1982)

- démonstration de l ’implication de son gène dans la susceptibilité aux ATNC

_________

Un prion est une entité infectieuse protéique dont l’unique support de

pathogénicité est lié à une conformation pathologique d ’une protéine

du soi, la PrPc.

Physipathologie

Entrée

macrophagesclairance

voie sanguine / lymphatique

organes lymphoïdes

terminaisons nerveusessystème nerveux périphérique

système nerveux central

Physipathologie et diagnostic

- Accumulation de protéines anormales PrPsc dans le SNC

- Concentration de PrPsc corrélées avec la clinique

� Diagnostic:

Recherche de la PrPsc dans le LCR