medline and more: pubmedurfist.univ-lyon1.fr/files/2014/06/pubmed-renommer.pdf · 2015. 4. 21. ·...

2-Dec-10Lardy JP - URFIST de LYON

Base de données bibliographique plus de 20 millions de références depuis 1947Plus de 5 400 journaux pris en compte

Tous les aspects des sciences bio-médicales et de la santé


92% des références en anglais

82% des références avec résumé d’auteur

journaux en 39 langues


MEDLINE et plus de références

Mise à jour quotidienne depuis 2002

Plus de 712 000 réf ajoutées en 2009

Consultation gratuiteLiens vers d’autres ressources et le texte intégral


3 types de références correspondant à 3 étapes de l’intégration dans la base :as supplied by publisher

in Process

indexed for MEDLINE


Depuis la National Library of Medicine◦ http://www.nlm.nih.gov

directement◦ http://pubmed.gov

Autre interface PubGet◦ http://pubget.com


http://pubget.com/

Le MeSH est un thésaurusMise à jour annuelleConsultable en ligne

MeSH bilingue : traduction de l’INSERM http://mesh.inserm.frou par Cismef http://terminologiecismef.chu-rouen.fr


http://mesh.inserm.fr/http://terminologiecismef.chu-rouen.fr/http://terminologiecismef.chu-rouen.fr/

Organisation hiérarchiséeUn même descripteur MeSH peut appartenir à plusieurs branchesTermes majeurs précédés d’une *Termes obligatoires : check tags


Principe d’indexation de la NLM : utiliser les descripteurs les plus précis.L’explosion permet de rechercher sur un descripteur et tous les termes spécifiques.L’explosion est automatique sur PubMed


1) utiliser la structure du MESH du terme le plus général (ex., Biological Sciences Category ) au plus précis (ex., Genes, Nitrogen Fixation)

2) rechercher par mots-clés dans l’ensemble du MESH, un même terme pouvant se trouver à plusieurs endroits de l’arborescence (ex., genetics)


Remplacement automatique d’un terme non MeSH par un terme MeSHSi il n’y a pas de correspondance, le terme est recherché dans tous les champs [All Fields]Voir DetailsExemple pour Vioxx"rofecoxib"[Substance Name] OR vioxx[Text Word]


Il utilise des “translation tables” dans cet ordre :

◦ MeSH – Medical Subject Headings◦ Journal Title◦ Phrase List◦ Author name

Si cela ne donne rien, reprise par sous ensemble


Baby walker accidents

Utilisez le bouton Details


Appuyez ici

utilise les termes MeSH majeurs

Attention : le nombre de réponses est réduit considérablement


Pour préciser un descripteur d’un point de vue conceptuel

Ex : aspirin/adverse effects

Ils sont hiérarchisés


Privilégiez le passage par le MeSH

Utilisez les limites pour diminuer le nombre de références

Utilisez les qualificatifs pour préciser les questions


Troncature : * ex. gene*Expressions : mettre entre guillemets ex. « breast implant »opérateurs booléens : AND, OR ou NOT (en majuscules !)ex. cold AND (vitamin c OR zinc)Mots vides : the, a ...


On peut rechercher les champs d ’indexation. La syntaxe est :terme [champ]

Ex. pour rechercher tous les articles écrits par G. Nicaise dont le titre contient le mot neurohypophysial :

nicaise g [au] AND neurohypophysial [ti]


Les résultats sont classés par ordre chronologique inverseOn peut redéfinir la recherche ou rebondir vers des articles dont le sujet est proche « Related articles »On peut afficher toutes ou quelques notices en les sélectionnant (case à cocher)Différents formats d’affichage sont disponiblesSauvegarde en HTML (SAVE) ou texte (TEXT)


“Je recherche des articles sur la simulation de blessures à la tête”

head injuries and malingering



Entrez les termes ici

Appuyez sur Go

Ajoutez des limites : date, langue, type de

publication

algorithme

Ensemble pré-calculé

Tri par ordre de pertinence


Recherche “baby walkers accidents”

Un article est très pertinent



On retrouve l’article d’origine

Une référence: cliquez sur « SINGLE CITATION MATCHER »

Plusieurs références : cliquez sur « BATCH CITATION MATCHER »


Le paramètre « accepter les cookies » du navigateur doit être activéPermet de lister les différentes recherches pendant une sessionPerdue après une heure d’inactivité (voir Cubby)Les étapes de la recherche peuvent être combinées entre elles

ex., #1 AND #2



Construction d’une recherche Appuyez sur Go


Liens vers d’autres ressources

Liens vers d’autres services

My NCBI permet de sauvegarder des recherchesde manière permanente.

NB : Ce service gratuit nécessite une inscriptionpréalable.

Une fois identifié, il est possible de :ajouter des filtres de personnaliser l'interface


Opérateurs booléens en majuscule AND, OR, NOT

Troncature *


MEDLINE �PubMed��URFIST de LYON��Lardy JP�MEDLINEMEDLINEPubMed par rapport à MedlineTypes de référencesAccès à PubMedDiapositive numéro 7Le MeSH�Medical Subject HeadingsLe plan de classement du MeSHLe MeSHLe MeSH : l’explosionComment utiliser le MeSHLe MeSH : le mappingComment PubMed interprète les questions ? Mapping de la questionDétails de la rechercheLe MeSH : la pondérationLe MeSH : les qualificatifsInterrogationSyntaxeRecherche par champsRésultatsDiapositive numéro 23Interface de rechercheLa fonction : Related ArticlesRelated ArticlesRésultats de Related ArticlesRecherche d’une référenceHistoriqueHistoriqueLa barre verticaleMy NCBIMy NCBITrucs pour PubMed

medline and more: pubmedurfist.univ-lyon1.fr/files/2014/06/pubmed-renommer.pdf · 2015. 4. 21. ·...

Documents