06 bioloska evolucija - pramolekula zivota

Upload: igor-petrina

Post on 06-Jul-2018

232 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    1/32

    RNA

    PRAMOLEKULAŽIVOTA

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    2/32

    RNA SVIJET

    Problem prve molekule života jednak je problemu kokoši i jajeta.

    Geni ne mogu opstati bez enzima (replikacija), a enzimi nemogu nastati bez gena (biosinteza).

     Dakle, što je bilo prvo – geni ili enzimi?

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    3/32

    Teorija RN svijeta elegantno rje!ava ovaj problem, koko! i

     jaje spaja u jednu cjelinu.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    4/32

    Teorija RN svijeta elegantno rje!ava ovaj problem, koko! i

     jaje spaja u jednu cjelinu.

    " molekularnoj biologiji dugo se vjerovalo da se geneti#kain$ormacija može prenositi jedino s %N molekula na RN

    molekule. &tkri'e enzima reverzne transkriptaze dokazalo je da je i obrnuti prijenos geneti#ke in$ormacije mogu'.

     

    &sim toga, u molekularnoj biologiji dugo se vjerovalo da

     jedino proteinske molekule imaju kataliti#ke sposobnosti.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    5/32

    " stvaranju teorije o RN svijetu klju#no je bilo otkri'e

    kataliti#ke aktivnosti RN molekula (RIBOZIMI).

    Godine *+. Th!as "e#h otkrio je daodreene rRN molekule imaju sposobnostsamoizrezivanja (sel$-splicing) - prekursor

    odreene RN molekule samoizrezivanjemstvara intron koji zadržava kataliti#ku aktivnostte može trans$ormirati ostale RN molekule(poput enzima).

    a to je *. godine dobio Nobelovunagradu

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    6/32

    ri$n%k&eaza P (stvara /0 kraj tRN)

    Si'ne( A&t!an 1 Nobelovanagrada *. godine

    rRNA (stvara peptidnu vezu)

    Osta&i tkriveni ri$zi!i s%)

    te&!eraza (produljujetelomere na osnovi RN

    kalupa)

    viri'na RNA (cijepanjekonkatamera na monomere)

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    7/32

    *ILBERT je tvorac teorije o RN svijetu prije svijeta %N i proteina. Ta teorija predlaže slijede'i redoslijed dogaaja2

    . RN je katalizirala vlastitu replikaciju i razviladodatne enzimatske aktivnosti.

    3. RN je po#ela sintetizirati proteine koji su se

     pokazali boljim enzimima 1 sa svoji4 35 razli#iti4graevni4 jedinica (amoinokiseline) raznovrsniji suod RN koje imaju samo 6 razli#ite graevne

     jedinice (nukleotidi).

    +. %N je stvorena reverznom transkripcijom RN i

    zamijenila ju je kao geneti#ki materijal 1 %N je,sa svojom strukturom dvostrukog 4eliksa, punostabilnija od RN.

    6. RN se zadržala u živom svijetu s $unkcijomglasnika (mRN) i prevoditelja (tRN) te kao

    glavna komponenta ribosoma.

    RN

    RN

    %N

    RN

     proteini

     proteini

     proteini

    RN

    RN

    %N

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    8/32

    %akle, RN se #ini idealnom prvom molekulom života zato!to obavlja $unkciju i gena i enzima.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    9/32

    %akle, RN se #ini idealnom prvom molekulom života zato!to obavlja $unkciju i gena i enzima.

    zasebno su nastali !e'er riboza,du!i#ne baze i anorganski $os$at

    kemijskom reakcijom su se te

    komponente povezale u nukleotid

    nukleotidi su se spontano povezaliu polimer 1 RN

    Pretpostavlja se da je RN prebioti#kom sintezom nastala naslijede'i na#in2

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    10/32

    7 obzirom na to da je po#etni korak u stvaranju RN svijeta tolikotežak, smatra se da je postojao i pre+RNA svijet odnosno pre+

    pre#e&%&arni život koji je bilo puno lak!e konstruirati.

    To je mogao biti PNA (peptid-

    nukleinska kiselina) svijet. PN je polimer s kosturom nalik na protein koji kao bo#ne lance ima baze nukleinski4 kiselina. 8edantakav lanac može se vezati sasebi komplementarnim lancem.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    11/32

    %okazano je da su nasumi#ne RN sekvence ponekad$unkcionalne.

    %obar primjer je strukturno vrlo složen i visoko kataliti#ni aktivnaRNA &i,aza koja je u laboratoriju dobivena iz nasumi#nog RNslijeda. 9z nasumi#nosti, dakle, može može nastati $unkcionalnost.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    12/32

    %okazano je da su nasumi#ne RN sekvence ponekad$unkcionalne.

    %obar primjer je strukturno vrlo složen i visoko kataliti#ni aktivnaRNA &i,aza koja je u laboratoriju dobivena iz nasumi#nog RNslijeda. 9z nasumi#nosti, dakle, može može nastati $unkcionalnost.

    9pak, ovi rezultati dobiveni u sterilnom laboratoriju ne zna#e da je u bitnodruk#ijim uvjetima u pro!losti iz nasumi#nosti uistinu nastala$unkcionalnost. Naime, RN je kemijski vrlo nestabilna i te!ko se sintetiziraabioti#ki, pa je nevjerojatno da je bilo kakva RN spontano nastala u prirodi.

    :ijela teorija o precelularnom svijetu se, o#ito, zasniva na nasumi#nimdogaajima. Nastanak $unkcionalni4 gena i proteina te celularnog svijetaisklju#ivo na osnovi nasumi#ni4 dogaaja trajao bi jako dugo 1 problemvremena;

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    13/32

     Na svaki4 5/55 nasumi#no stvoreni4 proteina samo bi jedan bio$unkcionalan

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    14/32

     Na svaki4 5/55 nasumi#no stvoreni4 proteina samo bi jedan bio$unkcionalan

    =5 godina

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    15/32

    Teoretski, precelularni život mogao je nastajati, postojati i razvijatise 5.=5  godina

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    16/32

    Realno, na po#etku je emljina povr!ina bila neprikladna za životzbog previsoke temperature uzrokovane meteorskim

     bombardiranjem i vlastitom geolo!kom di$erencijacijom, pa je precelularni život ?imao na raspolaganju@ svega 5. = 5 godina 

    "sporedba teoretski4 555 = 56/5 i realni4 5. = 5 godinaopravdava sumnju u teoriju o nasumi#nom nastanku života tj.$unkcionalni4 gena i proteina

    Teoretski, precelularni život mogao je nastajati, postojati i razvijatise 5. = 5  godina

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    17/32

     Nisu pronaeni nikakvi dokazi o postojanju precelularnog

    života. 7vi zaklju#ci o njegovom postojanju su pretpostavke.9ako je te!ko zamisliti nastanak života iz neživog, precelularniživot se morao pojaviti u vrlo kratkom vremenu

    Precelularni život nikada nije stvoren u laboratorijskimuvjetima. 9ako se #esto spominje teorija o RN svijetu, tajmodel nastanka života nije u potpunosti pri4va'en.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    18/32

    Ae'er ri$z% vrlo je te!ko sintetizirati bez pomo'i enzima udovoljnoj koli#ini.

    →  poznato je da se nizom reakcija iz -r!a&'ehi'a može dobiti riboza, alismjesa !e'era nastala tim putem sadrži %vi.ek vi/e svih 'r%,ih !e'era, a

    na.!an.e .e ri$ze→  #injenice da se te!ko dobije riboza govori protiv ideje o svijetu RN

    → do danas jo! nikome nije uspjelo dobiti jednostavni niz lan#ani4 reakcijas ribozom kao glavnim zavr!nim produktom

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    19/32

    Poku!aji sinteze n%k&eti'a u laboratorijskim uvjetima(opona!anje praatmos$erski4 uvjeta) isto nisu uvijek uspje!ni

    → u nekim pokusima su dobilikombinacije purina i riboze, ali bez$os$ata

    → meutim, na sli#an na#in nisumogli stvoriti pirimidinskenukleotide, osim ako su uzeli u pomo' enzime

    → nukleotidi dobiveni ovakvimreakcijama obi#no nemaju pravilnustrukturu

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    20/32

    7toga se pretpostavlja da su na prvotnoj emlji u reakcijesinteze nukleotida morali biti uklju#eni neki anorganskikatalizatori - oni su bili zaduženi za sintezu pravilni4 strukturanukleotida

    Pretpstavka I2 ti su katalizatori mogli biti minerali- nakon !tosu se komponente nukleotida adsorbirale na povr!inu minerala,moglo je do'i do nji4ovog spajanja, a&i ' sa'a takvasposobnost nije dokazana niti za jedan testirani mineral

    Pretpstavka II2 sinteza ribonukleotida je i!la posvenekataliziranim putevima, ali se ni ona do danas ne može

     potvrditi

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    21/32

    JA"K 01 SZOSTAK  

    na!ao jo! #vr!'i dokaz da je RN nastala prebioti#kim putem mogla provoditireplikaciju RN u uvjetima koji su vladalina primitivnoj zemlji2

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    22/32

    B uzeo je smjesu nasumi#ni4 oligonukleotida (pretpostavio je da je takvasmjesa mogla nastati na emlji prije cca. 6 mlrd. god) i iz te smjese .e%spi iz&irati RNA  koja je bila katalizator tj. mogla je povezivatioligonukleotide

    Bosim toga, ovaj RN-katalizator je energiju potrebnu za odvijanjereakcije mogao uzimati iz tri$os$atne grupe, iste grupe koja kao gorivodanas pokre'e ve'inu reakcija u živim sustavima

    B ta s&i2nst p'%pire teri.% 'a s% RNA kata&izatri preth'i&iprteinski! kata&izatri!a

    JA"K 01 SZOSTAK  

    na!ao jo! #vr!'i dokaz da je RN nastala prebioti#kim putem mogla provoditireplikaciju RN u uvjetima koji su vladalina primitivnoj zemlji2

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    23/32

    Podr!ku 4ipotezi o primarnosti RN svijeta daju i st%'i.eri$s!a2

    &ni se sastoje od rRN i proteina, a imaju svojstvo pomicanjauzduž lanca mRN (tijekom procesa sinteze proteina).

    Pri pomicanju ribosoma uzduž mRN dolazi do povezivanjaniza aminokiselina pomo'u peptidni4 veza.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    24/32

    Podr!ku 4ipotezi o primarnosti RN svijeta daju i st%'i.eri$s!a2

    &ni se sastoje od rRN i proteina, a imaju svojstvo pomicanjauzduž lanca mRN (tijekom procesa sinteze proteina).

    Pri pomicanju ribosoma uzduž mRN dolazi do povezivanjaniza aminokiselina pomo'u peptidni4 veza.

    CRRD E. N&FFR 8R stvaranje peptidni4 veza

    katalizira RN, a ne proteinskidio ribosoma

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    25/32

     Niz radova iz ovog podru#ja navodi na zaklju#ak da se uuvjetima prvobitne emlje mogla kao zajedni#ki predak razvitiRN.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    26/32

     Niz radova iz ovog podru#ja navodi na zaklju#ak da se uuvjetima prvobitne emlje mogla kao zajedni#ki predak razvitiRN.

    SOL SPIE*ELMAN

     pokazao da i RN molekule mogu stjecati nove osobine

    ko se RN neprekidno replicira u nazo#nosti ribonukleaze, poneka

    kopija replicirane RN 'e ste'i otpornost na degradativni enzim.

    *ERAL3 41 JO5"E i SURA3NI"I

     '$i&i su $inijim postupcima % &a$ratri.% ri$zi!e koji su mogli

    rezati niz kemijski4 veza, uklju#uju'i i peptidne veze

    %akle, postoji niz razloga za ideju o postojanju svijeta RN teda je RN ?izumila@ sintezu proteina.

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    27/32

    PRIJE OKO TRI MILIJAR3E *O3INAPR&

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    28/32

    PRIJE OKO TRI MILIJAR3E *O3INAPR&

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    29/32

    PRIJE OKO TRI MILIJAR3E *O3INAPR&

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    30/32

    &&N

    3 E 4

    PRIJE OKO 3VIJE MILIJAR3E *O3INA PRIJE OKO 678 MILIJAR3E *O3INA

    "

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    31/32

    &&N

    3 E 4

    PRIJE OKO 3VIJE MILIJAR3E *O3INA PRIJE OKO 678 MILIJAR3E *O3INA

    "

  • 8/18/2019 06 Bioloska Evolucija - Pramolekula Zivota

    32/32

    &&N

    3 E 4

    PRIJE OKO 3VIJE MILIJAR3E *O3INA PRIJE OKO 678 MILIJAR3E *O3INA

    "