serwisy.umcs.lublin.plserwisy.umcs.lublin.pl/michal.kalita/cwiczenia/prezentacja.pdf · title:...

Analiza sekwencji DNA. Biologiczne bazy danych.

Genetics. A conceptual approach. © 2005 by W. H. Freeman and Company.

Genetics. A conceptual approach. © 2005 by W. H. Freeman and Company.

Genetics. A conceptual approach. © 2005 by W. H. Freeman and Company.

Genetics. A conceptual approach. © 2005 by W. H. Freeman and Company.

www.oxfordjournals.org/nar/database/c/

1512 baz danych

EMBL GenBank

DDBJ

1987

International Nucleotide Sequence Database Collaboration

MetaBazy - bazy kojarzące ze sobą odpowiednie rekordy wielu baz.

Entrez - zintegrowany dostęp do różnych baz danych

TrEMBL PIR

SwissProt

2002

UniProtR – International Protein Sequence Database

Elementy typowego rekordu w formacie GenBank

PubMed – baza danych literaturowych (medycyna i nauki biologiczne)

Format

FASTA

Trzyliterowy kod wskazujący na

przynależność taksonomiczną,

technikę sekwencjonowania

lub typ sekwencji

CDS Coding DNA Sequence

Ciekawostki z bazy danych GenBank

Sprawdź pod podanymi poniżej numerami dostępowymi

co było materiałem źródłowym do izolacji DNA

Z71230

NC_001610