August 25th, 2016THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION

Advanced data publishing using the IPT

Nicolas Noé

August 25th, 2016THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION

Publication avancée de données en utilisant l’IPT

Nicolas Noé

Content

●Cores and extensions●Anatomy of a Darwin Core Archive●Data Papers●DOIs and citations●Data filtering and translation●Connecting to a database●IPT Administration

Contenu

●Coeurs/Cores et extensions●Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive●Data Papers●DOIs et citation●Filtrage et traduction des données●Connexion à une base de données●Administration d’un IPT

Available Core and extensions: overview

Apercu des coeurs et extensions disponibles

Core and extensions: concepts

●Each dataset has one and only one Core file●Each core file corresponds to a dataset type:

Occurrence, Checklist or Sampling event.●Each dataset can have one or more extensions

file●The aim of an extension is to add new data fields

not present in the core.●Each row in an extension file references one and

only one row in the core (with an ID).

Coeurs et extensions: concepts

● Chaque jeu de données est composé d’un et un seul fichier Coeur.

● Chaque coeur correspond à un type de jeu de données: Occurrence, Checklist or Evenement d'échantillonnage.

● Chaque jeu de donnée peut avoir une ou plusieurs extensions.

● Le but d’une extension est d’ajouter des champs, en plus de ce qui est dans le coeur.

● Chaque ligne dans une extension référence une et une seule ligne dans le fichier coeur.

Core and extensions: concepts

Implications of this relationship:

Each entry in the core file is linked to zero, one or several rows in an extension file.

Each row in an extension file reference one and only one core Row.

Coeurs et extensions: concepts

Cette relation a des implications

Chaque entrée dans le fichier coeur est liée à zéro, une ou plusieurs entrées dans un fichier d’extension.

Chaque entrée dans un fichier d’extension référence une et une seule entrée dans le fichier coeur.

Core and extensions: concepts

Examples:●Core is Occurrence, with “multimedia” extension●Core is Taxon, no extensions●Core is Occurences, with multimedia and

measurement extensions.●Core is Event with Occurrence and Measurement

extensions.

Coeurs et extensions: concepts

Exemples:●Coeur Occurrence, avec extension multimédia.●Coeur Taxon, pas d’extensions●Coeur Occurences, avec extensions multimédia et

“mesures”.●Coeur Event avec extension Occurrence et

“mesures”.

Anatomy of a Darwin Core Archive

Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive

Anatomy of a Darwin Core Archive

Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive

Anatomy of a Darwin Core Archive

Anatomie d’un fichier Darwin Core Archive

Data papers

“... a searchable metadata document, describing a particular dataset or a group of datasets, published in the form of a peer-reviewed article in a scholarly journal.”

Data papers

“… un document de métadonnées référencé, décrivant un (ou plusieurs) jeu(x) de données, publié sous forme d’une revue à comité de lecture.”

DOIs and citations

●On each registered dataset●Also on data downloads●Allows proper tracking/citations!

DOIs et citations

●Pour chaque jeu de données au GBIF●Mais aussi sur les données téléchargées!●Permet un suivi et des citations correctes des

données.

Advanced IPT features: data filtering and translation

Filtrage et traduction des données

Advanced IPT features: connecting to a database

Connexion à une base de données

IPT Administration

Administration d’un IPT

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