filogenia – Árboles filogenéticos. filogenia filogenia – Árboles filogenéticos filogenia y...

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenia

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenia y genealogía

Filogenia – Árboles filogenéticos

La filogenia reproduce la trayectoria evolutiva del taxón

Filogenia – Árboles filogenéticos

Un árbol evolutivo es una hipótesis

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenia basada en la morfología

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenética

Filogenia – Árboles filogenéticos

Árbol basado en caracteres morfológicos

Filogenia – Árboles filogenéticos

Datos moleculares vs. datos morfológicos

Filogenia – Árboles filogenéticos

Análisis filogenético

Filogenia – Árboles filogenéticosUn árbol filogenético es un gráfico bidimensional que muestra

relaciones evolutivas entre organismos o, en el caso de secuencias, entre determinados genes de diversos organismos.

Árbol filogenético

Gene tree

Species tree

Filogenia – Árboles filogenéticos

¿Para qué se puede utilizar la filogenética?

Filogenia – Árboles filogenéticos

The tree of life vs. the web of life

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenia – Árboles filogenéticos

Terminología (1)

Filogenia – Árboles filogenéticos

Terminología (2)

Filogenia – Árboles filogenéticosLos nodos terminales

(hojas) representan a los distintos taxa. Todos ellos

son contemporáneosCada una de las

unidades filogenéticas representadas en el árbol es un taxón (plural taxa)raíz

Estructura de un árbol filogenético (1)

Nodos terminales

(hojas)

La raíz representa al “último ancestro común” del que

derivan todos los taxa representados

en el árbol

Filogenia – Árboles filogenéticos

Nodos internos

Las relaciones entre los distintos taxa se indican mediante nodos y ramas

Cada nodo es una bifurcación de la

ruta evolutiva que da lugar a dos

especies distintas.

De cada nodo surgen dos ramas (árbol binario), que evolucionarán de forma

distinta.

ramasLa longitud de cada rama representa el número de

cambios producidos antes de llegar a la

siguiente bifurcación

Estructura de un árbol filogenético (2)

Filogenia – Árboles filogenéticos

Estructura de un árbol filogenético (3)

Filogenia – Árboles filogenéticos

El grupo externo y los clados

raíz

Grupo externo

Clado (equinodermos)

Ancestro común del clado

Filogenia – Árboles filogenéticos

Clados y cladogramas

Un clado es un conjunto de especies emparentadas

(que comparten un antepasado común). Su

representación gráfica se denomina cladograma.

Varios clados se pueden agrupar en un clado de

orden superior

Filogenia – Árboles filogenéticosUn cladograma se puede

representar de muchas maneras. Lo único que importa es el orden en el que se suceden las diversas

bifurcaciones, es decir, su topología. Todos los cladogramas de esta figura son equivalentes.

Topología del árbol

Filogenia – Árboles filogenéticosLa forma del árbol y

las bifurcaciones que contempla constituyen

su “topología”.

Estos cuatro árboles son equivalentes. Se puede rotar cualquier nodo interno sin que cambie la topología

porque esta operación no cambia el

agrupamiento de las especies.

Topología del árbol (2)

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenia – Árboles filogenéticos

La flecha del tiempo

Filogenia – Árboles filogenéticos

Cladogramas y filogramas

Filogenia – Árboles filogenéticos

En un cladograma, la longitud de las ramas no contiene

ningún tipo de información. Sólo indican en qué orden se

sucedieron las ramificaciones.

En un filograma, la longitud de las ramas es proporcional a la divergencia. Suelen incluir una escala que indica los cambios

acumulados con el tiempo.

Cladogramas y filogramas

Filogenia – Árboles filogenéticos

Con moléculas: la hipótesis del reloj molecular

Filogenia – Árboles filogenéticos

El citocromo c es un reloj molecular

Filogenia – Árboles filogenéticos

Inconvenientes de la hipótesis del reloj molecular

Filogenia – Árboles filogenéticos

El registro fósil es el mejor reloj evolutivo

Filogenia – Árboles filogenéticos

Filogenia con escala temporal

Filogenia – Árboles filogenéticos

El registro fósil ayuda a construir o modificar árboles filogenéticos

Filogenia – Árboles filogenéticos

Tipos de árbol

Filogenia – Árboles filogenéticos

Árboles con raíz y sin raíz

Filogenia – Árboles filogenéticos

Anatomía de los árboles filogenéticos

5 nodos terminales (OTU)

Nodos internos

Ramasn externas

(n-2) internas

nn-1

2n-2 2n-3

nn-2

n externas

(n-3) internas

Filogenia – Árboles filogenéticos

Árboles con raíz

Un árbol evolutivo con raíz muestra las

relaciones evolutivas que hay entre

secuencias que proceden de un mismo

ancestro y el orden cronológico en que tuvieron lugar las

diversas ramificaciones. También puede mostrar qué especies presentan una velocidad evolutiva

elevada.

Filogenia – Árboles filogenéticos

Árboles sin raíz

Un árbol evolutivo sin raíz también muestra

las relaciones evolutivas que hay entre las diversas

secuencias pero no especifica la ubicación

del último ancestro común ni el orden temporal en que

tuvieron lugar las diversas

ramificaciones. La longitud de cada rama

es proporcional a la distancia evolutiva.

Filogenia – Árboles filogenéticos

Árboles escalados y sin escalar (1)

Filogenia – Árboles filogenéticos

Árboles escalados y sin escalar (2)

Filogenia – Árboles filogenéticos

Posibles combinaciones

Filogenia – Árboles filogenéticos

Bosques filogenéticos (1)

Filogenia – Árboles filogenéticos

Bosques filogenéticos (2)

Filogenia – Árboles filogenéticos

Árbol verdadero y árboles inferidos

Filogenia – Árboles filogenéticos

El formato Newick