Nama : Novira Chandisa

NIM : 10513054

Problems:

I.  Evaluate the solubility of the following peptides at the given pH. For each pair, which peptide is more soluble and why? Hint: Evaluate the ionization states of the amino acid functional groups.

 pH 7: Gly20 and (Glu-Asp)10

Jawab : Kelarutan suatu protein tergantung pada pH pelarut dan titik isoelektrik dari asam amino tersebut. Asam amino glisin akan bersifat amfoter pada pH 7 sehingga larut dengan baik. Sedangkan (Glu-Asp)10 memiliki struktur yang dapat mengalami resonansi sehingga interaksi dengan air lebih banyak yang mengakibatkan (Glu-Asp)10 larut lebih baik dalam air

 

II.  Match the terms below with the accompanying statements. (More than one term may apply to a statement.)

A. dansyl chloride                           D. 2-mercaptoethanol

B. phenylisothiocyanate                   E. cyanogen bromide

C. iodoacetate

1)             ___C__  An alkylating agent that reacts with Cys residues.

2)             __D___  A reducing agent that carries out reductive cleavage of disulfide bonds.

3)             _A____  A reagent used to identify N-terminal residues.

4)             __E___  A reagent that cleaves polypeptides into smaller fragments.

5)             _B____  A reagent used in sequencing polypeptides from the N-terminus.

III.  You have a polypeptide that has been degraded with cyanogen bromide and trypsin. The sequences of the fragments are listed below (using one-letter codes). Is there enough information to derive the complete amino acid sequence of the polypeptide? What further treatments might support the deduced sequence?

Cyanogen bromide treatment:

(1) K

(2) RFM

(3) MLYCRGM

(4) NIKGLM

Trypsin treatment:

(5) FMK

(6) GMNIK

(7) GLMR

(8) MLYCR

Jawab :

CNBr : MLYCRGMNIKGLMRFMK

Tripsin : MLYCRGMNIKGLMRFMK

Ya, informasi cukup untuk menunjukkan urutan. Namun untuk memastikan lebih lanjut harus dilakukan degradasi Edman.