genes and genomes: why do we look like our parents

67
Гени та геноми: чому ми схожі на батьків Древицька Тетяна к.б.н., ст.н.сп. відділу загальної та молекулярної патофізіології Інституту фізіології ім.О.О.Богомольця

Upload: -

Post on 22-Jan-2018

130 views

Category:

Science


6 download

TRANSCRIPT

Page 1: Genes and genomes: why do we look like our parents

Гени та геноми:

чому ми схожі на батьків

Древицька Тетяна к.б.н., ст.н.сп. відділу загальної та молекулярної патофізіології Інституту фізіології ім.О.О.Богомольця

Page 2: Genes and genomes: why do we look like our parents

Всі живі організми складаються з клітин, клітини бувають різними

Page 3: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 4: Genes and genomes: why do we look like our parents

І не зважаючи на те, що вони такі різні мають однакові органели

Page 5: Genes and genomes: why do we look like our parents

Функції клітин

загальні

специфічні

Всі функції організму в цілому та клітин реалізуються завдяки білкам

В свою чергу білки бувають різними за функціями, локалізацією та будовою

Page 6: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 7: Genes and genomes: why do we look like our parents

Що таке білки?

Page 8: Genes and genomes: why do we look like our parents

Приклади організації білків

Page 9: Genes and genomes: why do we look like our parents

Ядро – це органела клітини, де міститься інформація про білки і не

тільки

генетична!

Page 10: Genes and genomes: why do we look like our parents

Як виглядає ядро під мікроскопом?

Page 11: Genes and genomes: why do we look like our parents

Де розташовані гени і шо це таке?

клетка

хромосомы в ядре

ДНК

хромосома

1 молекула ДНК ген

ген

Page 12: Genes and genomes: why do we look like our parents

Що таке нуклеїнові кислоти?

Page 13: Genes and genomes: why do we look like our parents

DNA bases: A G C T DNA bases: A G C T RNA bases: A G C URNA bases: A G C U

DNA bases: A G C T DNA bases: A G C T RNA bases: A G C URNA bases: A G C U

RNА

Нуклеотиди

Page 14: Genes and genomes: why do we look like our parents

BASEBASEBASEBASE

PHOSPHATEPHOSPHATEPHOSPHATEPHOSPHATE

Page 15: Genes and genomes: why do we look like our parents

Як в ДНК закодований білок?

Page 16: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 17: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 18: Genes and genomes: why do we look like our parents

ACTGAAACTAGGGGCAAGGAGACGAAGAGAACATGAAAGTTAAACTTTAAGATGAAGAACAAAGCTGAACATACTGATGCATTGGATCTTTGGAGAGGATCTCAGAACTCATTGTACTTAATTTACAGGCTAAAACCTTAGAAGAGGAATTTATTATATCCTACACAAGACTCCAGGGAAGCACATGGCCTTGGACTGAAGGCTGGCATCGAAGCTGTCAGCCACCAGCACCTTCTGCAGCAGGTACCTGCTCTCTAAGAGGGAGGCCTGGGTGGTGCACCTCCAGAGCTGCCCAGGCTGGGCCTCAAGGAAGAAAAAGATTTTCATTTGTCAGAGGCGGAAGGGAGAGTGGAGGGAACAGCACAGCAGCGGCCCAGGGGCAGGGAAGCACAGGACCATTAGGGAGACACGAGAAAGCCATTTGTCTAGAACAGAGGATTCAAGCAGTGCACCAAGGAAAATGAGGGCCAGGCCAATGTGCTGGAGTGGCTTTGTTCTTGGCTGAGGGTTTTGGGTAGTGCCAAAGCGTAAGGTAAGCCCTGCTTTCCAGAAGAATCTAGCAGAGTGTGGAGCCCAGATGGGACTGGAAGGCCTGGGAGGGGTCAGGTGGCCACAGGGACGGGCCACAGCCAGTGGTGCAGGCAAGAAGACAATGGCATCCATGGTGGCTCACACCTGGAATCCCAGCCCATTGGGAGGTCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCTGCTCTAATAAAATTATAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGTACCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGGGTCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATAGCACCATTGCATTCCAGCCTGGACAACAAAAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCCTGTCGTCCTCGGGAGGCTGAGGCATGAGAATCACTCCGGGAGGCAGAGGTTGCAATGAACCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTAAAAAAAAAAAAAAGACAGAAGGATGTCAGCATCTGATGCTGCCTGTCACCTTGACCCTGAGGATGCCAGTCACAGCTCCATTAACTGGGACCTAGGAAAATGAGTCATCCTTGGTCATGCACATTTCAAATGGTGGCTTAATATGGAAGCCAGACTTGGGATCTGTTGTCTCCTCCAGCATGGTAGAAGATGCCTGAAAAGTAGGGGCTGGATCCCATCCCCTGCCTCACTGGGAAGGCGAGGTGGTGGGGTGTGGTGGGGCCTCAGGCTTGGGGTCATGGGACAAAGCCCAGGCTGAATGCCGCCCTTCCATCTCCCTCCTCCTGAGACAGGGGCAGCAGGGCACACTAGTGTCCAGGAGCAGCTTATGAGGCCCCTTCACCCTCCATCCTCCAAAACTGGCAGACCCCACCTTCTTGGTGTGACCCCAGAGCTCTGAGCACAGCCCGTTCCTTCCGCCTGCCGGCCCCCCACCCAGGCCCACCCCAACCTTATCCTCCACTGCTTTTCAGAGGAGTCTGGCCAACACAAATCCTCTTGTTTGTTTGTCTGTCTGTCTGCTGCTCCTAGTCTCTGCCTCTCCCAGTCTCTCAGCTTCCGTTTCTTTCTTAAACTTTCTCTCAGTCTCTGAGGTCTCGAAATCACGAGGCTTCGACCCCTGTGGACCAGATGCCCAGCTAGTGGCCTTTCTCCAGCCCCTCAGATGGCACAGAACTACAAACCCCAGCATGCACTCTGGCCTGAAGTGCCTGGAGAGTGCTGGTGTACCCCACCTGCATTCTGGGAACTGTAGTTTCCCTAGTCCCCCATGCTCCCACCAGGGCATCAAGCTCTTCCCTGGCCGGCTGACCCTGCCTCAGCCCTAGTCTCTCTGCTGACCTGCGGCCCCGGGAAGCGTGCGTCACTGAATGACAGGGTGGGGGTGGAGGCACTGGAAGGCAGCTTCCTGCTCTTTTGTGTCCCCCACTTGAGTCATGGGGGTGTGGGGGTTCCAGGAAATTGGGGCTGGGAGGGGAAGGGATACCCTAATGTCAGACTCAAGGACAAAAAGTCACTACATCCTTGCTGGGCCTCTATCCCCAAGAACCCAAAAGGACTCAAGGGTGGGGATCCAGGAGTTCTTGTATGTATGGGGGGAGGTGAAGGAGAGAACCTGCATGACCCTAGAGGTCCCTGTGGTCACTGAGAGTGTGGGCTGCCATCCCCTGCTACAGAAACGGTGCTCACCTTCTGCCCAACCCTCCAGGGAAAGGCACACAGGGGTGAGGCCGAAGGCCCTTCCGTCTGGTGCCACATCACAGAAGGACCTTTATGACCCCCTGGTGGCTCTACCCTGCCACTCCCCAATGCCCCAGCCCCCATGCTGCAGCCCCAGGGCTCTGCTGGACACCTGGGCTCCCACTTATCAGCCTCAGTCCTCACAGCGGAACCCAGGCGTCCGGCCCCCCACCCTTCAGGCCAGCGGGCGTGGAGCTGAGGCTTTAGAGCCTCCCAGCCGGGCTTGTTCCTGTCCCATTGTGTATGGGATAGGGGCGGGGCGAGGGCCAGCACTGGAGAGCCCCCTCCCACTGCCCCCTCCTCTCGGTCCCCTCCCTCTTCCTAAGGAAAAGGCCAGGGCTCTGCTGGAGCAGGCAGCAGAGTGGACGCACAGTAACATGGGCAACTTGAAGAGCGTGGCCCAGGAGCCTGGGCCACCCTGCGGCCTGGGGCTGGGGCTGGGCCTTGGGCTGTGCGGCAAGCAGGGCCCAGCCACCCCGGCCCCTGAGCCCAGCCGGGCCCCAGCATCCCTACTCCCACCAGCGCCAGAACACAGGTAAGGGCCAGGCAGCTAGGAGCAGGTGGGCAACAAGGGTGGTGTCAAGGCCTGAAGCCTGGGGCTGGGAAGGTCTGGAACTTGTAGCTGAGTCGGGAGGGCCAGGTC

Page 19: Genes and genomes: why do we look like our parents

Від гена до білка, або що таке експресія генів?

Page 20: Genes and genomes: why do we look like our parents

Етапи синтезу білка

Page 21: Genes and genomes: why do we look like our parents

Етапи синтезу білка

Page 22: Genes and genomes: why do we look like our parents

Етапи синтезу білка

Page 23: Genes and genomes: why do we look like our parents

Етапи синтезу білка

Page 24: Genes and genomes: why do we look like our parents

Етапи синтезу білка

Page 25: Genes and genomes: why do we look like our parents

Що необхідно клітині для синтезу білку?

• послідовність ДНК (промотор та регуляторні послідовності)

• транскрипційний фактор (один або комплекс)

• фермент (РНК-полімераза)

• помічникі (або кофактори)

• нуклеотиди

Page 26: Genes and genomes: why do we look like our parents

Типова структура гену

Page 27: Genes and genomes: why do we look like our parents

Транскрипція (відбувається в ядрі)

Етапи: ініціація, елонгація, термінація

Page 28: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 29: Genes and genomes: why do we look like our parents

Транскрипцію можна побачити!)

Page 30: Genes and genomes: why do we look like our parents

Процесінг (відбувається в ядрі)

Події:-кепування-сплайсінг-кепування

Page 31: Genes and genomes: why do we look like our parents

Дієві особи трансляції

• мРНК

• амінокислоти

• транспортні РНК

• аміноацил-тРНК-синтетази

• рибосоми

• фактори ініціації

• фактори елонгації

• фактори терминації

• енергія, багато енергії!

Page 32: Genes and genomes: why do we look like our parents

Трансляція (відбувається у цитоплазмі)

Етапи:ініціація, елонгація, термінація

Page 33: Genes and genomes: why do we look like our parents

Як клітина дізнається, що необхідно синтезувати нові

білки?

Page 34: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 35: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 36: Genes and genomes: why do we look like our parents

Рівні контролю експресії генів

36

- хромосомна активація або інактивація - контроль початку (ініціації) транскрипції - дозрівання (процесінг) РНК - контроль транспорту РНК - контроль руйнування (деградації) мРНК - контроль початку (ініціації) трансляції - посттрансляційні модифікації

Page 37: Genes and genomes: why do we look like our parents

ВАРІАЦІЇ ГЕНІВ ВИЗНАЧАЮТЬ ГЕНЕТИЧНУ ІНДИВІДУАЛЬНІСТЬ

КОЖНОЇ ЛЮДИНИ

Геном людини – 3.2 млрд. пар нуклеотидів~ 60 млн. варіацій (2 % геному)

Кожний ген може бути представлений у більш ніж 2000 варіантах !

Page 38: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 39: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 40: Genes and genomes: why do we look like our parents

Схема розповсюдження Homo sapiens по світу та частота поліморфізму

гена DDR2 (рецептор дофаміну)

Page 41: Genes and genomes: why do we look like our parents

ІШЕМІЧНА ІШЕМІЧНА ХВОРОБА СЕРЦЯ ХВОРОБА СЕРЦЯ ЯК ПОЛІГЕННЕ ЯК ПОЛІГЕННЕ ЗАХВОРЮВАННЯЗАХВОРЮВАННЯ

PPAR-α, γ , δ

BNP

Печінкова ліпаза

Ліпопротеїд-ліпаза Ангіотензиноген

AПФ

Адипонектин

5-ліпоксигеназа

Фактор XIIIФактор V

CD14

Рецептор ox-LDL

Параоксоназа

Апо-ліпопротеїни

eNOS

Епоксигеназа

Рецептор ангіотензину ІІ

Фактор VII

Toll-рецептор

Page 42: Genes and genomes: why do we look like our parents

ЦУКРОВИЙ ДІАБЕТ ІІ ЦУКРОВИЙ ДІАБЕТ ІІ ТИПУ ЯК ПОЛІГЕННЕ ТИПУ ЯК ПОЛІГЕННЕ ЗАХВОРЮВАННЯЗАХВОРЮВАННЯ

PPAR-α, γ , δ

CEPT

Transcription factor 7–like-2

Ліпопротеїд-ліпаза Ангіотензиноген

AПФ

Адипонектин

Лептиновий рецептор

Фактор XIIIФактор V

CD14

Рецептор ox-LDL

Параоксоназа

Апо-ліпопротеїни

eNOS

Рецептор ангіотензину ІІ

Фактор VII

Toll-рецептор

Page 43: Genes and genomes: why do we look like our parents

Ймовірні фенотипові ознаки людини- майбутнього як результат експансії в геном патологічних алельних варіантів

• Схильність до серцево-судиних захворювань• Високий ризик розвитку пухлин• Ожиріння• Млявий перебіг інфекційних захворювань

(«хронізація» інфекцій)• Підвищена чутливість до болю• Порушення репродуктивної функції (імпотенція,

гестози, самовільні аборти)• Психічна депресія, суіцидальність• Креативність, когнітивність ?

Page 44: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 45: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 46: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 47: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 48: Genes and genomes: why do we look like our parents

Наскільки гени визначають нашу долю і

чи правда, що деяких помилок не виправити?

Page 49: Genes and genomes: why do we look like our parents

Для того, щоб встановити вплив генів є

близнюковий метод

коркондантністьдискордантність

Page 50: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 51: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 52: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 53: Genes and genomes: why do we look like our parents

http://www.scq.ubc.ca/the-genetic-basis-of-intelligence/

Page 54: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 55: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 56: Genes and genomes: why do we look like our parents

ЕПІГЕНЕТИКА – розділ генетики, що вивчає зміни в генетичному апараті, що не

пов`язані з порушенням послідовності науклеотидів у ДНК

Page 57: Genes and genomes: why do we look like our parents

ЕПІГЕНЕТИКА – ЦЕ ЖИТТЯ ЕПІГЕНЕТИКА – ЦЕ ЖИТТЯ ГЕНОМУГЕНОМУ

Page 58: Genes and genomes: why do we look like our parents

Основні механізми епігенетичних змін:метилювання генів та модифікація гістонів

(ацетилювання, метилювання,

фосфорилювання, тощо)

Page 59: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 60: Genes and genomes: why do we look like our parents

+ + ubiquitylation ubiquitylation andand sumoylation sumoylation

Page 61: Genes and genomes: why do we look like our parents

АЦЕТИЛИРОВАНИЕ – ДЕАЦЕТИЛИРОВАНИЕ ГИСТОНОВ

(acetyltransferases vs histone-deacetylases)

Page 62: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 63: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 64: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 65: Genes and genomes: why do we look like our parents

Female offspring demonstrate impaired glucose tolerance and insulin secretion to a glucose challenge.

Page 66: Genes and genomes: why do we look like our parents
Page 67: Genes and genomes: why do we look like our parents