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Grammann / Eiden BioAnalytik
BioAnalytik : 12015-2016
- Standort Recklinghausen-
Wintersemester 2015-16
BioanalytikBioanalytik23.11.1523.11.15
ImmunoassaysImmunoassays007_001007_001
Rev. 1.5 | 091206
Fol
ienb
asis
: Pro
f. B
eyer
Grammann / Eiden BioAnalytik
BioAnalytik : 32015-2016
fatty acid-binding protein, FABP
Das Fettsäure bindende Protein (fatty acid-binding pr otein, FABP) wurde erstmals als Blutmarker für die Diagnos e eines akuten Myokardinfarkts 1988 vorgeschlagen. FA BP spielt heute eine wichtige Rolle für die Diagnose v on Patienten mit Brustschmerz, besonders in den frühen Stunden nach Einsetzen der Symptome
Die biochemischen Marker haben jedoch den Nachteil, dass nach einem AMI (akuter Myokardinfarkt) ihre Blut-konzentration erst etwa 4 (CKMB) oder 4 – 6 h (bei Troponinen) nach Einsetzen der Symptome ansteigt.
Sowohl bei Myoglobin als auch bei dem Fettsäure bind enden Protein (FABP) erhöhen sich die Konzentrationen im Blut inner halb von 2 h nach dem Einsetzen der Symptome.Klinische Studien haben gezeigt, dass FABP spezifis cher ist als Myoglobin. Das macht FABP zum bevorzugten Blutmarker für die Früherkennu ng oder den Ausschluss eines AMI.
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fatty acid-binding protein, FABP
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• Fettsäurebindungsproteine (FABPs) als Marker für Gewebeschädigungen(gewebespezifische Expression der unterschiedlichen Typen)
• bereits etabliert: Herz hFABP wird bei Herzinfarkten freigesetzt
• Projekt: Wird intestinales iFABP bei Darmschädigungen freigesetzt?
• Testsystem: Retrospektive Analyse von Serum von Neugeborenen mitenterkolitischen Komplikationen
Reinigung & Assay-Etablierung – ein Fallbeispiel
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ampr
ori
hI-FABP
Bam HI
Nde I
T7 promoter
T7 terminator
pEThI-FABP(5018 bp)
RBS
E. coli BL21(DE3)pLysS pEThI-FABP
0,4 mM IPTG Nach 3 h Zellernte, Zentrifugation
Bakterienpellet
Benzonuklease (15 Min, 37°C), Aufschluss mit Ultraschall
(30 W, 3 x 15 s, 0°C)
Aufgeschlossene Bakterien
Zentrifugation � Ammoniumsulfat-Präzipitation
Lysat
1. Heterologe Expression
Fallbeispiel iFABP
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0 100 200 300 400
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7Sephadex G25 (5 cm x 20 cm)10 mM Tris/HCl pH 7.45 ml/min
OD
280
Volumen [ml]
2. Reinigung
2. 1. Entsalzen(Gelfiltration)
0 300 600 900 1200
0.0
0.4
0.8
1.2
0
20
40
60
80
100
120
140
OD
280
Volumen [ml]
Lei
tfähi
gkei
t [m
Si/c
m]
Q-Sepharose BB (5 cm x 20 cm)10 mM Tris HCl, 230 mM NaCl, pH 7.45 ml/min
2. 2. Ionenaustausch-Chromatographie
Fallbeispiel iFABP
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0 20 40 60 80 100 120 140
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4Superdex (1.6 cm x 60 cm)10 mM Na-phosphate, 154 mM NaCl, pH 7.40.75 ml/min
OD
280
Volumen (ml)
3. Polishing
mixed-bed GelfiltrationReinigungsfortschritt
SDS-PAGE
Fallbeispiel iFABP
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rec. Human I-FABP
Generierung monoklonaler AK
I-FABP Sepharose oder ProteinA-Sepharose
0
20
40
60
80
100
0 10 20 30 40 50 60
0.0
0.1
0.2
0.3
0.8
0.9
Puf
fer
B (
%)
Volumen
I-FABP Sepharose (1 cm x 6 cm)PBS, 1 ml/minElution 0.1 M Glycin pH 2.8
OD
280
1 ml Anti-I-FABP
Modifizierung der Anti-I-FABP IgGmit Biotin
5. Generierung & Biotinylierung von Antikörpern
Affinitätsgereinigte Anti-I-FABP IgG
Fallbeispiel iFABP
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I-FABP [ng/ml]
0 1 2 3 4
OD
490
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
y= - 0.060 x2 + 0.726 x + 0.074r2 = 0.9999
Detection limit: 0.05 ng/mlmeasurement range: 0.1 - 4 ng/ml
dilution of serum: 1 : 10Inter-Assay Varianz ~ 5%
Y BSA
bioHRP
I-FABP
OPDStreptavidin
490 nm
Optimierte Parameter: Konz. Fänger- Detektorantikörper,Sav-HRPInkubationszeiten
7. Etablierung des Sandwich ELISA
Fallbeispiel iFABP
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7. Etablierung des Sandwich ELISA - Charakterisierun g
Fallbeispiel iFABP
0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05
OD
490
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
rekomb. I-FABP [ng/ml]
Rekombinantes und Plasma-
human I-FABP sind äquivalent
plasma I-FABP [plasma dilution factor]
0 20 40 60 80 100
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Immunoassays
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BioAnalytik : 142015-2016
Immunoassays z.B. im klinischen Umfeld - Serumanalyti k
„klassische“ Auswertung der Antigen-Antikörperreaktion:Agglutination = Zusammenklumpen durch Präzipitatbildung
Ausführung (a) ⇒ als „Tüpfeltest“ auf Objektträgern oder kleinen Vertiefungen
(b) im Mittel-/Hochdurchsatz:optische Detektionsmethodenzur Trübungsmessung
⇒ Turbidimetrie (s. weitere Folien)
⇒ Nephelometrie (s. weitere Folien)
Serologie: Agglutinationstests
anti-A
anti-B
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Heidelberger Kurve!
Agglutination: Präzipitatbildung durch Immunkomplexe
(AG mit monovalenten Epitopen, z.B. Protein) +/- lineare Beziehung AG - Signal
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Agglutination: Präzipitatbildung durch Immunkomplexe
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Latex-verstärkte Agglutination
Detektion spezifischer AK Latexpartikel mit AG gecoatet: (Partikel < λ� interferieren nicht mit Lichtstrahl)
Sie bilden jedoch poly valente Bindungspartner für die AK� große AG/AK-Komplexe
AK-Assay: direkt �
AG-Assay: kompetitiv �
(Anm.: ggf. können auch die AK die an die Latexpartikelgekoppelt werden!)
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Optische Detektion der Präzipitat- / Immunkomplexbild ung
hν-Streuung � viele optische Effekte: Nebel, Milch, blauer Himmel…
Streuung physikalische Beschreibung:
Elastische Streuung(keine Energieübertragung an die Probe)
- Diffraktion (Röntgenstreuung an Kristallen)
- Rayleigh-, Mie-Streuung sichtbaren Lichts an suspendierten bzw. kolloiden Teilchen (Parameter in Formeln: Winkel, Partikelgröße und Wellenlänge)
Inelastische Streuung (Energieübertragung zwischen Probe und Strahlung)
- Ramanspektroskopie
Agglutination: Messung
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FL D
c kleinefür ckI ⋅=
Turbidimetrie
FL D
• Ausblenden des Lichtstrahls• Detektion
der (Vorwärts-)Streuung
Nephelometrie
Turbidimetrie � Trübungsmessung / Nephelometrie � Streulicht-Messung
Agglutination: Messung
Eλ
= lg(I0/I) = ελ·c·d
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BioAnalytik : 202015-2016
Laborautomaten
Vorteile :
• bar-code gesteuerte Erfassung & Prozessierung
• Medium & high througput
• Reagenzien on board(Vorratsflaschen)
• schnelle Messung• Hohe Reproduzierbarkeit � gering Systemvarianz
Agglutinationstest im Labor
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BioAnalytik : 212015-2016
Latex-Agglu-Test entwickelt Anfang der 1980er, angewendet u.a. in folgenden heute gängigen Tests:
• Nachweis v. Antistaphylolysin(ein Staphylokokken-Enzym)
• Antistreptolysin-Test(bei Streptokokkeninfektion)
• Nachweis von C-reaktivem Protein, einem Entzündungsmarker
• Immunglobulin M-Nachweis
• Latex-RF-Test(Nachweis von Rheumafaktoren)
• Schwangerschaftstest (Nachweis von beta-HCG)
Agglutination: Testkits
Evaluation of Latex Agglutination Tests for Establishing Coagulase Status of Staphylococci from Milk;
Can J. Comp Med 1984; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1236043/pdf/compmed00006-0101.pdf
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BioAnalytik : 222015-2016
… im klinischen Zentrallabor
Nephelometrie ( vs. Turbidimetrie ): besseres Signal-Rausch Verhältnis im Bereich geringer Signale, weil c=0 � I = 0 (vs. c = 0 � I = max.)
Agglutinationstests
Zentrallabor Universitätsklinikum Schleswig-Holstei n Campus Kiel
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kinetische vs. fixed time (Endpunkt-) Methode
� Abwarten des Gleichgewichtes kann umgangen werden, indem die Anfangssteigung (meist aus 2 frühen Messpunkten) bestimmt wird
Messung:
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BioAnalytik : 252015-2016
Turbidimetrischer, immunologischer Inhibierungsassay
direkt vs. kompetitiv (Variante: Inhibition)
Test-Setup
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BioAnalytik : 262015-2016
Z.B. in der Mikrobiologie: Bakterienwachstum
Messung von Streustrahlung im Mikrotiterplattenformat
Messung im 96er-Format
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BioAnalytik : 272015-2016
Feinstaubmessung
Andere Einsatzgebiete der Nephelometrie
Detektor
Referenz-Detektor
Lichtquelle(LED)
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BioAnalytik : 282015-2016
Strip-Tests
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BioAnalytik : 292015-2016
� Geschwindigkeit� Zuverlässigkeit
… im Zusammenhang mit …
• Wissenschaftlicher Analytik� Exaktheit zählt;
Aufwand & Zeit sind nebensächlich
• Klinischer Labor-Diagnostik� Hochdurchsatz bei geringem Aufwand� Zuverlässigkeit� definierte Genauigkeit
• Schnellanalytik � geringer Aufwand� Robustheit
-- Biosensoren (Immunsensoren)-- Strip-Tests
Praxisanforderungen
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Spezielle Membranen
• Nitrozellulose (High Protein Binding) • Cellulose Acetate (Low Protein Binding) • Glass Fiber Membranes (Non-Protein Binding)
Immunoschnelltest - Teststreifen
Parameter: Porengröße,Oberflächen-
beschaffenheit
Integration der Reagenzien
• Immobilisierte Fänger- und Kontroll-Antikörper• markierte Detektor-Antikörper in Matrix (lösliche Form)
Andere Bezeichungen:
• Lateral Flow Tests• Strip Assay• Immunochromatographie
Strip Assays
Prinzip: AG (oder AK) aus Probe fließt (Kapillarkräfte!) über Teststreifen;� wird an durch AG-AK-Interaktion an „reagent line“ fest gehalten
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BioAnalytik : 312015-2016
Kinetische Parameter: einfach vs. Sandwich / direkt vs. kompetitiv
• Einstellung der Flussrate (Antrieb: Kapillarkraft ) � Analysenzeit, Empfindlichkeit, Hintergrund, Reagenzienverbrauch
• visuelle Detektion: AK-Markierung mit kolloidalem Gold (ca. 30nm) oder gefärbten Mikropartikeln (Latex, ca. 300nm) � Größe sollte max. 10% der Porengröße betragen!
z.B. Sandwich:größere Antigene
(mit mehreren Epitopen)• Plasma Proteine• GVO-Nachweis
z.B. kompetitiv:kleine Antigene
(mit nur einem Epitop)• Schwangerschaftstest
hCG - human chorionicgonadotropin
Strip-Assays: Setup
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BioAnalytik : 322015-2016
C T
Negativ-Kontrolle � markierte Antikörper werden auf der Kontrolllinie C abgefangen
C T
Beispiel für einen kompetitiven Teststreifen
Strip-Assays
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BioAnalytik : 332015-2016
C T
Viel AG in der Probe � markierte Antikörper werden maskiert und auf der Testlinie T von Anti-IgG gebunden
C T
Strip-Assays
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BioAnalytik : 342015-2016
In einem Bild: kompetitiver Strip Assay
Bevorzugt für kleine AG / Haptene: Medikamente, Drogen, kleine Hormone
Wo ist C? T?
Strip-Assays
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BioAnalytik : 352015-2016
Beispiel für einen Sandwich-Teststreifen
Strip-Assays
positiv negativ
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BioAnalytik : 362015-2016
• poröse Materialien (Pads, Membran)• (lyophilisierte) Reagenzien• Laminierungsmaterialien• Gehäuse
Bestandteile eines Teststreifens:
Optimierungsziel: Vorgaben erfüllen, Kosten im Cent-Bereich
Strip-Assays
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BioAnalytik : 372015-2016
GVO Nachweis auf Protein-Ebene
Vorteile? Nachteile?
relevante Proteine:
- Bacillus Thuringiensis (Bt)-Toxin,
- Agrobacterium sp. CP4 - EPSPS (alle Roundup Ready Konstrukte)(5-enol-pyruvyl-shikimate-3-phosphate Synthase, Schlüsselenzym der Val/Leu/Ile-Biosynthese, Glyphosat-[in]sensitiv)
Anwendungsbeispiel GVO AnalytikPoint-of-Sale Messungen (z.B. Wareneingangskontrolle )!
Strip-Assays
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BioAnalytik : 382015-2016
Low Te
ch abe
r : ei
nfach
und sc
hnell!!
Strip-Assays
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BioAnalytik : 392015-2016
Einsatzgebiete in der klinischen Analytik
Roche
Point of Care Diagnostik
⇒ Aufwendigeres Design
Strip-Assays
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BioAnalytik : 402015-2016
Aspekte
Fallbeispiel:• Klonierung / Überexpression• Vorbereitung / Evaluierung des ELISA
Agglutionstionstests• Turbidimetrie vs. Nephelometrie: Detektionsprinzip• Heidelberger Kurve• Fixed time (kinetisch) vs. Endpunkt • Latextest: Prinzip der Signalverstärkung
Strip Assays• Funktionsweise (direkt vs. kompetitiv)• Beispielanwendungen
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BioAnalytik : 412015-2016
„ To live, to err, to fall, to triumph, to recreate life out of life!“James Joyce