12 exportar de pubmed medline a zotero con la herramienta de documentalista

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Health & Medicine

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Exportar una selección de registros de PUBMED / MEDLINE en formato medline e importarlos con la Herramienta de Documentalista. Exportar desde la Herramienta de Documentalista en formato RIS e importarlos desde el gestor bibliografico ZOTERO Crear diferentes estilos de bibliografia con los estilos de cita que contempla Zotero, tales como Vancouver, National Library of Medicine, Hardvard Reference Format etc...

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Importar de PUBMED Medline y Exportar a Zotero con el Software Herramienta de Documentalista12

© hdd 2009 madera

DESCRIPCION Y OBJETIVOS DE ESTE TEMA

Exportar una selección de registros de PUBMED / MEDLINE en formato medline e importarlos con la Herramienta de Documentalista.

Exportar desde la Herramienta de Documentalista en formato RIS e importarlos desde el gestor bibliografico ZOTERO

Crear diferentes estilos de bibliografia con los estilos de cita que contempla Zotero, tales como Vancouver, National Library of Medicine, Hardvard Reference Format etc...

PubMed comprises more than 19 million citations for biomedical articles from MEDLINE and life science journals. Citations may include links to full-text articles from PubMed Central or publisher web sites.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Zotero [zoh-TAIR-oh] is a free, easy-to-use Firefox extension

to help you collect, manage, and cite your research

sources. It lives right where you do your work—in the web

browser itself

Mas informacion sobre Herramienta de Documentalistahttp://funciones.wordpress.com

Desde PUBMED exportar a formato MEDLINE para importar desde la Herramienta de Documentalista

Realizamos una busqueda en PubMed, en esta caso gripe y pulsamos Searchhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Pulsamos en Sent to, señalamos File, Format MEDLINE y pulsamos en Create File

PMID- 19698745OWN - NLMSTAT- In-ProcessDA - 20091012IS - 1532-2742 (Electronic)IS - 1532-2742 (Linking)VI - 59IP - 4DP - 2009 OctTI - Potential therapeutic failure of generic vancomycin in a liver transplant patient with MRSA peritonitis and bacteremia.PG - 277-80AB - We report a case of generic vancomycin treatment failure in a liver transplant patient with MRSA peritonitis and bacteremia, followed by a rapid sterilization of blood and peritoneal fluid after switching to the branded product. It raises concern about therapeutic equivalence of generic vancomycin.AD - GRIPE: Grupo Investigador de Problemas en Enfermedades Infecciosas, University of Antioquia Medical School, Medellin, Colombia.FAU - Rodriguez, Carlos AAU - Rodriguez CAFAU - Agudelo, MariaAU - Agudelo MFAU - Catano, Juan CAU - Catano JCFAU - Zuluaga, Andres FAU - Zuluaga AFFAU - Vesga, OmarAU - Vesga OLA - engPT - Journal ArticlePT - Research Support, Non-U.S. Gov'tDEP - 20090819PL - EnglandTA - J InfectJT - The Journal of infectionJID - 7908424SB - IM

Nos guardara en nuestro disco un fichero de texto con este formato, Es importante recordar el directorio donde lo guardamos, para luego poder proceder a la importacion

Importar desde la Herramienta de Documentalista

Pulsamos en el icono E (Entrada de Documentos) y en la opcion de menu Importar formato PUBMED MEDLINE

Buscamos el directorio, donde guardamos el fichero de texto y pulsamos Abrir

Los registros son importados a nuestra base de datos y aparecen con este icono en la columna Origen de Recolecion

Al introducirlos en nuestra base de datos podemos modificar y comprobar los datos extraidos, asi como cualquier otra operación propia del programa

En la pestaña Ver nos muestra el contenido del documento

Exportar a formato RIS para importar desde Zotero

Pulsamos en Buscar y elegimos la opcion filtrar por Origen de Recoleccion

Elegimos la opcion P PubMed MedLine y pulsamos en Aceptar

Ahora nos aparecen en la rejilla los documentos. Seleccionamos todos o solo los que nos interesen marcando las casillas de verificacion

Pulsamos en el icono Difusion y elegimos la opcion del menu Exportar a Formato RIS

El procedimiento anterior nos creara un fichero de texto en el dirctorio que deseemos, con el formato RIS que aquí se muestra

Desde la Herramienta de Documentalista es posible tambien generar un informe de la bibliografia importada.

Importar desde Zotero

Iniciamos MOZILLA FIREFOX y abrimos ZOTERO

Pulsamos en el icono Acciones y elegimos la opcion del menu Importar...

Una vez elegido el fichero en formato RIS, Zotero comienza la importacion

Una vez realizada la importacion, los documentos quedan incluidos en una carpeta de “Mi Biblioteca” del Gestor Bibliografico Zotero

Seccion de Marcas, que coinciden con el campo Materia de HDD

Con Zotero, podemos producir un informe a partir de la coleccion

Crear una bibliografia a partir de la colección, eligiendo los diferentes estilos que proporciona Zotero. En este caso puede verse el resultado con el estilo de cita Chicago Manual Style

La misma bibliografia en estilo de cita Vancouver

Este documento se termino el 24 de diciembre de 2009

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