a novel single-nucleotide mutation in a gene homolog ... · brassica rapa . l. chuchuan fan....
TRANSCRIPT
A Novel Single-Nucleotide Mutation in a CLV3 Gene Homolog Controls a Multilocular Silique Trait in Brassica rapa L
Chuchuan Fan
National Key Lab of Crop Gentic Improvement Huazhong Agricultural University Wuhan China
fanchuchuanmailhzaueducn
Bilocular silique
Background
uuml Brassica rapa is an important crop and a model plant for studying Brassica genome evolution
Brassica rapa AA 2n=2x=20 yellow sarson from India (Mohammad et al 1942) Sangribai from Tibet (He et al 2003)
B juncea AABB 2n=4x=36 such as Santong Silun Duoshi and Sileng (Liu 2000)
Multilocular silique
uuml Multilocular trait of Brassica is considered advantageous because the multilocular type potentially produces more seeds per silique than the bilocular type increasing the seed yield (Katiyar et al 1998 Lv et al 2012 Zhu et al 2012)
uuml Researchers made attempts to introgress the multilocular silique trait of B rapa to B juncea and B napus through interspecific hybridization and achieved success in developing stable and uniform multilocular lines with significantly improved seed numbers per silique and yields per plant (Katiyar et al 1998 Choudhary and Solanki 2007)
uuml Thus multilocular lines of Brassica as valuable germplasm resources can be used as materials for both practical breeding and for molecular mechanism studies of silique development
uuml Previous genetic analyses of multilocular traits had demonstrated that multilocular silique is controlled by a recessive gene in B rapa and is controlled by either one or two nuclear genes in B juncea
uuml Recently some studies reported the mapping of the multilocular genes in Brassica
u Paritosh et al (2013) mapped the multilocular gene to the A4 chromosome in B rapa
u Xu et al (2013) discovered that two recessive genes (mc1 and mc2) controlled the multilocular trait in B juncea and mc1 was mapped to the A7 chromosome
u Xiao et al (2013) reported the fine mapping of a multilocular gene Bjln1 in B juncea to a 208 kb region
uumlBrassica rapa var yellow sarson
ml4 mutant line (silique with 2-4 locules) 98 of siliques are
multilocular (3-4 locules with a mean of 39 locules)
wt wild type (silique with two locules)
gynoecium 2-4 locules per silique
ml4
wt
Materials
A B C
D E F
G
H I
Fig A and D wt flowers carrying 6 stamens B C E and F mutant flowers carrying 6-7 stamens G Gynoecia of mutant (top) and wt (bottom) H and Istigma
1 The phenotype of ml4 mutant in B rapa
The mutation increases the number of the inner whorls of the floral organs
Results
uumlVariations of floral organs
0
1
2
3
4
5
6
7
Sepal Petal Stamen Carpel
wtml4
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
Bilocular silique
Background
uuml Brassica rapa is an important crop and a model plant for studying Brassica genome evolution
Brassica rapa AA 2n=2x=20 yellow sarson from India (Mohammad et al 1942) Sangribai from Tibet (He et al 2003)
B juncea AABB 2n=4x=36 such as Santong Silun Duoshi and Sileng (Liu 2000)
Multilocular silique
uuml Multilocular trait of Brassica is considered advantageous because the multilocular type potentially produces more seeds per silique than the bilocular type increasing the seed yield (Katiyar et al 1998 Lv et al 2012 Zhu et al 2012)
uuml Researchers made attempts to introgress the multilocular silique trait of B rapa to B juncea and B napus through interspecific hybridization and achieved success in developing stable and uniform multilocular lines with significantly improved seed numbers per silique and yields per plant (Katiyar et al 1998 Choudhary and Solanki 2007)
uuml Thus multilocular lines of Brassica as valuable germplasm resources can be used as materials for both practical breeding and for molecular mechanism studies of silique development
uuml Previous genetic analyses of multilocular traits had demonstrated that multilocular silique is controlled by a recessive gene in B rapa and is controlled by either one or two nuclear genes in B juncea
uuml Recently some studies reported the mapping of the multilocular genes in Brassica
u Paritosh et al (2013) mapped the multilocular gene to the A4 chromosome in B rapa
u Xu et al (2013) discovered that two recessive genes (mc1 and mc2) controlled the multilocular trait in B juncea and mc1 was mapped to the A7 chromosome
u Xiao et al (2013) reported the fine mapping of a multilocular gene Bjln1 in B juncea to a 208 kb region
uumlBrassica rapa var yellow sarson
ml4 mutant line (silique with 2-4 locules) 98 of siliques are
multilocular (3-4 locules with a mean of 39 locules)
wt wild type (silique with two locules)
gynoecium 2-4 locules per silique
ml4
wt
Materials
A B C
D E F
G
H I
Fig A and D wt flowers carrying 6 stamens B C E and F mutant flowers carrying 6-7 stamens G Gynoecia of mutant (top) and wt (bottom) H and Istigma
1 The phenotype of ml4 mutant in B rapa
The mutation increases the number of the inner whorls of the floral organs
Results
uumlVariations of floral organs
0
1
2
3
4
5
6
7
Sepal Petal Stamen Carpel
wtml4
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
uuml Multilocular trait of Brassica is considered advantageous because the multilocular type potentially produces more seeds per silique than the bilocular type increasing the seed yield (Katiyar et al 1998 Lv et al 2012 Zhu et al 2012)
uuml Researchers made attempts to introgress the multilocular silique trait of B rapa to B juncea and B napus through interspecific hybridization and achieved success in developing stable and uniform multilocular lines with significantly improved seed numbers per silique and yields per plant (Katiyar et al 1998 Choudhary and Solanki 2007)
uuml Thus multilocular lines of Brassica as valuable germplasm resources can be used as materials for both practical breeding and for molecular mechanism studies of silique development
uuml Previous genetic analyses of multilocular traits had demonstrated that multilocular silique is controlled by a recessive gene in B rapa and is controlled by either one or two nuclear genes in B juncea
uuml Recently some studies reported the mapping of the multilocular genes in Brassica
u Paritosh et al (2013) mapped the multilocular gene to the A4 chromosome in B rapa
u Xu et al (2013) discovered that two recessive genes (mc1 and mc2) controlled the multilocular trait in B juncea and mc1 was mapped to the A7 chromosome
u Xiao et al (2013) reported the fine mapping of a multilocular gene Bjln1 in B juncea to a 208 kb region
uumlBrassica rapa var yellow sarson
ml4 mutant line (silique with 2-4 locules) 98 of siliques are
multilocular (3-4 locules with a mean of 39 locules)
wt wild type (silique with two locules)
gynoecium 2-4 locules per silique
ml4
wt
Materials
A B C
D E F
G
H I
Fig A and D wt flowers carrying 6 stamens B C E and F mutant flowers carrying 6-7 stamens G Gynoecia of mutant (top) and wt (bottom) H and Istigma
1 The phenotype of ml4 mutant in B rapa
The mutation increases the number of the inner whorls of the floral organs
Results
uumlVariations of floral organs
0
1
2
3
4
5
6
7
Sepal Petal Stamen Carpel
wtml4
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
uuml Thus multilocular lines of Brassica as valuable germplasm resources can be used as materials for both practical breeding and for molecular mechanism studies of silique development
uuml Previous genetic analyses of multilocular traits had demonstrated that multilocular silique is controlled by a recessive gene in B rapa and is controlled by either one or two nuclear genes in B juncea
uuml Recently some studies reported the mapping of the multilocular genes in Brassica
u Paritosh et al (2013) mapped the multilocular gene to the A4 chromosome in B rapa
u Xu et al (2013) discovered that two recessive genes (mc1 and mc2) controlled the multilocular trait in B juncea and mc1 was mapped to the A7 chromosome
u Xiao et al (2013) reported the fine mapping of a multilocular gene Bjln1 in B juncea to a 208 kb region
uumlBrassica rapa var yellow sarson
ml4 mutant line (silique with 2-4 locules) 98 of siliques are
multilocular (3-4 locules with a mean of 39 locules)
wt wild type (silique with two locules)
gynoecium 2-4 locules per silique
ml4
wt
Materials
A B C
D E F
G
H I
Fig A and D wt flowers carrying 6 stamens B C E and F mutant flowers carrying 6-7 stamens G Gynoecia of mutant (top) and wt (bottom) H and Istigma
1 The phenotype of ml4 mutant in B rapa
The mutation increases the number of the inner whorls of the floral organs
Results
uumlVariations of floral organs
0
1
2
3
4
5
6
7
Sepal Petal Stamen Carpel
wtml4
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
uuml Recently some studies reported the mapping of the multilocular genes in Brassica
u Paritosh et al (2013) mapped the multilocular gene to the A4 chromosome in B rapa
u Xu et al (2013) discovered that two recessive genes (mc1 and mc2) controlled the multilocular trait in B juncea and mc1 was mapped to the A7 chromosome
u Xiao et al (2013) reported the fine mapping of a multilocular gene Bjln1 in B juncea to a 208 kb region
uumlBrassica rapa var yellow sarson
ml4 mutant line (silique with 2-4 locules) 98 of siliques are
multilocular (3-4 locules with a mean of 39 locules)
wt wild type (silique with two locules)
gynoecium 2-4 locules per silique
ml4
wt
Materials
A B C
D E F
G
H I
Fig A and D wt flowers carrying 6 stamens B C E and F mutant flowers carrying 6-7 stamens G Gynoecia of mutant (top) and wt (bottom) H and Istigma
1 The phenotype of ml4 mutant in B rapa
The mutation increases the number of the inner whorls of the floral organs
Results
uumlVariations of floral organs
0
1
2
3
4
5
6
7
Sepal Petal Stamen Carpel
wtml4
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
uumlBrassica rapa var yellow sarson
ml4 mutant line (silique with 2-4 locules) 98 of siliques are
multilocular (3-4 locules with a mean of 39 locules)
wt wild type (silique with two locules)
gynoecium 2-4 locules per silique
ml4
wt
Materials
A B C
D E F
G
H I
Fig A and D wt flowers carrying 6 stamens B C E and F mutant flowers carrying 6-7 stamens G Gynoecia of mutant (top) and wt (bottom) H and Istigma
1 The phenotype of ml4 mutant in B rapa
The mutation increases the number of the inner whorls of the floral organs
Results
uumlVariations of floral organs
0
1
2
3
4
5
6
7
Sepal Petal Stamen Carpel
wtml4
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
A B C
D E F
G
H I
Fig A and D wt flowers carrying 6 stamens B C E and F mutant flowers carrying 6-7 stamens G Gynoecia of mutant (top) and wt (bottom) H and Istigma
1 The phenotype of ml4 mutant in B rapa
The mutation increases the number of the inner whorls of the floral organs
Results
uumlVariations of floral organs
0
1
2
3
4
5
6
7
Sepal Petal Stamen Carpel
wtml4
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
An extra gynoecium inside the fruit often called a fifth whorl was frequently observed (811) in the mutant (arrow)
The fifth whorl is forms when the FM fails to terminate due to prolonged WUS expression (Clark et al 1993 1997 Schoof et al 2000)
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
b
c d
e f
g h
i j
a Embryo (0d)
Seedling (15d)
The primary inflorescence meristems
SAM
area (μm2)
uumlThe multilocular plants exhibited abnormal enlargement of the shoot apical meristems (SAMs)
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
0 d 15 d
wtmutant
wt mutant
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
These observations suggest that multilocular mutation is important for the control of SAM size
A H B
uumlThe difference of SAM size in Near-Isogenic Lines
0
20000
40000
60000
80000
100000
120000
A B H
SAM
area (μm2)
ml4timeswt
ml4timesF1
ml4timesBC1F1
BC2F1
BC2F2
U
NIL development A homozygous of mutant B homozygous of wt H heterozygous
14d-old-seedling
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
It indicate that the extra locules in siliques were initiated from the extra carpels of early stages of the developing gynoecium in the mutant
uumlLocular numbers during different stages of the developing gynoecium
wt
ml4
early stage late stage middle stage
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
Table 1 Descriptive statistics of the traits for parents and F1 hybrids
Fig Frequency distribution of siliques with mutiple carpels in the random F2 population
F2 population Bilocular multilocular=31 (χ2=248 Pgt005)
2 Genetic control of multilocular trait in B rapa
A recessive nuclear gene ml4 controls the multilocular trait in B rapa
Materials Silique Length(mm)
Seed Number per Silique
100-seed weight(g)
Siliques with multiple carpels
Range MeanplusmnSD ml4 mutant 344plusmn22A 233plusmn49A 036plusmn007 796-1000 979plusmn51 wt 385plusmn16B 166plusmn24B 035plusmn004 00 00plusmn00 ml4wt F1 381plusmn15B 174plusmn17B 036plusmn004 00 00plusmn00 wtml4 F1 370plusmn19B 171plusmn19B 035plusmn005 00 00plusmn00
020406080
100120140
No
of p
lant
s
percentage of multilocular siliques
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
3 Preliminary mapping of the ML4 gene
Fig Location of the ML4 locus on the molecular linkage map in B rapa
A random F2 subpopulation (183 individuals) was subsequently screened in the preliminary linkage analysis
A4_18
ML4 A4_38 A4_43
DXP21
116
00 19 12
31
A4_20 A4_26
A4
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
4 Fine-mapping and gene cloning of the ML4 gene
uuml1704 plants with the recessive phenotype from the F2 population of 6771 individuals were selected for recombinant screening
A4_38 DXP72 A4_18 DXP67 DXP63 DXP96 A4_20 31 17 6 2 2 4 17
DXP63 DXP96 DXP58 A4_26 DXP94 2 2 2 0 0
Scaffold000094
ML4 386 K
50 kb
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
B rapa gene Arabidopsis homologs E value Arabidopsis annotations
Bra034338 AT2G27230 0 LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor
Bra034339 AT2G27240 0 Aluminium activated malate transporter family protein
Bra034340 AT2G27250 100E-22 CLV3 (CLAVATA3)
Bra034341 AT2G27260 500E-64 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034342 AT2G27270 100E-31 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Bra034343 AT2G27285 500E-72 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
Bra034344 AT3G57020 0 strictosidine synthase family protein
Table 2 the information of candidate genes of ML4
p Bra034340 is the closest homologue to the CLV3 gene of Arabidopsis in B rapa (79 similarity) and thus this gene is named as BrCLV3
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
In Arabidopsis CLV3 gene plays a critical role in controlling the stem cells differentiation in the SAM and loos-of-function clv3 mutant shows enlargement of SAM and multicarpel siliques
BrCLV3 is most likely the candidate gene of ml4 in B rapa
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
(a)
ATG TAA
(b)
ml4
wt
100 bp
BrCLV3_ml4 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3_wt MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 BrCLV3 MDSRT-LVLLLLFCLMFLHDASDITHANANVHALPIRKMMVMKKDNEWGGANG-IEEEKE 58 AtCLV3 MDSKSFLLLLLLFCFLFLHDASDLTQAHAHVQGLSNRKMMMMKMESEWVGANGEAEKAKT 60 BrCLV3_ml4 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_wt KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
T
C
T
C ATAT
hellip T
C
secretion signal
CLE motif
uumlThe gene structure and comparative sequencing analysis of the candidate gene BrCLV3
2260 bp upstream + the entire gene + 2541 bp 3rsquo flanking
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
Fig the relative contributions of individual residues in the core CLE motif the CLV3 function in SAMs
The alanine scan of MCLV3
In Arabidopsis Pro9 in the core CLE motif is critical for endogenous CLV3 function in SAM maintenance
Thus the C-to-T Nucleotide Substitution in BrCLV3 probably leads to the Multilocular phenotype in B rapa
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
J
Car
pel n
umbe
r
B C C C
C
B B B A
uumlOverexpression of BrCLV3Brclv3 in Arabidopsis
K
5 Genetic transformation of BrCLV3 gene in Arabidopsis and B rapa
BrCLV3 35S
BrCLV3 OE
Brclv3 35S
Brclv3 OE
NOS
NOS
clv3-2
Ler clv3-2 OE OE OE
Ler clv3-2 OE
clv3-2
no obvious changes
Chart1
定位标记
候选基因
亲本表型
亲本表型
35S OE T1
35S OE T1
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
20135 35sclv3 OE材料T1植株考种结果 | |||||||||||||||||
carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||
clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||
OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||
OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | seed number per silique | |||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | ||||||||||||||
OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | ||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | ||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | ||||||||||||||
silique length | |||||||||||||||||
carpel number |
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
01 | 01 | 02 | 02 | ||||||
0 | 0 | 04 | 04 |
花瓣数 | 花萼数 | 雄蕊数 | 雌蕊数 | Genotype | No of plants | Sepal | Petal | Stamen | Carpelsflower | |||||||||||||
LXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 10plusmn00 | Wild type | 19 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 20plusmn00 | ||||||||||||
DXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 10plusmn00 | DXP mutant | 21 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 35plusmn04 | ||||||||||||
P18 | P12 | |||||||||||||||||||||
Sepal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Petal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Stamen | 6 | 62 | 01 | 02 | ||||||||||||||||||
Carpel | 2 | 35 | 0 | 04 |
定位区段内的候选基因信息 | |||||||
B rapa gene | Arabidopsis homologs | E value | Arabidopsis annotations | ||||
Bra034338 | AT2G27230 | 0 | LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor | ||||
Bra034339 | AT2G27240 | 0 | Aluminium activated malate transporter family protein | ||||
Bra034340 | AT2G27250 | 100E-22 | CLV3 (CLAVATA3) | ||||
Bra034341 | AT2G27260 | 500E-64 | Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family | ||||
Bra034342 | AT2G27270 | 100E-31 | Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family | ||||
Bra034343 | AT2G27285 | 500E-72 | Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040) | ||||
Bra034344 | AT3G57020 | 0 | strictosidine synthase family protein |
Table 3 Primer sequences of the molecular markers developed in the study | |||||||||
Marker | Marker type | Sequence (5-3) | Production size (bp) | ||||||
A4_18 | SSR | forward | CTAGATGATTTTATGTGTCATGTGC | 250 | |||||
reverse | AGAAAAGCAACACGGTTCGT | ||||||||
A4_20 | SSR | forward | TGATTATGAAACACAATAAAAACATCA | 230 | |||||
reverse | AGATGACGGCACTCACAGC | ||||||||
A4_26 | SSR | forward | TCAATTCCATTTGCTCCTCC | 238 | |||||
reverse | CATTCGCAAGGTTTGCTTCT | ||||||||
A4_38 | SSR | forward | TCCATTTCCCTTTTGTTTCTTT | 229 | |||||
reverse | TGAATGCCTTTATACGCGAG | ||||||||
A4_43 | SSR | forward | AATCATACATTTTTCGTGTTGAAA | 278 | |||||
reverse | TATCCGGCTTGGTGAAGAAG | ||||||||
DXP21 | SSR | forward | AGTCATGGAAACAAACGGCG | 196 | |||||
reverse | GGTTTACGCTATGGGCATGA | ||||||||
DXP58 | SNP | forward 1 | TGGTAAGTCGCTTGGAAGCGC | 949 (P17) | |||||
forward 2 | GGTGGTAAGTCGCTTGGAAGATT | 949 (P12) | |||||||
reverse | CACCTGCTACGGAAGGAGCA | ||||||||
DXP63 | SNP | forward 1 | GCCGTCGTGGACGGTCTTA | 655(P17) | |||||
forward 2 | CCGTCGTGGACGGTCATG | 655(P12) | |||||||
reverse | TCGCAGATGTATAGATCTCCCGTT | ||||||||
DXP67 | SNP | forward 1 | ATTCTTCTTCAGGAGGGAGACAATG | 460 (P17) | |||||
forward 2 | TTCTTCTTCAGGAGGGAGACAACA | 460 (P12) | |||||||
reverse | GTTTGGTAGGCTGAGAAGATGGG | ||||||||
DXP72 | SNP | forward 1 | GATCGGTCACTTTCTCCATCGC | 315(P17) | |||||
forward 2 | AGGATCGGTCACTTTCTCCATACA | 315 (P12) | |||||||
reverse | GATTCTCTTTGGTTGCTCCCTTTT | ||||||||
DXP94 | SNP | forward | ATGGCATGTGGGAGTATGATCGCT | 956 (TA) | |||||
reverse | TACCAGCGGAGAATTGGAGAAGCA | ||||||||
DXP96 | SNP | forward | ACACCCAGCCCTATCACACAGAAA | 808 (GT) | |||||
reverse | TGACTTGTCCCAAACTGATCTGGC | ||||||||
下划线为引入的错配碱基 | |||||||||
SNP标记开发网址httpausubellabmghharvardedu 进入SNAP program |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3-2 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
定位标记
候选基因
亲本表型
亲本表型
35S OE T1
35S OE T1
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
20135 35sclv3 OE材料T1植株考种结果 | |||||||||||||||||
carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||
clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||
OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||
OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | seed number per silique | |||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | ||||||||||||||
OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | ||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | ||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | ||||||||||||||
silique length | |||||||||||||||||
carpel number |
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
01 | 01 | 02 | 02 | ||||||
0 | 0 | 04 | 04 |
花瓣数 | 花萼数 | 雄蕊数 | 雌蕊数 | Genotype | No of plants | Sepal | Petal | Stamen | Carpelsflower | |||||||||||||
LXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 10plusmn00 | Wild type | 19 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 20plusmn00 | ||||||||||||
DXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 10plusmn00 | DXP mutant | 21 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 35plusmn04 | ||||||||||||
P18 | P12 | |||||||||||||||||||||
Sepal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Petal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Stamen | 6 | 62 | 01 | 02 | ||||||||||||||||||
Carpel | 2 | 35 | 0 | 04 |
定位区段内的候选基因信息 | |||||||
B rapa gene | Arabidopsis homologs | E value | Arabidopsis annotations | ||||
Bra034338 | AT2G27230 | 0 | LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor | ||||
Bra034339 | AT2G27240 | 0 | Aluminium activated malate transporter family protein | ||||
Bra034340 | AT2G27250 | 100E-22 | CLV3 (CLAVATA3) | ||||
Bra034341 | AT2G27260 | 500E-64 | Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family | ||||
Bra034342 | AT2G27270 | 100E-31 | Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family | ||||
Bra034343 | AT2G27285 | 500E-72 | Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040) | ||||
Bra034344 | AT3G57020 | 0 | strictosidine synthase family protein |
Table 3 Primer sequences of the molecular markers developed in the study | |||||||||
Marker | Marker type | Sequence (5-3) | Production size (bp) | ||||||
A4_18 | SSR | forward | CTAGATGATTTTATGTGTCATGTGC | 250 | |||||
reverse | AGAAAAGCAACACGGTTCGT | ||||||||
A4_20 | SSR | forward | TGATTATGAAACACAATAAAAACATCA | 230 | |||||
reverse | AGATGACGGCACTCACAGC | ||||||||
A4_26 | SSR | forward | TCAATTCCATTTGCTCCTCC | 238 | |||||
reverse | CATTCGCAAGGTTTGCTTCT | ||||||||
A4_38 | SSR | forward | TCCATTTCCCTTTTGTTTCTTT | 229 | |||||
reverse | TGAATGCCTTTATACGCGAG | ||||||||
A4_43 | SSR | forward | AATCATACATTTTTCGTGTTGAAA | 278 | |||||
reverse | TATCCGGCTTGGTGAAGAAG | ||||||||
DXP21 | SSR | forward | AGTCATGGAAACAAACGGCG | 196 | |||||
reverse | GGTTTACGCTATGGGCATGA | ||||||||
DXP58 | SNP | forward 1 | TGGTAAGTCGCTTGGAAGCGC | 949 (P17) | |||||
forward 2 | GGTGGTAAGTCGCTTGGAAGATT | 949 (P12) | |||||||
reverse | CACCTGCTACGGAAGGAGCA | ||||||||
DXP63 | SNP | forward 1 | GCCGTCGTGGACGGTCTTA | 655(P17) | |||||
forward 2 | CCGTCGTGGACGGTCATG | 655(P12) | |||||||
reverse | TCGCAGATGTATAGATCTCCCGTT | ||||||||
DXP67 | SNP | forward 1 | ATTCTTCTTCAGGAGGGAGACAATG | 460 (P17) | |||||
forward 2 | TTCTTCTTCAGGAGGGAGACAACA | 460 (P12) | |||||||
reverse | GTTTGGTAGGCTGAGAAGATGGG | ||||||||
DXP72 | SNP | forward 1 | GATCGGTCACTTTCTCCATCGC | 315(P17) | |||||
forward 2 | AGGATCGGTCACTTTCTCCATACA | 315 (P12) | |||||||
reverse | GATTCTCTTTGGTTGCTCCCTTTT | ||||||||
DXP94 | SNP | forward | ATGGCATGTGGGAGTATGATCGCT | 956 (TA) | |||||
reverse | TACCAGCGGAGAATTGGAGAAGCA | ||||||||
DXP96 | SNP | forward | ACACCCAGCCCTATCACACAGAAA | 808 (GT) | |||||
reverse | TGACTTGTCCCAAACTGATCTGGC | ||||||||
下划线为引入的错配碱基 | |||||||||
SNP标记开发网址httpausubellabmghharvardedu 进入SNAP program |
候选基因
亲本表型
亲本表型
35S OE T1
35S OE T1
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
20135 35sclv3 OE材料T1植株考种结果 | |||||||||||||||||
carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||
clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||
OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||
OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | seed number per silique | |||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | ||||||||||||||
OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | ||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | ||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | ||||||||||||||
silique length | |||||||||||||||||
carpel number |
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
01 | 01 | 02 | 02 | ||||||
0 | 0 | 04 | 04 |
花瓣数 | 花萼数 | 雄蕊数 | 雌蕊数 | Genotype | No of plants | Sepal | Petal | Stamen | Carpelsflower | |||||||||||||
LXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 10plusmn00 | Wild type | 19 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 20plusmn00 | ||||||||||||
DXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 10plusmn00 | DXP mutant | 21 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 35plusmn04 | ||||||||||||
P18 | P12 | |||||||||||||||||||||
Sepal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Petal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Stamen | 6 | 62 | 01 | 02 | ||||||||||||||||||
Carpel | 2 | 35 | 0 | 04 |
定位区段内的候选基因信息 | |||||||
B rapa gene | Arabidopsis homologs | E value | Arabidopsis annotations | ||||
Bra034338 | AT2G27230 | 0 | LHW (LONESOME HIGHWAY) protein homodimerization transcription activator transcription factor | ||||
Bra034339 | AT2G27240 | 0 | Aluminium activated malate transporter family protein | ||||
Bra034340 | AT2G27250 | 100E-22 | CLV3 (CLAVATA3) | ||||
Bra034341 | AT2G27260 | 500E-64 | Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family | ||||
Bra034342 | AT2G27270 | 100E-31 | Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family | ||||
Bra034343 | AT2G27285 | 500E-72 | Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040) | ||||
Bra034344 | AT3G57020 | 0 | strictosidine synthase family protein |
亲本表型
亲本表型
35S OE T1
35S OE T1
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
20135 35sclv3 OE材料T1植株考种结果 | |||||||||||||||||
carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||
clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||
OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||
OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | seed number per silique | |||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | ||||||||||||||
OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | ||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | ||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | ||||||||||||||
silique length | |||||||||||||||||
carpel number |
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
01 | 01 | 02 | 02 | ||||||
0 | 0 | 04 | 04 |
花瓣数 | 花萼数 | 雄蕊数 | 雌蕊数 | Genotype | No of plants | Sepal | Petal | Stamen | Carpelsflower | |||||||||||||
LXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 10plusmn00 | Wild type | 19 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 60plusmn01 | 20plusmn00 | ||||||||||||
DXP | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 10plusmn00 | DXP mutant | 21 | 40plusmn00 | 40plusmn00 | 62plusmn02 | 35plusmn04 | ||||||||||||
P18 | P12 | |||||||||||||||||||||
Sepal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Petal | 4 | 4 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||
Stamen | 6 | 62 | 01 | 02 | ||||||||||||||||||
Carpel | 2 | 35 | 0 | 04 |
亲本表型
35S OE T1
35S OE T1
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
20135 35sclv3 OE材料T1植株考种结果 | |||||||||||||||||
carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||
clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||
OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||
OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | seed number per silique | |||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | ||||||||||||||
OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | ||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | ||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | ||||||||||||||
silique length | |||||||||||||||||
carpel number |
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
0 | 0 | 0 | 0 | ||||||
01 | 01 | 02 | 02 | ||||||
0 | 0 | 04 | 04 |
35S OE T1
35S OE T1
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
20135 35sclv3 OE材料T1植株考种结果 | |||||||||||||||||
carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||
clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||
OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||
OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | seed number per silique | |||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | ||||||||||||||
OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | ||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | ||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | ||||||||||||||
silique length | |||||||||||||||||
carpel number |
35S OE T1
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
OE64 | 07022132499 | 07022132499 | |||
OE13 | 05483188806 | 05483188806 | |||
OE4 | 07867957925 | 07867957925 | |||
OE72 | 08502873078 | 08502873078 | |||
OE74 | 03051285766 | 03051285766 | |||
OE47 | 06666666667 | 06666666667 | |||
OE71 | 1 | 1 | |||
clv3 | 08193072487 | 08193072487 | |||
ler | 0 | 0 |
35S OE T2
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
35S OE T3
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
角果粒数 | 角果粒数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 18 | 21 | 23 | 39 | 69 | 49 | 36 | 42 | 28 | 18 | 19 | 46 | 29 | 42 | 29 | 32 | 41 | 7 | 13 | 70 | 19 | 44 | 32 | 28 | 43 | 57 | 16 | 12 | 38 | 25 | 1 | OE64 | 328 | 158 | carpel number | silique length | seed number per silique | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 35 | 18 | 37 | 16 | 46 | 26 | 13 | 13 | 6 | 8 | 5 | 13 | 29 | 5 | 12 | 9 | 9 | 53 | 11 | OE13 | 196 | 147 | clv3-2 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 20 | 15 | 41 | 15 | 29 | 5 | 5 | 9 | 34 | 51 | 18 | 34 | 15 | 7 | 23 | 42 | 33 | 23 | 18 | 58 | 21 | 17 | 15 | 15 | 16 | 16 | 14 | 21 | 13 | OE4 | 225 | 133 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 22 | 48 | 17 | 50 | 39 | 29 | 39 | 50 | 47 | 39 | 45 | 31 | 11 | 8 | 20 | 41 | 43 | 36 | 24 | 16 | 13 | 28 | 30 | 17 | 50 | 20 | 19 | 66 | 26 | 20 | 17 | OE72 | 315 | 144 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 51 | 44 | 47 | 48 | 54 | 31 | 32 | 52 | 51 | 54 | 42 | 47 | 27 | 31 | 35 | 48 | 44 | 66 | 23 | 28 | 56 | 54 | 51 | 56 | 47 | 50 | 42 | 58 | 52 | 38 | 18 | OE74 | 453 | 105 | OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 6 | 12 | 22 | 9 | 15 | 27 | 9 | 11 | 12 | 22 | OE47 | 137 | 67 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 17 | 21 | 35 | 29 | 15 | 6 | 19 | 30 | 39 | 24 | OE71 | 234 | 106 | OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 14 | 19 | 21 | 13 | 22 | 27 | 12 | 17 | 15 | 26 | 14 | 18 | 32 | 16 | 25 | 22 | 30 | 37 | 10 | 17 | 28 | 23 | 34 | 9 | 14 | 6 | 38 | 6 | 33 | 19 | clv3-2 | clv3 | 206 | 89 | OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 34 | 31 | 36 | 33 | 30 | 22 | 34 | 32 | 13 | 30 | 35 | 27 | 19 | 24 | 24 | 22 | 38 | 21 | 20 | 24 | 32 | 24 | 31 | 21 | 24 | 25 | 33 | 33 | 20 | 25 | ler | ler | 272 | 62 | OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长 | 角果长 | ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 413 | 593 | 624 | 871 | 714 | 62 | 548 | 771 | 564 | 595 | 536 | 743 | 579 | 615 | 465 | 582 | 688 | 367 | 451 | 787 | 488 | 764 | 734 | 591 | 639 | 555 | 425 | 384 | 585 | 525 | 1 | OE64 | 59 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 607 | 466 | 59 | 478 | 765 | 599 | 466 | 45 | 409 | 476 | 4 | 471 | 523 | 441 | 429 | 395 | 381 | 68 | 11 | OE13 | 50 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 625 | 444 | 577 | 51 | 542 | 411 | 387 | 34 | 466 | 579 | 386 | 475 | 423 | 365 | 442 | 577 | 508 | 382 | 443 | 601 | 446 | 381 | 417 | 418 | 438 | 299 | 361 | 398 | 13 | OE4 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 498 | 546 | 462 | 75 | 808 | 644 | 76 | 826 | 758 | 709 | 628 | 533 | 416 | 49 | 436 | 587 | 539 | 624 | 567 | 435 | 362 | 521 | 513 | 481 | 576 | 432 | 462 | 736 | 501 | 525 | 17 | OE72 | 57 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 957 | 878 | 934 | 748 | 902 | 748 | 697 | 96 | 947 | 895 | 913 | 907 | 789 | 923 | 738 | 788 | 791 | 771 | 758 | 722 | 856 | 922 | 992 | 897 | 84 | 825 | 784 | 678 | 753 | 652 | 18 | OE74 | 83 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 504 | 389 | 428 | 422 | 336 | 639 | 427 | 383 | 525 | 22 | OE47 | 45 | 09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 432 | 5 | 492 | 482 | 424 | 366 | 393 | 49 | 485 | 24 | OE71 | 45 | 05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 429 | 451 | 375 | 314 | 459 | 413 | 392 | 42 | 421 | 463 | 398 | 462 | 535 | 346 | 441 | 526 | 567 | 465 | 355 | 377 | 441 | 393 | 456 | 361 | 33 | 302 | 476 | 425 | 477 | 404 | clv3-2 | clv3 | 42 | 06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 647 | 693 | 694 | 697 | 628 | 619 | 712 | 671 | 562 | 577 | 765 | 619 | 562 | 601 | 554 | 625 | 737 | 53 | 494 | 552 | 779 | 531 | 623 | 567 | 621 | 702 | 813 | 719 | 682 | 638 | ler | ler | 64 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | 心皮数 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | OE64 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 1 | OE64 | 33 | 07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | OE13 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 11 | OE13 | 22 | 05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | OE4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 13 | OE4 | 32 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | OE72 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 17 | OE72 | 30 | 09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | OE74 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 18 | OE74 | 21 | 03 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | OE47 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 22 | OE47 | 22 | 07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | OE71 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 24 | OE71 | 30 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | clv3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | clv3-2 | clv3-2 | 45 | 08 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | ler | ler | 20 | 00 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析单因素方差分析 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUMMARY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组 | 观测数 | 求和 | 平均 | 方差 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE64 | 30 | 985 | 328333333333 | 2490402298851 | 233796728972 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 18 | 353 | 196111111111 | 2150751633987 | 35108366251 | 324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE4 | 28 | 630 | 225 | 1765555555556 | 784 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30 | 944 | 314666666667 | 2086022988506 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 30 | 1359 | 453 | 1096655172414 | 57753262483 | 900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 9 | 123 | 136666666667 | 455 | 816620599 | 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE71 | 9 | 211 | 234444444444 | 1115277777778 | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 30 | 617 | 205666666667 | 794264367816 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 30 | 817 | 272333333333 | 380471264368 | 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差分析 | carpel number | silique length | seed number per silique | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
差异源 | SS | df | MS | F | P-value | F crit | clv3 | 45plusmn08 A | 42plusmn06 E | 206plusmn89 CD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组间 | 158545109034268 | 8 | 19818138629284 | 137541319502 | 639109212884869E-16 | 19837794548 | OE64 | 33plusmn07 B | 59plusmn13 B | 328plusmn158 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
组内 | 295381666666667 | 205 | 1440886178862 | OE4 | 32plusmn08 B | 45plusmn08 DE | 225plusmn133 C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE72 | 30plusmn09 B | 57plusmn13 C | 315plusmn144 B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
总计 | 453926775700935 | 213 | OE71 | 30plusmn10 B | 45plusmn05 DE | 234plusmn106 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13 | 22plusmn05 C | 50plusmn11 D | 196plusmn147 CD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47 | 22plusmn07 C | 45plusmn09 DE | 137plusmn67 D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74 | 21plusmn03 C | 83plusmn09 A | 453plusmn105 A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 20plusmn00 C | 64plusmn08 B | 272plusmn62 BC |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
OE64 | 12617522937 | 12617522937 | |||
OE13 | 10604339967 | 10604339967 | |||
OE4 | 08464456498 | 08464456498 | |||
OE72 | 12667500729 | 12667500729 | |||
OE74 | 09437638634 | 09437638634 | |||
OE47 | 09169514709 | 09169514709 | |||
OE71 | 04923949409 | 04923949409 | |||
clv3 | 06305319775 | 06305319775 | |||
ler | 08022027147 | 08022027147 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
OE64 | 157810085193 | 157810085193 | |||
OE13 | 146654411253 | 146654411253 | |||
OE4 | 13287420952 | 13287420952 | |||
OE72 | 144430709633 | 144430709633 | |||
OE74 | 104721305015 | 104721305015 | |||
OE47 | 67453687816 | 67453687816 | |||
OE71 | 10560671275 | 10560671275 | |||
clv3 | 89121510749 | 89121510749 | |||
ler | 61682352774 | 61682352774 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
07022132499 | 07022132499 | |||
05483188806 | 05483188806 | |||
07867957925 | 07867957925 | |||
08502873078 | 08502873078 | |||
03051285766 | 03051285766 | |||
06666666667 | 06666666667 | |||
1 | 1 | |||
08193072487 | 08193072487 | |||
0 | 0 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | 角果长度 | 心皮数 | 每角果粒数 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-20 | 82plusmn10 | 30plusmn12 | 461plusmn177 | OE13-20 | 82 | 1 | 3 | 12 | 461 | 177 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE74-18 | 110plusmn13 | 20plusmn00 | 520plusmn132 | OE74-18 | 11 | 13 | 2 | 0 | 52 | 132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE47-22 | 88plusmn15 | 24plusmn07 | 406plusmn247 | OE47-22 | 88 | 15 | 24 | 07 | 406 | 247 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OE13-11 | 75plusmn18 | 32plusmn10 | 453plusmn174 | OE13-11 | 75 | 18 | 32 | 1 | 453 | 174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ler | 83plusmn17 | 20plusmn00 | 251plusmn146 | ler | 83 | 17 | 2 | 0 | 251 | 146 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | 51plusmn11 | 47plusmn09 | 343plusmn151 | clv3 | 51 | 11 | 47 | 09 | 343 | 151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-20-5 | 793 | 991 | 68 | 692 | 822 | 858 | 874 | 827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE74-18-3 | 115 | 1121 | 1004 | 109 | 1124 | 775 | 1185 | 1172 | 1048 | 1212 | 1260 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE47-22-7 | 814 | 796 | 635 | 783 | 819 | 901 | 1088 | 105 | 1042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | OE13-11-14 | 93 | 739 | 569 | 911 | 679 | 986 | 761 | 63 | 482 | 95 | 602 | 608 | 421 | 556 | 657 | 402 | 893 | 859 | 987 | 992 | 586 | 999 | 88 | 555 | 571 | 64 | 773 | 93 | 651 | 774 | 947 | 720 | 731 | 1109 | 584 | 779 | 963 | 864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | ler | 744 | 698 | 71 | 655 | 77 | 778 | 701 | 745 | 827 | 846 | 869 | 881 | 533 | 863 | 787 | 713 | 718 | 81 | 792 | 876 | 845 | 677 | 1132 | 1057 | 797 | 775 | 832 | 738 | 731 | 779 | 786 | 802 | 659 | 879 | 767 | 825 | 647 | 81 | 742 | 1008 | 8 | 783 | 741 | 694 | 681 | 776 | 569 | 935 | 612 | 482 | 572 | 879 | 755 | 746 | 85 | 866 | 934 | 1222 | 1075 | 1095 | 1104 | 1026 | 1264 | 735 | 747 | 892 | 1031 | 115 | 1117 | 737 | 1161 | 1026 | 1049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
角果长度 | clv3 | 571 | 855 | 379 | 391 | 42 | 662 | 582 | 461 | 534 | 481 | 525 | 497 | 293 | 663 | 603 | 379 | 519 | 538 | 437 | 560 | 540 | 454 | 601 | 509 | 455 | 482 | 489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-20-5 | 50 | 47 | 54 | 42 | 8 | 51 | 71 | 46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE74-18-3 | 39 | 56 | 74 | 53 | 28 | 47 | 59 | 58 | 55 | 65 | 38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE47-22-7 | 36 | 68 | 7 | 32 | 85 | 39 | 40 | 11 | 47 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | OE13-11-14 | 38 | 77 | 31 | 33 | 59 | 50 | 59 | 37 | 56 | 77 | 30 | 44 | 30 | 29 | 58 | 71 | 45 | 62 | 28 | 47 | 22 | 68 | 50 | 18 | 28 | 28 | 65 | 85 | 16 | 53 | 37 | 36 | 51 | 57 | 41 | 34 | 32 | 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | ler | 20 | 17 | 16 | 12 | 18 | 14 | 21 | 23 | 27 | 20 | 21 | 24 | 21 | 13 | 10 | 24 | 21 | 30 | 22 | 15 | 61 | 51 | 19 | 14 | 14 | 22 | 11 | 20 | 15 | 19 | 31 | 22 | 13 | 13 | 18 | 15 | 15 | 21 | 12 | 11 | 10 | 23 | 22 | 13 | 26 | 10 | 13 | 18 | 16 | 13 | 23 | 27 | 35 | 53 | 50 | 46 | 60 | 45 | 47 | 19 | 20 | 44 | 17 | 49 | 35 | 16 | 62 | 57 | 58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
每角果粒数 | clv3 | 39 | 34 | 28 | 26 | 14 | 60 | 28 | 39 | 18 | 31 | 25 | 29 | 27 | 46 | 47 | 13 | 37 | 42 | 56 | 41 | 58 | 27 | 72 | 14 | 24 | 35 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-20-5 | 2 | 2 | 5 | 4 | 2 | 2 | 4 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE74-18-3 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE47-22-7 | 3 | 3 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | OE13-11-14 | 2 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | 4 | 4 | 2 | 4 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | ler | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
心皮数 | clv3 | 4 | 2 | 5 | 5 | 4 | 5 | 4 | 7 | 5 | 6 | 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 5 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 31842105263 | 平均 | 47037037037 | 24444444444 | 平均 | 47037037037 | 2 | 平均 | 47037037037 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 10192034139 | 方差 | 0754985755 | 05277777778 | 方差 | 0754985755 | 0 | 方差 | 0754985755 | 14285714286 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 02003023432 | 合并方差 | 09101612055 | 合并方差 | 07015250545 | 合并方差 | 05452674897 | 合并方差 | 08978675645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 268200382705 | t Stat | 63278561277 | t Stat | 70080366466 | t Stat | 102362461311 | t Stat | 44666382373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 312135071098724E-47 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000146 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000218 | P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000439814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 624270142197448E-47 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000292 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000437 | P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000879629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 343333333333 | 25115942029 | 平均 | 343333333333 | 452631578947 | 平均 | 343333333333 | 405555555556 | 平均 | 343333333333 | 52 | 平均 | 343333333333 | 46125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 2268461538462 | 2133393009378 | 方差 | 2268461538462 | 301226173542 | 方差 | 2268461538462 | 6082777777778 | 方差 | 2268461538462 | 173 | 方差 | 2268461538462 | 3129821428571 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 69 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2170752389763 | 合并方差 | 270529657477 | 合并方差 | 3165947712418 | 合并方差 | 2118888888889 | 合并方差 | 2451174242424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 94 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | 27559649625 | t Stat | -26401144355 | t Stat | -09085431012 | t Stat | -33930241395 | t Stat | -18710308791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 00035144325 | P(Tlt=t) 单尾 | 00052174808 | P(Tlt=t) 单尾 | 01849933467 | P(Tlt=t) 单尾 | 00008470438 | P(Tlt=t) 单尾 | 00351149838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16612258553 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0007028865 | P(Tlt=t) 双尾 | 00104349615 | P(Tlt=t) 双尾 | 03699866935 | P(Tlt=t) 双尾 | 00016940877 | P(Tlt=t) 双尾 | 00702299676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19855234419 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | t-检验 双样本等方差假设 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
clv3 | ler | clv3 | OE13-11-14 | clv3 | OE47-22-7 | clv3 | OE74-18-3 | clv3 | OE13-20-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
平均 | 51407407407 | 83164383562 | 平均 | 51407407407 | 75447368421 | 平均 | 51407407407 | 88088888889 | 平均 | 51407407407 | 110372727273 | 平均 | 51407407407 | 817125 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
方差 | 12145763533 | 2722806583 | 方差 | 12145763533 | 33223445235 | 方差 | 12145763533 | 22926111111 | 方差 | 12145763533 | 17156218182 | 方差 | 12145763533 | 10042982143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
观测值 | 27 | 73 | 观测值 | 27 | 38 | 观测值 | 27 | 9 | 观测值 | 27 | 11 | 观测值 | 27 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
合并方差 | 2322663869 | 合并方差 | 24524719453 | 合并方差 | 14682315904 | 合并方差 | 13537556491 | 合并方差 | 11699718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | 假设平均差 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
df | 98 | df | 63 | df | 34 | df | 36 | df | 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t Stat | -92510126111 | t Stat | -60988610235 | t Stat | -78650497103 | t Stat | -141681434111 | t Stat | -69601845189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 单尾 | 0 | P(Tlt=t) 单尾 | 0000000036 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000019 | P(Tlt=t) 单尾 | 134962586222509E-16 | P(Tlt=t) 单尾 | 00000000295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 单尾临界 | 16605512171 | t 单尾临界 | 16694022217 | t 单尾临界 | 16909242552 | t 单尾临界 | 16882977141 | t 单尾临界 | 1692360309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P(Tlt=t) 双尾 | 0 | P(Tlt=t) 双尾 | 0000000072 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000037 | P(Tlt=t) 双尾 | 269925172445019E-16 | P(Tlt=t) 双尾 | 00000000589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
t 双尾临界 | 19844674545 | t 双尾临界 | 19983405425 | t 双尾临界 | 20322445093 | t 双尾临界 | 2028094001 | t 双尾临界 | 20345152974 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
OE13-20 | 1 | 1 | |||
OE74-18 | 13 | 13 | |||
OE47-22 | 15 | 15 | |||
OE13-11 | 18 | 18 | |||
ler | 17 | 17 | |||
clv3 | 11 | 11 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
OE13-20 | 12 | 12 | |||
OE74-18 | 0 | 0 | |||
OE47-22 | 07 | 07 | |||
OE13-11 | 1 | 1 | |||
ler | 0 | 0 | |||
clv3 | 09 | 09 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
OE13-20 | 177 | 177 | |||
OE74-18 | 132 | 132 | |||
OE47-22 | 247 | 247 | |||
OE13-11 | 174 | 174 | |||
ler | 146 | 146 | |||
clv3 | 151 | 151 |
1 9 10 2 3 4 5 6 7 8 M
Detection of positive transgenic plants in B rapa M 3kb marker 1~9 transgenic plants 10 positive control 11 negative control
Control Transgenic plants
uumlTransgenic complementation in B rapa
BrCLV3 COM construct
ml4 mutant
11
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uumlIn vitro peptide assay
BrCLV3 RTVPSGPDPLHH BrCLV3Leu9 RTVPSGPDLLHH
The endogenously functional CLV3 signal is a 12-aa peptide derived from the CLE motif in Arabidopsis (Kondo et al 2006)
Synthesize peptides
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
ml4 wt
A B
Ler clv3-2 Ler clv3-2 Ler clv3-2
00
100
200
300
400
500
600
700
800
7d 10d 13d 7d 10d 13d
Ler clv3-2
12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1microM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1microM BrCLV3
12 MS BrCLV3 10nM
BrCLV3Leu9 10nM 12 MS BrCLV3
1μM BrCLV3Leu9 1μM
Main root length (mm) Main root length (mm)
Root length inhibition assay of the synthetic peptides
ml4 wt ml4 wt
Arabidopsis B rapa
05
101520253035404550
wt ml4
12 MS
1μM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
a b c d e f g
h i j k l m n
00
1000
2000
3000
4000
5000
Ler clv3-2
RA
M le
ngth
of m
ain
root
(μm
) 12 MS
10nM BrCLV3Leu9
100nM BrCLV3Leu9
1μM BrCLV3Leu9
10nM BrCLV3
100nM BrCLV3
1μM BrCLV3
12MS
clv3-2
Ler
BrCLV3Leu9 10nM 100nM 1μM 10nM 100nM 1μM
BrCLV3 Root apical meristem inhibition assay of the
synthetic peptides
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
0
1000
2000
3000
4000
Ler clv3-2
SAM
size
(μm
2 ) 12 MS
1 μm 1 μm
A B C
D E F
G H I
J K L
M N
clv3-2
Ler
ml4
wt
12MS 1μM BrCLV3Leu9 1μM BrCLV3
SAM inhibition assay of the synthetic peptides
Arabidopsis
B rapa
BrCLV3Leu9
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
wt ml4
SAM
size
(μm
2 )
BrCLV3
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
The results of peptide assay indicate that
BrCLV3_P12 KVFGLNEELRTVPSGPDLLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3_P18 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 BrCLV3 KVFGLNEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRKPRTDSHIP 94 AtCLV3 KGLGLHEELRTVPSGPDPLHHHVNPPRQPRNNFQLP 96
CLE motif
uuml The BrCLV3 peptide can function in both Arabidopsis and B rapa uuml Pro9rarrLeu9 mutation could disrupts the function of CLV3 peptide
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
00000000020000400006000080001000012000140001600018
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
A
5 Expression analysis of BrCLV3 gene
How does the abnormal activation of BrCLV3 in the SAM of ml4 plants happen
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
0
0001
0002
0003
0004
0005
wt ml4
B
SAM BrCLV3
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
00
05
10
15
P17 P12
CLV1
00
01
02
03
04
P17 P12
CLV2
000001002003004005006
P17 P12
POL
0000000100020003000400050006
P17 P12
CRN
0000
0001
0002
0003
P17 P12
WUS
000002004006008010012
P17 P120000
0004
0008
0012
0016
P17 P12
PLL1
Lev
el o
f gen
e ex
pres
sion
RPK2
uumlThe expression of the Arabidopsis homologues in the CLV3WUS pathway increased by three to nine fold in the SAM of ml4
Perales and Reddy et al Plant Biology 2012
wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4 wt ml4
a positive-negative feedback loop involved in the CLV3WUS maintains the SAM size in Arabidopsis
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
Receptor complex
POLPLL1
WUS
ml4 mutant
times
BrCLV3Leu9
Membrane Receptor complex
POLPLL1
WUS
BrCLV3
wt
uumlThe possible mechanism of multilocular formation in B rapa
Extracellular
Intracellular
Fan et al Mol Plant 2014
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
Summary uumlThe multilocular mutant ml4 of B rapa shows enlarged SAM increased numbers of inner whorls of floral organs and seed number per silique without reduction of seed weight
uumlThe multilocular trait of B rapa is controlled by a recessive gene ml4 on the A4 chromosome
uumlThe multilocular gene ml4 was identified by map-based cloning approach it encodes a small putative secreted peptide that is the putative orthologue of the Arabidopsis CLAVATA3 gene
uumlIn the ml4 mutat the Pro-to-Leu substitution in the core CLE motif disrupts the function of BrCLV3
uumlExpression analyses indicated that the putative negative pathway in the feedback loop between CLV3 and WUS was disrupted in ml4
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
Acknowledgement u Prof Yongming Zhou
u Dr Qingyong yang
Yudi Wu Keqiao Zhang
Qingwei Meng Yang Yang
u Prof Zaiyun Li
u Students participated in the work
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
Thanks for your attention
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-
Seed number per silique
Silique length
Seed weight
Seed number per silique 1 Silique length 050 1 Seed weight 002 -014 1 Mutilocular silique 020 -054 018
Seed number per silique
Silique length (mm)
Seed weight (g)
Mutilocular type 198plusmn43 314plusmn36 039plusmn007 Bilocular type 153plusmn42 345plusmn46 037plusmn006
Table 2 Coefficients of pairwise correlations of the silique related traits in F2 population
Table 3 Statistics of the traits for bilocularmultilocular silique in F2 population
ml4 mutant holds great potential for the future high-yield breeding
- Slide Number 1
- Slide Number 2
- Slide Number 3
- Slide Number 4
- Slide Number 5
- Slide Number 6
- Slide Number 7
- Slide Number 8
- Slide Number 9
- Slide Number 10
- Slide Number 11
- Slide Number 12
- Slide Number 13
- Slide Number 14
- Slide Number 15
- Slide Number 16
- Slide Number 17
- Slide Number 18
- Slide Number 19
- Slide Number 20
- Slide Number 21
- Slide Number 22
- Slide Number 23
- Slide Number 24
- Slide Number 25
- Slide Number 26
- Slide Number 27
- Slide Number 28
- Slide Number 29
- Slide Number 30
- Slide Number 31
- Slide Number 32
-