Itu Keragaman dan Distribusi dari Jamur di Resident i al

Surfing ces sebuah

Abs t ract Itu utama hipotesa mengenai komposisi dari mikroba kumpulan di dalam lingkungan adalah bahwa kumpulan jamur terstruktur oleh di luar ruangan udara dengan sebuah moderat kontribusi oleh permukaan pertumbuhan, sedangkan dalam kumpulan bakteri mewakili sebuah campuran bakteri masuk dari di luar ruangan udara, menumpahkan oleh bangunan penduduk, dan dewasa di permukaan. Untuk uji itu jamur aspek dari ini hipotesis, kita sampel jamur dari tiga jenis permukaan mungkin untuk mendukung pertumbuhan dan karena itu mungkin kontributor dari jamur untuk dalam udara: saluran air di dapur dan kamar mandi, kusen di bawah kondensasi rawan jendela, dan kulit dari manusia penduduk. Contoh adalah matang di unit direplikasi dari sebuah universitas-perumahan kompleks tanpa dilaporkan cetakan masalah, dan urutan adalah dianalisis menggunakan kedua QIIME dan itu baru UPARSE pendekatan untuk OTU-Binning, untuk itu sama Hasil. Permukaan ditunjukkan sebuah mikologi profil mirip untuk bahwa dari di luar ruangan udara dari itu sama lokalitas, dan kumpulan clustered oleh permukaan ketik. '' Weedy '' genera khas dari dalam udara, seperti itu sebagai Cladosporium dan Cryptococcus, yang berlimpah di kusen, sebagai adalah sebuah berbeda set dari jamur dari mungkin di luar ruangan asal. Saluran air didukung lebih memiskinkan kumpulan dari itu lain permukaan dan terkandung tahan panas genera seperti itu sebagai Exophial a, Candid a, dan Fusariu m. Paling menakjubkan adalah komposisi terdeteksi di warga ' dahi. Di tambahan untuk penyembunyian Malassezi a, sebuah diketahui manusia komensal, Kulit juga kerasukan sebuah menakjubkan kesempurnaan dari yg tak bertempat tinggal jamur, termasuk patogen tanaman seperti itu sebagai ergot (Claviceps purpere a). Secara keseluruhan, jamur kesempurnaan di dalam permukaan adalah tinggi, tapi berdasarkan pada diketahui autecologies, paling dari ini jamur tidak mungkin untuk menjadi pertumbuhan di permukaan. Kita menyimpulkan bahwa sementara beberapa endogen jamur pertumbuhan di khas rumah tangga permukaan tidak terjadi, terutama di saluran air dan kulit, semua perumahan permukaan muncul - untuk bervariasi derajat - untuk menjadi pasif kolektor dari udara jamur dari diduga di luar ruangan asal, sebuah pandangan dari itu asal dari itu dalam microbiome sungguh berbeda dari bakteri.

Aku n troduction Meskipun hanya sebagai banyak sebagai 0,7% dari itu global lahan

permukaan tertutup di bangunan [1], Amerika menghabiskan di rata-rata tentang 87% dari mereka waktu dalam ruangan, dan paling itu, 69%, di mereka rumah [2]. Biasanya, jamur adalah dari bunga hanya ketika bangunan adalah rusak oleh air memasuki itu bangunan karena untuk kebocoran di itu amplop, pipa kegagalan, atau kondensasi. Di bawah ini kondisi, indoor jamur pertumbuhan bisa penyebab atau mempertajam penyakit termasuk asma, terutama melalui jamur racun dan alergen [3]. Tradition- sekutu, jamur adalah diidentifikasi oleh mengamati mereka morfologi langsung dari ditangkap spora atau setelah budidaya. Ini berdasarkan morphological- metode memiliki diproduksi sebuah daftar sekitar 90 spesies yang diperkirakan menjadi umum dan penting pemain dalam ruangan - cetakan dan ragi seperti itu sebagai itu di itu genera Alternaria, Aspergillus, Cladosporium, Penicilliu m, Rhodotorul a, dan Wallemia [4,5]. Ini dalam jamur cenderung menjadi saprobik taksa dengan tertentu relung dalam itu rumah bahwa tergantung di substrat dan air ketersediaan. Untuk Misalnya, Rhodotorula mucilaginosa umum di lembab

Kamar seperti itu sebagai kamar mandi dan itu lebih xerophilic Aspergillus fumigatus dikaitkan dengan pengering daerah seperti itu sebagai hidup kamar, sementara Cladosporium adalah di mana-mana sepanjang tinggal [6,7].

Baru-baru ini, asam nukleat sequencing memiliki telah terapan untuk debu di dalam ruangan udara dari rusak dan utuh bangunan survei kedua

jamur dan bahkan mikroba yang lebih kecil dalam ruangan, bakteri. Ini studi memiliki tidak hanya sangat diperluas nomor dari mikroba taksa dikenal dari dalam udara, mereka bisa disintesis ke hipotesis umum tentang itu struktur dari dalam udara mikroba komu- nitas: dalam jamur mewakili subsampel sebuah dari outdoor Komunitas jamur dengan sederhana atau sedikit indikasi intern Pertumbuhan [8 2 11], sedangkan dalam ruangan Bakteri adalah lebih sangat terpengaruh oleh penduduk dari itu bangunan [1 2 217]. Jamur studi memiliki terutama terfokus di spora, ragi sel, dan potongan-potongan dari propagul ini dan hifa bahwa adalah udara atau menetap dari udara. Sebagai contoh, kami pekerjaan sebelumnya menunjukkan bahwa udara kumpulan jamur dikumpulkan dari pasif lunas debu melakukan tidak berbeda antara ruangan tersebut sebagai dapur, kamar mandi, kamar tidur, dan ruang keluarga, bahkan meskipun mereka memiliki perbedaan yang jelas di menggunakan, sumber air, dan potensi substrat untuk jamur pertumbuhan [10]. Di sisi lain tangan, bakteri studi di rumah memiliki lebih sering sampel termasuk dari permukaan dan itu kulit dari bangunan penduduk sebagai indikator dari dalam bakteri masyarakat [13,17].

Untuk mengenali mungkin daerah dari lingkungan indoor di mana jamur tumbuh dan bisa menyumbang untuk udara kumpulan melalui aerosolisasi di non-air rusak bangunan, kami membandingkan jamur di tiga permukaan jenis untuk itu jamur bahwa kita memiliki terdeteksi sebelumnya di pasif menetap udara debu [10]. Pengetahuan jamur yang pertumbuhan adalah sebagian besar air terbatas di bangunan, kita dicari untuk

situs yang adalah kedua basah berkala dan umum ditemukan di berbeda tinggal di pesanan untuk uji itu hipotesa bahwa itu jamur dalam ruangan kumpulan di permukaan adalah tidak sebuah penting sumber untuk indoor airbone jamur kumpulan, sebagai mereka adalah untuk bakteri. Kami memilih tiga jenis permukaan: jendela, saluran air, dan dahi dari penduduk.

Sebelumnya bekerja memiliki disarankan berbeda jamur masyarakat di ini permukaan jenis. Di jendela, yang adalah basah dengan kondensasi, kami harapkan untuk lihat itu umum dalam cetakan disebutkan di atas [4]. Di itu saluran air, yang oleh definisi adalah basah, kita hipotesis bahwa kita akan lihat sederhana masyarakat karena untuk yang dilaporkan dominasi Fusarium dibandingkan untuk taksa seperti itu sebagai Penicillium dan Mucor [18], dan kita diharapkan untuk lihat komunitas yang berbeda terstruktur oleh itu tertentu gizi lingkungan dari menguras Jenis (dapur, kamar mandi tenggelam, bak mandi). Akhirnya, kita prediksi itu dahi mycobiota kulit untuk menjadi didominasi oleh Malassezi a, sebuah khas penduduk dari manusia kulit bahwa bisa menjadi sebuah penyebab ketombe, tapi juga bisa pelabuhan lainnya, kurang sering ditemui taksa seperti itu sebagai Candida dan Aspergillus [19,20]. Sementara kita melakukan mendeteksi kehadiran dari ini diketahui jamur asosiasi dari permukaan, kita secara keseluruhan ditemukan itu pengaruh dari di luar ruangan udara untuk menjadi dominan.

M a terials dan M e tho d s Penelitian Situs dan sam p le collecti o n

Kami sampel daerah dari potensi jamur pertumbuhan di daerah dari tempat tinggal yang terbuka untuk itu hidup ruang, tidak daerah tersembunyi di balik Dinding: saluran air di itu kitchen sink, kamar mandi tenggelam, dan bak mandi; itu menurunkan atas menghadap tepi dari windowsills di dapur, hidup kamar, kamar tidur, dan Kamar mandi; dan itu dahi semua warga dari itu satuan (Gambar 1). Contoh adalah direplikasi di 11 unit dari sebuah universitas perumahan kompleks, di yang semua tinggal memiliki konstruksi yang sama bahan dan mirip lantai Rencana dan yang tidak tidak mengizinkan kucing atau anjing, sebagai sebelumnya dijelaskan [10]. Untuk sampel permukaan, steril, nukleotida bebas air adalah bekas untuk lap kapas swab, dan itu permukaan adalah mengusap untuk 5210 detik. Kami melakukan tidak mengamati apa saja terlihat jamur pertumbuhan ini tinggal di luar dari saluran air. Penyeka dari rumah permukaan adalah tersimpan dalam individu kaca botol kecuali untuk itu dahi penyeka, yang dikumpulkan untuk semua penduduk dari satuan untuk melindungi sukarelawan ality kerahasiaan,. Penyeka yang tersimpan beku di 2 80 UC sampai ekstraksi nukleotida. Selain itu, warga selesai sebuah penelitian di karakteristik dan khas penggunaan dari mereka satuan untuk menyediakan informasi mengenai: itu nomor dari kamar tidur, kamar mandi, dan warga, itu usia dari Unit, itu Kehadiran houseplant (s) dan itu penggunaan dari sebuah humidifier. Lain parameter (Frekuensi dari memasak, pembersihan, hunian, dan jendela pembukaan) adalah berubah-ubah dan oleh karena itu dikecualikan dari analisis. Mengepel Survei adalah dilakukan dua kali, sekali di Agustus 2011 di 11 unit dan lagi di Januari 2012 untuk 8 dari itu sama unit. Itu contoh protokol adalah diatur oleh itu University of California Komite untuk itu Perlindungan Manusia Subyek, Protokol ID # 2011-03-2947, dan disetujui oleh kedua itu Warga desa Asosiasi untuk itu perumahan

kompleks di Mei 18, 2011 dan itu Residential dan Mahasiswa Program layanan dari Universitas di Juli 25, 2011. DNA Prosedur s sing dan bioinfor m atics ana l ysis

Genomic DNA pencabutan mengandalkan di itu MoBio PowerSoil Kit (Carlsbad, CA, USA) dengan beberapa modifikasi berikut Fierer et al. [21]. Menggunakan gunting yang memiliki telah yg terbenam di etanol dan dinyalakan, itu kapas kepala dari itu mengepel adalah dipotong langsung ke yang disediakan PowerBead tabung yang berisi larutan C1. Itu tabung yang diinkubasi di 65 UC untuk 10 menit dan vortexed horizontal untuk 10 menit, setelah yang manipulasi mengikuti direkomendasikan protokol. Itu intern ditranskripsikan pengatur jarak (ITS) daerah 1 dari itu nuklir ribosom coding cistron adalah ditargetkan dengan primer ITS1F dan ITS2 [22,23]. Itu depan cat dasar terkandung itu 454

Fusi Cat dasar A-adapter dan sebuah 8-basepair MID barcode unik untuk masing-masing lingkungan sampel, sedangkan itu membalikkan primer yang terkandung itu B-adapter untuk itu pyrosequencing. PCR tions amplifica- dari kedua sampel dan negatif Kontrol adalah adalah dilakukan dalam rangkap tiga, dikumpulkan, dimurnikan menggunakan itu AMPure magnetik manik-manik (Beckman Coulter Genomics, Danvers, MA), diukur menggunakan yang fluorometer qubit (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA), dan gabungan di 50 ng equimolar konsentrasi untuk sequencing hilir; penuh rincian di amplikon perpustakaan persiapan memiliki telah dijelaskan sebelumnya [10]. Lingkungan sampel adalah terbelah di tiga berbeda 1/8 th 454 FLX + picotiter piring, yang adalah sequencing di dua sequencing yang berbeda fasilitas, satu piring di Duke Lembaga untuk Genomic Ilmu dan Polis (Durham, NC) dan dua piring di itu Universitas dari Illinois di WM Urbana-Champaign itu Muntah Pusat untuk Perbandingan dan Fungsional Genomics. Informasi di semua itu diproses sampel di itu unit eksperimental, termasuk itu MID, adalah terperinci di Tabel S1.

Awalnya, urutan adalah bioinformatically diproses dengan QIIME [24], dan di itu Proses penulisan itu kertas, UPARSE [25] adalah dirilis. UPARSE adalah sebuah baru metode bertujuan di pengelompokan urutan global-dipangkas ke operasional taksonomi unit (Otus) dengan sebuah fokus pada mengurangi OTU inflasi. Meskipun nomor dari Otus turun dari 1.305 taksa di QIIME (Protokol S1) ke 966 di UPARSE, itu kualitatif hasil adalah identik, menguatkan umum observasi bahwa beta-keragaman kesimpulan yang cenderung untuk menjadi kurang peka dari alfa keragaman untuk '' Berisik '' membaca seperti itu sebagai itu yang dihasilkan oleh sequencing error atau Pembentukan chimera [26]. Hasil yang dilaporkan berdasarkan di analisa dengan UPARSE. Kami mengikuti itu direkomendasikan pipa saluran [27], dengan pengaturan sebuah pemotongan panjangnya dari 150bp dan sebuah maksimum diharapkan

error dari 0,5 untuk individu urutan dan menghapus lajang. Chimera adalah diperiksa terhadap itu UNITE Database jamur [28] versi terlepas Agustus 26, 2013, dan database ini adalah juga digunakan untuk menetapkan taksonomi berdasarkan di itu BLAST algoritma. Urutan baku arsip dan menyertainya metadata memiliki telah disetorkan ke itu NCBI SRA di bawah pencapaian SRP029981, dan -wakil tative urutan dari itu terakhir Otus memiliki juga telah setor ke GenBank dengan pencapaian nomor KF221245-KF222494.

Di pesanan untuk perkiraan jamur biomassa, kita dipekerjakan sebuah Real-Time PCR Sistem (Terapan Biosystems 7300, Carlsbad, CA, USA). PCR sampel terkandung 5 m l genomik DNA ekstrak, 10 m l Itaq SYBR Hijau Supermix dengan ROX (Bio-Rad, Hercules, CA, USA), 0,2 m l dari 100 mg ml 21 BSA, 0,15 ml dari masing-masing 50 mM maju dan primer sebaliknya, dan air untuk 20 ml. Universal jamur primer FF2 dan FR1, yang memperkuat sebuah 425-bp daerah dari itu kecil subunit rRNA, adalah bekas [29]. Itu standar melengkung adalah dihasilkan menggunakan sebuah 5 kali lipat pengenceran seri dari Penicillium purpurogenum spora mencakup 5250.000 spora. Itu thermocycler profil mulai dengan asi denatur- di 95 UC untuk 3 menit, diikuti oleh 40 siklus dari 95uC untuk 15s dan 60 UC untuk 60s (Yang kemudian makhluk itu data koleksi tahap), dan berakhir dengan sebuah disosiasi melengkung dari 95 UC untuk 15s, 60 UC untuk 30-an, dan 95 UC untuk 15s. Kita diperiksa untuk inhibisi di sebuah bagian dari sampel dengan termasuk sebuah diketahui Jumlah P. purpurogenum spora dengan sebuah lingkungan sampel. Jika itu diukur perkiraan adalah kurang dari yang dikenal masukan dari spora, itu akan menunjukkan itu genomik ekstrak mengandung inhibitor untuk amplifikasi. Tidak indikasi dari inhibisi diamati untuk apa saja dari itu permukaan jenis, jadi semua sampel adalah menjalankan dengan murni genomik DNA. Itu qPCR untuk masing-masing contoh adalah dilakukan rangkap tiga, dan berarti nilai bekas untuk analisis. Karena untuk mewarisi tersebut keterbatasan dari qPCR untuk perkiraan biomassa, kita mengobati Hasil sebagai indikator dari relatif Perbedaan dari jamur material di sampel. Co m Tengoklah ana l yses

Jamur taksa sekarang di negatif Kontrol (Tabel S2) dikeluarkan dari itu penelitian sampel. Itu taksa di negatif kontrol (n = 67) adalah tidak tertentu berlimpah-limpah atau sering (Tabel S2), dan dengan demikian, mengecualikan semua taksa sekarang di itu negatif kontrol adalah konservatif pendekatan bahwa hindari perhitungan mungkin taksa kontaminan dengan sedikit efek di kumpulan sampel. Dua daerah dari swabbing, itu bak mandi ubin dan itu dinding belakang itu dapur kompor (kemungkinan Situs dari kondensasi karena untuk memasak), adalah dikecualikan karena miskin contoh pengerasan dan rendah nomor dari berbunyi bagi mereka yang melakukan memperkuat. Akhirnya, kita hanya termasuk itu sampel yang berisi di paling sedikit 100 urutan dan jernih itu meja masyarakat untuk bahwa urutan nomor sebelumnya untuk semua analisis. Meskipun sebuah cakupan rendah nomor, itu memiliki telah ditampilkan untuk menjadi cukup untuk mengidentifikasi perbedaan di mikroba masyarakat [30].

Untuk perbandingan di sampel, itu masyarakat tabel dianalisis di R [31] untuk melaksanakan statistik Tes kekayaan, komposisi perbedaan, dan isolasi

oleh jarak. Kami divisualisasikan perbedaan masyarakat komposisi menggunakan nonmetric yang bersifat multidimensional mensional skala (NMDS) dan diperiksa Faktor termasuk komposisi dengan ADONIS, sebuah permutational multivariat analisis perbedaan [32]. Perbedaan di masyarakat komposisi bekas kedua Jaccard dan Morisita-Horn indeks, yang mengandalkan di tidak adanya presence- dan kelimpahan data, masing-masing. Sebagai disebutkan, sampel sequencing di tiga piring yang berbeda di dua Fasilitas sequencing, jadi kita laporan Hasil dari diukur lingkungan elemen setelah anjak di luar itu efek dari sequencing menjalankan [Berikut 33] di model multifaktorial sebagai diimplementasikan dengan ADONIS [32]. Statistik Efek dari geografis Perbedaan adalah berdasarkan di korelasi perapian.

Re s ults Fun g al com m kesatuan com p ositio n: link ke dalam udara dan ion indica t dari pertumbuhan

Jamur masyarakat komposisi di dalam permukaan adalah sangat beragam dengan menghormati untuk taksonomi perwakilan dan ekologi peran (Tabel 1; Angka 2). Banyak dari itu paling umum taksa tumpang tindih dengan itu diketahui dari berbasis budaya- Survei dari indoor Lingkungan: Cladosporiu m, Cryptococcu s, Penicilliu m, Candida, Malassezi a, Phoma, Exophiala, Rhodotorula, Wallemia, dan Fusarium. Namun, itu keragaman dalam umum tingkat Klade, untuk Misalnya, Cladosporiu m, Cryptococcu s, Exophiala, adalah lebih besar dari diharapkan. Selain itu, di sana adalah berlimpah-limpah taksa, seperti, Botryotinia fuckeliana dan Kondoa Aeria, yang memiliki tidak telah sering terdeteksi dari budaya kerja di itu dibangun di lingkungan. Banyak taksa, meskipun tidak paling umum yang, hanya cocok lain tidak disebutkan namanya urutan dalam itu Database dan bisa oleh karena itu tidak menjadi diidentifikasi.

Taksonomi keragaman pada semua permukaan cocok itu Komposisi tingkat kelas sebelumnya dilaporkan dari pasif dikumpulkan debu luar di itu sama lokalitas [10] (Gambar 2). Di seberang semua itu permukaan jenis dan itu udara sampel, Basidiomycota seperti Agaricomycetes, Microbotryomycetes, dan Tremellomycetes, dan Agaricomycota seperti sebagai Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Leotiomycetes, charomycetes Sac-, dan Sordariomycetes, adalah baik diwakili. Sebagai luas snapshot, itu komposisi dari jamur di itu berbeda permukaan dengan taksonomi kelas menunjukkan dgn cara yg menyolok kesamaan untuk dalam dan outdoor udara sampel dari itu sama situs dilaporkan sebelumnya, dan masing-masing lain bagaimanapun dari permukaan ketik.

Jelas Perbedaan di komposisi di permukaan adalah hanya tampak saat perbandingan adalah terbatas untuk sering taksa, orang-orang yang adalah ditemukan di di paling sedikit 10% masing-masing contoh jenis dan kemudian hanya saluran air melihat berbeda dari lain permukaan (Gambar 2). Kapan melihat hanya ini sering taksa, itu menguras sampel memiliki sebuah persentase yang lebih besar dari Eurotiomycetes (Exophial a), Saccharomycetes (Bisa- melakukan), dan Sordariomycetes (Fusariu m). Secara khusus, itu adalah ragi hitam seperti Exophiala dan Ochroconis, bahwa adalah umum terdeteksi di saluran air (Tabel 1). Di itu lain tangan, Agaricomycetes, Dothideomycetes, Glomeromycota, Lecanoromycetes, dan Rinomycetes Taph- dan banyak taksa umum di kusen adalah juga umum di dahi sampel (Tabel 1). Kulit sampel adalah didominasi oleh suite dari taksa yang adalah hanya diketahui dari non-manusia dan hewan non habitat, jamur termasuk Cladosporiu m, Penicillium spinulos sebuah, Rhodotorul a, dan Claviceps purpurea. Dari ini, satu yang terutama berdiri di luar

adalah Claviceps purpurea, itu ergot jamur dikenal nya patogen hubungan dengan biji-bijian. Ergot adalah umum pada kedua windowsills dan dahi di itu musim panas. Itu hanya dikenal manusia terkait jamur yang adalah sering ditemukan adalah Candida parapsilosis dan Malassezia sp. (Tabel 1). Biogeog r ap h ic p a tterns a m ong dalam permukaan

Bioinformatika pengolahan menghasilkan di sebuah total dari 59.201 urutan jamur individu berbunyi clustered ke 966 Otus. Akumulasi Teramati kurva menunjukkan bahwa meningkat contoh kedua dalam dan di perumahan unit akan mungkin menemukan lebih lanjut jamur Otus, terutama untuk windowsills (Gambar S1). Meskipun kekayaan keseluruhan adalah tinggi, beberapa jamur taksa adalah umum ditemukan dalam beberapa sampel, dan itu rata-rata diamati kekayaan di sebuah sampel adalah 32 Otus. Itu luas mayoritas dari taksa adalah langka di dua cara: kelimpahan (Nomor dari dibaca) dan frekuensi (Bagaimana sering mereka muncul di sebuah sampel, Angka S2). Untuk Misalnya, itu kelimpahan median untuk semua taksa adalah sekitar dua individu membaca, dan 147 taksa (15%) adalah diwakili oleh satu atau dua membaca. Demikian juga, 35% dari taksa muncul di hanya satu sampel, dan hanya 11% dari itu Otus muncul di di paling sedikit 10 dari itu 101 sampel.

Sebagai sampel oleh permukaan penyeka, saluran air muncul kurang kaya dari kusen dan dahi: itu rata-rata diamati rarified kesempurnaan adalah 6 taksa di saluran air, 19 di kusen, dan 32 di kulit. Shannon dan Simpson indeks keanekaragaman juga menunjukkan yang mengalir adalah kurang berbeda dari itu permukaan lainnya jenis (Tabel S3). Dalam permukaan jenis, kamar mandi tenggelam (n = 14) menunjukkan taksa lebih sedikit dari dapur tenggelam (N = 5) (Gambar S3). Plus, jamur kesempurnaan dari windowsills menurun sebagai itu jumlah kamar tidur atau warga meningkat (Gambar S3). Di sana adalah tidak diamati Perbedaan di saluran air, kusen, dan kulit di jamur kekayaan oleh lain satuan atau penduduk karakteristik (Seperti sebagai kehadiran humidifier atau houseplant (s)).

Biomassa Perkiraan menunjukkan sebuah jelas Pola: kulit menunjukkan konsisten sinyal untuk rendah jamur biomassa, dan kusen dan saluran air jauh lebih variabel tapi umumnya menunjukkan banyak lebih tinggi jamur

biomassa. Itu berarti spora setara di kulit adalah 114 P. purpurogenum spora (S 2 = 187). Windowsills menunjukkan tinggi biomassa rata-rata (M = 906.608 spora setara, s 2

= 2.196.719) dan berkisar dari 14 untuk 9834754 spora setara. Dalam saluran air yang paling sampel adalah dari moderat biomassa (M = 1.430 P. purpurogenum spora setara, s 2 = 3383). Namun, tiga saluran air (Satu dapur, dua kamar mandi sink) sampel adalah ekstrim outlier, bahkan setelah amplifikasi berulang, menunjukkan biomassa dari .70,000,000 Spora setara. The-biomassa tinggi menguras sampel muncul dalam tiga berbeda unit, sedangkan -biomassa tinggi windowsills sampel semua datang dari sebuah tunggal Unit. Luar jenis permukaan, itu hanya signifikan trend kami diamati di kelimpahan adalah sebuah meningkatkan di jamur biomassa dengan Meningkatnya jumlah dari warga.

Visualisasi dari masyarakat komposisi menunjukkan pengelompokan melalui darat jenis dan ini hasil adalah independen dari apakah membaca kelimpahan dari taksa (Gambar 3; ADONIS p, 0,05) atau hanya kehadiran-tidaknya dari taksa (Gambar S4) adalah dipertimbangkan. Sampel jamur di kusen, kulit, dan menguras penyeka adalah berbeda di ruang komposisi, meskipun kusen memiliki lebih taksa di umum dengan penyeka kulit dari saluran air. Di pengujian untuk Perbedaan di kelompok varians, saluran air dan kulit menunjukkan sederhana signifikan Perbedaan dari masing-masing lainnya (multivariat kehomogenan dari kelompok dispersi [34] sebagai diimplementasikan di vegan [32]; Tukey kelipatan perbandingan dari berarti p = 0,05), dengan saluran air lebih variabel dari kulit penyeka. Setelah anjak di luar piring Efek di itu tiga pyrosequencing berjalan yang berbeda (Antara 129% dari itu total variasi), itu perumahan Unit menjelaskan itu terbesar persentase dari variasi di jamur komposisi komunitas (Tabel 2). Karena untuk itu dominan efek dari Unit, kita hanya laporan itu Faktor bahwa memiliki sebuah penting efek setelah variasi disebabkan oleh perumahan satuan dicatat untuk. Dengan demikian, hanya permukaan jenis sampel dan ruang fungsi (Dan tidak satuan karakteristik atau faktor perilaku itu warga di itu Unit, seperti itu sebagai itu nomor kamar tidur atau itu penggunaan dari humidifier) sisa sebagai prediktor signifikan dari jamur masyarakat Komposisi.

Dalam saluran air, itu prediktor terbesar dari jamur komposisi komunitas adalah Unit, diikuti oleh jenis (Kamar mandi tenggelam, Menguras bak mandi, dapur sink) (Tabel 2). Untuk jendela, satuan adalah dominan Komunitas prediktor komposisi, diikuti oleh Fungsi kamar (Dapur, kamar tidur, hidup kamar, atau kamar mandi). Untuk kulit, Unit adalah itu hanya penting tukang ramal dari masyarakat Komposisi. Hasil adalah konsisten ketika masyarakat komposisi dianalisis menggunakan itu Jaccard Indeks, sebuah Kehadiran-tidaknya berdasarkan

metrik bahwa akan menjadi lebih peka untuk langka taksa, tapi itu Faktor menjelaskan sedikit kurang dari itu variasi di masyarakat Komposisi (Tabel S4) dari ketika menggunakan itu Morisita-Horn indeks dilaporkan pada Tabel 2.

Jamur komposisi di saluran air menunjukkan lebih kontinuitas lebih waktu dari ambang jendela. Kita dibandingkan itu beta-keragaman Jarak masyarakat dari itu sama contoh tempat di waktu dengan masyarakat jarak di space: untuk Misalnya, sebuah menguras sampel di itu musim panas dengan nya musim dingin contoh terhadap semua saluran air sampel di musim panas. Variasi dalam sebuah individu menguras di waktu bervariasi tapi secara signifikan menurunkan dari variasi di ruang (Gambar S5). A jendela, di itu lain tangan, adalah tidak lebih mungkin untuk menunjukkan serupa jamur Komposisi di waktu sebagai itu adalah untuk windowsills lain di ruang. Untuk kulit, tidak waktu perbandingan adalah tidak mungkin, karena penyeka kulit adalah hanya diidentifikasi oleh Unit, tidak untuk individu.

Kita ditemukan beberapa bukti oleh jarak di kami sampel, meskipun kita adalah terpaksa oleh rendah contoh ukuran ketika melihat ke dalam contoh jenis dan musim (Tabel S5). Di tertentu, perbedaan di masyarakat jamur meningkat dengan jarak geografis di itu musim dingin di kedua windowsills dan dahi. Discu s sion Dalam d oor fung sebuah l warga

Itu pertanyaan untuk ini penelitian adalah untuk menentukan jika permukaan di gedung-gedung atau di mereka penghuni kontribusi untuk itu komponen jamur dari dalam udara di sebuah lokal skala, sebagai memiliki telah ditunjukkan untuk bakteri. Motivasi datang dari kami sebelumnya pekerjaan di perumahan ini kompleks, yang menunjukkan bahwa penyebaran dari itu udara luar didominasi itu sinyal dari dalam

udara, bahwa banyak dari itu umum dalam ruangan jamur memiliki sebuah mungkin di luar ruangan asal, dan bahwa Keterbatasan penyebaran di jamur adalah itu tunggal paling penting faktor penataan ruangan udara [10]. Di itu arus penelitian kita menunjukkan bahwa, meskipun jamur yang kumpulan di berbagai permukaan di ini rumah adalah berbeda, mereka adalah masih sebagian besar didominasi oleh jamur umum di di luar ruangan udara. Jamur taksa bahwa adalah mungkin tumbuh di ini permukaan (Misalnya, Malassezia di kulit, Exophiala di saluran air - dibahas kemudian) dan yang paling diharapkan untuk menyumbang untuk mikroba untuk dalam udara adalah tapi kecil Komponen dari itu dalam udara (Sebagai ini genera adalah itu 65 dan 29 t h, masing-masing, paling sering dari 271 genera ditemukan di indoor udara dari kami sebelumnya penelitian [10]).

Windowsills menawarkan menarik contoh dari pengendapan daerah. Banyak dari itu dominan jamur kelompok pada windowsills (Misalnya Agaricomycetes, Glomeromycetes, Lecanoromycetes, dan Rinomycetes Taph-) yang mungkin menjadi tumbuh di itu permukaan disebabkan oleh umumnya mereka didefinisikan Ditanam atau tanah terkait ekologi. Di itu sisi lain, anggota dari itu marga Cladosporium (Dothideomycetes) sering diamati pertumbuhan di windowsills dan lain sporadis dibasahi permukaan di rumah. Tapi Cladosporium adalah juga antara paling umum jamur ditemukan di di luar ruangan udara di ini sama situs [10], dan jadi kelimpahan mereka di sini pada kusen bisa menjadi menjelaskan terutama oleh endapan agak Pertumbuhan itu. Endapan jelas menjelaskan mereka kehadiran di kulit sampel, karena ada adalah tidak Bukti sebelumnya dari Cladosporium pertumbuhan di manusia yang sehat, dan frekuensi mereka di kusen adalah hanya marginal lebih tinggi dari bahwa diamati pada kulit. Diambil bersama-sama, Hasil dari ini studi menunjukkan bahwa di gedung-gedung yang sehat tanpa dilaporkan cetakan masalah, dalam permukaan yang tidak sebuah dominan sumber untuk dalam jamur. Di fakta itu sebaliknya adalah benar: permukaan tampak menjadi terutama pengendapan lingkungan yang mengumpulkan banyak dari itu sama jamur umum di luar ruangan dan indoor udara.

Namun demikian, kita melakukan menemukan spasial struktur di kami sampel itu tergantung di kedua itu fisik tempat (Unit) sebagai baik sebagai itu

permukaan jenis (Sill, kulit, dan menguras - Angka 3). Ini Struktur biogeografi dari permukaan - absen dari udara sampel dari pasif menetap debu [10] - menunjukkan bahwa permukaan yang berbeda jenis adalah mungkin untuk menyimpan berbeda endapan Pola atau pertumbuhan. Saluran air menunjukkan jelas bukti dari keduanya. Komposisi Perbedaan didorong oleh deposisi adalah ditampilkan oleh itu Malassezia kulit terkait bahwa terdeteksi di kamar mandi saluran air (Sink dan bak mandi) tapi tidak dapur. Sebuah penjelasan untuk itu lebih besar kesempurnaan di dapur saluran dibandingkan dengan kamar mandi sink (Gambar S3) bisa melibatkan sebuah masukan kaya dari nutrisi untuk jamur di dapur dari di kamar mandi. Di yang lain tangan, endogen dewasa paling mungkin account untuk beberapa dari unik Pola ditemukan di saluran air. Itu peningkatan frekuensi dan kelimpahan relatif dari Fusarium dan Exophiala, taksa bahwa yang tahan panas, acidotolerant, oligotrophic, dan mampu memanfaatkan surfaktan [35.238], menunjukkan sebuah berbeda menguras ceruk relatif untuk yang lain permukaan. Kami Hasil menunjukkan bahwa itu bagian dari itu dalam

lingkungan bahwa adalah paling cocok untuk mikroba pertumbuhan di sehat bangunan, mengejutkan, milik untuk itu pipa ledeng sistem. Kulit adalah diketahui untuk menjadi sebuah habitat untuk beberapa jamur, tapi kami

Hasil penelitian menunjukkan bahwa ini jamur mungkin tidak menjadi sebuah terutama berlimpah-limpah set taksa relatif untuk itu bahwa pasif

mengumpulkan di kulit. Untuk Misalnya, baru-baru ini pekerjaan di itu jamur asosiasi dari itu manusia tubuh telah menunjukkan itu ketinggian dari

Malassezia dan untuk sebuah lebih rendah sejauh Aspergillus dan Candida [19,20]. Sementara kita melakukan mengenali Malassezia dan Candida

parapsilosis di dahi (Tabel 1), mereka adalah tidak dominan taksa, di salah satu frekuensi atau kelimpahan, di kami studi. Beberapa dari itu variasi di relatif kontribusi dari taksa di studi bisa menjadi berdasarkan di cat dasar

seleksi, sebagai taksonomi prasangka di PCR pengerasan adalah sebuah diketahui pembatasan dari itu nukleat-acid pendekatan berbasis [Misalnya

39]. Bagaimanapun dari cat dasar pilihan, banyak studi menemukan mendadak tinggi kesempurnaan dari jamur di dan di itu manusia Tubuh

[40], terutama itu kaki [20], dan ini keragaman adalah tersusun jamur yang diketahui ekologi membuat pertumbuhan di manusia mungkin. Kami data

adalah di Perjanjian dengan ini studi dan mendukung hipotesis bahwa terkena kulit permukaan adalah pasif kolektor dari lingkungan jamur, seperti

itu bahwa kita manusia muncul untuk menjadi berjalan melalui tipis mikroba sup dari udara semua sementara acak mengumpulkan jamur di

kami Tubuh [41] dan pakaian. Tidak ada membuat ini titik sebagai jelas sebagai itu ubiquity di dahi dari itu patogen tanaman Claviceps purpere a,

lebih baik dikenal sebagai ergot, yang adalah diketahui terjadi di rumput tumbuh di itu garam rawa dekat itu penelitian Situs [42]. Meskipun kita

terdeteksi banyak Cryptococcus ragi bahwa bisa secara teoritis menjadi pertumbuhan di kulit, itu marga adalah beragam, dan sebagian besar spesies adalah mycoparasitic dan Ditanam atau tanah terkait. Cryptococcus victoriae

adalah itu paling sering takson di di luar ruangan udara di ini situs yang sama [10], dan Crytococcus adalah enam di luar dari itu teratas 30 paling

jamur umum di ini studi. Dengan demikian, di sana adalah sedikit bukti bahwa itu jamur berlimpah di dahi (Tabel 1), dengan pengecualian

Malassezia spp. dan Candid a, memiliki berasal dari pertumbuhan di manusia.

Ini tidak untuk mengatakan bahwa penumpahan dari -manusia terkait mikroba tidak tidak terjadi atau bahwa itu adalah tidak secara medis relevan. Malassezia dan Candida parapsilosis adalah terpilih naik di paling sedikit jarang di udara debu dan windowsills dan lebih umum di saluran air (Tabel 1), menunjukkan bahwa penumpahan dari jamur saat kulit adalah dicuci mungkin terjadi lebih segera dari kulit mengelupas langsung ke itu udara. Dari sebuah perspektif kesehatan, itu adalah aerosolisasi dari jamur material, agak dari

langsung kontak, bahwa khas menganugerahkan itu lebih besar pencahayaan risiko [43], dan pencahayaan untuk jamur aerosol di jamuran bangunan memiliki telah terkait dengan baru-onset asma di dewasa [44]. Aerosolisasi dari jamur dari air Sistem bisa juga memiliki implikasi untuk manusia kesehatan [45]. Untuk Misalnya, Fusarium pertumbuhan di wastafel saluran air adalah itu mungkin sumber kontaminasi di kontak lensa larutan bahwa dipimpin untuk sebuah pecahnya Fusarium keratitis [18,46]. Namun, kami pekerjaan menunjukkan bahwa ketika melihat itu seluruh jamur profil di sehat bangunan, aerosolisasi dari tertentu jamur dari pertumbuhan di permukaan minor ketika dibandingkan untuk jamur masukan dari di luar ruangan. Fun g al b undance dan bersenandung n menjadi h Avior

Kita memiliki baru-baru ini ditampilkan bahwa sangat bervariasi kelimpahan sampel di seluruh bisa hasil di sebuah dirasakan pengurangan di kesempurnaan untuk yang berlimpah sangat sampel [47]. Itu pengurangan di kesempurnaan adalah terkait dengan itu terbatas nomor dari ITS molekul bahwa bisa menjadi sequencing dari masing-masing equimolar PCR-diperkuat lingkungan sampel. Dimana biomassa di itu sampel adalah rendah, membaca kedalaman untuk masing-masing contoh tinggi, tapi dimana itu biomassa adalah tinggi, itu membaca kedalaman adalah rendah. Dengan demikian, dalam tinggi sampel biomassa dengan taksa berlimpah, itu langka taksa akan dilewatkan dan kekayaan yang akan muncul menurunkan dari rendah sampel biomassa sequencing berbarengan [47]. Ini potensi bias juga di bermain di ini studi, dimana itu lebih tinggi jamur kekayaan di dahi dibandingkan untuk lain permukaan (Gambar S1) adalah mungkin disebabkan oleh itu menurunkan jamur biomassa dari dahi sampel. Dengan demikian, biomassa adalah penting potongan dari data untuk benar menafsirkan Hasil dan menyimpulkan proses dari lingkungan survei. Di sini estimasi biomassa ditunjukkan jamur yang kehadiran di dahi adalah agak terbatas, dan ditambah dengan itu komposisi dari jamur kita ditemukan, sebagian besar itu jamur pada kulit mungkin lunas dari itu sekeliling udara. Demikian pula, menurun jamur kesempurnaan sebagai itu jumlah penduduk meningkat (Gambar S4) adalah mungkin menyebabkan oleh meningkatkan biomassa di ini diduduki tinggi- unit. Sebaliknya skenario kemungkinan benar untuk menguras sampel: itu kesempurnaan adalah mungkin diremehkan karena banyak dari itu dominan taksa (Exophiala, Fusarium, & lain) yang mungkin warga pertumbuhan di ini lembab habitat dihasilkan di jamur lebih tinggi biomassa. Solusinya untuk ini masalah adalah untuk meningkatkan nomor dari membaca diperoleh per contoh di teknologi sequencing tinggi-throughput di pesanan untuk jenuh itu Kurva akumulasi.

Sementara manusia laku memiliki discernable efek di Komunitas jamur komposisi (Tabel 2), itu mungkin mempengaruhi kekayaan, dan Aspek ini dari itu penelitian layak lebih lanjut investigasi. Untuk Sebagai contoh, kita ditemukan meningkat kesempurnaan dari windowsills pada mereka unit yang dilaporkan kadang-kadang penggunaan dari sebuah humidifier. Humidifikasi akan diharapkan untuk meningkatkan kondensasi dan oleh karena itu tersedia air alat pendingin permukaan seperti itu sebagai jendela, dan di ini cara bisa memimpin untuk jamur lokal pertumbuhan, meskipun kita melakukan tidak mengamati lebih tinggi biomassa jamur di dilembabkan unit. Penelitian memiliki dilakukan bagaimana kelembaban mempengaruhi bioaerosol

kelangsungan hidup tapi tidak, untuk kami pengetahuan, bioaerosol konsentrasi. Di sana adalah dari kuliah aspek lainnya penduduk laku bahwa salah satu pergi terukur atau adalah invarian, dan itu paling penting dari ini mungkin menjadi itu ketiadaan dari hewan peliharaan. Hewan, terutama anjing, adalah sebuah Sumber dikenal dari mikroba di rumah, baik melalui mereka penduduk masyarakat dan melalui itu pelacakan outdoor mikroba untuk itu dalam ruangan [13,48]. Co m Pariso n s dengan bakteriofag r besarbesaran

Jamur dan Bakteri menunjukkan sangat berbeda sumber pola pada permukaan di itu dibangun di lingkungan. Itu Hasil di sini menunjukkan yang dikenal -manusia terkait jamur menyumbang sekitar 6% dari total jamur untuk non-manusia permukaan. Di Sebaliknya, Bakteri menunjukkan jauh lebih tinggi persentase dari manusia-asosiasi taksa di sebuah variasi indoor permukaan. Lima jenis dari Bakteri terkait dengan manusia

terbuat naik 30% dari permukaan sampel di pesawat [49], dan 20% bakteri di dapur permukaan yang terkait dengan itu palm khusus [12]. Publik kamar kecil permukaan, mengecualikan itu lantai, yang di paling sedikit 75% -manusia terkait Bakteri ketika itu bakteri yang terkait dengan tidak hanya kulit tapi juga usus, urin, dan mulut [17]. Baru-baru ini, penyeka dari permukaan di 40 tinggal menunjukkan bahwa sekitar 80% dari Bakteri di permukaan di rumah adalah manusia-terkait [13]. Meskipun Perbedaan di itu keunggulan manusia sebagai sebuah sumber dari mikroba di dalam permukaan, studi bakteri juga menunjukkan kumpulan yang berbeda di berbeda permukaan jenis [17], dan itu paling sedikit beragam bakteri masyarakat terkait dengan logam permukaan sekitar itu dapur tenggelam, termasuk itu menguras [12], karena kita ditemukan untuk jamur di ini studi.

Mikroba kumpulan di udara sampel menunjukkan sebuah mirip kecenderungan untuk dalam permukaan dengan sebuah lebih tinggi frekuensi dari Bakteri-manusia terkait dibandingkan untuk -manusia terkait jamur. Kami sebelumnya bekerja pada pasif-dikumpulkan udara debu menunjukkan bahwa manusia-diasosiasikan- diciptakan jamur make naik sekitar 3% dari itu total Komunitas jamur [10], dan ini adalah mirip untuk bahwa perkiraan dari global penelitian dari kekosongan debu [9]. Namun, Bakteri-manusia terkait meliputi tentang 20% dari semua Bakteri di dalam ruangan udara ruang kelas [14]. Meadow et al. [50] laporan mirip nilai untuk udara Bakteri di ruang kelas, dengan sebuah max dari 38% dan berarti dari 7,8% dari semua bakteri urutan. Dalam tinggal, itu Bakteri di atas kusen - permukaan khususnya ditargetkan untuk merupakan kolektor pasif dari mikroba kumpulan di udara - adalah kira--kira 30% manusia berasal [13].

Ini perbedaan itu pentingnya dari Bakteri-manusia terkait lawan jamur di itu dalam lingkungan adalah mungkin karena hingga besar Perbedaan di relatif sumber kekuatan antara ini dua kelompok dari mikroba, sebagai jamur populasi ukuran pada manusia jauh menurunkan dari bakteri populasi [40]. Di kontrak, kumpulan jamur di di luar ruangan udara adalah besar [51], dan bisa menjadi lebih besar dibandingkan mereka bakteri [52], tapi menurut perbandingan itu rias sumber luar untuk -manusia terkait kumpulan adalah banyak lebih besar untuk jamur dari untuk bakteri. Oleh karena itu adalah tidak menakjubkan bahwa jamur dari outdoor lingkungan rawa di luar itu tanda tangan dari manusia-terkait jamur di itu dalam lingkungan, sementara bakteri kumpulan ruangan menahan sebuah kuat -manusia terkait tanda tangan. Apa mungkin menakjubkan adalah bahwa di sana adalah sedikit bukti apa saja signifikan dalam ruangan Sumber jamur untuk udara kumpulan seperti itu bahwa dalam ruangan muncul untuk menjadi sebagian besar sebuah pindah himpunan dengan penyebaran dan endapan dari itu di luar

rumah luar biasa Pertumbuhan dalam ruangan. Masalah ini dari pertumbuhan lawan endapan memiliki sebagian besar telah terselesaikan di bakteri studi, tapi ini mungkin akhirnya membuktikan menjadi sebuah sumber kesamaan di mikroba jika, sebagai kita tersangka, paling dari kumpulan bakteri di permukaan giliran di luar untuk mewakili deposisi pasif agak dari di Situ pertumbuhan sebagai mereka muncul untuk menjadi untuk jamur.