Instituto Nacional de Biodiversidad (INBIO)20 agosto 2009, Heredia

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

Pere Roca Ristol

Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC), España

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

Areas de trabajo en WP 5:

-taxonomic editing -publishing of edited data-data storage and exchange-collections & specimens -descriptions; -fieldwork-literature-geography

Se detectaron dos necesidades básicas:

-herramienta web de fácil uso para la publicación de mapasEDIT mapViewer

-visualizar información georeferenciada proveniente de diferentes fuentesmapREST services

Pasos:1) Construcción de una infraestructura centralizada de datos geográficos

-edición capas GIS

-introducción en bases de datos (postGIS)-instalación de programario servidor (GeoServer, ImageMagick, PHP…)

2)Desarrollo de las aplicaciones web (mapRest services y EDIT mapViewer)

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

Elementos centrales para el desarrollo

Herramientas del servidor: generación y manipulación de imágenes para

descarga, conexión base de datos…

Estándares para servicions geoespaciales

EDIT mapViewer mapREST services

Servidores de mapas

Bases de datos geográfica

Todas las herramientas usadas y creadas son gratuitas y de código abierto

Base datos geográfica en Madrid (CSIC)

Mi base de datos remota

El usuario construye las URLs con su información y los parámetros de simbolización deseados

ejemplo: especie 1 presente en áreas con código 1, 2 y 3. especie 2 en áreas 4 y 5.

Aplicar estilo “a” a especie 1, y estilo “b” a especie 2

Usuario define el estilo “a” como.. color azul, borde negro, grosor 5…

Imagen (mapa)

Archivo de simbolización(usar en aplicación web local)

Especialmente útil en bases de datos distribuidas.Nos da total independencia en la simbolizaciónEjemplos en uso:1) DistribucionesEDIT PalmWeb portalEDIT Diptera portalEDIT Cichorieae portal

2) RegistrosMercantour/Alpi Marittime ATBIGemer ATBI

Uso para distribuciones (polígonos) y registros (puntos)

mapREST services

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

archivo CSV

EDIT mapViewer http://edit.csic.es/geo/mapviewer/edit_cr.html

Datos georeferenciados en latitud / longitud y datum WGS84 y con notación decimal

Operaciones básicas:-Composición del mapa (añadir/quitar capas) y navegación (zoom in/out, pan…)-Simbolización datos propios-Acceso información propia (query) -Leyenda, escala-Impresión en diferentes formatos y resoluciones-acceso información de GBIF

Operaciones más complejas:-creación y simbolización de nuestros propios polígonos-Análisis geo-espacial:

1) Número de registros por unidad espacial (polígono)

2) Número de géneros por unidad espacial3) Relación número de géneros/núm. Registros4) Análisis completitud del inventario

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDITAnálisis de la fiabilidad de los inventarios (I): Número géneros / número de registros

Número de registros Número de géneros

Área muy muestrada, con poca diversidad (géneros).Las posibilidades de encontrar nuevos géneros es baja

Área muypoco muestrada, con relativamante alta diversidad.Las posibilidades de encontrar nuevos géneros es baja

Número de géneros/Número de registros

Alta pendiente al final de la curva.Si siguiéramos muestreando encontraríamos nuevas especies.Zona mal muestreada (inventario incompleto)

Baja pendiente al final de la curva.Aunque aumentemos las observaciones no encontrariamos nuevas especiesLa unidad territorial está biológicamente exhaustaZona bien muestreada

Visualización en forma de mapa

Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDITAnálisis de la fiabilidad de los inventarios (II): curvas de acumulación/colecta

Algunos videos… y alguna pregunta? gracias!

mapREST services: http://www.screencast.com/t/iFRTfDDB1

Análisis espacial: http://www.screencast.com/t/RUfWGvui

Simbolización datos puntuales: http://www.screencast.com/t/kb5YNSvZ 

Uso herramienta GBIF: http://www.screencast.com/t/iXCFJ5GB

Interrogación datos: http://www.screencast.com/t/TLclIQRGQk8 

Impresión mapas: http://www.screencast.com/t/eBSYhc5EHBi

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