antibiotikaresistensövervakningstrama.se/wp-content/uploads/2016/02/607_14... · diagnostik på...

Antibiotikaresistensövervakning Stramautbildning, Långholmen, 2015-03-13

Olle Aspevall

2015-03-13

Syften

• Underlag empirisk behandling.

• Underlag för revidering av farmakopé.

• Kartlägga burden of disease.

• Tidig varning för prevention.

• Upptäcka smittspridning.

• Utvärdera effekt av interventioner.

Surveillance standards for antimicrobial resistance, WHO 2002

Typer

• Heltäckande – Sentinel

• Kontinuerlig – Episodisk

• Passiv – Aktiv

• Rutin – Utvidgad

Surveillance standards for antimicrobial resistance, WHO 2002

Felkällor

• Selektion av provtagning.

• Selektion för resbest baserat på kliniska uppgifter.

• Selektion av resbest baserat på tid resbest.

• Multipla fynd på samma patient.

• variation beroende på metoder och lab.

System för övervakning

• Punktprevalensstudier ; ResNet, Folkhälsomyndigheten

• EARS-Net, ECDC; europeiskt nätverk för övervakning av invasiva isolat (8 arter)

• Anmälningspliktiga agens; SmiNet, Folkhälsomyndigheten: MRSA, VRE, PNSP, Enterobacteriaceae med ESBL inkl ESBL-CARBA

• Svebar, kontinuerlig, real-tid, 13 lab, >60%, Folkhälsomyndigheten.

• Phenotypic test methods

ResNet: övervakning och kvalitetssäkring av resistensbestämning

ResNet för övervakning och kvalitetssäkring

AMR övervakning i Europa; EARSS/EARS-Net vid ECDC

EARSS 1998-2009 Start och kontinuerlig uppbyggnad/utveckling för att ge aktuell och

korrekt information (data for action), koordinerades från RIVM, Bilthoven, Holland

EARS-Net 2010 och framåt Europeiskt (EU) övervakningssystem av AMR hos invasiva isolat;

nätverk av nationella nätverk som leds av ECDC, Stockholm, Sweden

Escherichia coli – UVI – aggregerade data från ResNet 2001-2014

0

5

10

15

20

25

30

35

2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016

Ampicillin

Mecillinam

Cefadroxil

Nitrofurantoin

Nalidixic acid

Ciprofloxacin

Trimethoprim

EARS-Net 2009, 2013; E.coli-CephR

EARS-Net 2009, 2013; K.pneum-CarbaR

Staphylococcus aureus – sårodling – aggregerade data från ResNet 2001-2014

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

2000 2002 2004 2006 2008 2010 2012 2014 2016

Oxacillin/Cefoxitin

Erytromycin

Klindamycin

Fusidinsyra

Genta/Tobra

Norfloxacin

EARS-Net 2009, 2013; S.aureus-MRSA

Aktiviteter och presentation av statistik

• Epidemiologisk övervakning i SmiNet

• Isolat till SMI för epidemiologisk typning

• Aktuell statistik finns på SMIs hemsida, uppdateras månadsvis för anmälningspliktiga agens

• Veckoövervakning och årsrapporter för C. difficile.

• Fördjupad analys i SWEDRES (engelska)

SmiNet

• Web-baserat elektroniskt rapporteringssystem

• Kliniska anmälningar och laboratorieanmälningar kombineras till fall i SmiNet – Undantag: ESBL med endast anmälningsplikt från laboratoriet

• ”Falldefinitioner – vid anmälan enligt smittskyddslagen”

– Socialstyrelsen, Ny version maj 2012

• SmiNet samfinansieras mellan SMI (50%) och landstingen (50%)

Informationsflöden - SmiNet

SmiNet

Toby

Behandlande

läkare

Laboratorium

Smittskyddsenhet

Vilken information finns i anmälan?

• Klinisk anmälan

– Basuppgifter: anmälningsdatum, diagnos, personuppgifter – När? Var? Hur?: smittdatum, smittland, smittväg, provtagningsorsak – Övriga uppgifter av betydelse för smittskyddet – Åtgärder/Förhållningsregler – Uppgifter om ansvarig läkare

• Laboratorieanmälan – Basuppgifter – Provinformation: undersökningsmaterial

– Resultat: metod, art, diagnosspecifika fynd, resistens,epidemiologisk typning

– Ansvarig läkare på laboratoriet – Uppgifter om ansvarig läkare

Antibiotikaresistenta diagnoser i SmiNet

ESBLCARBA : Anmälningsplikt och smittspårningsplikt införd 15 maj

Övriga diagnoser med koppling antibiotikaresistens på SMI (andra enheter): Gonorré, GAS, H.influenza och TBC

0

1000

2000

3000

4000

5000

6000

7000

8000

9000

10000

2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014

Sverige

MRSA

ESBL

VRE

PNSP

Number of ESBLCARBA cases annually notified in Sweden 2007-2014.

Diagnostik på agens inom smittskyddslagen

• Ett isolat för epidemiologisk typning efterfrågas för varje nytt fall – MRSA, VRE, ESBLCARBA

• Diagnostik: Resistenskarakterisering

• Enterobacteriaceae: PCR för ESBLA, ESBLM, ESBLCARBA

• MRSA: PCR för nuc, mecA, mecALGA251 och PVL-gener

• VRE: PCR för E.faecalis/E.faecium och vanA/vanB • Resistensbestämning (Alla)

Epidemiologisk typning • PFGE (Enterobacteriaceae, MRSA, VRE) • MLST (VRE, på utvalda isolat) • spa-typning (MRSA)

Punktprevalensmätningar

Intiativ AB-resistenta diagnoser, med koppling till arbetet med SmiNet

• Aktiv komplettering av den epidemiologisk informationen i SmiNet (MRSA och VRE) – Samarbete med utsedd kontaktperson/er

(SME/Vårdhygien) – Nätverk att ”fånga upp” information

• Laboratorienätverk

Återkoppling SmiNet

Svebar

• Alla odlingsresultat, avidentifierade

• varje natt, automatiskt

• varningar med e-post

• rapporteringsverktyg på hemsida

Svebar – data export and import

• Laboratoriet exporterar de sista 14 dagarnas odlingsresultat

• Filerna importeras av Svebar under natten

• Svebar hanterar inkommna resultat (synonymisering och Ignorering av resultat) samt meddelar vilka den inte känner igen (Åtgärdslista)

• Varje fil går igenom den CENTRALA och den LOKALA ”early warning exceptional phenotype trapping” system.

• CENTRAL och LOKAL rapporter skapas

• Data från den 14:e dagen deponeras i ”övervakningsdatabasen”

• Rapporterande laboratorium

• År

• Ålder och kön på patient (årtal och månad)

• Lab-nummer (remissens ID-nummer)

• Provtyp (Undersökningsmaterial)

• Analys (ex. urinodling, blododling)

• Mikroorganism (alternativt NEGATIV)

• Resistens (SIR, Zon, Diskstyrka, MIC, Tolkning MIC)

Skickas inte (än)

• Provtagande enhet (HSA-Id)

Data som skickas till Svebar

Status Svebar

• 13 laboratorier deltar:

Växjö, Karlskrona, Halmstad, Kalmar, Visby, Trollhättan NÄL, Borås, Malmö/Lund, Karolinska US, Västerås, Östersund, Karlstad, Sahlgrenska

• >60% täckning.

• Ytterligare laboratorier är på gång med anslutning

• ”Officiell lansering” (inbjudan för påkoppling) 28 mars 2012.

• Svebar ingick som en del i ett regeringsuppdrag till SMI 2011 gällande övervakning av antibiotikaresistens.

• Intentionsförklaring gällande Svebar – SMI erbjuder laboratorierna samfinansiering av utvecklingskostnad för programvara gällande uppkoppling mot Svebar

Tack!