la era de la ecología y la demografía a gran escala€¦ · introducimos ahora las bases de datos...
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COMPADRE v. 1.0
COMPADRE v. 2.0
COMPADRE v. 3.0
Publicación de Leslie
Fig. 1a
COMPADRE fue fundada por M. Franco y J. Silvertown. En su versión 1.0 contenía las matrices de control de cerca de 100 especies de plantas. Esfuerzos paralelos extendieron la base de datos en los años siguientes (Y. Buckley, J. Che-Castaldo, E. Crone, D. Hodgson, T. Knight, S. Ramula, R. Salguero-Gómez). R. Salguero-Gómez aumentó significativamente el tamaño de la base a más de 500 especies, añadiendo algunos covariantes (por ej. Tratamientos en v. 2.0). COMPADRE 3.0 es actualmente dirigida por R. Salguero-Gómez y O.R. Jones y además de contener covariantes importantes (p. ej. geolocalización, taxonomía, forma de crecimiento) ha unificado los anteriores esfuerzos paralelos en un repositorio único.
COMADRE v. 1.0 fue creada por R. Salguero-Gómez y O.R. Jones. En su versión 2.0 ha integrado conjuntos paralelos de datos demográficos (p. ej. D. Hodgson, L.A. Velez-Espino, M. van de Kerk). Desde 2012, las bases de datos son apoyadas por el Laboratorio de Demografía Evolutiva y por el grupo de investigación independiente Modelos de Evolución del Envejecimiento, en el Instituto Max Planck de Investigaciones Demográficas (Rostock, Alemania).
Contacto: [email protected] Supervisores de bases de datos: Rob Salguero-Gómez y Owen Jones. Comité Central: Yvonne Buckley, Judy Che-Castaldo, Hal Caswell, Dalia Conde, Dave Hodgson, Rob Salguero-Gómez, Owen Jones, Alexander Scheuerlein, y James Vaupel. Digitisation team: Hendrik de Buhr, Alexander Hartmann, Anne Henning, Claudia Farack, Fränce Gottschalk, Gesa Roemer, Tara Ruoff, Julia Wille, y Stefan Zeh, con Ruth Archer (postdoc). Equipo de Digitalización: Res Altwegg, Fernando Colchero, Ming Dong, Miguel Franco, Hans de Kroon, Jean Dominique Lebreton, Jessica Metcalf, Maile Neel, Ingrid Parker, Bernt-Erik Sæther, Juan Silva, Jonathan Silvertown, Takenori Takada, Teresa Valverde, Luis Antonio Velez-Espino, y Glenda Wardle.
Del terreno al consumidor!COMPADRE y COMADRE archivan modelos matriciales de poblaciones publicados por investigadores en todo el mundo. Nuestro equipo de digitalizadores (presentado abajo) ha sido entrenado para extraer y verificar esta información y para contactar los investigadores cuando se requiera información adicional. Periódicamente se incorporan nuevos datos a través de la página web de COMPADRE-COMADRE, con excepción de aquellos datos con embargo temporal. Dado el incremento exponencial de las publicaciones (Fig. 1a, b), la recopilación de estos datos es un cometido tan urgente como excitante. Los investigadores que están por comenzar estudios demográficos deben considerar la fuerte parcialización geográfica (Fig. 2a, b*) y taxonómica (Fig. 3a, b) de las colecciones de datos. Tenemos la esperanza que tanto investigadores y estudiantes, asi como agencias de enseñanza y ambientales, entre otras, usarán estos recursos para abordar oportunamente cuestiones demográficas. *Noten que mucha de la información geográfica en COMADRE no ha sido digitalizada, por tanto esta figura está siendo procesada.
Number of matrices in COMPADRE
n = 6730
1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country
0 2500
Fig. 2a
Fig. 3a
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Year of publication
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1945 1950 1955 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 2015
COMADRE v. 1.0
COMADRE v. 2.0
Publicación de Leslie
Fig. 1b
Number of matrices in COMADRE
n = 2942
1 5 10 50 100 500 1000 1500 Number of population matrix models per country
0 2500
Fig. 2b
Fig. 3b
En la última década hemos visto la publicación en linea de datos genéticos (GenBank), anatómicos y fisiológicos (TRY, BIEN), y climáticos (FetchClimate), entre otros, ampliando los límites para hacernos preguntas biológicas a escalas muy amplias, globales. La demografía, el estudio de la dinámica de poblaciones y sus determinantes, es clave para responder preguntas tales como ¿por qué algunas especies se extinguen localmente mientras que otras se transforman en pestes invasoras? ¿Cómo podemos garantizar la seguridad alimentaria de paises en desarrollo? ¿Cómo responden las especies a los cambios globales? ¿Por qué algunas especies senecen mientras otras no? Sin embargo, la disponibilidad limitada de datos demográficos de muchas especies ha restringido nuestra habilidad para buscar respuestas a estas preguntas. Estas bases de datos contribuyen a resolver estas limitaciones.
Other
Anthozoa
Merostomata
Gastropoda
Bivalvia
Cephalaspidomorphi
Polychaeta
Chondrichthyes
Actinopterygii
Branchiopoda
Malacostraca
Maxillopoda
Insecta
Arachnida
Amphibia
Reptilia
Aves
Mammalia
0 10 20 30 40 50 60 70
% taxonomic class in COMADRE
Phaeophyceae
Florideophyceae
Rhodophyceae
Bryopsida
Polypodiopsida
Pteridopsida
Cycadopsida
Pinopsida
Liliopsida
Magnoliopsida
0 10 20 30 40 50 60 70
% taxonomic class in COMPADRE
La era de la ecología y la demografía a gran escala
Introducimos ahora las bases de datos COMPADRE y COMADRE ahora matrices de datos de plantas y de animales respectivamente
Estas bases de datos con acceso abierto serán publicadas en linea en el verano del 2014 (COMPADRE) y a comienzos del 2015 (COMADRE), auspiciados por el Instituto Max Planck de Investigaciones Demográficas (Rostock, Alemania). Actualmente COMPADRE y COMADRE contienen matrices de proyección de más de 900 especies vegetales y más de 1300 especies animales, con un total de más de 12000 matrices con variados tratamientos, condiciones anuales y poblaciones. Además, contienen información de covariantes (taxonómicos, biogeográficos, y de geolocalización) que ayudarán a los investigadores en la interpretación de los resultados. Los métodos demográficos actuales hacen posible la estimación de muchas variables en el análisis de estas matrices, que pueden ser directamente interpretadas biológicamente (por ej. Sensibilidades, esperanza de vida, tasas de crecimiento poblacional, etc.) .
www.comadre-db.orgwww.compadre-db.org
Año de publicación Año de publicación
Número de matrices por paísNúmero de matrices por país
Núm
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tota
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estu
dios
de
plan
tas
Núm
ero
tota
l de
estu
dios
de
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% del Taxón en COMPADRE % del Taxón en COMADRE
Inves&gado
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Inves&gado
res,,
Maestros,,
Estudiantes,,
Agen
cias,,etc,
Versión,en,línea,de(COMPADRE,Versión,en,línea,de(COMADRE,
Corrección,de,errores,
Versión,de,trabajo,de(COMPADRE,Versión,de,trabajo,de,COMADRE,
,
Digitalización,de,datos,
Búsquedas,periódicas,
Publicación, Comunicación,personal,
Construcción,del,modelo,matricial,poblacional,
Trabajo,de,campo,