Antibiotikaresistensövervakning Stramautbildning, Långholmen, 2015-03-13
Olle Aspevall
2015-03-13
Syften
• Underlag empirisk behandling.
• Underlag för revidering av farmakopé.
• Kartlägga burden of disease.
• Tidig varning för prevention.
• Upptäcka smittspridning.
• Utvärdera effekt av interventioner.
Surveillance standards for antimicrobial resistance, WHO 2002
Typer
• Heltäckande – Sentinel
• Kontinuerlig – Episodisk
• Passiv – Aktiv
• Rutin – Utvidgad
Surveillance standards for antimicrobial resistance, WHO 2002
Felkällor
• Selektion av provtagning.
• Selektion för resbest baserat på kliniska uppgifter.
• Selektion av resbest baserat på tid resbest.
• Multipla fynd på samma patient.
• variation beroende på metoder och lab.
System för övervakning
• Punktprevalensstudier ; ResNet, Folkhälsomyndigheten
• EARS-Net, ECDC; europeiskt nätverk för övervakning av invasiva isolat (8 arter)
• Anmälningspliktiga agens; SmiNet, Folkhälsomyndigheten: MRSA, VRE, PNSP, Enterobacteriaceae med ESBL inkl ESBL-CARBA
• Svebar, kontinuerlig, real-tid, 13 lab, >60%, Folkhälsomyndigheten.
• Phenotypic test methods
ResNet: övervakning och kvalitetssäkring av resistensbestämning
ResNet för övervakning och kvalitetssäkring
AMR övervakning i Europa; EARSS/EARS-Net vid ECDC
EARSS 1998-2009 Start och kontinuerlig uppbyggnad/utveckling för att ge aktuell och
korrekt information (data for action), koordinerades från RIVM, Bilthoven, Holland
EARS-Net 2010 och framåt Europeiskt (EU) övervakningssystem av AMR hos invasiva isolat;
nätverk av nationella nätverk som leds av ECDC, Stockholm, Sweden
Escherichia coli – UVI – aggregerade data från ResNet 2001-2014
0
5
10
15
20
25
30
35
2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016
Ampicillin
Mecillinam
Cefadroxil
Nitrofurantoin
Nalidixic acid
Ciprofloxacin
Trimethoprim
EARS-Net 2009, 2013; E.coli-CephR
EARS-Net 2009, 2013; K.pneum-CarbaR
Staphylococcus aureus – sårodling – aggregerade data från ResNet 2001-2014
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016
Oxacillin/Cefoxitin
Erytromycin
Klindamycin
Fusidinsyra
Genta/Tobra
Norfloxacin
EARS-Net 2009, 2013; S.aureus-MRSA
Aktiviteter och presentation av statistik
• Epidemiologisk övervakning i SmiNet
• Isolat till SMI för epidemiologisk typning
• Aktuell statistik finns på SMIs hemsida, uppdateras månadsvis för anmälningspliktiga agens
• Veckoövervakning och årsrapporter för C. difficile.
• Fördjupad analys i SWEDRES (engelska)
SmiNet
• Web-baserat elektroniskt rapporteringssystem
• Kliniska anmälningar och laboratorieanmälningar kombineras till fall i SmiNet – Undantag: ESBL med endast anmälningsplikt från laboratoriet
• ”Falldefinitioner – vid anmälan enligt smittskyddslagen”
– Socialstyrelsen, Ny version maj 2012
• SmiNet samfinansieras mellan SMI (50%) och landstingen (50%)
Informationsflöden - SmiNet
SmiNet
Toby
Behandlande
läkare
Laboratorium
Smittskyddsenhet
Vilken information finns i anmälan?
• Klinisk anmälan
– Basuppgifter: anmälningsdatum, diagnos, personuppgifter – När? Var? Hur?: smittdatum, smittland, smittväg, provtagningsorsak – Övriga uppgifter av betydelse för smittskyddet – Åtgärder/Förhållningsregler – Uppgifter om ansvarig läkare
• Laboratorieanmälan – Basuppgifter – Provinformation: undersökningsmaterial
– Resultat: metod, art, diagnosspecifika fynd, resistens,epidemiologisk typning
– Ansvarig läkare på laboratoriet – Uppgifter om ansvarig läkare
Antibiotikaresistenta diagnoser i SmiNet
ESBLCARBA : Anmälningsplikt och smittspårningsplikt införd 15 maj
Övriga diagnoser med koppling antibiotikaresistens på SMI (andra enheter): Gonorré, GAS, H.influenza och TBC
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
7000
8000
9000
10000
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014
Sverige
MRSA
ESBL
VRE
PNSP
Number of ESBLCARBA cases annually notified in Sweden 2007-2014.
Diagnostik på agens inom smittskyddslagen
• Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas för varje nytt fall – MRSA, VRE, ESBLCARBA
• Diagnostik: Resistenskarakterisering
• Enterobacteriaceae: PCR för ESBLA, ESBLM, ESBLCARBA
• MRSA: PCR för nuc, mecA, mecALGA251 och PVL-gener
• VRE: PCR för E.faecalis/E.faecium och vanA/vanB • Resistensbestämning (Alla)
Epidemiologisk typning • PFGE (Enterobacteriaceae, MRSA, VRE) • MLST (VRE, på utvalda isolat) • spa-typning (MRSA)
Punktprevalensmätningar
Intiativ AB-resistenta diagnoser, med koppling till arbetet med SmiNet
• Aktiv komplettering av den epidemiologisk informationen i SmiNet (MRSA och VRE) – Samarbete med utsedd kontaktperson/er
(SME/Vårdhygien) – Nätverk att ”fånga upp” information
• Laboratorienätverk
Återkoppling SmiNet
Svebar
• Alla odlingsresultat, avidentifierade
• varje natt, automatiskt
• varningar med e-post
• rapporteringsverktyg på hemsida
Svebar – data export and import
• Laboratoriet exporterar de sista 14 dagarnas odlingsresultat
• Filerna importeras av Svebar under natten
• Svebar hanterar inkommna resultat (synonymisering och Ignorering av resultat) samt meddelar vilka den inte känner igen (Åtgärdslista)
• Varje fil går igenom den CENTRALA och den LOKALA ”early warning exceptional phenotype trapping” system.
• CENTRAL och LOKAL rapporter skapas
• Data från den 14:e dagen deponeras i ”övervakningsdatabasen”
• Rapporterande laboratorium
• År
• Ålder och kön på patient (årtal och månad)
• Lab-nummer (remissens ID-nummer)
• Provtyp (Undersökningsmaterial)
• Analys (ex. urinodling, blododling)
• Mikroorganism (alternativt NEGATIV)
• Resistens (SIR, Zon, Diskstyrka, MIC, Tolkning MIC)
Skickas inte (än)
• Provtagande enhet (HSA-Id)
Data som skickas till Svebar
Status Svebar
• 13 laboratorier deltar:
Växjö, Karlskrona, Halmstad, Kalmar, Visby, Trollhättan NÄL, Borås, Malmö/Lund, Karolinska US, Västerås, Östersund, Karlstad, Sahlgrenska
• >60% täckning.
• Ytterligare laboratorier är på gång med anslutning
• ”Officiell lansering” (inbjudan för påkoppling) 28 mars 2012.
• Svebar ingick som en del i ett regeringsuppdrag till SMI 2011 gällande övervakning av antibiotikaresistens.
• Intentionsförklaring gällande Svebar – SMI erbjuder laboratorierna samfinansiering av utvecklingskostnad för programvara gällande uppkoppling mot Svebar
Tack!